宋静,戎建荣
(山西医科大学附属白求恩医院(原名山西大医院)检验科,山西 太原 030000)
碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的感染已严重威胁到公共卫生健康,其检出率呈现逐年上升的趋势。CRE对碳青霉烯类抗生素敏感性下降的主要机制是产碳青霉烯酶[1-2]。本研究是以聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)技术对肠杆菌科细菌耐药基因的检测作为金标准,就mCIM试验对于产碳青霉烯酶肠杆菌科细菌的表型检测的诊断价值作一系统评价,以期为临床微生物实验室工作的开展提供依据。
1.1 文献纳入及排除标准 纳入标准:(1)以mCIM试验与PCR法比较的产碳青霉烯酶CRE的表型诊断试验的文献;(2)研究中以PCR试验为金标准;(3)研究对象为临床收集的对任何碳青霉烯类抗菌药物耐药(即多利培南、美罗培南或亚胺培南最小抑制浓度(minimal inhibitory concentration,MIC)≥4 mcg/mL,或厄他培南(MIC≥2 mcg/mL)或产碳青霉烯酶肠杆菌科细菌。(4)待评价试验为mCIM试验。排除标准:(1)数据报道不完整;(2)无法提取四格表资料;(3)会议交流论文、通讯及信件。
1.2 方法
1.2.1 文献检索 以“enterobac teriaceae”、“carbapenemase”、“PCR”、“mCIM”、“sensitivity”、“specificity”等为检索词检索Pubmed、Cochrane图书馆、EMBASE数据库,并辅以文献追溯、手工检索。以“肠杆菌科细菌”、“改良碳青霉烯类灭活试验”、“碳青霉烯酶”、“PCR”、“灵敏度”、“特异度”等为检索词检索中国CNKI学术总库、万方数据库、中国生物医学文献数据库(CBM)。检索起始时间为2015年1月1日-2019年6月16日。
1.2.2 文献筛选 由两名研究者分别阅读所获文献的题目和摘要,在排除不符合纳入标准的研究后,对可能符合纳入标准的研究进行全文详细阅读,共同商榷是否真正符合纳入标准。
1.2.3 资料提取 提取资料主要包括:作者、年代、国家、纳入样本数、菌种及相关基因型,诊断参数(真阳性值TP、假阳性值FP、假阴性值FN、真阴性值TN)。
2.1 文献检索结果 经初步筛选,8篇来自中国知网,1篇来自万方,19篇来自CBM。检索EMBASE 10篇,Cochrane 1篇,Pubmed 7篇,重复文献15篇,排除不符合纳入标准1篇,剩余文献31篇进行全文复筛。进一步分析排除:未提供敏感性和特异性数据的研究15篇,资料类型不符的有3篇,对mCIM试验进行改良的文献有3篇,最终入选的合格的文献为8篇。
2.2 纳入文献基本特征及质量评价 Meta分析纳入的8篇文献均为2017年-2019年出版,其中7篇来自中国,一篇来自美国。通过文中数据可直接得到或计算出真阳性(TP)、假阳性(FP)、假阴性(FN)和真阴性(TN)例数,纳入研究基本特征见表1。
临床适用性(applicability concerns)方面,“patient selection”与“index test”偏倚方面所纳入文献均为低风险,“reference standard”低偏倚文献所占比例较大87.5%。说明本研究所纳入的文献质量总体质量较佳。
本研究结果显示分别在中英文共6个数据库进行连续4年相关文献的检索。最终纳入8篇文献,文献都集中在2018年发表。对纳入研究的文献采用QUADAS-2进行质量评估,结果显示:临床适用性(applicability concerns)方面,“patient selection”与“index test”偏倚方面所纳入文献均为低风险,“reference standard”低偏倚文献所占比例较大87.5%。说明本研究所纳入的文献质量总体较佳[3-8]。
本研究的meta-disc分析结果显示,纳入的8篇文章中,提示mCIM为阴性时肠杆菌科细菌不产碳青霉烯酶的可能性大;DOR合并=1402.35(95%CI:431.00-4562.84);SROC AUC=0.9984,提示mCIM对于产碳青霉烯酶肠杆菌科细菌表型检测的诊断效能很高。
综上所述,当前研究显示mCIM对于产碳青霉烯酶CRE的检测具有很高的敏感度、特异度及准确性,临床微生物实验室可以通过严格遵守CLSI操作指南,尽可能减少认为因素误差来提高检测的敏感性及特异型,可有效辅助临床开展对CRE的早期筛查。