蒙古族人MicroRNA-149 和196a2 单核苷酸多态性肝细胞癌易感性

2020-07-04 01:43徐海霞李心红
昆明医科大学学报 2020年6期
关键词:核苷酸缓冲液危险性

徐海霞,李心红

(内蒙古医科大学附属医院放疗科,内蒙古呼和浩特 010060)

肝细胞癌(hepatocellular cancer,HCC) 是目前全球第二大癌症死亡原因。在肝细胞癌患者中,约50%与肝炎有关肝细胞癌(HCC) 目前是全球第二大癌症死亡原因[1-2]。MiRNA 为19-24nt 短核苷酸序列,可与多个靶序列互补结合。单核苷酸多态性(SNPs) 是遗传多态性的常见变异,被认为是预测癌症风险的潜在生物标志物[3-5]。如果miRNA基因发生变异,可能会影响成熟miRNA 的质量和数量,甚至影响到被改变的miRNA 调控的数百个靶基因。因此,miRNA 单核苷酸多态性由pri-miRNA 单核苷酸多态性和pre-miRNA 单核苷酸多态性组成,分别位于miRNA 基因500~3 000 bp 和60~70 bp 区域[6]。

到目前为止,已有报道认为miRNA 单核苷酸与胃癌、食管癌、乳腺癌和神经母细胞瘤等多种肿瘤相关[7]。本研究对蒙古族人肝细胞癌发展中的miR-196a2 rs2910164,miR-149 rs2292832 的多态性进行了分析,以期望能够对于肝细胞癌的预防及诊断提供可靠的参考依据。

1 资料与方法

1.1 材料

主要试剂:血液DNA 提取试剂盒购自天根生物公司。PCR 试剂盒购自全式金生物公司。

1.2 研究对象

蒙古族肝癌患者均来自于内蒙古医科大学属医院2018年10月至2019年12月。各个盟市来内蒙古医科大学附属医院的蒙古族80例肝细胞癌患者和蒙古族60例对照受试者是在我医院进行体检后随机选择。每一名受试者均签署书面知情同意书。所有工作均在护士的帮助下完成。

1.3 方法

1.3.1 血液DNA 的提取DNA 的提取按试剂盒说明书操作。简单来说就是,取200 μL 的血液,加入200 μL的缓冲液肯20 μL的蛋白酶K,56℃消化10 min,期间混匀数次,直至溶液变清亮。室温静置3 min 然后加入350 μL的BD 缓冲液,混匀,倒入吸附柱CG2 中,13 400 g 离心30s,倒掉收集管中的液体。再加入500 μL的缓冲液GDB,13 400 g离心30 s 倒掉收集管中的液体。加入600 μL的漂洗液,13 400 g 离心30 s 倒掉收集管中的液体,重复此步骤,然后加入100 μL的洗脱液,13 400 g 离心2 min,收集液体保存。

1.2.2 基因检测引物序列(表1):所有引物由上海生工程合成。

表2 酶切位点Tab.2 Restriction sites

然后进行PCR 反应。PCR 反应过程为,95℃5 min,(95 ℃30 s,56 ℃30 s,72℃30 s) 35个循环,72 ℃40 min,4℃保存。

1.2.3 基因分析根据不同酶切位点进行酶切分析,所有酶切均在37℃下进行。酶切后进行电泳。

1.3 统计学处理

所有统计分析均由SPSS 软件完成。绝对变量表示为频率和百分比。分别通过双尾studentt检验和χ2检验对连续变量与绝对变量间的不同进行分析。显著水平为P<0.05。

2 结果

SNP 位点均采用PCR 产物酶切,依据电泳图可得到(图1) miR-196a2 rs11614913,CC 为202 bp,CT 为202 bp+50 bp,TT 为50 bp。miR-149 rs2292832,CC 为135bp,CT 为135 bp+40 bp,TT为40 bp。

本研究的肝细胞癌患者和对照受试者登记录入。肝细胞癌和对照受试者年龄、性别吻合度的P值(0.66 和1.00) 均大于0.05。

对 照 组 miR-196a2 rs11614913,miR-149 rs2292832 的基因型分布符合哈迪-温伯格平衡定律,人口的抽样合格。miR-196a2 rs11614913 的TT 基因型和T 等位基因与CC 基因型相比,肝细胞癌危险性分别增加了2.26 倍和1.50 倍,见表3。

miR-196a2 rs11614913 的多态性和肝细胞癌危险性之间的关系没有受到年龄、性别,饮酒与否,居住地区,肿瘤大小等影响,见表4。

图1 miR-196a 和miR-149SNP 酶切电泳图Fig.1 miR-196a and miR-149SNP digestion electrophoresis

表3 miR-146a rs2910164,miR-149 rs2292832 多态性与肝细胞癌危险性之间的关系Fig.3 The relationship between miR-146a rs2910164,miR-149 rs2292832 polymorphism and the risk of hepatocellular carcinoma

表4 人口统计及临床特征Tab.4 Demographics and clinical characteristics

3 讨论

肝癌是世界上第二常见的恶性肿瘤,据估计每年有782 500例新发病例和745 500例死亡病例报告,其中50%以上来自中国[2,8]。miRNA 在真核生物中保存良好,被认为是基因调控的重要组成部分[9-11]。新的研究表明miRNA 参与了多种生物学过程,包括发育、分化、细胞生长和凋亡[10,12]。本研究发现肝细胞癌危险性增加与miR-196a2 rs11614913 的TT 基因型和T 等位基因有明显的相关性[7,13]。有报道称,肝癌患者中miR-196a2(rs11614913) 基因型的频率有显著差异[6]。据报道,miR-196a2 基因型分布与正常对照组相比有显著性差异(C >T);发现miR-196a2cc 基因型和C等位基因在中国人肝癌发病中有重要作用,尤其是在 HBV 感染患者中研究表明 miR-196a2 rs11614913 的多态性可以作为肝细胞癌的诊断标记[8,14-16]。有 较 多 研 究 发 现miR-196a2 rs11614913的多态性与几种癌症,如胃癌、肺癌、结肠癌、乳腺癌和肾癌的危险性显著相关,但是结果不太一致[3]。miR-196a2 rs11614913 的多态性与胃癌危险性不相关。有研究发现,miR-196a2 rs11614913 影响肺癌的易感性[6]。在印度人中做了研究,多元统计分析显示miR-196a2 rs11614913 的多态性使绝经后的妇女乳腺癌危险性增加了3.2 倍[4]。本研究为临床诊断蒙古族肝癌的诊断奠定基础。

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