阿丽塔,许培扬,孙灵芝
(中国医学科学院医学信息研究所/图书馆,北京 100005)
药物研发除需了解化学实体及其合成工艺外,还需掌握相关的行政保护、药理、药效等信息及市场销售情况。由于药学数据库资源类型复杂,如何科学合理地加以利用,以提高药物研发的水平,是广大药学科研工作者需解决的问题。为此,笔者在系统分析新药研发流程(研发筛选、临床前研究、临床研究、新药报批)的基础上,依据新药研发的流程将药学数据库资源分为4类,为药学科研工作者提供查询方便。
药学数据库资源涵盖了从药物市场调研、新药发现、筛选设计到药学研究、药理学和毒理学评价、临床研究以及药品上市及上市后监管的信息等各个方面。由于长期以来药物研发主要由药物化学和药理学所驱动,寻找新药的过程起始于化合物合成,因此早期的药物数据库主要以化学数据为主。随着分子遗传学、功能基因组学、蛋白质组学和生物信息学的迅猛发展,药物研发正在向以药物靶标为起点转变,化学制药领域对生物信息的需求迅猛增长,化合物数据库开始整合生物信息以满足广大药学工作者的需求。创新药物的研究与开发是推动医药产业发展的不竭动力,因此,众多医药信息公司以此为契机,推出了为新药研发提供信息支持的各类数据库,以进一步推动医药产业的发展。
随着信息分析、评价理论的发展和信息分析工具的完善,药学数据库将在不断完善检索功能的基础上,结合信息分析评价的理论和方法对检索结果进行分析,为广大药学科研工作者提供更有价值的信息[1]。
2.1 项目调研数据库资源
Inpharma Databas(新药信息全文数据库):是美国Adis公司推出的药物信息全文数据库。该库主要收录了关于新药物、治疗突破、药物经济学、药物研究与开发(R%D)、药物反应、药物应用的发展趋势及卫生保健政策等方面的评论性、总结性报告。
Pharma-Transfer(药物研究与开发信息库):是由美国UTEK公司研制的药物研究与开发信息库,可提供药物早期发现、临床前及临床试验、产品注册等信息,为药物合作开发与授权提供机遇。
Prous Science Integrity(Prous综合医药信息平台):由Prous Science公司1958年研制开发,数据库中收录了30多万种上市和在研药物,以及关于这些药物的实验药理学数据、药代动力学、代谢数据、临床实验记录等,同时还包括相关疾病综合评述、药物合成方法、专利、生物标记物、公司、基因序列、文献新闻等信息。
Thomson Pharma(综合性全球药学信息解决方案):是Thomson Reuters公司于2004年研发的生物技术企业动态信息集成和知识管理平台。它集成了科学数据库、财经数据库、卫生保健数据库和法律及管理数据库4类数据库,每一类数据库中又包含了多个数据库。这4类数据库实现了无缝集成检索,而且对用户是透明的。
2.2 临床前研究数据库资源
DerwentDrug File(德温特药学文档):由德温特出版有限公司推出,收录了1983年至今几乎所有关于药物科学的文献,年收录量约为10万条,数据来源于1 200种科学出版物,包括世界范围内的期刊和会议记录,其中大约11%的资料来源于非英语语种文献,内容涉及药品开发、生产制备、药物评价等方面,包括分析化学、生物化学、内分泌、免疫学、医学、微生物学、制剂学、药理学、生理学、毒理学等。
World Drug Index(世界药物索引):由德温特出版有限公司推出,是世界上已上市药物和正在开发药物的权威索引,提供了每个药物的活性、作用机制、功能主治、生产者、别名以及医学信息。
Xpharm(药理学信息数据库):由Elsevier公司推出,提供了药剂、分子靶标、相关紊乱以及反应控制机理等信息。Xpharm包含3 700篇药理学文献,其格式简洁,引文丰富,易于阅读和吸收。Xpharm每年更新2次。
CrossFire Beilstein/Gmelin:由 Elsevier公司推出,CrossFire Beilstein是世界上最大的关于有机化学的事实型数据库,数据来源于175种期刊,已收录超过960万个化合物和1千万个有机化学反应,以及3亿2千万个按科学方法测试的事实。CrossFiregmelin是金属有机和无机化学领域收录数据最广泛的数据库,收录了1771年以来文献记录中的234万个化合物、180万个反应以及123万篇1995年以来包括标题和文摘的文献引文。
SciFinder数据库:1998年美国化学文摘社推出了CA网络版产品的学术版SciFinder。SciFinder的内容几乎涉及了化学家和生物学家感兴趣的所有领域,其中除有机化学、药物化学、分析化学、无机化学、材料学、物理化学、高分子化学外,还包括药物学、毒物学、环境化学、生物学以及物理学等共80大类学科领域。
BIOSISPreviews(生物学文献库):由美国生物科学信息服务社出版,该库收录了会议、报告、评论、图书、专论等多种文献,学科涵盖生物学、生物化学、生物技术、植物学、医学、药理学、动物学、农业、兽医学等领域。
EMBASE.com数据库(荷兰医学文摘数据库):是Elsevier公司推出的生物医学与药理学文献数据库,是EMBASE与MEDLINE强强联合而成的生物医学与药理学信息专业检索引擎。EMBASE.com覆盖各种疾病和药物信息,尤其涵盖了大量欧洲和亚洲医学刊物,其他同类型数据库无法匹敌。
PubMed数据库:由美国国立医学图书馆下属的国家生物技术信息中心开发研制,涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学等[2]。PubMed以收录期刊为主,是一个基于互联网的大型数据库系统,向全球公众免费提供生物医学论文的题录检索服务,并提供期刊或者其他相关网络全文链接[3]。
2.3 临床研究数据库资源
ClinicalTrial.gov(临床试验信息网站):是由美国国立卫生研究所通过美国国立医学图书馆与美国食品药品监督管理局合作建立的提供临床试验信息的数据库。截至2009年9月,Clinical Trial.gov共收录来自172个国家的78 337条临床试验信息,这些信息由NIH和其他联邦机构以及私营企业赞助。
Drugs in Clinical Trials Database(药物临床试验数据库):由美国CenterWatch信息服务公司研发。该数据库包含3 000多种药物的从临床!期到临床"期的详细研发信息,每周更新;数据来源广泛,包括通过与研发机构沟通获取信息、参加专业会议获取信息、与业内专业人士交流获取信息等;数据经过严格筛选,信息过时即刻被删除,确保了信息准确。
PharmaPendium(药物安全信息数据库):由Elsevier公司于2007年推出,是以搜索美国食品药物管理局和欧盟药品监督管理局的批准信息包为特色的产品。PharmaPendium能够提供临床前、临床中与上市后的药品安全信息的纵向视图,从而使得研究人员能够确定类似的候选复方药品已经观察到的动物疗效能否适用于人类。
2.4 药物评审信息数据库资源
European Medicines Agency(欧洲药品审评管理局):欧洲药品审评管理局集成了各欧盟成员国的研究资源和国家级的监督机构网络,主要负责整个欧盟范围内药物及相关医用产品的技术审查和批准上市工作,并全面负责评价药品的科学性,监测药品在欧盟范围内的安全性、有效性。
USFood and Drug Administration(美国食品药品监督管理局):美国食品药品监督管理局下属机构药品评审和研究中心(Center for Drug Evaluation and Research,CDER)是负责美国人用药(处方药、非处方药和生物制药)上市前审批和上市后监管的政府机构。CDER对同类信息提供多角度、多方位的检索途径和检索入口,同样的信息可通过不同的途径和方法来获取[4]。
Ministry of Health,Labour and Welfare(日本厚生劳动省):日本厚生劳动省是日本负责医疗卫生和社会保障的主要部门,设有11个局,主要负责日本的国民健康、医疗保险、医疗服务提供、药品和食品安全、社会保险和社会保障、劳动就业、弱势群体社会救助等职责。
中国国家食品药品监督管理局:是中国食品和药品的监管机构,其网站中提供数据查询,资源包括我国药品监督管理部门批准的药品、器械、保健食品、化妆品、安全监管、市场监管等相关数据。
Recently Approved Drugs by the Food and Drug Administration (美国FDA审批药物目录):由美国CenterWatch信息服务公司研发,该目录提供自1995年以来经美国FDA批准在美国销售的药物信息。
[1]马建玲.新一代制药和生物技术企业动态信息服务系统[J].中华医学图书情报杂志,2007,16(1):58-60.
[2]朱华玲.CHKD与PubMed检索功能对比分析[J].医学信息杂志,2008 (11):39-43.
[3]郑 静,郑传友,程绍敏,等.PubMed:一个重要的生物医学论文数据库系统的简介[J].中国现代医学杂志,2008,18(16):2 429-2 432.
[4]杨 悦,尹 戎,董 丽.美国FDA药品不良反应检测体系简介[J].中国工业医学杂志,2003,16(5):305-307.