周恪驰 何长安 纪春学 王辉 张恒
摘 要:本文以实时荧光PCR检测技术为例,对于玉米转基因成分进行分析。在具体处理中,会组建实验来完成阳性质粒、调控元件、目的基因、标记基因等内容的检测,从而积累有价值的数据信息,为后续同类型检测活动的顺利开展奠定基础。
关键词:阳性质粒;转基因成分;荧光PCR检测技术
转基因作物由于抗逆性强或产量高的优点,在全球范围内得以广泛种植。近年来,随着转基因作物种植面积的不断增加,关于其在食品和环境安全等方面存在的争议也越来越多,急需通过加强检测来为监管提供基础数据。荧光PCR技术具有实时动态、灵敏度高、精密度高、定量准确等优点,将其应用到玉米转基因成分检测当中,可以提升检测效率和检测精准度,从而为食品安全性的不断提升奠定基础。
1 实验组建要点
1.1 材料和仪器
在此次实验过程中,所使用到的材料为转基因玉米样品和非转基因玉米样品。而使用到的如下:①Probe q PCR Super Mix,为提升实验结果准确性,需评估合作公司,筛选综合实力最强的公司进行试剂的购买。②核酸蛋白质分析仪,可选择Nanodrop 2000c這一型号,以满足相应的分析需求。③实时荧光PCR扩增仪,选用7300plus型号仪器,使用前做好调试,确保后续活动的顺利推进。④高速台式离心机,结合实际情况进行选择,以满足后续应用要求。
1.2 实验方法
1.2.1 进行DNA提取
在对DNA进行提取时,多使用溴化十六烷三甲基铵来作为提取载体,从而获取到转基因玉米与非转基因玉米的DNA基因组。对于提取后的DNA基因组,也需要利用核算蛋白质分析仪来检测具体浓度,此过程中也会提前将母液稀释到100ng/μl,随后将其放置在定量PCR模板中,并且在-20℃环境中进行保存。
1.2.2 阳性质粒的构建
作为阳性质控的阳性质粒对于转基因检测至关重要,阳性质控的检出属于非常重要的内容,这也是顺利完成转基因检测的基础条件。在具体研究中,根据转基因外源序列的信息构建阳性质粒为核心的标准物质。通过人工合成的方法来合成启动子基因、终止子基因、抗虫基因草丁膦抗性基因和筛选基因的碱基序列,随后也会将其关联在TOPO载体中,借助转化的方式融入到感受态细胞中,等待基因稳定之后,也会依次进行PCR检测处理、酶切处理、基因测序,获取到相应的数据信息,而搭建的阳性质粒也会用作阳性质控,满足后续的应用需求。
1.2.3 实时荧光PCR扩增
完成上述工作后,会对转基因玉米样品中的DNA序列进行荧光PCR扩增处理,所使用到的试剂如下:①Probe q PCR Super Mix共10μL;②正反向引物各1μL;③反应探针1μL;④灭菌双蒸水共计7μL。在实验过程中的反应过程如下,在94℃温度下进行预变性处理,时间长度为10min,随后在94℃温度下进行变性处理,总时长为30s,最后在94℃温度下进行延伸处理,总时长为34s,如此循环处理40次后可以得到目标物。在实验中也会将阳性质粒作为阳性对照,而非转基因玉米的DNA则会作为阴性对照,而灭菌处理后的超纯水和空模板则会作为空白对照,由此来提升统计结果的准确性。
1.2.4 进行数据统计
完成上述工作后,利用实时荧光PCR扩增仪来对扩增后数据进行测量,然后利用分析软件来对扩增数据进行整理,主要以扩增曲线、表格等方式进行展示,从而提高数据统计结果的直观性。
2 实验结果分析
2.1 阳性质粒检测
在此次实验中,会将阳性质粒稀释液作为模板,随后向其中添加调控基因引物、目的基因引物和筛选基因引物,随后利用荧光PCR实验仪来采集相应数据。根据所统计的数据信息可以了解到,相较于其他载体,使用阳性质粒可以更好的和探针与引物进行匹配,可以将其作为转基因玉米样品检测时使用到的阳性对照物,能够基于此获取到更加有效的分析数据。并且和转基因阳性样品的DNA进行对比,所使用到的阳性质粒会作为质控参考,而且利用其对外输出时得到的数据也更加稳定,这样也更加有利于标准化阳性质控活动的推进,得到准确的统计数据信息。
2.2 调控元件检测
在具体实验中,会将转基因玉米样品的DNA组,分别利用启动子(包括pCaMV35S引物、pRice-Actin引物和p FMV35S引物)、终止子引物(包括tNOS引物、tE9引物和tCaMV35S引物)进行处理,待探针完成处理之后,也会借助荧光PCR仪对其进行定量处理,随后对于Ct数值进行求解,常规情况下会将Ct≤35.0作为检出时的判断依据。基于所得到的相关数据可以了解到,利用启动子引物处理的DNA组和终止子引物处理的DNA组中都顺利检出,所得到Ct平均值为29.35±0.13(pCaMV35S基因)、31.23±0.23(pRice-Actin基因)、28.35±0.35(tNOS基因)、30.11±0.21(tCaMV35S基因)、36.75±0.12(p FMV35S基因)和40.32±0.25(tE9基因),由数据可以看出,转基因玉米样品中并不包含p FMV35S基因和tE9基因,但其他基因都包含在内[1]。
2.3 目的基因分析
在目的基因分析过程中,主要目的是筛选抗虫基因(包括Cry1A(c)基因、Cry3A基因)、抗除草剂基因(包括CP4-EPSPS基因、CTP2-CP4-EPSPS基因)、草丁膦抗性基因(Bar基因),查看其在转基因玉米样品中的存在情况。具体实践中会借助荧光PCR仪对其进行定量处理,随后对于Ct数值进行求解,常规情况下会将Ct≤35.0作为检出时的判断依据。根据所得到的检测数据可以了解到,所得到的Ct数值为27.35±0.13(Cry1A(c)基因)、31.23±0.23(CP4-EPSPS基因)、29.35±0.25(CTP2-CP4-EPSPS基因)、36.11±0.21(Cry1A(c)基因)和41.75±0.12(Bar基因),根据数据可以了解到,在转基因玉米样品中,Cry1A(c)基因和Bar基因并没有检出,而其它基因都顺利检出,表示样品中含有这些基因[2]。
2.4 筛选标记基因
在标记基因分析过程中,主要目的是筛选PMI基因、NPTII基因,具体实践中会借助荧光PCR仪对其进行定量处理,随后对于Ct数值进行求解,常规情况下会将Ct≤35.0作为检出时的判断依据。根据所得到的检测数据可以了解到,所得到的Ct数值为33.36±0.21(PMI基因)、42.35±0.45(NPTII基因),根据所得数据可以了解到,在转基因玉米样品中包含了PMI基因,但是没有NPTII基因[3]。
结束语:综上所述,在本文研究中,利用荧光PCR检测法来确定转基因玉米中的基因组成,并且具备了良好的应用效果[4]。通过梳理应用时需要注意的相关内容,不仅可以积累价值数据,而且也为后续检测活动的顺利开展提供了科学参考。
参考文献
[1] 邢珍娟,董立明,龙丽坤,刘娜,夏蔚,谢彦博,李葱葱,李飞武.应用多重荧光PCR快速筛查作物中转基因成分研究[J].玉米科学,2021,29(04):35-42.
[2] 刘双.基于PCR技术的转基因耐除草剂大豆ZH10-6检测方法研究[D].河北农业大学,2020.
[3] 张海波,肖长文,刘冰,张田,张英.玉米转基因成分筛查方法比较[J].黑龙江农业科学,2020(09):78-84.
[4] 于园,刘国强,苏圣淋,罗建兴,郭梁.玉米转基因成分的检测[J].江苏农业学报,2020,36(04):836-841.