哺乳动物毛色调控机制及其适应性进化研究进展

2021-02-25 13:26章誉兴吴宏于黎
遗传 2021年2期
关键词:毛色黑素黑素细胞

章誉兴,吴宏,于黎

综 述

哺乳动物毛色调控机制及其适应性进化研究进展

章誉兴,吴宏,于黎

云南大学生命科学学院,省部共建生物资源与利用国家重点实验室,昆明 650091

哺乳动物类群呈现出的丰富毛色是引人注目的一种生物现象,是研究和理解哺乳动物适应性进化的理想模型之一。哺乳动物的毛色多态在躲避天敌、捕食、求偶及抵御紫外线等方面都具有重要作用。哺乳动物毛发的色素化过程由体内黑色素的数量、质量和分布状况所决定。黑色素的形成过程复杂,包括黑素细胞的分化、成熟,黑素体等细胞器的形态发生及黑色素在黑素细胞中的合成代谢和转运等过程;而在细胞色素化的每个阶段/时相都伴随着一些重要功能基因的参与,并通过基因之间的相互作用形成了黑色素生物代谢的复杂调控网络,进而形成不同的毛色有助于哺乳动物适应不同生存环境。对哺乳动物不同毛色形成机制的探究一直以来都是遗传学及进化生物学的重要研究领域和聚焦热点。本文综述了哺乳动物毛色色素化过程的主要分子机制以及毛色适应性进化的遗传基础,以期为哺乳动物毛色多态及其适应性进化的分子机制研究提供参考。

毛色;黑色素生成;遗传基础;适应性进化

哺乳动物类群展现出的丰富多彩的毛色特征是一种普遍且备受关注的生物现象。毛色多态性普遍存在于种内和种间,比如:孟加拉虎()有4种毛色表型,其中普遍存在的是橙色底黑色条纹,而其变种白虎是白色底黑棕条纹,金虎是金色底红棕色条纹以及雪虎是几乎全身雪白的毛色[1]。马()的毛色繁多,可大致分为黑色、骝毛、栗毛等[2]。不同品种的家犬()毛色也分为多种,例如拉布拉多犬有黑色、巧克力色和黄色[3],德国牧羊犬有黑色、蓝色和肝脏色等[4]。除了种内多态,毛色多态性还体现在种间,例如金丝猴属中有几乎全身为金黄色的川金丝猴(),黑色和白色为主的滇金丝猴()和越南金丝猴(),黑褐色和金黄色为主的黔金丝猴()以及全身黑色为主的怒江金丝猴()[5]。在猫科动物中,大部分猫科动物类群间都可以毛色、斑点或条纹的差异而进行区分[6]。

哺乳动物种内或种间的体色多态很大程度上是自然选择作用的结果;特定类群所呈现的特殊毛色分布模式往往反映了其对周围环境的协调和适应,例如躲避天敌、捕食、求偶以及抵御紫外线等[7]。亚利桑那州南部的岩小囊鼠()为了避免被捕食,其毛色类型与其栖息地密切相关,火山熔岩附近区域生活的岩小囊鼠有着深色皮毛,而生活在较远且遍布浅色花岗岩地区的群体其被毛颜色则相对较浅[8]。分布于喀斯特地貌区域的石山叶猴()除了头部、尾部有白色、黄色毛发外,几乎全身被黑色毛发覆盖,该毛色可能是石山叶猴的一种伪装适应策略[9]。大熊猫()黑白相间的毛色也与伪装有关,白色的毛发有助于在积雪的栖息地中隐藏,而黑色毛发则有助于在森林中隐藏,这有助于大熊猫在两种不同栖息地中活动[10]。不同猫科动物类群所具有的特殊毛色特征与其捕食行为密切相关,比如鹿和羊,因其仅具有二色视觉而无法有效区分橙色和绿色,因此捕食鹿和羊的老虎()其橙色被毛对于鹿和羊来说是一种非常有效的伪装,能够与所处的环境融为一体,使其能不动声色地靠近、捕食猎物[11]。Caro等[12]对鲸类()的着色模式研究发现,吃鱼、虾和乌贼的鲸类往往具有醒目的斑块化体色(例如:白侧腹、白头和不对称的白色下颌骨),这些明显的白色斑块能够迷惑猎物,使其聚集在一起,便于鲸类捕食。此外,性选择作用对于塑造哺乳动物类群间的毛色多态也有着重要影响[13]。如雄狮()的鬃毛是性选择的产物,深色的鬃毛对雌狮更有吸引力[14]。Cooper等[15]将10只不同亚种的褐狐猴()分别放进笼子里,在每个笼子中提供经过处理的不同色彩的雄猴照片,记录每只雌猴看照片的时间,结果发现雌猴更喜欢色彩鲜艳的雄性。在抵御紫外线方面,栖息于高海拔地区的藏猪()通过其黑色的毛发来抵御紫外辐射,能有效避免紫外辐射引起的DNA损伤[16]。

除了自然选择作用外,由于人类文明的兴起和发展,体色作为一种重要的经济性状,不同家养动物类群也受到强烈的人工选择作用而表现出高度的体色多态性。例如驴()的毛色可分为三粉、黑色、白色等[17];猪也有丰富的毛色表型,如黑色、红色、黑斑等[18];绵羊()也具有白色、灰色、棕色等多种毛色[19]。

对哺乳动物不同毛色形成机制的探究和揭示一直以来都是遗传学及进化生物学的重要研究领域和聚焦热点。杨广礼[20]、巫小倩等[21]、王磊等[22]先后对动物的毛色形成机制进行了综述。对哺乳动物的毛色长期研究发现,哺乳动物的毛色、眼睛颜色和肤色由体内黑色素的数量、质量和分布状况决定[23]。在哺乳动物中,一般存在真黑素和褐黑素两种黑色素:真黑素(棕黑或深色不溶性聚合物)能使皮肤和毛发表现为黑色或褐色;褐黑素(红黄色可溶性聚合物)能使皮肤和毛发表现为红色和黄色[24]。黑色素在哺乳动物的毛色形成中扮演着关键角色,黑色素的形成有着复杂的调控机制,从黑素细胞的分化成熟到黑色素合成及转运的过程中都有着多个基因的参与调控[25]。此外,越来越多的研究表明,microRNA (miRNAs)也可以调控黑色素沉积从而影响哺乳动物的毛色[21,26]。

本文综述了哺乳动物毛色色素化形成的主要调控机制,进一步阐述了这些重要功能基因产生的不同遗传突变对于哺乳动物适应性进化的重要意义(自然选择与人工选择);同时,也对哺乳动物类群中毛色多态与某些重大遗传疾病之间的关联性进行了探讨,以期为哺乳动物毛色多态、适应性进化以及重要遗传疾病致病机理的分子机制研究提供参考。

1 哺乳动物色素化过程调控机制

细胞色素化过程包含多个时相和阶段,主要分为:黑素细胞的发育成熟、黑素细胞中重要细胞器的形态发生、黑色素的合成代谢及黑色素的胞内胞外转运和功能行使等[27]。黑素细胞由黑素母细胞分化而来,该细胞起源于胚胎时期躯干神经嵴细胞[28]。神经嵴细胞是一种多能细胞,具有分化为黑素细胞、外周神经系统的神经元、神经胶质细胞和肾上腺髓质的嗜铬细胞等多种细胞的潜能[29]。神经嵴细胞分化为黑素细胞主要有两种途径:第一种通过背侧迁移途径,即沿着体节和外胚层的间隙迁移。前期神经嵴细胞分化为黑素母细胞,黑素母细胞沿着背侧途径增殖并迁移至胚胎各处。随后,黑素母细胞通过基底膜进入表皮层,其中部分黑素母细胞会进一步迁移至毛囊基质中。位于表皮层的黑素母细胞分化为黑素细胞后负责皮肤色素沉着;而迁移到毛囊基质的黑素母细胞,一部分分化为成熟的黑素细胞,还有一部分黑素母细胞则形成黑素细胞干细胞(melanocyte stem cells, MSC),负责维持体内平衡[25]。第二种是腹侧迁移途径,早期的神经嵴细胞沿腹侧迁移分化为神经元和施万细胞前体(schwann cell precursors, SCPs),SCPs进一步分化为施万细胞和黑素细胞,黑素细胞的分化与发育受神经调节蛋白1 (neuregulin-1, NRG1)、胰岛素样生长因子1 (insulin- like growth factor 1, IGF1)和血小板衍生因子(platelet- derived growth factor, PDGF)调控,NRG1抑制黑素细胞的分化而IGF1和PDGF促进SCPs分化为黑素细胞[30,31]。黑素体是黑素细胞中由高尔基体–内质网–溶酶体形成的不连续的膜状细胞器,是黑色素合成的场所[32]。在黑素体中,酪氨酸首先通过酪氨酸酶(tyrosinase, TYR)的催化作用形成多巴,再进一步氧化生成多巴醌(DOPA quinone, DQ),后经一系列酶促反应最终生成真黑素;当半胱氨酸存在时,DQ便与半胱氨酸反应生成半胱氨酸多巴,经过闭环和脱羧反应生成褐黑素[33,22]。此外,真黑素和褐黑素的合成还与黑素体内的pH值有关,低pH值有利于褐黑素合成而高pH值则有利于真黑素合成[34]。黑色素合成后,成熟的黑素体通过各种分子马达运输黑色素到周围的角质细胞中行使色素功能[35,36]。与皮肤黑色素生成不同的是,毛囊中黑色素的生成与毛发周期有关,在毛发生长期,毛囊黑素细胞中黑素体合成黑色素,随后成熟的黑素体转运至周围的皮层角质细胞最终形成有色毛干。与表皮黑色细胞相比,毛囊黑色细胞更大,树突更多,有更大的高尔基体和内质网,能产生更大的黑素体[30](图1)。

1.1 黑素细胞发育过程调控

随着第一个毛色基因在小鼠()中被克隆到现在[37],已经发现171个毛色相关基因(378个突变位点)在不同阶段调控毛色/肤色的产生(http://www.espcr.org/micemut/)。在黑素细胞的发育过程中,Wnt信号通路、内皮素3-内皮素受体B (EDN3/EDNRB)信号通路以及KIT/KITL信号通路与神经嵴细胞分化发育为黑素细胞的过程密切相关[20,26]。与此同时,MITF、SOX10、PAX3等转录因子也参与调控黑素细胞的分化与发育。

Wnt蛋白是富含半胱氨酸的分泌型糖蛋白,在诱导神经嵴细胞的迁移、增殖和分化过程中起重要作用[38]。Wnt信号通路能够通过不同方式和途径影响细胞存活、增殖、分化和迁移[39]。Wnt信号通路通过黑素细胞中β-catenin的积累而进入细胞核后与淋巴细胞增强因子(lymphoid enhancer factor 1, LEF1)结合而增强小眼畸形转录因子(microphthalmia-asso­ciated transcription factor, MITF)的转录表达,最终促进黑素母细胞的增殖分化,进而影响黑色素合成[40]。此外,Wnt1A和Wnt3A也是Wnt信号通路中重要的调控分子;Wnt1可促进黑素母细胞分化为黑素细胞,Wnt3a促进神经嵴细胞向黑素细胞的分化,维持或上调黑素母细胞中的表达及其下游基因和来促进黑色素的生成[41,42]。

图1 哺乳动物细胞色素化过程及其调控机制

A:黑色素合成的细胞过程;B:黑色素合成信号通路。根据参考文献[33]修改绘制。

内皮素(endothelin 3,)及其受体在黑素细胞的发育中有着不可或缺的作用。这两个基因上发生的遗传突变均会导致黑素细胞前体的数量减少和色素稀释[43]。EDN3在黑素细胞发育的整个过程中是必需的,它在黑素细胞发育早期可以补偿KIT的部分作用,辅助影响黑色素的形成,在基因突变的小鼠中的过表达能够减少白斑[44]。

KIT/KITL信号通路是黑素母细胞存活所必需。基因编码酪氨酸激酶受体,其表达量变化会影响黑素细胞的迁移过程。黑素母细胞迁移时,KIT与其配体KITL结合后通过MAPK使MITF-M的Ser73磷酸化而导致MITF-M功能上调;与此同时,转录共刺激分子(CBP/p300)也与MITF-M相互作用,进一步激活MITF-M的功能[45]。当基因发生突变不能正常表达时,会影响黑素细胞的正常迁移,导致毛根中缺乏黑素细胞而出现毛色稀释,白色毛发或白色斑点表型[45,46]。KIT和MITF能共同调控黑素细胞的发育,二者之间有着复杂的相互作用,是维持黑素细胞中表达所必需的,而信号传导则可调节黑素细胞中的活性和稳定性。首先在促进黑素母细胞向黑素细胞的分化中起作用,随后通过影响表达来促进黑素细胞的存活和迁移[47]。

MITF属于MiT转录因子家族成员,参与多种细胞类型的分化发育,例如黑素细胞、破骨细胞和肥大细胞等[48]。基因有多个启动子,存在多个具有不同5ʹ外显子的同工型,其中几乎只在黑素细胞和黑素细胞瘤中表达。MITF具有螺旋–环–螺旋–亮氨酸拉链结构(bHLHzip),它可以识别并与E-box(5ʹ-CACGTG-3ʹ)、M-box(5ʹ-TCATGTG-3ʹ)序列相互作用,形成专一的二聚体,对胚胎神经嵴细胞向黑素细胞的分化选择过程至关重要。MITF在黑素细胞发育过程中扮演着交通枢纽角色,可以和多种转录因子结合进而调节上游或下游信号通路。在上游信号通路中,启动子与LEF1/TCF结合激活表达,激活Wnt/β-catenin通路转导促进黑素细胞谱系的建立[49]。CREB是一种bZIP转录因子,可识别启动子中的TGACGTCA基序促进的表达,进而响应下游的cAMP浓度变化,最终促进黑色素的沉着。SOX10能响应cAMP信号而激活,而PAX3通过与基因的启动子结合来调节的表达;因此,与对的表达有协同作用,这对黑色素细胞的发育和黑素细胞干细胞活化的调节是必需的。通过抑制与启动子的结合,降低的表达最终维持黑素细胞的存活[48~50]。在下游信号通路中,能够识别并结合TYR家族启动子中的E-box序列,指导该家族成员()在黑素细胞中的特异性表达,从而产生黑色素[51](图1)。

方案三:谷物、薯类和杂豆统计为粮食,但不包括大豆。考虑到人们粮食消费的多元化,杂豆仍然可以作为粮食的一部分。因此,只将大豆从现有粮食统计口径中剔除,其中薯类(不含木薯)仍然按5比1折粮。

1.2 黑素体形态发生的调控

黑素体在黑素细胞中的形态发生和成熟主要包括4个阶段(I-IV期)。I期黑素体是圆形无定型的基质小囊泡,细胞器腔内开始出现早期的蛋白原纤维。II期黑素体包含有序的结构化纤维基质,黑素体呈椭圆形,无色素沉着。III期TYR催化L-酪氨酸氧化形成多巴,多巴经过氧化形成多巴醌,后者再经过一系列反应在黑素体中生成黑色素。IV期黑色素沉积在蛋白纤维上并充满整个黑素体[52~55]。

在黑素体形成前期(I-II期)中,基因编码一种黑素细胞特异性蛋白,并形成生理淀粉样蛋白纤维。前黑素体蛋白(PMEL)首先在内质网中合成,经过高尔基体和高尔基体网状结构加工修饰后进入黑素体(I期)。其进入方式有两种:(1) PMEL与衔接蛋白-1(AP1)首先形成复合物,之后通过网格蛋白包被的囊泡直接分选进入黑素体;(2) AP2与PMEL形成的复合物通过间接途径先分选至质膜,再重新回到黑素体[56],在II期形成纤维状结构,黑色素最终沉积在黑素体的管腔中。基因失活会导致黑素体的形态发生改变,导致毛色被稀释[57]。除外,也是黑素体形成过程中重要的功能基因。能与形成复合物,维持在黑素体中稳定表达。将进行siRNA处理后,黑素细胞中的稳定性受影响,影响其加工与运输[58]。基因敲除的小鼠体系中,小鼠的毛色淡化,黑素细胞中的黑素体形态结构也发生改变[59]。是一种糖基化的跨膜蛋白,与的氨基酸序列具有高同源性且在黑素体形成的整个过程中表达,将在黑素细胞中敲除后黑素细胞中黑素体减少,表明可促进早期黑素体的形成[60]。

在黑素体合成后期(III-IV期)中,和从循环内体(recycling endosome)到黑素体中的运输有两条不同的路径,依赖于AP-3运输,而依赖于BLOC-1或BLOC-2运输[61]。在该过程中,Mahanty等[62]研究表明,、或通过调节介导的循环内体来控制和在黑素体中的转运从而影响黑素体的成熟。在黑素体成熟过程中,基因编码的蛋白维持着黑素体内的环境稳态。TYR在pH为中性时活性最高,有利于黑色素的合成[63]。和基因编码的蛋白均作为一个Na+/H+交换器,将H+从黑素体中泵出去,将Na+泵进来维持体内的pH保持在中性。编码的离子泵偶联V-ATPase可调控黑素体内的阳离子浓度(K+/Na+/Ca+/H+)[64](图1)。

1.3 黑色素合成的调控

黑素皮质受体1()属于G蛋白偶联受体家族,主要在黑素细胞中表达,是调节哺乳动物毛色的重要受体。通过与α-MSH和ACTH结合,激活细胞膜上腺苷酸环化酶系统使三磷酸腺苷(ATP)转变为环腺苷酸(cAMP);之后启动子区的cAMP反应元件(cAMP-response element, CRE)与cAMP效应元件结合蛋白(cAMP response element-binding protein, CREB)结合而上调基因的表达,最终激活TYR而促进真黑素产生[65]。此外,角质细胞由于UVB照射导致的DNA损伤可激活P53反应机制而上调促黑皮质激素基因(Pro-opiomelanocortin,)的转录表达。该基因是α-MSH和ATCH的前体,α-MSH与结合激活cAMP,进一步激活PKA导致表达上调最终促进黑色素的合成[66]。是的拮抗剂,可与α-MSH竞争性地结合而抑制TYR表达,从而阻碍真黑素的合成而激活褐黑素合成[67]。

酪氨酸酶TYR是黑色素合成代谢过程中的关键酶,它能催化酪氨酸羟基化为多巴并随后形成DQ。哺乳动物的毛色类型与真黑素和褐黑素二者的比例有关,多巴醌是生成这两种黑色素的共同前体物,因此TYR控制着黑色素的生成,在毛色形成过程中扮演着不可缺少的角色。除了TYR,其酪氨酸酶基因家族还有TYRP1和TYRP2,二者在催化真黑素合成过程中也扮演着重要角色,催化多巴醌进一步合成真黑素[68](图1)。

1.4 黑色素的胞外转运调控

黑素体成熟后被转移至表皮或毛囊中的角质细胞中,以此吸收紫外线保护细胞核免受损害[69]。目前,成熟黑素体的转运主要有4种模型和假说:(1)吞噬作用模型中,黑素细胞通过延长树突与角质细胞接触,角质细胞将黑素细胞的树突包围、掐断并吞噬;(2)膜融合模型中,黑素细胞丝状伪足与角质细胞膜融合形成瞬时膜导管,黑素体通过该瞬时膜导管转移至角质细胞中;(3)脱落–吞噬作用模型中,黑素体沿着黑素细胞伸出的丝状伪足迁移至顶端聚集成色素小球并脱落,之后角质细胞将色素小球包裹并吞噬;(4)胞吐–内吞模型中,黑素体膜与黑素细胞质膜融合被分泌至细胞间隙,随后周围的角质细胞通过吞噬作用将黑素体吞噬内化[70]。角质细胞中黑素体的数量、分布能影响毛发、皮肤的色素沉着。等基因编码的蛋白复合物是黑素体转运所必需的,可协调黑素体沿微管的长距离转运和沿肌动蛋白丝的短距离转运,并在随后的色素沉着中也起到关键作用[71,72],这些基因的遗传突变均会导致小鼠的毛色被稀释[73]。在模型(1)、(2)和(4)中,黑素体的转移均需要角质细胞的吞噬完成,该作用受蛋白酶激活受体2 (recombinant protease activated receptor 2,)调节,的活化可增强吞噬作用和皮肤色素沉着[74]。

1.5 miRNA调节黑色素合成

除毛色相关基因调节哺乳动物的色素化过程外,研究发现miRNA的表达模式也与黑色素合成有关[21]。miRNA是一类长约22 nt的非编码RNA,它们能与细胞中其他因子结合形成沉默复合体(RNA- induced silencing complex, RISC),引起靶基因RNA的降解或翻译抑制而表现出细胞功能活性[75]。miRNA不仅可以通过与Wnt/β-catenin信号通路、TGF-β信号通路和cAMP信号通路中关键基因RNA结合而调控黑色素沉积,还能够通过调控、、等基因表达模式而影响黑色素合成代谢[21,26]。

2 毛色适应性进化的遗传基础

2.1 毛色表型与伪装行为的适应性进化

一般而言,哺乳动物成年个体的毛色是相对稳定的,不会出现明显的变化,但也有特例。由于真黑素/褐黑素的含量变化,使其毛色能够随着季节而变化。例如雪鞋兔()为了适应冬季的冰雪环境以此达到躲避天敌的伪装目的,它们在冬季褪去棕色的外衣转变为白色[76]。随着全球变暖,部分地区降雪减少,雪鞋兔为躲避捕食者,它们打破在冬季换装的规律,仍保留其棕色毛发。Jones等[77]研究发现北美雪鞋兔不同毛发颜色的转换与基因的顺式调控作用相关。白色毛发和棕色毛发中基因的表达量存在显著差异,白色雪鞋兔5ʹ非编码区存在1Kb左右的碱基插入,而北美雪鞋兔的棕色表型则是黑尾长耳大野兔基因适应性渗透的结果。北极狐()的毛色也能够随季节而变化,在冬季其毛色由棕灰色毛发蜕变为白色毛发以便更好地在雪地里伪装。有学者通过白色北极狐和其蓝色变种来研究其毛色变化机制,发现基因的遗传突变在其毛色调控中发挥了主要作用,其中两个非同义突变位点(p.C5G、p.C280F)影响黑色素的合成水平[78]。非洲条纹鼠()背部有两对深色浅色交替分布的条纹,其背部的条纹可能有利于躲避捕食者[79],研究发现背部的深浅条纹受调控,在浅色条纹中高水平表达,通过与的启动子结合,抑制活性,干扰黑素细胞分化以及黑色素的合成[80]。岩小囊鼠的毛色与其栖息地背景高度匹配,火山熔岩附近区域生活的岩小囊鼠有着深色皮毛,而生活在较远且遍布浅色花岗岩地区的群体其被毛颜色则相对较浅[8]。Nachman等[81]对不同来自栖息地的岩小囊鼠的和基因进行测序分析发现,栖息于亚利桑那州中南部Pinacate地区熔岩中的岩小囊鼠其黑色毛发受基因调控(p.R18C、p.R109W、p.R160W和p.Q233H) (表1)。

2.2 毛色表型与捕食行为的适应性进化

白灵熊()的错义突变(p.Y298C)使白灵熊呈现出白色毛发[82],这让它在森林和灌丛中显得格外醒目。但白灵熊主要以鲑鱼为食,白色毛发更能与天空背景融为一体,便于捕食蛙鱼,有报道也证实了在白天白色毛发的白灵熊比黑熊更容易捕食到鲑鱼[83]。非洲野犬()毛色多样,通常由黑色、白色和黄色组成形态各异的斑纹。其多样的毛色可能与伪装有关,有利于其捕食高角羚()等猎物。Chavez等[84]研究发现其毛色受、和三个基因的调节,其中和通过调节黑素体的转运从而调节黑、白毛色,而通过调节黑色素的合成从而调节黄、黑色毛发。Allen等[85]表明猫科(Felidae)动物的毛色与其生存环境息息相关,其斑点图案有助于在树木、灌木丛中伪装,便于捕食猎物。Kaelin等[86]发现和基因共同调控猫科动物的斑纹形成,在毛囊发育前期决定深浅斑纹形成区域,负责该区域黑、黄毛色的形成(表1)。

2.3 毛色表型与抵御紫外线辐射的适应性进化

紫外线对皮肤有穿透作用,皮肤在紫外线强烈照射下会导致皮肤变黑、老化、炎症甚至引发皮肤癌[87]。强紫外线照射能诱导环丁烷嘧啶二聚体(cyclobutane pyrimidine dimers, CPD)和嘧啶(6-4)嘧啶酮光产物(6,4-photoproducts,(6-4)PP)的产生而造成DNA损伤[88],也会诱导皮肤中活性氧自由基(ROS)过量产生对细胞及DNA结构造成损伤而导致细胞癌变[89]。对哺乳动物而言毛发中黑色素的沉积是哺乳动物抵御紫外线损伤的第一道防线,黑色素能够减少紫外线对皮肤的穿透作用而有效降低紫外辐射对细胞的损伤[90]。青藏高原高海拔地区有较强的紫外辐射,Li等[16]认为栖息于青藏高原的藏猪的黑色毛发可能用于抵御紫外辐射,避免紫外辐射引发的DNA损伤,作者基于基因组分析从藏猪中筛选出了多个与抵御紫外线相关的适应性进化基因,其中包含与黑色素合成有关的基因。Guo等[91]通过全基因组分析筛选出调控波尔山羊、美姑山羊、金堂黑山羊、南江黄羊、臧山羊和西藏绒山羊6种山羊毛色、高海拔适应、生长繁殖的正选择基因,其中在西藏绒山羊中筛选出可能调控其黑色毛发的基因,可能通过调控黑素细胞的分化和迁移来调控黑色素的生成,从而帮助西藏绒山羊抵御青藏高原强烈的紫外线辐射(表1)。

2.4 毛色表型与人工选择下的适应性进化

家养动物类群的毛色也是人类高度关注的经济表型性状,家养动物的毛色高度多样化很大程度上反应了人们的喜好差异,或者某些特殊毛色因为和某些关键驯化性状偶联,包括温顺、产崽率以及生长发育速率等而被搭载选择,导致群体/品系固定。例如,敲除基因的黑色鹿鼠()与正常黄色鹿鼠相比,基因的鹿鼠表现得更温顺,攻击性也较低[92];几乎所有突变的纯合白斑小鼠都是不育的[93];Avy基因型小鼠有黄色、黑斑、鼠灰色3种表型,而鼠灰色小鼠体重增加速率明显低于其他两种表型[94]。

表1 毛色表型与适应性进化遗传基础研究总结

人工选择是家养动物表型进化的主要驱动力,家养动物相较于野生哺乳动物类群往往呈现出了更多的毛色多态性。在中国家猪品系中,有黑色、白色和黑白花色等多种表型,其中黑色家猪在中国较为常见,该毛色也被认为是驯化出来的性状。Li等[95]认为黑色家猪的驯化与中国特殊的祭祀文化有关。与野猪()种群相比,中国家猪在瓶颈效应与人工选择共同作用下导致了中国家猪基因区遗传多样性的显著下降,最终使的两个错义突变(p.V95M和p.L102P)在家猪中固定。除了黑或白的纯色家猪,黑眼圈白毛、乌云盖雪、两头乌等家猪品系均在中国有分布。通过全基因组关联分析发现两头乌群体与非两头乌群体间在和基因处有显著信号和遗传差异[96]。对中国滇南小耳猪的全基因组测序和分析,发现其六白毛色表型(四蹄、头和尾尖白色)与等基因区的遗传突变相关。其中,基因上游调控序列中的CEBPB识别基序发生突变,影响了该基因的表达;基因上一个高度保守的非同义替换位点突变(p.E396D)可能消除功能,通过介导黑素细胞的凋亡而影响黑色素的合成[97]。与黑色家猪相似,受葬礼文化或宗教的影响,白色水牛()在中国等亚洲国家也受到特别的偏爱。基于全基因组测序分析发现,基因上游LINE-1转座子的插入使基因强表达,使黑色素合成受阻导致水牛表现出白色[98]。Yusnizar等[99]研究发现在水牛中基因突变(c.328C>T;c.840+2T>A)会造成白斑表型。此外,狗()是最早被驯化的家养动物,目前已有超过400个不同性状的家犬品系,毛色丰富的家犬受多种色素相关基因如和等调控[100,101]。例如昆明犬有狼青、黑背和草黄3种毛色表型,通过对昆明犬和三个色素调控基因进行测序和进化分析,发现(p.S90G、p.A105T、p.P159Q、p.M264V)在昆明犬狼青和黑背这两个群体中具有高度杂合性,可能通过平衡选择作用导致昆明犬的毛色差异[102]。另外,家马()大约包含900个品种,其黑色、栗色和骝毛等基础毛色主要受基因调节,而奶酪色、珍珠毛色等淡化毛色则由等相关基因的不同突变类型调节[103~105]。家兔()基因3ʹUTR的缺失使黑色素含量减少,导致灰色毛色[106]。Yao等[107]发现基因和基因在黑色绵羊和白色绵羊中表现出显著差异。美洲驼()中基因的突变(c.532T>C)造成白色斑点[108]。阿拉伯骆驼()中的一个移码突变导致基因转录–翻译提前终止,而出现白斑表型[109]。蓝狐基因中第12内含子的第一个碱基由G突变为T,改变mRNA剪切方式从而导致该基因的第12号外显子缺失,蓝狐出现了显性白色表型[110]。基因在不同毛色的獭兔()中差异表达,在黑色毛发中表达量最高,并且基因对其他毛色相关基因如和的表达也有影响[111]。野驴的毛色主要为灰色,在人工选择下出现了黑色和栗色的家驴,Wang等[112]基于全基因组数据分析发现家驴的黑色和栗色毛色的出现是由基因的转录因子结合位点下游约18.6 kb处有1 bp缺失所导致。Guo等[91]通过全基因组分析在南江黄羊(和)和美姑山羊(和)中筛选出了分别调控其黄色/黄褐色、黑色毛发的正选择基因。除了基因突变以外,在羊驼()中,Tian等[113]基于Illumina测序技术对白色羊驼和棕色羊驼皮肤中的miRNA全面分析,发现分别有35个和13个miRNA在白色羊驼和棕色羊驼中高表达。Ji等[114]研究发现可通过靶向的3′UTR区域调节TGF-β激活酶1信号通路的表达,抑制表达从而促进羊驼黑素细胞的增殖和迁移。Zhu等[115]通过实验验证发现和通过与靶基因的3′UTR结合,调节及其下游基因(和)的表达,抑制黑色素的形成。Liu等[116]研究发现是的靶基因,通过下调影响β-catenin和的转录和翻译,进而影响下游基因、和的表达抑制黑色素的形成(表1)。综上所述,在人工选择过程中,家养动物的毛色受多个基因的调控,但在黑素细胞发育、黑色素合成过程中主要受、、、等主效基因调控,此外在黑色素转运过程中相关基因突变(如)也能够导致家养动物毛色改变(表1)。

毛色相关基因的突变一方面能够导致毛色表型呈现多样化,实现对周围生存环境的适应或应对极端的人工选择压力,另一方面,越来越多的研究也发现哺乳动物中一些毛色相关基因的突变往往会偶联着一些比较明显的生理缺陷和病症。比如:在视觉上,基因外显子2的第975位胞嘧啶缺失,导致密码子提前终止使猫()患有白化病,表现为粉红色眼睛和白色毛发[117];日本黑牛()基因(p.H2015R)突变引起Chediak- Higashi综合征症,表现为眼皮肤白化病,伴有免疫缺陷,并且毛色变浅[118]。在听觉上,斑点狗基因的非编码区突变与先天性神经性耳聋(canine co­ngenital sensorineural deafness, CCSD)有关[119]。毛色相关基因的突变还与癌症偶联,黑色素瘤是由黑素细胞恶变引发的肿瘤,紫外线在黑色素瘤的发展中起着重要作用[81]。灰色马匹的毛色会随着年龄的增长而逐渐变白,该表型与内含子6的4.6 kb重复有关,的突变可能通过调节黑素体的产生或是运输而影响黑色素的沉着,从而导致马毛色变白。体内缺乏黑色素的马匹因而不能有效抵御紫外线的照射,增加了其患黑色素瘤的风险[120,121]。毛色相关基因突变还能够引发皮肤疾病,例如基因第2外显子的突变会导致杜宾犬毛色被稀释,同时,还伴随着色素稀释性脱毛(color dilution alopecia, CDA),表现为毛发逐渐脱落,并有时伴有毛囊炎[122]。此外,毛色相关基因的突变对哺乳动物的存活也有影响。除了参与黑素细胞的发育调控外,在肠神经元发育中也具有重要作用。在家马中,基因的突变与致死性白色马驹综合症密切相关,基因编码的第118位氨基酸由异亮氨酸变为赖氨酸,会导致患病的小马驹毛色全白或几乎全白,并且在几天内因肠神经节病变而死亡[123]。同样,在小鼠中敲除基因会引起小鼠出现白斑表型并伴随着巨结肠[124]。

3 结语与展望

目前,关于哺乳动物毛色性状的遗传学和进化生物学研究主要基于全基因组或CDS区上的点突变位点遗传标记来展开。通过对某物种/群体的基因组进行测序分析,筛选出单核苷酸多态性(single nuc­leotide polymorphisms,SNPs)位点进行保守性分析、功能富集等推测出影响该物种毛色变化的毛色相关基因。但对基于小片段插入或缺失(insertion-deletions, Indels)或大片段的基因组结构性变异(structural variations, SVs)展开的毛色多态性分子机制研究则相对较少;同时,大多数的研究都主要集中于模式物种类群,迄今为止在小鼠中已经发现有171个毛色相关基因(378个突变位点) (http://www.espcr.org/ micemut/),但是对非模式物种毛色的研究还相对欠缺。此外,在以往的研究中,人们一般仅通过生物信息学手段在全基因组范围内扫描和筛选出信号显著的遗传区域从而推测某些突变点与毛色表型之间的关联性,缺乏后续完整可靠的功能实验加以验证和支撑。

随着全基因组测序技术的不断发展和普及,针对模式和非模式物种,基于更多种类分子标记如插入缺失、拷贝数变异(copy number variations, CNVs)与基因组结构性变异的比较基因组学或群体基因组学研究将是哺乳动物毛色多样化研究的重要发展方向;此外,基因组编辑(如CRISPR/Cas9)等技术的日趋完善和成熟,有望从细胞水平或个体水平来深入探究候选基因不同突变类型在细胞层面或个体层面导致的细胞色素化或毛色差异,而不再仅局限于分析某不同毛色的物种中毛色相关基因在其组织中的相对表达量差异,可通过编辑细胞对非模式物种的毛色相关基因进行研究。

目前,对哺乳动物的毛色研究主要体现在两方面:从进化生物学角度探究哺乳动物毛色形成模式的作用和从分子生物学角度探究哺乳动物毛色形成的分子机制,但将二者结合进行研究的相对较少。我们既需要在已知哺乳动物毛色进化意义的情况下,进一步从分子水平层面探究其分子机制(如岩小囊鼠[81]);也需要在已知其分子机制情况下探究其毛色形成的演化意义(如黑色家猪[95])。

此外,人工选择在促进了家养动物毛色多样性的同时,也伴随着部分生理缺陷或疾病的产生,导致出现视觉障碍、听觉障碍、癌症等[117,119,121]。而在人类中,也发现了由毛色相关基因突变引发的类似疾病,比如基因突变常引起眼皮肤白化病I型(OCA1),表现为皮肤、头发和眼睛中的黑色素减少或者丧失,还会伴随着眼球震颤、视力下降的症状[106]。其他毛色相关基因如和能分别导致眼皮肤白化病II、III和IV型的产生[125~127]。因此,对不同哺乳动物类群毛色多态性分子调控机制的揭示,也能够为人们探究人群中某些重大遗传疾病的发病机理提供重要线索和启发。

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Progress on coat color regulation mechanism and its association with the adaptive evolution in mammals

Yuxing Zhang, Hong Wu, Li Yu

The various coat colorations exhibited in different mammalian groups is an attractive biological phenomenon, and is also one of the excellent models for studying and understanding mammalian adaptive evolution. Coat color polymorphism in mammals plays an important role in avoiding predator, predation, courtship, and protection against UV radiation. The coloration of hair or coat in mammal is determined by the quantity, quality and distribution of melanin in the body. Pigmentation in cells is a complicated cell process, including the differentiation and maturation of melanocytes, the morphogenesis of melanosome, the anabolism of melanin and the transportation of melanin in melanocytes. Every stage or phase of pigmentation in cells can always proceed with the participation of some important functional genes. The complex regulatory network formed through interactions between these genes has greatly led to different coat colors. With the coat color polymorphisms, mammals can adapt to various environments. Revealing the genetic basis of different coat colors in mammals has been an important research focus in genetics and evolutionary biology. In this review, we summarize the main advance in molecular mechanisms of pigmentation in cells and the genetic basis of coloration-related adaptations in mammals. Our review is expected to provide new clues for molecular mechanism studies on coat color polymorphism and adaptive evolutions in mammals.

coat color; melanogenesis; genetic basis; adaptive evolution

2020-11-18;

2021-01-12

国家杰出青年科学基金项目(编号:31925006)和国家自然科学基金重大研究计划项目(编号:91731311)资助[Supported by the National Science Foundation for Distinguished Young Scholars (No. 31925006) and the National Natural Science Foundation of China (No. 917313311)]

章誉兴,在读硕士研究生,专业方向:遗传学。E-mail: yuxingzhang2018@163.com

于黎,博士,研究员,研究方向:动物遗传与进化。E-mail: yuli@ynu.edu.cn 吴宏,博士后,研究方向:动物遗传与进化。E-mail: whzxsg@126.com

10.16288/j.yczz.20-390

2021/2/2 16:58:00

URI: https://kns.cnki.net/kcms/detail/11.1913.R.20210202.1335.004.html

(责任编委: 吕雪梅)

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