王喜娜 王敏 孔繁芳 王忠跃 张昊
摘要
葡萄霜霉病是葡萄最重要的病害之一,目前防治霜霉病主要依赖化学药剂,其中羧酸酰胺类杀菌剂是一类重要药剂,然而病原菌抗药性对其防效有重要影響。2015年本实验室首次在中国检测到抗烯酰吗啉的葡萄霜霉菌,并开发了TetraPrimer ARMS PCR快速检测法来检测抗药性。本研究利用此技术对采自山西省清徐县60株葡萄霜霉菌进行了烯酰吗啉抗性检测,结果显示其中1株具有抗药性,其他59株均为敏感菌株,说明该地区霜霉菌已经开始产生烯酰吗啉抗性,但尚未大范围扩展,需要进行持续监测以指导杀菌剂的使用,这也是首次报道山西省葡萄霜霉菌存在烯酰吗啉抗性菌株。
关键词
葡萄霜霉菌; TetraPrimer ARMS PCR技术; 烯酰吗啉; 抗药性
中图分类号:
S 436.631.1
文献标识码: A
DOI: 10.16688/j.zwbh.2017090
Identification of the dimethomorphresistant isolates of Plasmopara
viticola populations in Qingxu, Shanxi Province
WANG Xina1, WANG Min2, KONG Fanfang1, WANG Zhongyue1, ZHANG Hao1
(1. State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases and Insect Pests, Institute of Plant
Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100193, China;
2. Shanxi Academy of Agricultural Sciences Pomology Institute, Taiyuan 030031, China)
Abstract
Grape downy mildew is one of the most important diseases of grape. Chemical control is the most effective strategy for controlling this disease so far and carboxylic acid amide (CAA) fungicides are the main agents. However, the efficacy of CAAs in the field is limited due to developmental resistance of pathogen. In 2015, we detected dimethomorphresistant Plasmopara viticola in China for the first time and developed the TetraPrimer ARMS PCR method for dimethomorphresistance detection. Based on this method, 60 isolates of P.viticola collected from Qingxu County of Shanxi Province were identified.The results showed that one strain was resistant to dimethomorph and the others were all sensitive, indicating the presence of dimethomorphresistant P.viticola in this region. Although the low resistance frequency suggested that the resistance allele had not spread widely, continuous monitoring is required for the use of fungicides. This is also the first report of dimethomorphresistant strains of P.viticola in Shanxi.
Key words
Plasmopara viticola; tetraprimer ARMS PCR; dimethomorph; fungicide resistance
葡萄霜霉病是由葡萄单轴霜霉Plasmopara viticola (Berk et Curtis) Berl.et de Toni引起的。该病原菌为专性寄生菌[1],属于卵菌门、卵菌纲、霜霉目、霜霉科、单轴霉属[2]。葡萄霜霉菌可以侵染葡萄的任何绿色部分或组织,如叶片、嫩梢、幼果等,造成品质降低、产量下降,严重时绝产绝收,对我国的葡萄种植业和葡萄酒酿造业产生严重影响[3]。目前,葡萄霜霉病的防治措施有:选用抗性品种、预报预警、化学防治、生物防治、切断侵染途径的避雨栽培措施等,其中化学防治是最主要的防治手段。
羧酸酰胺类杀菌剂是防治霜霉病的主要化学药剂之一,是一类单靶标位点的化学农药,包括烯酰吗啉、双炔酰菌胺和氟吗啉等,其中烯酰吗啉是该类杀菌剂中最早被研发成功并投入市场的。研究发现烯酰吗啉对霜霉病有特效且与甲霜灵和苯酰胺类杀菌剂无交互抗性,因此被广泛使用[4]。羧酸酰胺类杀菌剂主要作用机理是抑制孢子囊形成。纤维素合酶3(CesA3)是其作用的靶标[5]。目前,葡萄霜霉菌对羧酸酰胺类杀菌剂的抗性机制已经明确,抗性菌株CesA3基因的1105位密码子出现单碱基突变[6]。
葡萄霜霉病对杀菌剂的抗性检测通常采用叶盘法[7],这种方法存在检测周期长、效率低、工作量大且稳定性差等缺点。随着对羧酸酰胺类杀菌剂抗性机制的解析,采用分子方法进行病原菌对其抗性频率检测成为可能。基于引起羧酸酰胺类杀菌剂抗性的单核苷酸点突变,Aoki等报道了PCRRFLP方法[8],显著提高了检测效率,但此方法也存在一些固有的弊端,比如在聚合酶链式反应扩增后需要一步额外的限制性内切酶溶解来区分抗药型和敏感型等位基因。针对这一问题,本实验室建立了基于抗性突变的Tetraprimer ARMS PCR检测法[9],该方法在一个聚合酶链式反应中加入两对引物,
其中一对为针对抗性和敏感等位基因的内引物,另一对为外引物。在反应中外引物和内引物可以相互反应扩增出不同长度的产物并通过凝胶电泳将其区分。Tetraprimer ARMS PCR方法可以通过一个反应区分抗性和敏感的纯合子菌株以及敏感杂合子,快速准确。
病原菌对杀菌剂的抗性频率监测对于指导田间杀菌剂的合理使用、提高防效具有重要意义。近年来,由于化学药剂的连续频繁使用,病原菌抗药性越来越强,导致防效逐年下降,严重影响我国葡萄产业的发展[10]。Tetraprimer ARMS PCR是目前检测葡萄霜霉菌对烯酰吗啉抗性最简便高效的方法之一,利用该方法,本实验室于2015年在我国广西首次检测到了烯酰吗啉抗性菌株,但其他产区的抗性情况尚不明确。本研究利用此方法对2016年采集自山西省清徐县葡萄霜霉菌进行了烯酰吗啉抗药性检测,研究结果将为该地区防治葡萄霜霉病的杀菌剂的合理使用及霜霉菌抗药性治理措施的制定提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 供试菌株的纯培养
供试葡萄霜霉病菌株于2016年采自山西省清徐县马峪乡西迎南风村的‘龙眼葡萄品种。田间采集新鲜、未使用杀菌剂的发病叶片,用无菌水冲洗3~4次后将叶背面向上置于1%的水琼脂培养基上,放于温度为21℃,光照条件为L∥D=16 h∥8 h,湿度为100%的光照培养箱内保湿培养,待重新长出新鲜菌丝之后,在显微镜下挑取单孢子囊,将其接种在直径为15 mm的‘里扎马特叶盘上,然后置于培养箱中保湿培养,待叶盘上重新长出的新鲜霉层即为纯培养的葡萄霜霉菌,将采摘的60株菌株均进行单孢分离纯培养。
1.2 DNA的提取
用小毛刷将纯培养的霉层刷至2 mL离心管中,置于-80℃冰箱冻存24 h后放于55~80℃烘箱中将其烘干。在干燥后的菌丝体内加入适量的石英砂和玻璃珠,后将其放入MiniBeadbeater96研磨仪模块,加入液氮冷冻,装入研磨仪研磨1 min。将研磨好的菌丝利用OMEGA公司的EZ96真菌基因组DNA提取试剂盒(D339002)提取DNA。
1.3 Tetraprimers ARMS PCR检测抗药性
引物[9]Cesa3OF: 5′GCACAGCAGACATGGTTTTCCTT3′,Cesa3OR:5′GTCCAAAAGTGCAAAGTCCAACG3′,Cesa3IW:5′TACCTTTACGGCAAATGTGTGCG3′,Cesa3IM:5′GACAATGTAGACAACCAGCAACGATCT3′。两条外引物Cesa3OF与Cesa3OR用来扩增敏感菌株与抗性菌株等位基因,目的条带612 bp,Cesa3IW针对敏感菌株等位基因,与Cesa3OR一起扩增可得到238 bp的目的条带,Cesa3IM针对抗性菌株等位基因,与Cesa3OF一起扩增可得到378 bp的目的条带。
PCR体系(20 μL):10 mmol/L TrisHCl,(pH 8.3),50 mmol/L KCl,1.5 mmol/L MgCl2,200 μmol/L dNTPs,引物Cesa3OF和Cesa3OR各0.25 μmol/L,引物Cesa3IW和Cesa3IM各0.5 μmol/L,0.5 unit聚合酶(TaKaRa, Japan),20 ng基因组DNA。
PCR反应体系:95℃预变性2 min;95℃变性30 s, 63℃退火30 s,72℃延伸30 s,30个循环;最后72℃延伸5 min。PCR产物用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测。
2 结果与分析
将分离自山西省清徐县的60株样本进行纯培养后提取其DNA。采用Tetraprimer ARMS PCR檢测其对烯酰吗啉的抗性。结果显示有59株同时含有612 bp和238 bp的扩增条带,只有一株样本同时含有612 bp和378 bp的扩增片段。
本实验室前期研究[9]显示,同时含有612 bp和238 bp以及同时含有612 bp和378 bp的菌株均为纯合体,同时含有612 bp、238 bp及378 bp的菌株为杂合体。本实验室通过传统叶盘法验证了纯合的突变体对烯酰吗啉具有抗性,而具有敏感等位基因的纯合体和杂合体对烯酰吗啉是没有抗性的。山西省清徐县的60株样本均为纯合体,其中59株含有葡萄霜霉菌纤维素合酶3的敏感等位基因,其对烯酰吗啉敏感、无抗性,1株菌株对烯酰吗啉具有抗性,这说明虽然该地区的抗性频率不高,但已经出现对烯酰吗啉具有抗性的葡萄霜霉菌株。
3 讨论
葡萄霜霉病是葡萄种植中的重要病害,几乎存在于我国所有的葡萄生产园中,由于目前抗病的栽培品种较少,所以控制葡萄霜霉病主要依赖杀菌剂。然而,随着杀菌剂的连续频繁使用,葡萄霜霉菌逐渐产生抗药性,导致杀菌剂防效下降。烯酰吗啉在20世纪80年代开始投入市场,1994年Chabane等在法国葡萄园中首次发现了抗烯酰吗啉的葡萄霜霉菌菌株[10],随后在意大利、瑞士等国也相继发现抗性菌株[7,11],抗性产生初期,由于抗性频率较低,并未明显影响防效,但随着羧酸酰胺类杀菌剂种类和使用量不断增加,菌株抗性频率急剧上升[12]。1996年烯酰吗啉在中国登记,至今已经使用20多年,是我国葡萄霜霉病防治最主要的杀菌剂之一。在中国,葡萄霜霉菌杀菌剂抗性相关研究较少,2010年Sun等对采自全国7个省11个地区的葡萄霜霉菌进行烯酰吗啉敏感性测定,未发现抗性菌株[13]。至2016年中国未见有关葡萄霜霉菌对烯酰吗啉具有抗药性的报道。2015年本实验室在广西资源县的葡萄霜霉菌菌株中发现了对烯酰吗啉具有抗药性的菌株,这是国内首次关于葡萄霜霉病菌对烯酰吗啉具有抗性的报道[9],但我国其他葡萄产区,是否存在抗性菌株,抗性频率如何尚不清楚。抗药性的产生严重影响了药剂的选择,因此,检测葡萄霜霉菌的抗性频率对于田间杀菌剂的合理使用具有指导作用。
葡萄霜霉菌為专性寄生菌,它的生长需要寄主,培养条件较为严苛,用传统方法检测其抗性频率,既耗费时间且其结果易受培养条件和药剂质量的影响。随着部分杀菌剂抗性机制的明确,分子检测技术被广泛应用于抗性频率的检测,比如突变阻滞扩增系统(ARMS)、PCRRFLP等[1417]。本实验室在前期工作中,根据已报道的引起烯酰吗啉抗性的突变位点,开发了Tetraprimer ARMS PCR检测方法,在一个反应中运用两对特异引物进行扩增,通过扩增的片段大小来区分抗性菌株和敏感菌株的等位基因,该方法快速简单,精确省时,并且通过叶盘法进行验证,准确率达到100%[9]。
烯酰吗啉属于低中等抗性风险的药剂,抗烯酰吗啉菌株出现后,若连续单独使用羧酸酰胺类杀菌剂数年,抗性频率将急剧上升至近100%,其防效可能会完全丧失,但停止使用两年后,抗性频率会迅速下降。因此抗药性监测是指导此类杀菌剂的合理使用,对抗性群体进行有效治理以延长杀菌剂使用寿命的有效手段。本试验所用的60株菌株中,检测到一株抗性菌株,且未出现杂合菌株,表明该地区存在对烯酰吗啉具有抗性的菌株。这一结果说明在此地区,烯酰吗啉仍然具有优秀的防效,推荐作为霜霉病的防治药剂。对于抗性菌株的出现,虽然抗性频率较低,并未影响烯酰吗啉的防效,但仍然应该引起足够重视,对抗性频率进行连续监测,在抗性频率上升时,及时采取轮换用药措施,防止抗性基因的扩展及抗性频率的进一步上升,以减少霜霉病造成的损失。
参考文献
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(責任编辑:杨明丽)