东北财经大学研究生院是学校主管研究生教育的职能管理部门,主要负责研究生的招生、培养、教学管理、学位管理、日常管理、就业、研究生指导教师管理及博士后管理等工作。研究生院下设招生办公室、学位办公室、教学科研管理科、研究生管理科 (团委)、专业学位管理科和综合办公室。此外,校学位评定委员会办公室和博士后流动站办公室也设在研究生院。
东北财经大学自1981年开始招收硕士研究生,1986年开始招收博士研究生。学校现有3个一级学科博士后流动站:理论经济学、应用经济学和工商管理;5个一级学科博士学位授权点:理论经济学、应用经济学、工商管理、管理科学与工程和公共管理。42个二级学科博士学位授权点 (含自主设置学科16个):政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、世界经济、人口资源与环境经济学、世界经济与金融、经济哲学、国民经济学、区域经济学、财政学 (含税收学)、金融学、产业经济学、国际贸易学、劳动经济学、统计学、数量经济学、国防经济、金融工程、国民经济核算、公共经济与公共政策、产业组织学、国际投资学、国际经济合作、全球化与大国经贸关系、规制经济学、保险学、投资经济、管理科学与工程、会计学、企业管理、旅游管理、技术经济及管理、财务管理、市场营销、人力资源管理、中国管理思想史、行政管理、社会医学与卫生事业管理、教育经济与管理、社会保障和土地资源管理。
学校现有65个学术型硕士学位授权点 (含自主设置学科21个):科学技术哲学、政治经济学、经济思想史、经济史、西方经济学、世界经济、人口资源与环境经济学、世界经济与金融、经济哲学、国民经济学、区域经济学、财政学 (含税收学)、金融学、产业经济学、国际贸易学、劳动经济学、统计学、数量经济学、国防经济、金融工程、国民经济核算、公共经济与公共政策、产业组织学、国际投资学、国际经济合作、全球化与大国经贸关系、规制经济学、保险学、投资经济、风险统计、法学理论、法律史、宪法学与行政法学、刑法学、民商法学、诉讼法学、经济法学、环境与资源保护法学、国际法学、军事法学、政治学理论、社会学、马克思主义基本原理、思想政治教育、职业技术教育学、外国语言学及应用语言学、计算机应用技术、管理科学与工程、会计学、企业管理、旅游管理、技术经济及管理、财务管理、市场营销、人力资源管理、中国管理思想史、电子商务、企业诊断、国际商务与管理、物流管理、行政管理、社会医学与卫生事业管理、教育经济与管理、社会保障和土地资源管理。我校还有11个硕士专业学位授权点:工商管理硕士、公共管理硕士、会计硕士、法律硕士、金融硕士、保险硕士、国际商务硕士、应用统计硕士、旅游管理硕士、税务硕士和资产评估硕士。
东北财经大学非常重视研究生教育事业的发展,在人力、物力和财力方面都给予了大力的支持,使研究生的培养水平不断提高,规模不断扩大,目前,在校博士、硕士研究生规模已达5 600余人。研究生教育形成了以经济学、管理学为主体,法学、理学、文学等其他学科协调发展的格局。经过多年的发展,学校已经形成一支学科结构齐全、年龄结构合理、师资力量雄厚的研究生导师队伍。其中,博士生导师102人 (含校外兼职博士生导师36人),硕士生导师433人。
在研究生教学设施建设方面,2007年建成并投入使用的研究生教学大楼面积达16 000平方米,可同时容纳5 000余名研究生上课。研究生教学大楼的硬件设施在国内也是一流的。
由于研究生教育培养工作成绩突出,研究生院多次被教育部和辽宁省教育厅评为研究生招生和学位工作先进集体。