在《自然·遗传学》发表的一项新研究中,来自美国农业部农业研究局和博伊斯·汤普森研究所等机构的研究人员绘制了人工栽培和野生西红柿的基因组图谱。该团队标记了近5000个以前未知的基因,将人工栽培西红柿的基因组与野生西红柿的基因组进行比较,并获得不少有趣的发现。
2012年科学家首次对普通栽培西红柿进行基因组测序,测序的西红柿品种为Heinz 1706。这项新工作将这种观点扩展到所有定期种植的番茄品种及其“近亲”的完整基因组。这包括来自725个品种的西红柿的所有基因,在此过程中,该团队发现了额外的4873个基因,这些基因未包括在Heinz 1706基因组中。
将人工栽培的西红柿与其野生对应物进行比较,研究人员注意到通常在超市中购买的西红柿丢失了数千种基因。在追求能够以更快的速度获得更大、更多西红柿的过程中,种植者似乎放弃了味道等特性。
“构建这种泛基因组最重要的发现之一是标记为TomLoxC的罕见基因形式,其DNA基因启动子的版本大多不同,”该论文的共同作者James Giovannoni在一份声明中说。“该基因通过催化许多脂质-挥发物的生物合成来影响水果的味道,而这些化合物容易消失。”根据测试,研究人员认为,这种与味道有关的基因仅存在于2%的人工栽培西红柿中,而在超过90%的野生西红柿中发现。
研究人员表示,获取如此多西红柿品种基因组的详细数据,将有助于育种者栽培更美味的作物并保留基因。