张侠家,沈继录,贾伟华
耐万古霉素肠球菌耐药表型检测和基因型分析
张侠家1,2,沈继录1,2,贾伟华3
目的 研究某院耐万古霉素肠球菌(VRE)的耐药特性、基因型及流行情况。方法 采用K-B纸片扩散法进行药敏试验;使用E-test法检测VRE对万古霉素的最低抑菌浓度(MIC),PCR法检测万古霉素的耐药基因,BLAST法对6株PCR产物测序结果比对分析其氨基酸序列。结果 193株肠球菌中检出6株万古霉素耐药屎肠球菌;该菌株对高单位庆大霉素、氨苄西林、环丙沙星、红霉素、利福平、替考拉宁均耐药,对呋喃妥因和利奈唑胺均敏感,对万古霉素的MIC值均>256 mg/L;基因型均为vanA;6株菌的vanA基因均有氨基酸发生了改变,其中5株菌均发生第83位氨基酸突变,由天冬酰胺(AAC)→天冬氨酸(GAC)。结论 我院VRE多为多重耐药,给临床治疗VRE感染带来困难,医院应加强预防监测,阻止其在院内的传播和流行。
万古霉素;耐药性;肠球菌;表型;基因型
肠球菌属可导致尿路感染、皮肤软组织感染,甚至会引起危及生命的腹腔感染、败血症、心内膜炎和脑膜炎。近年来,肠球菌耐药菌株的不断出现,耐药水平也迅速上升[1]。随着 1988年英国首次报道[2-3]了耐万古霉素肠球菌(vancomycin-resistantEnterococci,VRE),世界各地陆续有VRE被发现,并且世界各国VER检出率非常高,近年我国许多地区VRE也有一定检出率[4]。现对安徽医科大学第一附属医院2011年分离到的6株VRE进行分析,为临床治疗VRE用药、控制院内传播及进行流行病调查提供依据。
1.1 菌株来源 收集安徽医科大学第一附属医院2011年1月~12月临床分离的193株肠球菌 (剔除来自同一患者的重复株),其中粪肠球菌59例,屎肠球菌131例,鸟肠球菌3例。
1.2 质控菌株 金黄色葡萄球菌ATCC 25923和粪肠球菌ATCC 29212均购自卫生部临床检验中心。
1.3 主要仪器设备 MicroScan WalkAWay-96plus全自动微生物分析系统购自美国西门子公司;电泳仪(天能ESP 300)购自上海天能公司;PCR扩增仪购自德国Biometra公司;凝胶成像系统购自美国Bio-Rad公司。
1.4 培养基和试剂 M-H琼脂培养基为英国OXOID公司商品;PCR检测试剂Ex Taq酶、Ex Taq Buffer及dNTPs均为日本TaKaRa公司商品。
1.5 抗菌药物 高单位庆大霉素(120 μg)、氨苄西林、环丙沙星、氯霉素、磷霉素、红霉素、利福平、呋喃妥因、利奈唑胺、替考拉宁、万古霉素11种药物纸片均购自英国OXOID公司;E-test纸条购自法国生物梅里埃公司。
1.6 药敏试验 采用K-B纸片法进行药敏试验,结果判断依据美国临床实验室标准化委员会(CLSI)文件2011版标准。纸片法万古霉素耐药菌株再采用E-test纸条确认最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentrations,MIC)。耐药株选择标准:E-test纸条测定对万古霉素的MIC >256 mg/L。
1.7 PCR 引物 引物依据参考文献[5-6]进行设计,由上海生物工程公司合成。见表1。
1.8 肠球菌万古霉素耐药基因检测 应用PCR对van耐药的菌株进行耐药基因的扩增,包括:vanA、vanB 、vanC1和 vanC2-3型基因;PCR 反应条件与过程如下:挑取纯培养菌落置入去离子水中配制成悬液,100℃煮沸10 min,8 000 r/min离心5 min,上清液即为模板液。PCR反应体积为50 μl,包括4 μl的模板液,上下游引物各 2 μl(10 μmol/L),4 μl dNTPs(200 μmol/L),0.25 μl Ex Taq 酶(1.6 U),5 μl Ex Taq Buffer,去离子水 32.8 μl。扩增条件:预变性93℃ 2 min;变性93℃ 1 min,退火55℃ 1 min,延伸72℃ 1 min,共35个循环;最后72℃延伸2 min,停止4℃。PCR扩增产物经1.5%琼脂糖凝胶电泳,取出用BIO-RAD显像,拍照观察结果。
1.9 PCR产物测序分析 PCR阳性扩增产物送交上海生物工程公司测序。以屎肠球菌(taxid:1352)为阳性对照,将测序结果在GenBank序列数据库进行基因同源性分析(BLAST)。
表1 van基因PCR引物序列及产物大小
2.1 6 株耐万古霉素屎肠球菌(vancomycin-resistantEnterococci Faecium,VREFm)药敏试验 K-B纸片法测定6株VREFm对11种抗菌药物的耐药率,结果显示VREFm对高单位庆大霉素、氨苄西林、环丙沙星、氯霉素、红霉素、利福平100%耐药;对磷霉素耐药性呈现出差异;对呋喃妥因和利奈唑胺均敏感,对替考拉宁耐药。见表2。
2.2 6 株VREFm基因检测 6株耐药屎肠球菌经PCR扩增后均为vanA阳性基因,片段783 bp。未检测出vanB、vanC1和 vanC2-3型基因。见图1。
2.3 6 株PCR产物基因测序 从vanA基因表达阳性菌株中,进行vavA基因的测序,发现6株菌vanA基因均有氨基酸的突变,其中5株菌均发生第83位氨基酸突变Asn(AAC)→Asp(GAC),见表3。
万古霉素是治疗革兰阳性菌感染的一种重要的糖肽类抗生素,被认为是治疗严重肠球菌感染的“最后一道防线”。然而近年来,随着万古霉素在临床应用治疗肠球菌感染逐渐增多,使得VRE感染率迅速增加[7],给临床治疗带来了困难。本研究对我院2011年分离的193株肠球菌进行药敏试验,结果筛选出6株VRE,耐药率占3.1%,低于国内外的相关报道[2,8],并且药敏试验显示6株 VRE 全部是屎肠球菌。屎肠球菌对大多数抗菌药的耐药率高于粪肠球菌,并且屎肠球菌对大多数抗生素天然耐药,提示屎肠球菌耐药形势比粪肠球菌严峻[9],使临床治疗VRE感染更加棘手。
图1 vanA基因的PCR产物电泳图
表2 6株VREFm对11种抗菌药物的耐药率(%)
表3 6株VREFm的vanA基因氨基酸突变情况
目前,VRE耐药表型和基因型均可分为vanA、vanB、vanC、vanD、vanE、vanG、vanL、vanM 和 vanN 9型[10],其中vanA型为主要类型,对万古霉素和替考拉宁均耐药,其次为vanB型,表现为对万古霉素不同程度耐药而对替考拉宁敏感,vanC型对万古霉素敏感而对替考拉宁耐药。我院检出的6株VRE基因型均是vanA型,并且6株菌vanA基因均有氨基酸的突变,其中5株菌均发生第83位氨基酸突变Asn(AAC)→Asp(GAC)。6株vanA基因表达阳性菌株,对万古霉素耐药,其编码基因发生突变可能导致其编码的蛋白高表达,从而导致对万古霉素MIC的进一步提升,具体机制还有待进一步研究。vanA是肠球菌中最常见的耐糖肽类抗菌药物的耐药型,也是迄今为止唯一一个能在金黄色葡萄球菌中检出的耐药类型;vanA型耐药基因可由质粒介导传递给金黄色葡萄球菌,产生耐万古霉素金黄色葡萄球菌(VRSA)。VRSA的毒力和侵袭力更大,使目前存在的抗菌药物面临极大挑战。因此,要规范化使用抗菌药物,要不断完善实验室对VRE的检测,做到快速分离和鉴定,如果发现有VRE应及时与医院有关部门取得联系,做好消毒隔离工作,定期检测医院耐药菌株对常用抗菌药物的耐药情况,防止VRE在医院内的交叉感染和传播。
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Detection of phenotype and analysis of genotype in vancomycin-resistantEnterococci
Zhang Xiajia1,2,Shen Jilu1,2,Jia Weihua3
(1Dept of Clinical Laboratory Diagnostics,3The First Clinical College,Anhui Medical University,Hefei230032;2Dept of Medical Laboratory,The First Affiliated Hospital of Anhui Medical University,Hefei230022)
ObjectiveTo research the resistant characteristics,genotype and prevalence of vancomycin-resistantEnterococci(VRE).MethodsK-B disc diffusion method was used to determine the susceptibility,minimum inhibitory concentration(MIC)for vancomycin of VRE was detected by E-test method;VRE was then subjected to PCR for resistance related genes;6 strains sequencing results of PCR product were contrastively analyzed the amino acid sequence by BLAST.Results6 VREFm strains were found from 193 strains enterococci;6 VREFm strains were completely resistant to high unit gentamicin,ampicillin,ciprofloxacin,teicoplanin,but were sensitive to linezolid and macrodantin,MIC for vancomycin was more than 256 mg/L;Genotypes were vanA;Amino acids in vanA gene have changed with Asn83→Asp(AAC→GAC).ConclusionVRE in our hospital is mostly multi-drug resistant,
which bringS difficulty in clinical treatment for its infection.So the hospital should strengthen the prevention and monitoring,to prevent the spread of VRE strains in the hospital and popular.
vancomycin;drug resistance;enterococci;phenotype;genotype
R 378.1;R 446.5;R 453.2
A
1000-1492(2014)05-0662-03
2014-02-17接收
国家自然科学基金(编号:81171618)
安徽医科大学1临床检验诊断学教研室、3第一临床学院,合肥 230032
2安徽医科大学第一附属医院检验科,合肥 230022
张侠家,女,硕士研究生;
沈继录,男,博士,副主任技师,硕士生导师,责任作者,E-mail:shenjilu@126.com