qRT-PCR快速检测汉滩病毒抗体中和活性实验方法的建立

2017-11-06 01:24张晓晓张尧冯伟程林峰王芳应旗康马瑞雪马铁军刘梓谕刘蓉蓉张亮叶伟张芳琳徐志凯吴兴安
生物技术通讯 2017年4期
关键词:病毒感染微量单抗

张晓晓,张尧,冯伟,程林峰,王芳,应旗康,马瑞雪,马铁军,刘梓谕,刘蓉蓉,张亮,叶伟,张芳琳,徐志凯,吴兴安

第四军医大学 a.微生物学教研室;b.学员旅;陕西 西安 710032

qRT-PCR快速检测汉滩病毒抗体中和活性实验方法的建立

张晓晓a,张尧b,冯伟b,程林峰a,王芳a,应旗康a,马瑞雪a,马铁军a,刘梓谕a,刘蓉蓉a,张亮a,叶伟a,张芳琳a,徐志凯a,吴兴安a

第四军医大学 a.微生物学教研室;b.学员旅;陕西 西安 710032

目的:建立一种基于qRT-PCR的微量细胞中和实验改良法,快速、定量检测汉滩病毒感染中的中和抗体活性。方法:将本室前期制备的抗汉滩病毒高中和活性鼠源性单抗3G1、鼠/人嵌合单抗1D9和感染剂量为100 TCID50的病毒混合液于37℃孵育1h后感染Vero-E6细胞,提取细胞总RNA。根据GenBank数据库中汉滩病毒76-118株S基因序列设计特异性引物,在上述实验基础上以细胞总RNA为检测样品,建立qRT-PCR快速、定量检测汉滩病毒感染中中和抗体活性的实验方法。结果和结论:建立了一种基于qRT-PCR的微量细胞中和实验改良法,可定量测定汉滩病毒感染中的中和抗体活性,该法具有快速、灵敏、特异和重复性好等优点。

汉滩病毒;qRT-PCR;中和抗体;微量中和实验;肾综合征出血热

汉滩病毒(Hantaan virus,HTNV)属于布尼亚病毒科(Bunyaviridae),汉坦病毒属(Hantavirus),是一种分节段的负链RNA病毒。基因组分为L、M、S三个片段,分别编码病毒的RNA聚合酶、包膜糖蛋白(glycoprotein,GP,包括Gn和Gc)和核衣壳蛋白(nucleocapsid protein,NP)[1]。在临床上主要引起以发热、出血、急性肾功能损害和免疫功能紊乱为突出表现的肾综合征出血热(hemorrhag⁃ic fever with renal syndrome,HFRS)[2]。我国是世界上HFRS疫情最严重的国家,该病具有流行范围广、发病人数多、病死率高等特点。由于HFRS的宿主广泛,传播途径多,迄今临床上尚缺乏特异有效的治疗药物,因此其防治任务十分艰巨。而特异性疫苗是目前预防HFRS的最主要措施之一[3],因此准确、高效地测定其中和抗体效价成为评价疫苗有效性以及检测人群对HTNV感染后免疫力的关键。目前常用于检测病毒中和抗体的方法主要是微量细胞中和实验,是病毒中和抗体检测的“金标准”[4]。然而,由于宿主细胞感染HTNV后一般不出现细胞病变效应(cytopathic ef⁃fect,CPE),结果判定比较困难;且检测时间较长,一般为9~13d,这些都极大地限制了利用传统的微量细胞中和实验方法检测HTNV中和抗体的作用。因此,研究一种方便、快捷、高通量的测定中和抗体中和作用的方法显得十分必要。

我们根据HTNV 76-118株S基因保守区设计了一对特异性引物,利用实时荧光定量PCR方法建立了一种快速、准确测定HTNV中和抗体中和作用的实验方法,从而为HFRS新型疫苗的研究和评价奠定基础。

1 材料与方法

1.1 材料

非洲绿猴肾细胞Vero-E6购于中国科学院上海细胞库;无血清培养基DMEM购于Hyclone公司;胎牛血清购于上海生工生物工程公司;One-Step PrimeScript RT-PCR Kit购自TaKaRa公司;总RNA提取试剂盒购自天根生化科技有限公司。

HTNV 76-118株为本实验室保存;1A8为抗HTNV NP特异性高亲和力鼠源性单抗;3G1为抗HTNV高中和活性鼠源性单抗;1D9是本室以3G1为基础构建而成的抗HTNV鼠/人嵌合单抗,也具有高中和活性,均为本室制备保存。

细胞培养瓶购自Thomson公司;LightCycler96实时荧光定量PCR仪购自Roche公司;IX71倒置荧光显微镜购自Olympus公司;MX3000P实时荧光定量PCR仪购自Stratagenen公司。

1.2 HTNV感染的微量细胞中和实验

将Vero-E6细胞接种于1块96孔板,于37℃孵箱中培养24h,待细胞培养至单层后备用。用DMEM培养基将HTNV(TCID50=10-5.89)稀释至100倍 TCID50,并分别稀释单抗 3G1、1D9 至 10μg/mL,将稀释后的病毒液分别与DMEM、单抗3G1、单抗1D9等体积混合后于37℃孵育1h,将孵育后的混合液替换E6单层细胞的培养液,96孔板每孔加入100μL混合液,每组8个复孔,同时设置空白对照孔。37℃孵育90min后更换正常的完全培养基继续培养。96孔板每隔3d换液一次。第10d将96孔板于37℃和-80℃交替冻融3次,取裂解上清,用包被有抗HTNV NP的单抗1A8的酶标板夹心ELISA检测。

1.3 基于qRT-PCR的微量细胞中和实验改良法

将Vero-E6细胞接种于2块24孔板,微量细胞中和实验方法同1.2。24孔板每孔加入500μL混合液,每组10个复孔,同时设置空白对照孔。37℃孵育90min后更换正常的完全培养基继续培养。每隔24h提取病毒感染组、单抗3G1混合组、单抗1D9混合组、正常细胞组各1孔细胞总RNA,共提取10d,反转录成cDNA后于-80℃冻存备用。

1.3.1 荧光定量PCR引物的设计、合成 根据HTNV 76-118株(GenBank登录号为M14626.1)的S基因序列,利用Oligo6.0软件及NCBI Blast分析设计了一对特异性引物。上游引物为HTNV-F(5'-GAGCCTGGAGACCATCTG-3'),下游引物为HTNV-R(5'-CGGGACGACAAAGGATGT-3'),引物由北京奥科鼎盛生物科技有限公司合成。

1.3.2 验证PCR引物的有效性 以HTNV cDNA为模板,用HTNV-F/R特异性引物进行PCR,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,确定引物的有效性。

1.3.3 荧光定量PCR反应条件的建立 将从24孔板收取的转录产物进行Real-time PCR扩增,反 应 体 系 为 25μL[SYBR Premix ExTaq(2×)12.5μL,HTNV-F(10μmol/L)和 HTNV-R(10μmol/L)各1μL,模板2μL,用ddH2O补足]。反应条件:95℃预变性 10s,95℃变性 5s,60℃退火/延伸20s,每个循环退火延伸结束时检测荧光信号,共40个循环。在PCR过程中由实时荧光定量PCR仪自动绘制线性标准曲线。反应结束后先加热至95℃,然后降至72℃,开始以0.2℃/s递增加热至95℃,检测荧光信号得出扩增产物的熔解曲线。每次实验均设立1个空白对照即不加模板,当空白对照为阴性时实验有效。Ct值≤30为阳性,Ct值>30为阴性。

2 结果

2.1 微量细胞中和实验

培养10d后,将微量细胞中和实验的96孔板于37℃和-80℃反复冻融3次,取裂解上清作为待检样品,用单抗1A8作为包被抗体,ELISA检测抗体的中和活性。结果显示HTNV 76-118分别和单抗3G1、单抗D9孵育后感染细胞,细胞中残留的HTNV 76-118明显减少,表明上述特异性单克隆抗体均能有效抑制HTNV在细胞中的感染和复制(图1)。

2.2 基于qRT-PCR的微量细胞中和实验改良法

2.2.1 引物有效性验证 以HTNV的cDNA为样品,PCR扩增HTNV S基因片段,扩增产物经琼脂糖凝胶电泳,可见在1300bp左右有一条明亮条带,大小与预期相符(图2)。

2.2.2 改良法qRT-PCR结果 将每隔24h从24孔板中提取的细胞总RNA反转录成cDNA后,实时定量PCR检测病毒基因。结果显示感染24h后,中和抗体组(单抗3G1、单抗1D9)与HTNV 76-118孵育组病毒量明显低于病毒感染组,与经典的细胞微量中和实验结果相符。感染4d后病毒感染组的病毒量显著增长,而中和抗体组病毒增量不大,因此,可以选择感染后第4d作为最佳检测时间,与传统的微量细胞中和实验检测方法相比大大缩短了检测周期。见图3。

3 讨论

目前研究中的HTNV新型疫苗种类较多,疫苗接种后产生中和抗体的能力是评价其保护效应的重要指标[5],而且流行病学调查也须检测人群中中和抗体水平。国内外已建立了多种中和抗体活性检测方法,如过氧化物酶抗过氧化物酶(peroxidase-anti-peroxidase,PAP)法[6-7]、病毒空斑减少中和实验(plaque reduction neutralizaion test,PRNT)[8]、微量细胞中和实验等。上述方法前期病毒感染过程基本相同,而后期检测各有特色。PAP法在感染3~5d后即可用冷甲醇或丙酮固定细胞,通透后依序加入对应的抗体,用DAB显色后通过染色细胞计数。该法所需时间较短,且有一定的定量作用,但操作繁琐,主观性强。PRNT法是一种敏感度较高,可定量的抗体中和活性检测方法,它是将病毒与抗体的混合液加入预先培养的受体细胞中,用空斑计数测定其中和滴度。该方法耗时长,通量低,主观性强,而且在测定过程中对HTNV的活性和敏感性要求较高。由于HTNV增殖周期长,且缺乏明显的CPE,微量细胞中和实验是现在最常用的中和活性检测方法之一。此方法通常在病毒感染细胞9d后用双抗体夹心ELISA法或荧光细胞中和法进行检测,同样有耗时长、通量低等缺陷。因此,急需发展快速有效的方法来进行HFRS流行病学调查和评价HFRS新型疫苗保护效应。

图1 微量细胞中和实验结果

图2 反转录扩增产物电泳图

图3 qRT-PCR检测微量细胞中和实验结果

近几年,利用qRT-PCR检测中和抗体中和作用在病毒疫苗滴度检测方面得到广泛推广,如麻疹病毒疫苗、轮状病毒疫苗及痘病毒疫苗等[9-10]。目前,实时荧光定量PCR检测方法分为染料法和探针法,这2种方法都已被证实比常规RT-PCR更快速、灵敏[11]。SYBR GreenⅠ是一种双链DNA结合染料,可以与任何双链DNA结合,不必因为模板不同而特别定制,因此设计的程序通用性好,且价格相对较低、敏感度高。探针法则是通过探针偶联不同荧光基团而同时进行多重检测,但相对成本较高。本研究中,我们对汉滩病毒的全基因组序列进行了分析,针对其保守的S基因设计一对引物,建立了一种SYBR GreenⅠRealtime PCR方法,可快速测定汉滩病毒感染中中和抗体活性,在感染24h后病毒量甚微时即可定量检测到病毒核酸。结果显示病毒感染组的病毒载量(8.047×10-3)高于单抗 3G1(1.96×10-3)和 1D9组(3.01×10-3),之后48和72h的后续检测结果皆延续了此趋势。感染4d后病毒组的病毒量有显著增长,而中和抗体组病毒量增量不大。对感染第5~7d的样本进行持续检测,病毒感染组病毒增长速度变缓,与第4d的检测结果相似。但第8d后病毒感染组的病毒载量呈下降趋势,其原因可能是细胞在24孔板内生长8d后密度过高,细胞状态下降导致通过细胞提取的核酸质量不高,影响了检测结果。因此,可选择感染后第4d作为最佳检测时间。与传统方法相比,本实验通过荧光标记放大了病毒感染信号,从而大大提高了检测灵敏度,缩短了检测时间。同时,在结果判读方面减少了人为误差,更加确实可信。

[1] 金光香,王世文.汉坦病毒基因分型研究进展[J].中国地方病防治杂志,2003,18(3):158-1601.

[2] Ying Qikang,Ma Tiejun,Cheng Linfeng,et al.Con⁃struction and immunological characterization of CD40L or GM-CSF incorporated Hantaan virus like particle[J].Oncocarget,2016,7(39):63488-63503.

[3] Jiang D B,Sun Y J,Cheng L F,et al.Construction and evaluation of DNA vaccine encoding Hantavirus glycoprotein N-terminal fused with lysosome-associat⁃ed membrane protein[J].Vaccine,2015,33(29):3367-3376.

[4] WHO.Manual for the laboratory diagnosis and virologi⁃cal surveillance of influenza[Z].2015.

[5] Lee S,Nguyen M T.Recent advances of vaccine adju⁃vants for infectious diseases[J].Immune Network,2015,15(2):51-57.

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[11]张蓓,沈立松.实时荧光定量PCR的研究进展及其应用[J].国外医学临床生物化学与检验学分册,2003,24(6):327-329.

Establishment of a qRT-PCR Method for Quick Detection of Neutralizing Antibody Activity of Hantaan Virus

ZHANG Xiao-Xiaoa,ZHNAG Yaob,FENG Weib,CHENG Lin-Fenga,WANG Fanga,YING Qi-Kanga,MA Rui-Xuea,MA Tie-Juna,LIU Zi-Yua,LIU Rong-Ronga,ZHANG Lianga,YE Weia,ZHANG Fang-Lina,XU Zhi-Kaia,WU Xing-Ana*
a.Department of Microbiology;b.Student Brigade;Fourth Military Medical University,Xi'an 710032,China
*Corresponding author,E-mail:wuxingan@fmmu.edu.cn

Objective:To develop a fast and accurate evaluation system for neutralization antibodies against Han⁃taan virus.Methods:Vero-E6 cells were incubated at 37℃for 1 hour in the presence of Hantaan virus at 100 TCID50infectious dose and candidate antibody(mAb 3G1 or murine/human chimeric mAb 1D9).The total cellular RNAs from the incubation mix were extracted.The specific primers were designed according to the S gene se⁃quence of Hantavirus 76-118 in the GenBank database.The extracted total RNAs as template,qRT-PCR was per⁃formed to detect the effect of neutralization antibodies for Hantaan virus.Results& Conclusion:The method called qRT-PCR-based micro-cell-neutralization test was successfully established,which is capable to quantify the neutralizing antibodies rapidly and acurrately.

Hantaan virus;qRT-PCR;neutralization antibody;micro-neutralization test;hemorrhagic fever with renal syndrome

Q78;R392.1

A

1009-0002(2017)04-0524-04

2017-01-12

国家自然科学基金(31470890,31270978);陕西省科技统筹创新工程计划(2013KTCL03-06);军队重点课题(BWS13G024)

张晓晓(1985-),女,微生物学硕士,(E-mail)281166325@qq.com

吴兴安,(E-mail)wuxingan@fmmu.edu.cn

10.3969/j.issn.1009-0002.2017.04.024

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