PubMed数据库中参考文献题名引用和著录存在问题及分析

齐 烨，郑雨田，李 娜，芦 洋

(天津市第三中心医院生物医学工程与临床编辑部 天津300170)

参考文献是一篇完整的科技论文不可缺少的组成部分，是作者在学术研究中，对某一著作或论文整体的参考或借鉴，是对前人学术研究尊重的表现，同时也可为读者提供进一步查询资料或信息的线索。PubMed 数据库是目前国际公认的检索生物医学和生命科学领域文献的权威性数据库，旨在提供科研领域信息[1]。为确保编校质量，在编辑工作中，应十分关注稿件中参考文献的把关与核查。因此，利用PubMed 数据库中信息查对稿件参考文献，是编辑工作的一项重要内容。但笔者在编辑工作中发现，PubMed 数据库在收录文献基本信息时，部分存在著录的文章题名与实际内容不一致的情况，原因可能是对一些特定词语使用替代性处理[2]，这需要编辑查对原始文献并予以修改。现针对笔者利用PubMed 数据库查对参考文献时，在题名方面容易出现的不一致问题及其表现进行介绍和归纳，有助于减少错误著录的发生。

1 正斜体的核定

科技期刊中外文字母的应用较普遍，一些名词术语、符号的正、斜体常具有特定意义，这使得规范书写显得十分重要。然而PubMed 数据库中的文献题名多采用正体，导致参考文献存在著录不一致情况。编辑在查对时应特别留意，有针对性地查询原始文献并予以修改。

1.1 拉丁文名

一些拉丁词如 via(通过)、vs(相对)、in vitro/ ex vivo(体外)、in vivo(在体)、in situ(原处)，以及衍生词 In silico(于电脑中)需要用斜体表示。例如，某投稿文章引用一篇涉及羟基磷灰石生物活性体外评价的参考文献，该文献标题中的 in vitro 在作者原稿和PubMed 数据库[3]中均采用正体表达，而发表在Biomaterials 杂志中的原始文献[4]则以规范的斜体形式呈现。

1.2 生物物种的学名

目前，生物学名通常采用“双命名法”规则，其主要结构为：属名+种名+命名人。其中，属名应斜体书写，且首字母大写；种名采用斜体书写，全部为小写；命名人姓名需正体书写[5]。

在细胞分化和器官发育的研究中，题名常出现动植物学名。例如，一篇关于秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)转化的RNAi 载体构建方法的参考文献，该文献标题中的Caenorhabditis elegans在作者原稿和 PubMed 数据库[6]中均采用正体表达，而发表在 Nature 杂志中的原始文献[7]则以规范的斜体形式呈现。在免疫学文献题名中，经常出现微生物的学名。例如，一篇关于耐药金黄色葡萄球菌(Enterococcus faecium)感染的参考文献，该文献标题中的Enterococcus faecium 在作者原稿和PubMed 数据库 [8] 中均采用正体表达，而发表在Pharmacotherapy 杂志中的原始文献[9]则以规范的斜体形式呈现。

1.3 限制性内切酶

基于内切酶来源的微生物学名命名规则，内切酶前3 个字母采用斜体(第1 个为内切酶来源的微生物属名首字母需大写，其后 2 个为微生物种名需小写)，后面的字母(通常为该变种或品系名称)和编码(同一种微生物多种内切酶时便于分离)正体平排，如：BamHⅠ、HindⅢ、Sau3AⅠ等[10]。

1.4 基因和蛋白质

根据遗传学趋势(trends in genetics，TIC)遗传命名指南规定[11]，不同物种有不同的命名规则，但一般来说，基因名称应写成斜体，蛋白质名称与对应的基因/等位基因的名称相同，则采用正体。大小写常用于区分不同物种：一般地，对于小鼠、大鼠，基因名称首字大写，其余小写；对于人类、非人类灵长类动物/家畜，基因名称均使用大写字母；对于细菌、斑马鱼基因符号用 3 个小写字母表示；对于果蝇、豌豆，基因符号小写表示隐性突变基因，首字母大写表示显性突变基因。笔者曾编辑一篇关于基因突变的参考文献，该文献标题中的人 BTK 基因在作者原稿和 PubMed数据库[12]中均采用正体表达，而发表在 Gene 杂志中的原始文献[13]则以规范的斜体形式呈现。

1.5 化学符号

化学中表示旋光性、分子构型、取代基位置和异构体等符号应用斜体排版，并在其后加半字线，置于化合物名称前。例如，物质旋光性采用左旋 l-、右旋d-表示，官能团在有机化合物位置可以通过临位 o-、对位 p-表示，其他还包括反式 trans-、顺式 cis-。另外，在化合物表示中，共聚物连接用-co-来书写。例如，一篇关于化合物消旋体的参考文献，该文献标题中的 poly(D，L-lactic-co-glycolic acid)在作者原稿和PubMed 数据库[14]中均采用正体表达，而发表在Tissue Engineering Part A 杂志中的原始文献[15]则以规范的斜体形式发表。

1.6 医学统计学符号

统计学符号采用斜体书写，如t 检验、F 检验，概率 P，标准差 s 及相关系数 r 等。笔者在编辑加工过程中，曾查对过一篇关于线性回归模型显著性检验方面的参考文献，该文献标题中的F-test 在作者原稿和PubMed 数据库[16]中均采用正体表达，而发表在Statistics in Medicine 杂志中的原始文献[17]则是以正确的斜体形式呈现。

1.7 变量符号

在生物医学科技论文题名中，以斜体形式呈现的情况还包括表示物理量的符号、特征数符号(雷诺数Re、傅里叶数 Fo、格拉晓夫数 Gr、普朗特数 Pr)、数学符号表示变量(变量、坐标系符号、视为常数的参数、函数、矢量和矩阵符号等)的书写[18]，这些虽暂未出现在笔者查对的参考文献中，但在编校时也应予以注意，以免出现错误使用。

2 上下角标的核定

正确使用上下角标符号对读者快速、准确理解书稿内容起到画龙点睛的作用。笔者通过分析上下角标的编辑规范，在期刊中正确标注，对普及国家标准起到推动作用。

2.1 化学式

化和物分子式中表示某种元素原子个数，应标注在相应元素之后并以下角标形式表示，如：乙醇C2H6O。编辑曾收到一篇涉及镁合金材料的参考文献，该文献题名中碳酸镁(MgCO3)在作者原稿和PubMed 数据库[19]中均以错误形式 MgCO3 出现，而发表在Journal of Biomedical Materials Rresearch 杂志中的原始文献[20]原子个数则以正确的下角标形式呈现。

2.2 化合物名称

在一些化合物中会使用不同阿拉伯数字区分同一家族间不同成员，例如维生素 B 族有 12 种以上，主要有维生素(vitamin)B1、维生素 B2、维生素 B6等。该化合物中数字的表示应标注在字母之后并以下角标形式出现。

2.3 物质阴阳性

在一些名词术语中，加号(+)代表是该细胞含有某种物质分子表达，是阳性；减号(-)就是没有检测到某种物质，是阴性。无论该物质为阳性还是阴性，加号、减号均位于该物质后，且以右上角标形式呈现，例如干细胞Lgr5+ve。某作者文章引用一篇涉及表面阳性表达 CD4，CD25 T 细胞的参考文献，该文献标题中的 CD4+CD25+FOXP3+Treg 在作者文章原稿和 PubMed 数据库 [21] 中均以错误形式CD4+CD25+FOXP3+Treg 出现，而发表在 Cellular Physiologu and Biochemistry 杂志中的原始文献[22]阳性加号则以规范的上角标形式呈现。

2.4 离子符号

在元素符号右上角表示出离子所带正、负电荷数的符号。其中正电荷为+号，负电荷用-号表示。原子量用阿拉伯数字表示，以右下角标形式呈现，放在该元素符号后，如：SO42-，NH4+。例如，某作者文章引用一篇涉及铝离子对大鼠骨形态影响的参考文献，该文献标题中的 Al3+在作者文章原稿中和 PubMed 数据库[23]中均以错误形式 Al3+出现，而发表在 ASAIO Transactions 杂志中的原始文献[24]离子所带正电荷符号则以规范的上角标形式呈现。

2.5 同位素符号

原子量用阿拉伯数字表示放在该元素前，以上角标形式呈现，在核素中最常见，如碘的一种放射性同位素131I，放射性核素18F。还有一种形式多为存在于同位素标记的化合物，如氢质子波谱1H-MRS。某作者文章引用一篇涉及不稳定同位素锝(99mTc)在异位甲状旁腺肿瘤定位诊断的参考文献，该文献标题中的99mTc 在作者文章原稿和 PubMed 数据库[25]中均以错误形式出现，而刊载在European Journal of Nuclear Medicine and Molecular Imaging 原始文献[26]上则以规范的上角标形式呈现。

2.6 受体亚型

一种受体应该根据其内源性激动剂来命名，可以用该受体激动剂的缩写，如果有确凿证据可以把一些受体进一步分类时，可以用数字、字母下标的形式表示受体的不同亚型。某作者文章引用一篇涉及血管加压素受体拮抗剂的参考文献，该文献标题中的V1a/V2在作者文章原稿和 PubMed 数据库[27]中均以错误形式V1a/V2 出现，而刊载在 Neurocritical Care原始文献[28]上则以规范的下角标形式呈现。

2.7 影像技术

在医学影像稿件中，经常遇到名词术语使用不规范情况，特别是MRI 扫描序列的表示，阿拉伯数字应以下角标形式书写，如：T1WI。笔者曾编辑一篇涉及MRI 技术评价心肌功能的参考文献，该文献标题中的T1-mapping 在作者文章原稿和PubMed 数据库[29]中均以错误形式 T1-mapping 出现，而刊载在 Eur Heart Journal Cardiovascular Imaging 原始文献[30]上则以规范的下角标形式呈现。

3 特殊符号的核定

3.1 字母的混用

生物医学工程稿件中细胞因子、基因名称等常出现希腊字母，根据其生物学性质不同，肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor，TNF)包括 TNF-α、TNF-β，干扰素(interferon，IFN)可分为 IFN-α、IFN-β 及 IFN-γ，淋巴毒素(lymphotoxin，LT)可分为 LT-α、LT-β。例如，某作者文章引用一篇涉及Toller 样受体介导信号传导通路的参考文献，在该表题中的希腊字母κ 在作者文章原稿和 PubMed 数据库[31]中均以错误形式NF-kappaB 出现，而发表在 Nature Immunology 原始文献[32]上则以正确形式 NF-κB 呈现。

3.2 符号的遗漏

国外产品在中国国内正式注册后，会用®表示已经注册过商标的意思。R 是英文 register(注册)的第一个字母。生物工程类稿件中，偶尔会遇到注册商标丢失的情况。例如，一篇关于引用使用肝素涂层透析滤器的参考文献，该文献标题中的肝素涂层滤器Genius 在作者原稿和 PubMed 数据库[33]中均未标明注册符号，而发表在Nephrol Dial Transplant 杂志中的原始文献[34]则以规范的产品名称+注册符号的上角标形式呈现。

4 结 语

PubMed 数据库是生物医学科技工作者获取科研信息的重要途径，为相关研究工作的开展提供特定的文献资料。由于数据库应用系统设计存在弊端，其在收录、加工处理信息时对一些特定词语会给予与原文献有别的处理，通常表现在文章题名上，会出现错误的著录形式。这些问题常常被文献引用的作者忽视，而导致引用错误。编辑在编校工作中应给予足够的重视，持有严谨的科学态度，利用互联网和数据库等平台仔细查询源文献，及时核定和更正，避免留下编校差错，以提高论文水平和期刊质量。