基于网络药理学研究五味子抗心力衰竭作用

2024-03-04 08:32徐嘉豪刘成琳武子敬夏清瑶童华利刘雪坤
人参研究 2024年1期
关键词:五味子药理学靶点

徐嘉豪,刘成琳,武子敬,夏清瑶,童华利,刘雪坤

(通化师范学院•吉林 通化•134002)

心力衰竭(HF)是各类心脏病的最终过程。发病率和致死率均较高,五年内存活率小于50%,与恶性肿瘤相仿,正在成为21 世纪最严重的心血管病症[1-3]。中药具有辨证论治、整体观念的特点,可以更好的发挥治疗效果。五味子具有收敛固涩,益气生津,补肾宁心等功效,主要分布在东北、华北地区。五味子最早见于《神农本草经》,列为上品。现代药理学研究发现五味子能起到保护心血管细胞的作用[4-6]。

网络药理学是从生物网络的角度,研究疾病发生和发展的过程,认识药物化学成分与机体靶点的相互作用,并指导新药研发的新学科。应用高通量组学数据、分子网络数据,对药物-靶点网络整体的分析,有利于理解药物的多靶点、多途径网络作用模式,研究药物的药理作用机制及新药研发,将药物作用重新定位的同时开展老药新用的研究[7-10]。通过网络药理学研究五味子治疗心力衰竭的潜在作用靶点,探讨五味子治疗心力衰竭的作用机制,为后续的研究提供数据支持和科学依据。

1 材料与方法

1.1 五味子化学成分的筛选与靶点预测

使用TCMSP(http://tcmspw.com/tcmsp.php)数据库,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18、渗透性(Caco-2)>-0.4 为筛选条件,得到五味子的化学成分。将得到的化学成分信息通过TCMSP 数据库进行靶点提取,进一步使用Uniprot 数据库(http://www.uniprot.org/) 中的搜索功能,将物种设置为human,对搜集筛选得到的靶点蛋白与基因信息进行校正,获得靶点的Uniprot ID,运用Cytoscape3.9.2 软件构建“化合物-靶点”网络图。

1.2 疾病靶点筛选

通过GeneCards 数据库以”heart failure”为检索词,检索与HF 相关的疾病基因,并通过Uniprot 数据库进行基因注释。

1.3 成分作用靶点网络构建

通过Venny 2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)将筛选出的有效成分潜在作用靶点与疾病相关靶点取交集,获得五味子治疗HF 的潜在作用靶点。再运用STRING 11.0 数据库获得这些靶点间的相互关系,并通过Cytoscape3.9.2 软件构建“活性成分-基因-疾病”网络。网络中节点(node)分别代表活性成分和靶基因,它们之间的相互关系以边(edge)相连表示。

1.4 功能分析

利用Metascape(http://metascape.org/)数据库对五味子治疗HF 关键靶蛋白进行GO 功能富集分析和KEGG 通路富集分析。

2 结果

2.1 靶点网络

五味子药物-化学成分-靶点建立网络中有30 个节点,38 条边,结果见图1,Venn 图见图2,五味子“化学成分-疾病-靶点-通路”网络图见图3,其中2 个节点,55 条边,可以清晰地看出五味子的多靶点多通路作用,且与疾病的相关性较强。

图1 五味子药物-化学成分-靶点网络

图2 药物-疾病Venn 图

图3 药物-成分-靶点-疾病-通路网络

2.2 GO 富集分析及KEGG 通路注释分析

将预测出的11 个潜在靶点导入Metarscape 数据库中进行KEGG 通路注释分析和GO 富集分析,得到影响显著的通路(P<0.01)有8 条,筛选出主要抗心力衰竭的分别为hsa04020(Calcium signaling pathway)钙离子信号通路和hsa05200(Pathways in cancer)癌症通路,结果见图4。通过GO 富集分析,在生物学过程中这些靶点主要涉及乙酰胆碱受体信号、血压调节、低氧反应等方面调节,详见图5。

图4 KEGG 富集分析结果

图5 GO 功能富集分析结果

3 讨论

近年来,网络药理学方法表明,整体分析策略已从“一种药物,一个靶点,一种疾病”转变为结合多个靶点的思路。Andrew L.Hopkins 引入了网络药理学的概念,其核心思想是识别疾病特征、生物活性剂和药物目标相互关联的生物网络,优化治疗策略。网络药理学还可预测受个体影响的靶点和通路,尤其适用于中药多种成分且作用机制尚不完全明确的药物。

本次研究筛选五味子化学成分时,根据TCMSP数据库推荐标准和参考文献,以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18 和渗透性(Caco-2)>-0.4 为条件[7-9],避免筛选到含量高,但口服效率低的成分。

通过网络药理学的方法筛选出五味子的8 个化学成分,并对其进行了靶点预测。通过分析五味子药物-成分-靶点网络图发现,五味子具有多分子、多靶点的作用特性,并预测其化学成分可能与ACHE、PTGS2、NOS3等相关。将靶点进行KEGG 富集分析,发现其治疗HF 可能跟钙离子信号通路(Calcium signaling pathway)和癌症通路(Pathways in cancer)相关。Ca2+广泛存在于机体细胞中,起到调节细胞内钙离子浓度的作用,从而起到产生和传递兴奋,介导兴奋-收缩偶联等作用。钙离子信号通路是心力衰竭发生发展的中心环节。NOS3的活性受Ca2+浓度的调控,当细胞内Ca2+浓度升高时,Ca2+诱导钙调蛋白与NOS3二聚体结合,促进NOS3活性升高并刺激产生NO。CHRM2 可通过与G 偶联,调节Ca2+离子通道,从而调节心肌收缩。心力衰竭时交感神经兴奋性增强,心脏β 肾上腺素受体激活,使心肌细胞钙离子通道开放,代偿心脏负荷变化,导致心脏重构,可预测其作用机制为通过调控钙离子通道,拮抗心肌过度收缩,拮抗心室重构[10-11]。研究发现,癌症与心力衰竭之间可能存在着因果关系,因此预防癌症可能会降低心力衰竭的发生率。其中五味子的核心靶点PTGS2 可参与炎症反应、肿瘤细胞的增殖和凋亡等多种病理过程,因此可以推测五味子通过抑制癌症通路达到治疗HF 的作用。GO 富集分析表明五味子治疗HF 与乙酰胆碱受体信号、血压调节、低氧反应等生物学调节相关。

综上所述,本次研究基于网络药理学阐述了五味子治疗HF 的作用机制,通过对具有多成分、多靶点特点的五味子与HF 复杂网络关系的研究,阐述了五味子治疗HF 的有效成分、关键靶点、涉及的生物学过程和通路,使“药物-靶点”网络可视化,为后续研究五味子治疗HF 提供了理论依据。

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