格列卫对K562细胞中miR-146a、miR-29b及3种甲基化酶表达的影响*

2014-03-04 05:12王丽娜曾建明王华成龙一飞邓光远
重庆医学 2014年3期
关键词:格列卫甲基化酶逆转录

王丽娜,曾建明,王华成,李 沫,龙一飞,邓光远,陈 茶

(1.广东省中医院大学城医院检验科,广东广州510006;2.广州市脑科医院检验科,广东广州510370)

慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)是造血干细胞水平发生的获得性恶性血液肿瘤。染色体异位t(9;22)(q34;q11)形成BCR/ABL融合基因,其编码的特异性融合蛋白BCR/ABL具有强烈酪氨酸激酶活性,异常调控多种生物学行为,引发宿主细胞恶性转化。BCR/ABL调节的主要信号通路有 NF-κB、STATs、PI3K、RAS-MAPK 等。NF-κB二聚体对靶启动子的结合启动了多种免疫调节基因的转录激活。

通过抑制BCR/ABL融合蛋白的活性,进而逆转其下游信号通路来治疗CML已有数年的历史,其中最有代表性的BCR/ABL抑制剂就是格列卫。格列卫是特异性的BCR/ABL酪氨酸激酶抑制剂。用格列卫抑制CML细胞的BCR/ABL活性会抑制NF-κB的转录活性[1],受 NF-κB调控的基因表达也将受到抑制[2]。

Starczynowski等[3]研究了急性白血病细胞系HL-60细胞中microRNA(miR)-146a的表达情况,发现HL-60细胞在用5-aza处理后,miR-145及miR-146a的水平呈3倍以上的升高。但对于CML细胞中miR-146a表达情况的研究尚未见报道。

本研究目的是观察格列卫作用后,NF-κB的下游靶基因miR-146a的表达情况,检测能够抑制甲基化酶表达的miR-29b水平的变化,并且检测3种甲基化酶基因的表达水平,为分析miR-146a的调控机制奠定基础。

1 材料与方法

1.1 材料 胎牛血清(FBS)购于美国Gibco公司,台盼蓝、MTT试剂分别为BBI公司及上海生工产品。格列卫(100mg相对分子质量589.7)为瑞士诺华公司产品。Trizol试剂购于东盛生物公司,Bio-Rad Ssofast EvaGreen PCR kit购于美国Bio-Rad公司,Fermentas逆转录PCR试剂盒购于法国Fermentas公司,U6、miR-146a、miR-29b逆转录及正、反向引物为广州锐博公司产品,DNMTs引物由Invitrogen公司合成,GoldView核酸染料为赛百胜公司产品。所用的3种甲基化酶(DNMTs)引物序列如下,DNMT1上游:5′-GAG GAA GCT GCT AAG GAC TAG TTC-3′,下游:5′-ACT CCA CAA TTT GAT CAC TAA ATC-3′,产物大小:190bp;DNMT3a上游:5′-CAG CTT CCA CGT TGC CTT CT-3′,下游:5′-CAT CTG CAA GCT GTC TCC CTT T-3′,产物大小:66bp;DNMT3b上游:5′-TAC ACA GAC GTG TCC AAC ATG GGC-3′,下游:5′-GGA TGC CTT CAG GAA TCA CAC CTC-3′,产物大小200bp。

1.2 K562细胞培养及格列卫IC50确定

1.2.1 K562细胞培养 使用含10%胎牛血清(使用前于56℃恒温水浴箱中放置30min以灭活补体)的RPMI1640培养基,细胞置于37℃、5%CO2细胞培养箱中,适时换液及传代,取对数生长期的细胞进行实验。

1.2.2 格列卫配置 母液 A,浓度为10mmol/mL;母液B,浓度为3.33μmol/mL;母液C,浓度为500μmol/L。

1.2.3 4%的台盼蓝母液配置 1g台盼蓝,加入少量蒸馏水研磨,加0.9%NaCl至25mL,用滤纸过滤,4℃保存。染色时,将2μL染液及18μL细胞悬液混合,充入计数池,立即于显微镜下计数,计算细胞抑制率(%)=死细胞数/细胞总数×100%。

1.2.4 配置5mg/mL MTT试剂 使用时于180μL细胞培养体系中加入上述 MTT溶液20μL(即 MTT终浓度为1mg/mL)。按每孔1 000个细胞接种至96孔板(总体积为180μL)置于37℃、5%CO2,饱和湿度条件下培养24h后,加入不同浓度的格列卫,每一浓度设3个平行孔,阴性对照加入等量的磷酸盐缓冲液(PBS)。继续培养48h后每孔加入MTT试剂,继续培养4h,将培养板进行离心,吸弃上清液,每孔中加入150μL DMSO,在492nm(检测波长)/630nm(参比波长)处进行检测。以不加药物的对照孔吸光度OD值在0.8~1.2为佳。

1.3 荧光定量PCR检测mRNA

1.3.1 总RNA提取 分别取格列卫处理的K562细胞、及生理盐水处理(阴性对照)的K562细胞各1×106个。用PBS洗涤一次,置于1.5mL EP管中,加入1mL Trizol试剂,充分混匀。加入0.2mL氯仿,盖紧后剧烈振荡15s,室温静置5min,4℃12 000×g离心15min。取上层水相置于一新EP管中,加入0.5mL异丙醇,轻轻颠倒,充分混合均匀后,室温静置10 min。4℃12 000×g离心10min。弃上清液,加入1mL 75%乙醇,漩涡混匀,4℃7 500×g离心5min。弃上清液,室温干燥10min,加20μL焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶解。在Nanodrop核酸定量分析仪上测定RNA浓度。

1.3.2 逆转录 miRNAs的逆转录反应步骤如下:首先加入RT-PCR反应体系的试剂并进行变性退火:RT-PCR引物(62.5nM)2μL,RNA 2μL,加ddH2O至19μL。放入PCR仪70℃10min进行变性退火反应。之后继续加入反应体系:5×缓冲液(Buffer)10μL,2.5nM dNTP 2μL,Prime Script RTase 200U/μL 2.5μL,加ddH2O 至50μL,按30 ℃ 10 min,42℃60min,70℃15min的反应条件进行逆转录反应。

1.3.3 荧光定量PCR 依照说明书操作ABI 7500Real-Time PCR System,反应体系如下:Sso Fast EvaGreen supermix with low Rox 9μL,正向引物2μL,反向引物2μL,RT-PCR反应液2μL,无RNA酶的ddH2O 5μL。扩增过程如下:95℃预变性20s;95℃10s,60℃34s;扩增40个循环后进行熔解曲线分析。数据采用2-△△CT法进行分析,以阴性对照为参照进行计算。

1.4 统计学处理 用SPSS13.0软件进行统计学处理。各指标的结果采用±Sx表示,组间比较用方差分析,当方差齐时组间两两比较用LSD,当方差不齐时,组间两两比较用Dunnett′s T3,格列卫IC50的确定,采用MTT法,并参考文献[4]进行。

2 结 果

2.1 格列卫最适浓度的选择 由于本实验采用的是未经纯化处理的格列卫,因此需要重新确定其作用于K562的IC50浓度。台盼蓝染色结果显示,生理盐水以及系列浓度(10、20、30、40、50μmol/L)的格列卫作用于K562细胞,细胞抑制率结果如图1所示。MTT实验确定IC50浓度为40.85μmol/L,后续实验中格列卫的浓度选用30、50μmol/L两种浓度。

图1 不同浓度格列卫作用于K562细胞的细胞存活率(±Sx)

2.2 miR-146a、miR-29b表达水平改变 miR-146a水平在格列卫作用后显著升高(P<0.05),miR-29b水平在格列卫作用后上升,结果见表1。

表1 格列卫作用后K562细胞中miR-146a及miR-29b表达水平改变

表2 格列卫作用后K562细胞中甲基化酶的表达水平改变

2.3 格列卫作用后K562细胞甲基化酶表达水平改变 30、50μmol/L格列卫作用后,K562细胞中甲基化酶基因mRNA的变化呈下降趋势,见表2。

3 讨 论

MiR-146a在造血及免疫反应中具有重要作用[5-7]。格列卫是特异性的BCR/ABL酪氨酸激酶抑制剂。格列卫抑制K562细胞中BCR/ABL活性后,导致系列生物学行为的改变,其中包括 NF-κB、cMyc的抑制等[8]。作为 NF-κB的下游靶基因之一,miR-146a的表达在STI571作用后却并未受到抑制。本研究在临床患者(结果未显示)及体外细胞研究中均发现,格列卫作用后,患者外周血单个核细胞中miR-146a水平无显著变化,格列卫作用于K562细胞,可使其细胞内miR-146a水平升高,与Stéphane Flamant等[9]的研究结果相互印证。但本研究选取的病例均为慢粒加速期的患者,而Stéphane Flamant等[9]的研究中纳入为初诊慢粒患者,并且均为首次接受IM治疗。Wang等[10]的研究结果显示 miR-146a的表达水平与ALL和AML患者的生存呈相反的关系,高表达miR-146a的患者临床预后相对差。但Wang等[10]的研究对象为急性白血病,与CML不可比较,无论细胞遗传学分型还是疾病的治疗方面均有显著差异。因此,本研究结果为全面理解miR-146a在CML中的调控及作用机制提供了新的证据和线索。

MiR-29b可以通过直接下调DNMT3A、DNMT3B,以及通过sp1间接下调DNMT1,从而导致大部分DNA的去甲基化,进而使得急性白血病细胞中多种肿瘤抑制基因得以重新表达[11-12]。本研究结果也显示了格列卫作用后miR-29b的水平升高。

本研究结果表明,格列卫作用后,三种甲基化酶的水平降低,结合Starczynowski等[3]对pre-miR-146a启动子区进行甲基化分析的结果,本研究认为甲基化酶水平降低是格列卫作用后miR-146a升高的原因之一,也就是说,K562细胞中甲基化酶水平升高导致miR-146a前体启动子区的甲基化,这是K562细胞中miR-146a维持在较低水平的原因之一。

在今后的实验中将继续探讨升高miR-146a对K562细胞的作用,并进一步从转录因子的结合能力等方面,探讨格列卫作用后miR-146a不降反升的可能作用机制。

[1]Kaufmann SH.Imatinib spells BAD news for Bcr/ablpositive leukemias[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2006,103(40):14651-14652.

[2]Taganov KD,Boldin MP,Chang KJ,et al.NF-kappaB-IN-dependent induction of microRNA miR-146,an inhibitor targeted to signaling proteins of innate immune responses[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2006,103(33):12481-12486.

[3]Starczynowski DT,Morin R,McPherson A,et al.Genome-wide identification of human microRNAs located in leukemia-associated genomic alterations[J].Blood,2011,117(2):595-607.

[4]赵斌,葛金芳,朱娟娟,等.小议在MTT法测细胞增殖抑制率中IC50的计算方法[J].安徽医药,2007,11(9):834-836.

[5]Wang S,Zhang X,Ju Y,et al.MicroRNA-146afeedback suppresses T cell immune function by targeting Stat1in patients with chronic hepatitis B[J].J Immunol,2013,191(1):293-301.

[6]Zhao JL,Rao DS,O′Connell RM,et al.MicroRNA-146a acts as a guardian of the quality and longevity of hematopoietic stem cells in mice[J].Elife,2013,2:e00537.

[7]Yang L,Boldin MP,Yu Y,et al.miR-146acontrols the resolution of T cell responses in mice[J].J Exp Med,2012,209(9):1655-1670.

[8]Nakamura S,Yokota D,Tan L,et al.Down-regulation of Thanatos-associated protein 11by BCR-ABL promotes CML cell proliferation through c-Myc expression[J].Int J Cancer,2012,130(5):1046-1059.

[9]Flamant S,Ritchie W,Guilhot J,et al.Micro-RNA response to imatinib mesylate in patients with chronic myeloid leukemia[J].Haematologica,2010,95(8):1325-1333.

[10]Wang Y,Li Z,He C,et al.MicroRNAs expression signatures are associated with lineage and survival in acute leukemias[J].Blood Cells Mol Dis,2010,44(3):191-197.

[11]Garzon R,Liu S,Fabbri M,et al.MicroRNA-29binduces global DNA hypomethylation and tumor suppressor gene reexpression in acute myeloid leukemia by targeting directly DNMT3Aand 3Band indirectly DNMT1[J].Blood,2009,113(25):6411-6418.

[12]Griffiths EA,Gore SD.MicroRNA:mIR-ly regulators of DNMT[J].Blood,2009,113(25):6269-6270.

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