儿童Mowat-Wilson综合征的临床特点及基因变异和遗传情况

2024-01-09 10:00季文雅郑必霞张爱华
山东医药 2023年36期
关键词:外显子变异基因组

季文雅,郑必霞,张爱华

1 南京医科大学附属儿童医院儿科学重点实验室,南京 210008;2 南京医科大学附属儿童医院肾脏科

Mowat-Wilson综合征(MWS)是一种罕见的常染色体显性遗传病,由ZEB2 基因突变引起,患儿主要表现为特殊面容、智力发育落后、癫痫及先天性畸形[1]。ZEB2 为转录调控因子,在胚胎发育过程中起着重要的作用,因此MWS 表型可累及全身多个系统,包括神经系统、心血管系统、消化系统、眼部及泌尿生殖系统等,呈现高度异质性[1-3]。MWS 最早于1998 报道[4],目前世界范围内已有400 例左右的病例,但其临床及遗传特点、长期预后尚未完全明确,给临床诊断和提供咨询造成了困难。本文回顾性分析了8 例MWS 患儿的临床资料,总结其临床特点,并了解本病的基因变异和遗传情况。

1 资料收集及全外显子基因组测序和分析

1.1 资料收集 回顾性分析2017 年1 月—2022 年12月在南京医科大学附属南京儿童医院就诊的8例MWS 患儿。通过医院电子病历系统获得患儿的病例资料,包括临床症状、体格检查、辅助检查等,随访患儿预后以及被临床医生忽略的表型。

1.2 全外显子基因组测序和分析 DNA 提取:患儿及其父母的外周血各2 mL,采用血液基因组柱式提取试剂盒(天根)提取外周血基因组DNA,操作步骤按试剂盒说明书进行。全外显子基因组测序及Sanger测序验证:对患儿进行全外显子测序(WGS),筛选可疑的变异位点,利用Sanger法验证,同时对先证者父母进行共分离验证,测序及验证过程由北京全谱医学检验实验室完成。生物信息学分析:将得到的变异位点信息在各大数据库(HGMD、gnomAD、Pubmed、中国知网、万方医学网)查询。通过Mutation Taster 和PolyPhen-2 预测软件对基因变异危害性进行预测。借助Ensembl 数据库及Clustal Omega对突变位点蛋白质氨基酸的保守性进行分析。最后,按照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)于2015年发布的序列变异解读标准和指南[5-6],对遗传变异的致病性进行评级。

2 结果

2.1 8例患儿临床资料 ①患儿1:女,8月龄,因“8月龄不能翻身”于2019 年5 月21 日就诊,患儿不会翻身,系G2P3 足月产,为双胎之小,有母孕期保胎史。有新生儿缺血缺氧性脑病史、黄疸史,有“先天性巨结肠、先天性心脏病”手术史。查体:身长67 cm,眼距宽,外耳畸形,鼻梁低平,右侧耳前瘘管,肌张力稍高,双足外翻。诊断为“全面性发育迟缓”,建议定期体检,康复科随诊。电话随访,现患儿4岁,只会叫“ba ba、ma ma”,可以走路跑步上下楼梯,不会穿衣穿鞋。②患儿2:女,3 岁8 月龄,因“3 岁8月龄仅会喊人”于2019 年12 月10 日就诊,患儿走路稳,只会叫“ba ba、ma ma”。查体:眼距宽,喜伸舌,微笑面容,肌张力正常。目光交流时间尚可,呼之有回应,不会指物。有“先天性巨结肠”手术史。0~6岁小儿发育筛查量表示“DQ<59,MI<50,智龄12/9/9 月”。头颅磁共振示“两侧侧脑室旁终末带T2WI及FLAIR 序列信号略偏高”,诊断为“全面性发育迟缓”,建议定期康复训练。电话随访,目前患儿7岁2月龄,未上学,只会叫“ba ba、ma ma、nai nai”,能听指令,会上下楼梯,可穿衣穿鞋。③患儿3:女,1岁,因“发现运动认知落后1 年”于2020 年9 月10 日就诊,患儿竖头稳,独坐不稳,不能独站,无意识发“ba ba、ma ma”。母亲孕早期有先兆流产保胎3周病史。查体:眼距宽,鼻梁塌陷,鼻孔前倾,人中长,外耳大,快乐举止,有双足外翻,肌张力正常。查心脏彩超示“卵圆孔未闭”,头颅磁共振示“左侧侧脑室稍饱满,左颞部脑外间隙稍宽”,诊断为“全面性发育迟缓”,建议定期康复训练,康复科随诊。患儿定期于我院康复科评估发育情况并进行康复训练,卵圆孔未闭2 岁时自行闭合,病程中多次出现突发双眼凝视、口周流涎、呼之不应,每次持续1~2 min,请神经内科会诊,脑电图示“弥散性2~4 Hz 慢波背景,额、顶、枕、中后颢区为主多灶棘波、尖波、尖慢波发放,睡眠期广泛性2~4 Hz 尖慢波、(多)棘慢波发放,监测到清醒期1 次和睡眠期1 次孤立性痉挛及睡眠期1 次强直痉挛发作”,诊断为癫痫,予左乙拉西坦口服治疗。目前患儿3岁9月,可独走10步左右,无意识喊“ba ba、ma ma、nai nai”,不会指认五官,会欢迎再见动作,会伸手拿玩具。④患儿4:男,3 岁8 月龄,因“语言发育落后”于2021 年6月11日就诊,患儿不能说短句子,能喊人,能冒话,发单字或叠音为主,“ba,ma,nai”,约3 个字,不说短句,视听觉颜面反射欠灵敏。有新生儿败血症、新生儿肺炎,患儿母亲的二叔智力差,母亲第一胎16 周时流产,具体原因不详。查体:头前后径长,三角形尖下巴、眼距宽,耳垂隆起伴中心凹陷。心脏彩超示“房间隔缺损”,头颅磁共振未见明显异常。诊断为“言语和语言发育障碍,多动性障碍”,建议定期康复训练,未按时复查。电话随访,现患儿5 岁7 月龄,会喊“ba ba、ma ma、nai nai、ge ge”,能听指令,未上幼儿园,自己会走会跑,会上下楼梯,可以自己穿鞋穿衣服。⑤患儿5:男,7 月龄,于2021 年12 月29 日就诊,竖头不稳,不会翻身,拉坐一般,拇指内收,无主动抓握意识。有“先天性巨结肠手术”病史。查体:前额突,鼻根部凹,耳位低,俯卧抬头90°,拉坐头后仰,拇指内收,竖头不稳,不会抓物。儿童发育商检测量表示“发育商为52/50/43/65/62”,头颅磁共振提示脑发育不良,泌尿系B 超提示”左肾盂扩张”,心脏彩超示”动脉导管未闭、永存左上腔静脉”。诊断为“全面性发育迟缓”,建议加强大运动、精细运动训练,康复科就诊,定期康复训练,未按时随诊训练。⑥患儿6:男,2岁7月龄,因“反复抽搐6月余”于2022年9月22日就诊,患儿有反复抽搐发作,表现为双眼上翻、眨动,口周抖动,呼之不应,每次持续2~3分钟,每天2~3次,有摔倒2 次,发作时体温正常,发作后患儿无相关记忆。2 岁可独走,目前只会叫“ma ma”。查体:眼距宽、外耳畸形,高颚弓,喜笑,缺乏眼神对视,呼名不应,听理解欠佳,无法按要求指物,只会叫“ma ma”。患儿入院后完善相关检查,头颅磁共振示“两侧脑室饱满,左颞部脑外间隙增宽”。0~6 岁儿童发育量表示“DQ<50,MI<50”,孤独症ABC 量表测试示“CHAT 高度可疑,MCHAT 孤独症可疑组”。脑电图示“弥散性2~4 Hz 慢波背景,额、顶、枕、中后颢区为主多灶棘波、尖波、尖慢波发放,睡眠期广泛性2~4 Hz 尖慢波、(多)棘慢波发放,监测到清醒期1 次和睡眠期1 次孤立性痉挛及睡眠期1 次强直痉挛发作”。诊断为癫痫、孤独症、全面性发育迟缓。予德巴金口服治疗,康复科定期训练。电话随访,患儿目前3 岁3 月龄,只会叫“ma ma”,独走稳,癫痫控制不佳。⑦患儿7:女,1 岁,因“反复抽搐4 d”于2022 年5 月26 日就诊。患儿有反复抽搐,抽搐时无热,2~3 次每日,表现为双手握拳,双眼紧闭,肢体抽动,口唇发绀,头往后仰,持续3~4 s可自行缓解。既往因肛门狭窄行肛门成形术。患儿生长发育落后于同龄儿,家长诉患儿3月龄开始翻身,10月龄开始坐,现独坐不稳、不会爬,无意识发“nai nai”音。查头颅磁共振示“WI 序列左侧侧脑室前角旁白质异常信号、右侧大脑前动脉开窗畸形、右侧枕窦开放,右侧横窦较细”,儿童智力发育筛查量表示“运动智龄6月,社会适应智龄5月,智力智龄5月”,查心脏彩超示“卵圆孔未闭”。诊断为癫痫、全面性发育迟缓、卵圆孔未闭。予丙戊酸口服治疗,康复科随诊复查。电话随访,患儿目前2岁,癫痫持续未发作5 个月,卵圆孔未闭自然闭合,当地医院康复训练,不能独站,无意识喊“nai nai、ba ba、ma ma”。⑧患儿8:男,7 岁9 月,因“尿频伴蛋白尿7 月余”于2018 年8 月22 日就诊。病初患儿在“急性上呼吸道感染”后出现尿频,约1 次/小时,尿中有泡沫,尿色黄,至当地医院查尿沉渣提示“尿蛋白 + + + ”,24小时尿蛋白“1.89 g”,予“黄葵、保肾康”口服6个月,尿频症状无明显好转,尿蛋白持续 + + + ,2天前患儿尿频加剧,晨起有眼睑水肿。患儿生后即诊断为室间隔缺损,6 月龄时已行室间隔缺损修补术,出生时有缺氧病史,3 岁会走路,目前仅会说两字词语,不会成句,理解能力差,不能交流,否认其他病史。查体:体温36.8 ℃,脉搏92 次/分,呼吸25 次/分,血压110/75 mmHg,体质量27 kg,身高110 cm。双眼睑及双下肢轻度水肿,招风耳,左手通贯掌,双侧扁平足,阴茎短小,阴囊发育差,左侧睾丸活动度大。辅助检查:尿沉渣示尿蛋白 + + ,尿微量蛋白示尿微量白蛋白1 400 mg/L、尿lgG 72.10 mg/L、尿α1微球蛋白29.0 mg/L,24 小时尿蛋白1.55 g/L,尿白蛋白肌酐比值22 mg/g,双侧泌尿系B 超未见明显异常,肾静脉未见明显胡桃夹征象,肾脏穿刺病理活检示局灶节段性肾小球硬化(见图1B),韦氏智力测试IQ58 分。综合诊断:(1)慢性肾脏病(局灶节段性肾小球硬化);(2)发育迟缓;(3)室间隔缺损术后。予口服环孢素、强的松及双嘧达莫治疗,居家检测尿蛋白,门诊随诊调药,患儿尿蛋白控制在“- + ~ + ”,激素按序减量,目前未再复诊。

图1 患儿4、患儿8变异位点(p.C1060Y、p.D654A)保守性分析结果及患儿8(p.D654A)的肾脏活检病理报告

2.2 8 例患儿基因变异和遗传情况 ①患儿1:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示患儿ZEB2基因上存在c. 2350_c. 2351insT(p. S784F*11)杂合移码变异,其父母均无该基因变异,为新生变异。该突变在之前文献中有过报道,且病例临床表型类似[7]。根据ACMG 指南,截断突变导致基因功能可能丧失,属于超强致病证据(PVS1);在千人基因组数据库、EXAC 及ClinVar 等所有正常人群数据库频率<0.0005,为中等致病证据(PM2);有可靠来源的数据库(HGMD)认为该变异为致病的,为可能致病证据(PP5)。综上,该变异初步判定为致病性变异(PVS1 + PM2 + PP5)。②患儿2:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示患儿ZEB2 基因上存在c.1150C>T(p.Q384*,831)杂合无义变异,其父母均无该基因变异,为新生变异。该变异在既往文献中有过报道[8]。根据ACMG 指南,无义突变导致基因功能可能丧失,属于超强致病证据(PVS1);在所有正常人群数据库频率<0.000 5,为中等致病证据(PM2);有可靠来源的数据库(HGMD)认为该变异为致病的,为可能致病证据(PP5);两种统计方法(Mutation Taster、GERP)预测出变异对基因(基因产物)有影响,为可能致病证据(PP3)。综上,该变异初步判定为致病性变异(PVS1 + PM2 + PP5 + PP3)。③患儿3 和患儿6:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示患儿3 和患儿6 在ZEB2 基因均存在c.2073G>A(p.W691*,524)杂合无义变异,2例患儿父母均无该基因变异,该变异为新生变异,该突变在既往文献中有过报道[9]。根据ACMG 指南,无义突变导致基因功能可能丧失,属于超强致病证据(PVS1);在所有正常人群数据库频率<0.000 5,为中等致病证据(PM2);两种统计方法(Mutation-Taster、GERP)预测出变异对基因(基因产物)有影响,为可能致病证据(PP3)。综上,该变异初步判定为致病性变异(PVS1 + PM2 + PP3)。④患儿4:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示ZEB2 基因上存在c.3179G>A(p.C1060Y)杂合错义变异,其父母均无该基因变异,故为新生变异。检索Pubmed、HGMD 及万方等数据库未见文献报道,为新发现的1 个错义突变。借助Ensembl 数据库及Clustal Omega 对突变位点蛋白质氨基酸的保守性进行分析,显示该位点在多物种中均为半胱氨酸,高度保守(图1A)。根据ACMG 指南,错义变异位于非良性变异的关键功能域,为中等致病证据(PM1);在所有正常人群数据库频率<0.000 5,为中等致病证据(PM2);经家系验证分析,该变异为新生突变,为中等致病证据(PM6);GnomAD 数据库中mis_Z score≥3.09 的基因上的突变,为支持致病证据(PP2);经多种统计学方法(PolyPhen-2、Mutationtaster、PROVEAN、REVEL)预测出变异对基因(基因产物)有影响,为支持致病证据(PP3)。综上,该变异初步判定为可能致病突变(PM1 + PM2 + PM6 + PP2 + PP3)。⑤患儿5:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示ZEB2 基因上存在c. 904C>T(p. R302*,913)杂合无义变异,其父母均无该基因变异,故为新生变异。该变异在既往文献中有过报道[10]。根据ACMG 指南,无义突变导致基因功能可能丧失,属于超强致病证据(PVS1);在所有正常人群数据库频率<0.000 5,为中等致病证据(PM2);该变异在经家系验证为新生变异(PM6)。综上,该变异初步判定为致病性变异(PVS1 + PM2 + PM6)。⑥患儿7:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母进行验证,结果显示ZEB2基因上存在c.2467(exon8)C>T(p.Q823*,392)杂合无义变异,其父母均无该基因变异,故为新生变异。检索Pubmed、HGMD及万方等数据库未见文献报道,为新发现的1 个无义突变。根据ACMG 指南,无义变异导致基因功能可能丧失,属于超强致病证据(PVS1);经双亲验证的新生变异,为强致病证据(PS2);所有正常人群数据库频率<0.000 5,为中等致病证据(PM2)。综上,该变异初步判定为致病性变异(PVS1 + PS2 +PM2)。⑦患儿8:对患儿进行全外显子基因组测序,同时利用Sanger 测序对患儿父母基因组进行验证,结果显示ZEB2 基因上存在c. 1961A>C(p. D654A)杂合错义变异。借助Ensembl 数据库及Clustal Omega 对突变位点蛋白质氨基酸的保守性进行分析,显示该位点在多物种中均为天冬氨酸,高度保守(图1B)。检索Pubmed、HGMD 及万方等数据库未见文献报道,为新发现的1 个错义突变。根据ACMG 指南,在所有正常人群数据库频率<0.005,属于低频变异,为中等致病证据(PM2);GnomAD 数据库中mis_Z score≥3.09 的基因上的突变,为支持致病证据(PP2);经多种统计方法(PolyPhen-2、Mutationtaster、PROVEAN、REVEL)预测出变异对基因(基因产物)有影响,为支持致病证据(PP3)。该变异初步判定为临床意义未明变异(PM2 + PP2 + PP3)。

3 讨论

目前已报道的MWS患儿表型呈现高度异质性,但主要可以分为以下几个方面:①智力发育迟缓,以语言表达能力落后为主;②特殊面容,如耳垂隆起,鼻尖圆润,宽鼻根,眼距宽、尖下巴、喜张口、小头畸形;③癫痫;④矮小症;⑤多系统先天性发育畸形,如心血管系统发育畸形引起的先天性心脏病、胃肠道系统发育畸形引起的先天性巨结肠幽门狭窄、泌尿生殖系统发育异常引起的尿道下裂隐睾、肾脏异常、眼结构异常以及骨骼发育异常如唇腭裂等。本研究中的患儿6 慢性肾脏病表型之前无报道提及,MWS患儿肾脏异常以肾盂扩张肾积水、膀胱输尿管反流为主,除此之外还有盆腔肾、重复肾[1-2]。慢性肾脏病的单基因原因是近年来的研究热点,已证实有超过600 种基因突变与慢性肾脏病有关[11],有文献[12]提出通过恢复ZEB2 的表达改善高血压患者肾脏预后的建议,指出了ZEB2 和肾脏病变的相关性,后有研究[13]进一步在小鼠层面证实ZEB2 突变可引起肾小球囊性肾病,本次研究中患儿6有慢性肾脏病,病理结果为局灶节段性肾小球硬化,故推测ZEB2 突变可能解释了患者的慢性肾脏病表型,但其明确相关性仍需进一步的研究证实。我们对6位患儿进行了随访,均仍处于发育迟缓状态,主要表现为语言发育迟缓,而语言理解能力和运动能力发育迟缓相对不明显,能听懂部分指令,穿衣穿鞋上下楼梯等生活自理能力可,均未能正常上学。这种发育迟缓的表现形式与之前报道的有关MWS 患儿发育迟缓表型特点相一致,目前已有研究随访到患儿可以通过上特殊学校获得教育[14],这为MWS患儿的后期照护提供了一个新的思路。MWS 患儿目前共有的临床表型集中体现在智力发育迟缓和特殊面容,我们此次报道的8 例患儿均存在不同程度的智力发育落后和特殊面容,且5位患儿是因“智力发育落后”就诊,因此可将这智力发育落后作为临床诊断MWS 的重要突破口,但智力发育落后存在于多种基因病中,需要利用其特殊面容进行鉴别,并送全外显子基因测序以便早期明确诊断。

MWS 是一种罕见的常染色体显性遗传病,位于染色体2q22.3 上的ZEB2 基因是其致病基因,该基因编码ZEB2 蛋白,ZEB2 蛋白[15]属于锌指结合蛋白家族中的一种,功能域包括6 个:NIM(核小体质量构和去乙酰化酶相互作用基序)、N-ZF(n 端锌指簇)、SBD(smad 结合域)、HD(同源域)、CID(ctbp 相互作用域)和C-ZF(c 端锌指簇),发挥转录调控作用,表达广泛,参与调控细胞增殖分化和神经系统产生发育等重要生理过程[16-18]。已有研究[1]证实,ZEB2突变的致病机制是由单倍体剂量不足引起的,而无义突变以及移码突变可导致基因表达和功能的丧失。本研究中发现6 个无义突变和移码突变,根据ACMG 指南突变均使翻译提前终止,导致蛋白截断突变,支持这6个变异是致病变异。然而患儿4和患儿8 的错义突变则分别被评级为可能致病和临床意义未明的变异,基因的错义突变由于不直接造成蛋白截断突变,在缺乏实验数据时明确突变致病性一直较为困难[19-20]。患儿4 在ZEB2 基因上存在c.3179G>A(p.C1060Y)杂合错义变异,之前没有相同位点突变的患儿被报道,缺乏实验数据支持,但多种软件预测该突变对基因产物有影响,且通过借助Ensembl 数据库及Clustal Omega 对突变位点蛋白质氨基酸的保守性进行分析,显示该位点高度保守,全外显子测序显示该患儿在其他基因位点上未发现有害突变,且患儿有发育迟缓、典型的面容、房间隔缺损、注意缺陷多动障碍等典型表现,故考虑ZEB2 该位点的突变为致病病因。患儿8 在ZEB2 基因上存在c. 1961A>C(p. D654A)杂合错义变异,由于缺乏实验数据且无法获得家庭成员携带信息,故被评级为意义未明的变异。但突变位点氨基酸高度保守,多种软件预测该突变对基因产物有影响,追问家长得知家庭成员无相似表型,患儿有发育迟缓、特殊面容、室间隔缺损、小阴茎隐睾和慢性肾脏病等典型表现,全外显子基因检测显示其他位点无有害突变,故目前仍考虑ZEB2 突变导致患儿相关表型。结合上述8例患儿的临床表现及基因分析结果,我们认为8例患儿均患有ZEB2 导致的MWS,无义突变患儿诊断明确,错义突变患儿的明确诊断需要更多实验数据支持。

总之,WMS 患儿主要表现为智力发育迟缓、特殊面容、癫痫、矮小症及其他各系统的发育畸形等,需与其他造成智力发育迟缓的基因病相鉴别,对于有上述表现的患儿,应及时应用全外显子基因测序,以便早期诊断,如遇意义不明的新发错义突变必要时进行功能验证。WMS 患儿的慢性肾脏病表型为首次报道,但其明确相关性仍需进一步探究。同时本次随访数据还显示,MWS患儿智力发育迟缓以语言发育落后为主,可考虑通过早期接受特殊教育改善预后。

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