美洲大蠊肠道耐热碱性蛋白酶产生菌筛选及其酶特性

2022-03-24 08:41李小波刘文彬朱家勇金小宝
环境昆虫学报 2022年1期
关键词:酪蛋白热稳定性碱性

王 宁,李小波,刘文彬,唐 彬,汪 洁,朱家勇,金小宝

(广东药科大学生命科学与生物制药学院,广东省生物活性药物研究重点实验室,广州 510006)

碱性蛋白酶是一类最适反应pH为碱性范围的蛋白水解酶,在轻工业(洗涤剂、皮革鞣制等)、食品加工业(蛋白质水解物生产、肉类加工等)、医药工业(例如,在制药业中催化某些合成反应)中具有广泛应用价值(Kouhdashtetal., 2018; 谢宗波等, 2019)。微生物来源的碱性蛋白酶通常为胞外酶,其产酶量高,适合大规模生产(袁媛等, 2021),目前大部分工业酶制剂是利用微生物生产的。因此,产碱性蛋白酶菌种的分离和选育一直被关注。

人们一直尝试从自然界丰富的微生物种群中筛选有应用价值的产酶菌种。生长于动物体内的一些共存微生物,尤其是各种肠道微生物,在其宿主的消化、营养吸收、抗菌和免疫等生理过程中发挥重要作用,构成了发现新型天然代谢产物和生物活性酶的特殊生境微生物资源库(Akbaretal., 2019; 江宇航等, 2020)。目前昆虫共生菌在生物医药、农业和生态等方面已展现出重要的研究和应用价值(魏舸等, 2018)。

美洲大蠊是已知最古老的昆虫之一,有很强的生理和环境适应能力,已在地球上生存了约3.5亿年(Liuetal., 2020)。美洲大蠊为杂食性昆虫,食物来源多样(包括腐烂的植物和动物肉类等),且通常生活在温暖、湿润、微生物丰富的环境中,其体内或体表可携带多种微生物。这些微生物,部分作为人类和动物病原体(细菌、病毒、寄生虫等),已得到了广泛研究(Abbas, 2019)。另一方面,这些昆虫的共生菌,其组成具有丰富的多样性,可作为有益微生物资源(Guzman and Vilcinskas, 2020)。但已有的对蜚蠊共生菌的研究多采用常规pH培养基(中性或弱酸碱性)进行分离和筛选,对这类昆虫肠道中嗜酸性、嗜碱性或嗜盐性微生物及其代谢产物和酶的研究有限。事实上,一些研究表明,某些具有生物技术重要性的嗜极微生物,也可在普通的非极端环境中分离到(Low-Décarieetal., 2016; Baselga-Cerveraetal., 2020)。本课题组前期曾以常规高氏I号琼脂培养基分离到284株美洲大蠊肠道菌(放线菌159株,其它细菌125株)(陈至里等, 2016; 蒋诗林等, 2021),并对相关菌株的次级代谢产物进行了研究。为更充分地挖掘和利用昆虫肠道菌资源,本研究拟采用含碱性介质(Na2CO3)的蛋白酶筛选培养基从美洲大蠊肠道中筛选嗜碱细菌,并对其所产碱性蛋白酶的酶学性质进行研究。

1 材料与方法

1.1 材料

实验用美洲大蠊捕捉自广州市黄沙轮渡码头和黄沙水产交易市场之间桥梁的洞穴中。

支持嗜(耐)碱微生物生长的筛选培养基采用Horikoshi I培养基(Liuetal., 2018),并作适当改动(葡萄糖1 g/L、蛋白胨5 g/L、酵母提取物5 g/L、K2HPO41 g/L、Mg2SO4-7H2O 0.2 g/L、Na2CO30.15 mol/L、琼脂粉20 g/L、脱脂奶粉20 g/L),主要的改动是提高了培养基中的碱性介质Na2CO3浓度,以及添加脱脂奶粉作为蛋白酶作用底物。Na2CO3和脱脂奶粉均溶于适量水中单独灭菌。

发酵培养基采用适宜于芽孢杆菌属细菌发酵的玉米粉-黄豆饼粉培养基,按沈萍和陈向东(2018)的配方稍加改变:玉米粉40 g/L,黄豆饼粉30 g/L,Na2CO30.04 mol/L,CaCO310 g/L。基础的肉汤蛋白胨培养基(牛肉膏5 g/L、蛋白胨10 g/L、氯化钠5 g/L)按常规配制,根据测试目的向其中加入不同pH缓冲液或不同浓度的Na2CO3。

1.2 方法

1.2.1产碱性蛋白酶细菌的分离和纯化

以75%乙醇和无菌水充分清洗美洲大蠊虫体表面,然后用无菌手术剪剪开虫体腹部,取肠道及其内容物混合放入0.15 mol/L Na2CO3溶液中,在匀浆器中充分研磨。取匀浆液涂布于含Na2CO3的筛选培养基平板,置28℃倒置培养5~7 d,观察菌落出现及牛奶蛋白的水解情况,挑取产生明显水解圈的菌落,进一步以平板划线分离法进行菌种纯化。取上述具明显水解圈的菌株的纯化物,再次接种于含Na2CO3筛选培养基和普通肉汤蛋白胨培养基(不含Na2CO3)平板上,置37℃倒置培养 4~5 d,取在普通肉汤蛋白胨培养平板上未见明显生长、而在含Na2CO3筛选培养平板上能形成牛奶蛋白水解圈的菌株进行下一步测试。

1.2.2产碱性蛋白酶细菌的鉴定

形态学鉴定:取菌株纯培养物划线接种于含Na2CO3的平板培养基,于37℃培养,观察菌落特征。取适当阶段的培养物涂片、固定,分别作革兰氏染色(结晶紫初染、碘液媒染、乙醇脱色和沙黄复染)及芽孢染色(孔雀绿初染、沙黄复染)后用油镜观察。

分子生物学鉴定:取新鲜细菌培养物,应用细菌核糖体16S rDNA序列引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-TACGGCTACCTTGTTACGACTT-3′)进行PCR扩增,PCR产物经琼脂糖电泳鉴定后送华大基因公司测序。将菌株的16S rDNA序列与NCBI核酸数据库已有核酸序列进行BLAST比对,采用NCBI-BLAST Tree View程序构建进化树(www.ncbi. nlm.nih.gov/blast/treeview/treeView.cgi)(Cardosoetal., 2021),通过和高度相似序列的比对确定该菌株分类地位(采用Neighbor Joining法构建,最大序列差异= 0.75)。

1.2.3温度、pH和Na2CO3对菌株生长的影响

菌株在含适量Na2CO3的肉汤蛋白胨液体培养基中振荡培养48 h,取该新鲜培养物,制成OD600=1.0的均匀细菌悬液,用于如下测定:(1)温度对菌株生长的影响:上述细菌悬液按0.5%接种量接种于5 mL含Na2CO3(0.04 mol/L)的肉汤蛋白胨培养基中,分别在25℃、28℃、31℃、34℃、37℃、40℃的摇床中振荡培养24 h,观察培养液是否浑浊,并测定培养液的OD600值,考察温度对菌株生长的影响。每个样品设3个重复,结果取平均值。(2)pH和Na2CO3浓度对菌株生长的影响:上述细菌悬液按0.5%接种量接种于5 mL pH分别为7、8、9、10、11、12(以及Na2CO3浓度分别为0、0.03、0.06、0.09、0.12、0.15 mol/L)的肉汤蛋白胨培养基中,在前述确定的最适生长温度条件下振荡培养24 h,观察培养液是否浑浊,并测定培养液的OD600值,分别考察pH和Na2CO3对菌株生长的影响。每个样品设3个重复,结果取平均值。

1.2.4菌株发酵和粗酶液制备

将菌株接种到玉米粉-黄豆饼粉发酵培养基中,37℃振荡培养144 h,其间每隔12 h取发酵液离心,取上清(粗酶液)测定其在60℃、pH11条件下的蛋白酶活性,以确定发酵时间对菌株产蛋白酶活性的影响。后续SDS-PAGE酶谱法定性检测及酶学性质测试所用粗酶液,均按上述确定的产酶最佳发酵时间培养后的发酵液离心制备。

1.2.5碱性蛋白酶活性的SDS-PAGE酶谱法定性检测

参考Tarrahimofradetal.(2020)的方法略作改动,以酪蛋白为底物进行蛋白酶活性的SDS-PAGE酶谱法检测:将上清与5×上样缓冲液混合,进行SDS-PAGE电泳,分离胶中含0.1%酪蛋白,于冰水浴中低温电泳,电泳结束后,凝胶浸入含1% Triton X100的硼酸钠-氢氧化钠缓冲液(pH=11)中,60℃孵育2 h,漂洗后用考马斯亮蓝染色,脱色后观察蛋白质降解区域显现状况。

1.2.6酶学性质测试

以菌株发酵液离心上清作为粗酶液,进行如下测定:(1)反应温度对酶活性的影响:反应温度设定为两组:首先在20~100℃范围内(间隔10℃)进行测试,可初步判断酶最适反应温度的大致范围。然后,在一个较小温度范围内(50~70℃,间隔2℃)测试,可较精确地确定酶的最适反应温度。(2)反应pH对酶活性的影响:用相应pH的缓冲液配制的1%酪蛋白为底物,分别测定在pH 7、8、9、10、11、12、13条件下碱性蛋白酶的活性,确定碱性蛋白酶的最适反应pH,反应在最适反应温度条件下进行。(3)酶热稳定性的定量测定:将粗酶液分别在40℃、60℃、80℃、100℃条件下水浴,所有温度处理后的粗酶液均分别在1 h、2 h、3 h、4 h取出,置于冰上。待所有粗酶液取出后,在最适反应温度和pH条件下测定酶活力,计算其相对于未进行热处理的残留酶活性(相对酶活性),确定酶的热稳定性。(4)酶热稳定性的SDS-PAGE酶谱法检测:将粗酶液分别于40℃、50℃、60℃、70℃、80℃、90℃条件下水浴10 min,然后进行SDS-PAGE电泳(分离胶中含0.1%酪蛋白),电泳后照前述方法反应并染色,观察蛋白质降解区域显现状况。(5)酶在不同pH条件下的稳定性测试:将粗酶液分别和pH为7、8、9、10、11、12的缓冲液等体积混合,4℃静置24 h,然后测定酶活力,计算其残留酶活性(相对酶活性),确定在不同pH条件下酶的稳定性。

碱性蛋白酶活力的定量测定采用福林-酚试剂法进行,操作主要参考沈萍和陈向东(2018)和现行蛋白酶制剂国家标准(GB/T23527-2009)中的方法进行,简述如下:粗酶液和酪蛋白混合后水浴反应10 min,加三氯醋酸以终止反应,离心后取上清加入Na2CO3和福林-酚试剂,测定其OD680值。空白对照组为粗酶液中首先加三氯醋酸以使酶灭活,然后加酪蛋白,其它条件保持一致。每个样品设3个重复,结果取平均值。酶活力单位定义:1 mL粗酶液在一定温度和pH条件下,1 min水解酪蛋白产生1 μg酪氨酸,即为1个活力单位,以U/mL表示。计算公式:酶活力(U/mL)=K×A×N×(5/10)。式中:K为比色常数,A为样品OD值与空白对照OD值之差,N为酶样品稀释倍数,5为测定OD值时终止反应液的稀释倍数,10为酶反应时间(min)。

2 结果与分析

2.1 产碱性蛋白酶细菌的初步筛选结果

美洲大蠊肠道及其内容物匀浆液在初筛平板上培养5~7 d后,共得到3个可产生明显牛奶水解圈的菌株。经划线分离、纯化后,重新接种进行复筛,仅一株生长良好且可形成牛奶水解圈(图1-A, B),而在不含Na2CO3的肉汤蛋白胨培养基平板上培养未见明显生长,初步说明该菌株具有嗜碱性,并可分泌碱性蛋白酶,将其命名为PaGA523-1。

2.2 菌株的鉴定

2.2.1形态学鉴定

在含Na2CO3的肉汤蛋白胨培养基平板上,菌株PaGA523-1的菌落呈圆形,凸起、光滑,乳白色-乳黄色(图1-A)。经革兰氏染色,油镜下观察见革兰氏染色阳性短杆状菌(图1-C)。经芽孢染色,细胞中可见绿色芽孢(图1-D)。

图1 菌株PaGA523-1菌落和染色特征Fig.1 The colony and staining characteristics of strain PaGA523-1注:A,菌落;B,形成的牛奶蛋白水解圈;C,革兰氏染色;D,芽孢染色。Note: A, Colony characteristics; B, Milk protein hydrolysis zone of strain PaGA523-1 on agar plate; C, Gram staining characteristics; D, Spore staining characteristics.

2.2.2菌株16S rDNA基因序列分析

以PaGA523-1基因组为底物,用引物27F和1492R进行PCR扩增菌株16S rDNA序列,经琼脂糖凝胶电泳鉴定,PCR产物约为1 500 bp(图2-A)。

菌株16S rDNA序列进行NCBI-BLAST比对后构建的进化树分析显示(图2-B),PaGA523-1和芽孢杆菌属各种细菌的16S rDNA序列形成一个大的分支,且和其中的BacilluslehensisG1株(GenBank No.CP003923.1)距离最近,其相似率为99.24%。结合菌落形态和细胞形态特征、16S rDNA基因序列分析,菌株PaGA523-1可被确定为B.lehensis。将菌株PaGA523-1的16S rDNA序列在NCBI-GenBank进行注册,获得注册号MZ448243。

图2 菌株PaGA523-1 16S rDNA基因PCR产物琼脂糖电泳和进化树分析Fig.2 PCR product of 16S rDNA of strain PaGA523-1 and its phylogenetic tree analysis注:A,琼脂糖电泳。Lane M,DNA marker;Lane 1,PCR product。B,进化树分析。Note: A, Agarose gel electrophoresis. Lane M, DNA marker; Lane 1, PCR product. B, Phylogenetic tree analysis.

2.3 温度、pH和Na2CO3对菌株生长的影响

以肉汤蛋白胨培养基为基础,分别考察了温度、pH对菌株生长的影响,结果显示,其最适生长温度为37℃(图3-A),最适生长pH范围为9~11(图3-B),可在含0.03~0.09 mol/L Na2CO3的肉汤蛋白胨液体培养基中良好生长,其最适浓度范围为0.03~0.06 mol/L(图3-C)。

图3 温度、pH和Na2CO3对菌株PaGA523-1生长的影响Fig.3 Effect of temperature, pH and Na2CO3 on the growth of strain PaGA523-1注:A,温度;B,pH;C,Na2CO3。Note: A, Temperature; B, pH; C, Na2CO3.

2.4 发酵时间对酶活性的影响

菌株在玉米粉-黄豆饼粉发酵培养基中37℃连续振荡培养144 h,每隔12 h取发酵上清检测碱性蛋白酶活性。结果显示,发酵时间96 h碱性蛋白酶活性达最高值,并在96~120 h趋于稳定,120 h后酶活性开始呈下降趋势(图4)。

图4 发酵时间对蛋白酶活力的影响Fig.4 Effect of fermentation time on the protease activity

2.5 碱性蛋白酶活性的SDS-PAGE酶谱法检测

未经煮沸变性的发酵上清经电泳后在硼酸钠-氢氧化钠缓冲液(pH=11)中孵育2 h,可在含酪蛋白的SDS-PAGE凝胶中形成一条明显的降解条带,定性说明菌株可产生碱性蛋白酶(图5)。

图5 碱性蛋白酶活性的SDS-PAGE酶谱法检测Fig.5 Alkaline protease activity assay using SDS-PAGE zymography注:Lane M,蛋白质分子量标记;Lane 1,酶经煮沸变性;Lane 2,酶不经煮沸变性。Note: Lane M, Protein molecular weight marker; Lane 1, Boiled enzymes; Lane 2, Non-boiled enzymes.

2.6 酶学性质测定

2.6.1反应温度对酶活性的影响

在较宽范围内(20~100℃)测试温度对酶活性的影响,发现在50~70℃范围内酶均有一定酪蛋白降解活性,初步估计最适反应温度在60℃左右(图6-A)。然后,在50~70℃范围内进行测试,确定其最适反应温度为62℃(图6-B)。

图6 温度对蛋白酶活性和稳定性的影响Fig.6 Effect of temperature on the protease activity and stability注:A,反应温度对酶活性的影响(20~100℃);B,反应温度对酶活性的影响(50~70℃);C,酶在不同温度下的热稳定性。Note: A, Effect of reaction temperature on the protease activity (20~100℃); B, Effect of reaction temperature on the protease activity (50~70℃); C, Thermal stability of protease at different temperature.

2.6.2酶的热稳定性

热稳定性测试表明,60℃(接近其最适反应温度)孵育1 h后,粗酶液仍保留其初始活性的62.68%,说明酶具有一定程度的热稳定性(图6-C)。

SDS-PAGE酶谱检测结果也表明,酶经40℃、50℃、60℃处理10 min后,仍然能在SDS-PAGE凝胶上呈现明显降解条带。随着处理温度的升高,其降解强度减弱,90℃处理后仅能表现微弱降解条带(图7)。

图7 热稳定性的SDS-PAGE酶谱检测Fig.7 Thermal stability of protease at different temperature (SDS-PAGE zymography)注:Lane M,蛋白质分子量标记;Lane 1~6,蛋白酶经40,50,60,70,80,90℃热处理10 min。Note: Lane M, protein molecular weight marker; Lane 1~6, protease was heat treated at 40, 50, 60, 70, 80 and 90℃ for 10 min.

2.6.3反应pH对酶活性的影响

在中性和碱性环境中测试pH对酶活性的影响,发现在pH 7~12范围内酶均显示一定程度的酪蛋白降解活性,其最适反应pH范围是9~11(图8-A)。

2.6.4酶在不同pH条件下的稳定性

酶分别在pH为7、8、9、10、11、12的缓冲液中4℃保存24 h后,仍然保留大部分活性,结合其最适反应pH为碱性的结果,说明其在碱性条件下具有一定稳定性(图8-B)。

图8 pH对酶活性和稳定性的影响Fig.8 Effect of pH on the protease activity and stability注:A,反应pH对酶活性的影响;B,酶在不同pH条件下的稳定性。Note: A, Effect of reaction pH on enzyme activity; B, Stability of the enzyme under different pH conditions.

3 结论与讨论

昆虫构成了最丰富和最多样化的动物类群,其体内有种类繁多的共生菌,可为宿主提供有益的次级代谢物、酶和营养物质,它们在宿主生长发育过程中发挥重要作用(刘润进和王琳, 2018)。作为生境独特的一类微生物,昆虫肠道细菌和真菌所产生的一些水解酶,如蛋白酶、脂肪酶、多糖降解酶(木聚糖酶、纤维素酶、淀粉酶等),被认为可为工业酶的筛选和利用提供新的来源而得到广泛研究(Liangetal., 2018)。本研究从美洲大蠊肠道内分离到一株嗜碱性的芽孢杆菌,其分泌的蛋白酶是一种耐碱耐高温酶,在食品和饲料加工、生物活性肽生产及疾病治疗等方面具有潜在应用价值。

嗜碱微生物可从多种环境中分离到,除盐碱湖等外,还可从昆虫肠道、动物粪便、植物体及其根际土壤等非碱性环境中分离得到(Borkar, 2015; Banerjeeetal., 2017; Yueetal., 2017; Sandeshetal., 2019; Shinetal., 2020)。本研究从杂食性昆虫美洲大蠊肠道中分离得到嗜碱性的芽孢杆菌B.lehensisPaGA523-1菌株,并测试其所产蛋白酶性质。菌种B.lehensis来源和应用范围比较广范,有研究者从多种环境中分离到其它B.lehensis菌株,如沙漠盐渍土(Bhatt and Singh, 2020)、木薯厂废水(Amorimetal., 2020)、橡胶园土壤(Abd Rahmanetal., 2020; Jaafaretal., 2020; Nawawietal., 2020),分别进行了蛋白酶、环糊精糖基转移酶、果聚糖酶、内切-β-1, 3-葡聚糖酶、麦芽糖淀粉酶等研究。

热稳定性是影响酶的工业应用的关键因素之一。在工业应用中,较常温酶而言,热稳定酶具有一些优势,如在较高反应温度下具有更高的活性水平、稳定性和更快的反应速度(Lietal., 2014)。Joshi and Satyanarayana (2013)利用大肠埃希菌表达系统表达了从印度土壤分离到的B.lehensisMTCC7633菌株的一种碱性蛋白酶BLAP(编码基因ORF全长为1 140 bp),其最适反应温度为50℃;Sulaimanetal.(2019)从马来西亚橡胶园土壤来源的嗜碱性B.lehensisG1菌株发酵上清液中得到的碱性蛋白酶的最适反应温度40℃;Bhatt and Singh (2020)利用大肠埃希菌表达系统表达了分离自盐碱地的B.lehensisJO-26菌株的一种碱性蛋白酶APrBL(编码基因ORF全长为1 014 bp),其最适反应温度为50℃。本研究中所分离到的嗜碱性菌株B.lehensisPaGA523-1所分泌的碱性蛋白酶,在50~70℃内可发挥良好的蛋白质水解活性,其最适反应温度为62℃,均高于上述研究者所得到的结果,具有进一步研究价值。热稳定性试验表明,该蛋白酶在60°C(接近最适反应温度)处理1 h后仍具有62.68%的活性,另一方面,SDS-PAGE酶谱法检测结果也定性说明该碱性蛋白酶具有一定程度的热稳定性,表明其可以视作一种良好的热稳定酶。在饲料和食品加工业中,通常会使用高温发酵等工艺,该蛋白酶的热稳定特性可使其在这类生产过程中发挥较好水解作用。此外,这种耐热酶的最适反应pH值范围为9~11,且在碱性条件下表现一定的稳定性,与Joshi & Satyanarayana (2013)的研究结果相近。独特的耐高温和耐碱的酶学特性,使其在蛋白质的生物转化方面具有很大的应用优势。

综上所述,本研究从美洲大蠊肠道分离出一株嗜碱性的芽孢杆菌B.lehensisPaGA523-1,其最适生长pH范围为9~11,最适生长温度为37℃。该菌株所分泌的碱性蛋白酶最适反应温度为62℃,最适反应pH范围为9~11,且具有一定的热稳定性和耐碱性。该蛋白酶的耐热耐碱特性表明其有潜在工业应用价值,值得进一步深入研究。

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