杨宁,周婕,吴瑞,徐新荣
(南京中医药大学附属医院,江苏 南京 210029)
年龄相关性黄斑变性(Age-related macular degeneration, AMD)是全球老年人主要不可逆致盲眼病之一,其致盲人数约占全球法定盲的8.7%,全球约有3 000多万AMD患者,每年有50多万人因AMD而致盲[1]。在中国,随着人口的老龄化,AMD所造成的视功能损害人数正逐年增加。
临床上,AMD分为干性和湿性两型,干性AMD至今尚无确切有效的治疗措施,湿性AMD的治疗因抗血管内皮生长因子(VEGF)药物的广泛应用,有效改善和稳定了AMD患者的视力。但抗VEGF药物价格昂贵,又需反复球内注射,这给AMD患者带来心理困扰。有研究报道,六君子汤治疗湿性AMD取得良好效果[2],但是确切作用机制和靶点并不明确。
网络药理学通过构建靶点-靶点、成分-靶点、成分-靶点-通路等网络来阐明药物的作用机制,非常适合于多成分、多靶点的中药复方作用机制的研究[3]。本研究采用网络药理学方法,探明六君子汤治疗AMD的活性成分、作用靶点和信号通路,并对主要信号通路作用进行验证,以揭示其作用分子机制,阐释其科学内涵,为临床推广应用提供依据。
1.1.1 药物 六君子汤由人参9 g,白术12 g,茯苓12 g,炙甘草6 g,陈皮3 g,法半夏5 g组成。药物为颗粒剂,购于江阴天江药业有限公司。
1.1.2 细胞 人视网膜色素上皮细胞ARPE-19,购自美国ATCC公司。
1.1.3 动物 SPF级SD雌性大鼠30只,体质量230~250 g,由南通大学实验动物中心提供,许可证号:SCXK(苏)2019-0001。
1.1.4 主要试剂 t-BHP购于美国Sigma Chemical公司,MTT试剂盒购自南京建成生物工程研究所(批号:G020-1-2),AKT/p-AKT(4691/4060)、ERK1/2/p-ERK1/2(9102/9101)、p38/p-p38(9212/9211)一抗购自美国Cell Signaling Technology公司,VEGF(sc-7269)、β-actin(sc-47778)一抗和IgG/HRP二抗(sc2030)购自美国Santa Cruz公司。
1.1.5 主要仪器 倒置生物显微镜(德国Leica公司),酶标仪(美国Synergy公司),电泳系统(美国Bio-RAD公司),凝胶成像仪(美国Bio-RAD公司)。
1.2.1 六君子汤活性成分筛选及靶点预测 通过中药网络药理学数据和分析平台(TCMSP),查询到六君子汤6味中药的化学成分。设定口服生物利用度(OB)≥30%和药物相似性(DL)≥0.18作为筛选条件,筛选出每味中药的可能活性成分,经PubChem数据库确认后,在Swiss Target Prediction数据库查询,设定物种为人,输出前100个靶点,得到该成分的靶点。
1.2.2 AMD相关靶点的收集 以Age-related macular degeneration为检索词,查询DrugBank、TTD和OMIM数据库,检索结果汇集、去重后得到AMD疾病靶点。
1.2.3 活性成分-疾病共同靶点的获取 将筛选得到的可能活性成分靶点和疾病靶点导入Venny 2.1在线平台,获得活性成分与疾病的共同靶点。
1.2.4 蛋白-蛋白相互作用网络、活性成分-靶点网络的构建 将共同靶点导入String 11.0数据库,设定物种为人、置信度为0.700,获取蛋白相互作用信息;采用Cytoscape 3.8.0软件,构建蛋白-蛋白相互作用网络及活性成分-靶点网络。
1.2.5 靶点功能通路富集分析 将共同靶点导入David 6.8数据库,设定物种为人,进行GO功能和KEGG通路富集分析,结果用R语言软件进行可视化处理。
1.2.6 含药血清制备 SD大鼠随机分为空白对照组和六君子汤组,每组15只。依据“人和动物体表面积折算的等效剂量比值”计算出六君子汤大鼠给药的等效剂量为0.296 g/kg,生理盐水溶解后(2 mL)给大鼠灌服,空白对照组灌服等量生理盐水,每日1次,连续7 d。末次给药后1 h股动脉采血,采血后室温静置2~4 h,4 ℃离心15 min后取上清液,然后56 ℃水浴灭活,超净台过滤除菌后制得含药血清,血清分装成几管,每管1 mL,-20 ℃保存备用。
1.2.7 六君子汤对ARPE-19细胞活性的影响 取对数生长期细胞接种于96孔板中,每孔1×104个细胞,细胞长满80%时,先加入空白血清和2.5%、5%、10%含药血清常规培养24 h,后加入10 μL的0.5% MTT溶液,继续孵育4 h。吸出孔内培养液,每孔加入DMSO终止反应,酶标仪在490 nm波长处测定各孔吸光度(OD值),计算细胞存活率。
1.2.8 六君子汤对氧化损伤ARPE-19细胞活性的影响 细胞分为空白对照组、溶媒对照组、含药血清组(分2.5%、5%、10% 3个剂量组)。取对数生长期细胞接种于96孔板中,每孔1×104个细胞,细胞长满80%时,先加入溶媒(空白血清)和2.5%、5%、10%含药血清常规培养24 h,后加入浓度为200 μmol/L的氧化诱导剂叔丁基过氧化氢(t-BHP)溶液常规培养24 h,空白对照组不加含药血清和t-BHP。各组细胞按方法“1.2.7”项下测定各孔吸光度(OD值),计算细胞存活率。
1.2.9 Western blot 按“1.2.7”方法进行细胞铺板和培养,细胞裂解后提取蛋白,BCA法测定蛋白浓度。变性后取50 μg上样,用100 g/L分离胶、50 g/L浓缩胶电泳,之后转到硝酸纤维素膜上。加一抗(1∶1 000) 4 ℃孵育过夜后加兔二抗(1∶5 000),β-actin为内参,加入化学发光剂显影,Image J软件进行图像分析。
通过TCMSP平台以及Swiss Target Prediction数据库查询得到的六君子汤化学成分、活性成分及靶点数见表1。
查询DrugBank、TTD和OMIM数据库,分别得到232、12和37个靶点,去重后获得AMD疾病靶点266个。
将活性成分靶点934个和疾病靶点266个进行Venny分析,得到共同靶点92个。见图1。
图1 六君子汤活性成分和AMD靶点韦恩图
将共同靶点导入String 11.0数据库,获取蛋白相互作用信息,经Cytoscape 3.8.0软件可视化分析,结果见图2。网络由88个节点和506条边构成。节点表示靶蛋白,用于显示节点的重要性,节点越大、颜色越深,表明度值越大;每条边则表示蛋白与蛋白之间的相互作用关系,线条越多表示关联度越大。靶蛋白平均节点度值为11.5,超过平均度值的靶蛋白有37个:MAPK3、MAPK1、AKT1、VEGFA、MAPK8、RAC1、NFKB1、MAPK14、PRKCD、PRKCB、APP、HDAC1、RELA、PRKCA、HDAC3、MAPK9、LYN、HDAC6、MAPK11、HDAC2、PRKCQ、PTK2、MAPK10、PRKCZ、PTK2B、HDAC5、PRKCE、KDR、HDAC10、HDAC4、IKBKB、PRKCG、MAPK13、MCL1、AKT2、EPHB2、NTRK1,这些蛋白可能是六君子汤治疗AMD的关键靶点。
图2 六君子汤与AMD共同靶点蛋白作用网络图
将共同靶点及活性成分数据导入Cytoscape 3.8.0软件进行可视化分析,结果见图3。网络由189个节点和798条边构成。绿色节点代表活性成分,橙色节点代表靶点,边代表活性成分和靶点之间的相互关系。活性成分网络平均节点度值为8.443,超过平均度值的活性成分有39个,其中甘草26个,人参11个,茯苓2个,半夏1个,陈皮1个。结果见表2。这些化合物可能是六君子汤治疗AMD的主要活性成分。
表2 六君子汤治疗AMD的主要活性成分
GO分析得到417个条目,其中生物过程277个,将排名前20的生物过程条目进行可视化分析,结果见图4。由图可见,生物过程主要富集在转录因子结合、丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白质磷酸化、蛋白激酶C活性、蛋白激酶活性、蛋白脱乙酰酶活性、蛋白自磷酸化、肽-丝氨酸磷酸化、NAD依赖的组蛋白脱乙酰酶活性、MAP激酶活性等。提示六君子汤通过多种生物途径发挥治疗作用。
图3 六君子汤活性成分-靶点网络图
图4 共同靶点的GO功能的生物过程富集图
KEGG通路分析产生107个条目,可视化分析结果见图5。由图可见,共同靶点主要富集在VEGF信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、神经鞘脂质信号通路、NOD样受体信号通路、催乳素信号通路、神经营养素信号通路、MAPK信号通路、炎症介质对TRP通道的调节、Fc epsilon RI信号通路,提示六君子汤治疗AMD可能与影响这些信号通路有关。
图5 共同靶点的KEGG富集图
检测结果见图6。由图可知,空白血清及3个浓度六君子汤含药血清对细胞存活率没有明显影响。
图6 不同浓度六君子汤对ARPE-19细胞活性的影响
检测结果见图7。由图可知,与空白对照组比,溶媒对照组细胞存活率显著降低(P<0.01);与溶媒对照组比,含药血清组细胞存活率显著增加(P<0.05,P<0.01),呈浓度依赖性。
注:与空白对照组比较,**P<0.01;与溶媒对照组比较,
各组细胞VEGF、AKT/p-AKT、ERK1/2/p-ERK1/2、p38/p-p38蛋白表达检测及分析结果见图8。与空白对照组比,溶媒对照组各蛋白表达水平显著上调(P<0.01);与溶媒对照组比,含药血清组各蛋白表达水平明显下调(P<0.05,P<0.01),均呈浓度依赖性。
六君子汤出自明代医籍《医学正传》,由人参、白术、茯苓、甘草、陈皮、半夏6味中药组成,有益气健脾、燥湿化痰功效。临床主要用于治疗慢性胃肠功能紊乱、消化道溃疡、慢性阻塞性肺炎、心脑血管疾病、帕金森病等。眼科主要用于湿性AMD和糖尿病性视网膜病变的治疗[4-5]。
AMD的发病机制尚不十分清楚。目前普遍认为,各种致病因素导致的视网膜色素上皮细胞(RPE)功能损伤是AMD发病的关键。RPE细胞为光感受器提供结构支撑和功能维护、维持血-视网膜屏障完整、参与视色素的代谢、吞噬和降解光感受器脱落的膜盘、表达分泌多种生长因子。RPE细胞功能受损,导致Bruch膜老化、玻璃疣形成,影响视网膜营养代谢,使外层视网膜缺氧,这是脉络膜新生血管形成(CNV)的关键驱动因素[6]。氧化应激和炎症反应,也可通过多种途径刺激RPE产生过量VEGF,诱导CNV形成,最终导致AMD患者视功能严重损害。
基于中药多组分、多靶点、多途径的作用特点,本研究采用网络药理学方法,以探明六君子汤治疗AMD的机制。活性成分-靶点网络分析获得主要活性成分39个,其中甘草26个、人参11个、茯苓2个、半夏1个、陈皮1个,提示甘草、人参是六君子汤治疗AMD的主药。活性成分有多种生物作用:啤酒甾醇(Cerevisterin)通过调控MAPK、NF-κB、AP-1和Nrf2/HO-1信号通路,对炎症性疾病起治疗作用[7];甘草查尔酮A (Licochalcone A)可激活Nrf2通路和自噬,对LPS/Galn诱导的肝毒性具有保护作用[8];五味子酯B(Gomisin B)通过上调PI3K/AKT/mTOR通路,增加GLT-1水平,起到抗抑郁作用[9];山柰酚(Kaempferol)通过多个信号通路发挥抗退行性疾病、抗氧化、抗炎、抗癌、抗糖尿病等作用[10];吉九里香碱(Girinimbine)通过PI3K/AKT、mTOR和Wnt/β-Catenin信号通路抑制人卵巢癌细胞的体外增殖[11];山柰酚、槲皮素(Quercetin)和柚皮素(Naringenin)则有防治AMD的潜力[12-14]。蛋白相互作用网络分析得到37个关键靶点,对这些靶点进行GO功能分析,主要富集在转录因子结合、丝氨酸/苏氨酸激酶活性、蛋白质磷酸化、蛋白激酶C活性、蛋白激酶活性、蛋白脱乙酰酶活性、蛋白自磷酸化、肽-丝氨酸磷酸化、NAD依赖的组蛋白脱乙酰酶活性、MAP激酶活性等生物过程;KEGG通路分析显示主要富集于VEGF信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、神经鞘脂质信号通路、NOD样受体信号通路、催乳素信号通路、神经营养素信号通路、MAPK信号通路、炎症介质对TRP通道的调节、Fc epsilon RI信号通路等。VEGF信号通路是CNV形成的关键途径,Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、NOD样受体信号通路、MAPK信号通路均与AMD发病密切相关[15-18],这些通路影响细胞增殖和迁移、血管形成、细胞凋亡、炎症过程。基于VEGF信号通路是CNV形成的关键通路,又是六君子汤和AMD共同靶点KEGG富集最高的通路,本研究采用ARPE-19细胞进行了验证。结果显示,六君子汤能提高氧化损伤细胞的存活率;进一步观察发现,六君子汤可下调VEGF通路相关蛋白VEGF、AKT、ERK1/2 (MAPK3、MAPK1)、p38(MAPK14)表达水平,提示六君子汤可能通过抑制VEGF通路,对CNV形成起到抑制作用,这解释了临床上六君子汤治疗湿性AMD效果确切的原因[2,4]。需要指出的是,AMD是一种多因素疾病,发病机制涉及多条信号通路,VEGF通路只是其中之一。本研究结果也提示,六君子汤对多条AMD相关信号通路有影响。因此,要阐明六君子汤治疗AMD的机制,尚需进行更多深入研究。
综上所述,本研究采用网络药理学方法,对六君子汤治疗AMD可能活性成分、作用靶点、信号通路及作用机制做了初步探讨。研究结果显示,六君子汤的活性成分主要通过VEGF信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、NOD样受体信号通路、MAPK信号通路,影响细胞增殖和迁移、血管形成、细胞凋亡和炎症过程,发挥防治AMD的作用;通过氧化损伤ARPE-19细胞,初步验证六君子汤能抑制VEGF信号通路,从而起到抑制CNV形成的作用。本研究存在一定的局限性,研究仅基于数据分析,但无论是中药成分及靶点、疾病靶点,不同数据库间的数据差异比较大。另外,研究结果尚需进行更多体内、外验证,以期为六君子汤在AMD防治的推广应用提供依据。