武汉地区汉族人群纤溶酶原激活物抑制物基因多态性分析

2017-08-30 10:05马良鹏唐静宜蒋捷胡磊张耕
山东医药 2017年31期
关键词:汉族等位基因多态性

马良鹏,唐静宜,蒋捷,胡磊,张耕

(武汉市第一医院,武汉 430030)

武汉地区汉族人群纤溶酶原激活物抑制物基因多态性分析

马良鹏,唐静宜,蒋捷,胡磊,张耕

(武汉市第一医院,武汉 430030)

目的 分析武汉地区汉族人群纤溶酶原激活物抑制物-1(PAI-1)基因多态性。方法 采用荧光染色原位杂交技术检测1 533例(男728例、女805例)武汉汉族人群PAI-1-675基因多态性,并结合文献比较不同地区及种族PAI-1-675位点等位基因、基因型频率。结果 武汉地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因及基因型分布不具有性别差异(P>0.05)。武汉地区汉族人群4G等位基因频率低于广州地区,4G/4G基因型频率低于广州、长沙地区,4G/5G基因型频率高于广州、长沙地区,P均<0.01。武汉汉族人4G等位基因频率高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人;4G/4G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、马其顿人、日本人、南非人;4G/5G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人,低于马其顿人;P均<0.01。结论 武汉地区汉族人群PAI-1基因多态性有地区、种族差异,但无性别差异。

纤溶酶原激活物抑制物-1;武汉市;汉族;基因多态性

静脉血栓栓塞(VTE)是血栓在形成部位脱落,随血液流动时部分或完全堵塞静脉血管,引起相应组织或器官缺血坏死的病理过程。VTE是一种环境及遗传因素共同促发的障碍性疾病,多见于长期卧床、肢体制动、大手术或创伤后、晚期肿瘤或有遗传风险因素的患者。遗传因素促发VTE约占60%[1],多项研究指出纤溶酶原激活物抑制物-1(PAI-1)基因多态性为VTE形成的遗传风险因素之一[2]。此外,由于基因多态性分布在不同地区、种族、性别间可能存在差异,且目前国内外尚无关于PA1-1基因多态性分布的性别、地区、种族差异性研究。本研究对武汉地区汉族人群PAI-1多态性进行分析,并探讨不同性别、地区及种族间的差异,旨在为VTE的遗传流行病学研究提供方向。

1 资料与方法

1.1 临床资料 选取2016年1~6月来武汉市第一医院进行PAI-1基因检测的1 533例汉族人群,男728例,女805例;年龄21~95岁;相互之间无亲缘关系,且籍贯为武汉市户籍。

1.2 PAI-1-675基因多态性分析 ①血液采集和处理:静脉采血2 mL,加至EDTA抗凝管中,并充分混匀,避免凝血或溶血。血液标本采集后应及时处理(-20 ℃保存不超过7周),送检。②白细胞提取:取出200 μL混匀全血,分别加入1 mL 1×NH4Cl预处理液,颠倒混匀,室温静置5 min,隔2~3 min混匀1次,至液体颜色为橙清红色。3 300 r/min离心5 min,弃上清,以1×NH4Cl小心洗涤沉淀,弃上清,加入30 μL PHARM-GENE 01 SNP分析保存液,涡旋震荡10 s至混匀。③加入耀金分:取1.5 μL白细胞样本,加入相应的耀金分基因分析检测试剂中,混匀。④上机杂交:双击“Microseq”检测程序,选择标本放置的管口及检测位点后运行检测程序,待检测完成后仪器在结果栏自动给出检测结果的基因类型。⑤结果分析:PAI-1-675位点多态性分为5G/5G(野生型)、5G/4G(突变杂合型)、4G/4G(突变纯合型)。

1.3 统计学方法 采用SPSS22.0统计软件。等位基因、基因型频率用%表示,组间比较采用χ2检验。P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 Hardy-Weinberg平衡检验及PAI-1-675位点等位基因、基因型分布 本研究对收集到的汉族人群PAI-1基因启动子区-675 bp处的检测数据进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验,计算检验结果P=0.54,符合Hardy-Weinberg遗传平衡检验,样本具有本区域群体代表性。武汉地区汉族人群PAI-1-675 4G、5G等位基因频率分别为56.72%和43.28%,4G/4G、4G/5G、5G/5G基因型频率分别为32.55%、48.34%、19.11%。

2.2 不同性别武汉地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因、基因型频率比较 结果见表1。由表1可知,不同性别之间的等位基因和基因型频率比较无统计学差异(P均>0.05)。

2.3 不同地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因、

表1 不同性别武汉地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因、基因型分布比较

基因型频率比较 结果见表2。由表2可知,武汉地区汉族人群4G等位基因频率低于广州地区,4G/4G基因型频率低于广州、长沙地区,4G/5G基因型频率高于广州、长沙地区,P均<0.01。

2.4 不同种族人群PAI-1-675位点等位基因、基因型频率比较 结果见表3。由表3可致,武汉汉族人4G等位基因频率高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人;4G/4G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、马其顿人、日本人、南非人;4G/5G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人,低于马其顿人;P均<0.01。

表2 不同地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因、基因型分布比较

表3 不同种族人群PAI-1等位基因、基因型分布比较

3 讨论

VTE是多因素参与的常见病、多发病,病死率高。国外流行病学资料[16,17]显示,VTE年发病率为1/1 000~2/1 000,其高发病率给患者和国家带来了沉重的医疗负担。PAI-1通过特异性抑制血管纤溶酶原激活物(PA)来调节纤溶系统活性,若PAI-1-675位点发生突变,可能导致PA活性降低,进而导致血管内纤维蛋白凝块溶解降低,最终导致VTE发生[18]。

在遗传流行病学领域,基因型的群体变异、种族变异被认为是研究遗传因素和疾病关系的重要桥梁。由于PAI-1的基因多态性分布存在明显的性别、地区及种族差异,所以本研究对武汉地区1 533例汉族人群PAI-1-675位点进行基因分型,并比较了不同性别、地区及种族间PAI-1-675位点等位基因及基因型频数频率分布差异,旨在为VTE的流行病学研究提供遗传分子基础。本研究我们发现,武汉地区汉族人群PAI-1-675位点等位基因及基因型分布不具有性别差异,提示性别可能不是武汉汉族人PAI-1-675位点4G/5G多态性分布的影响因素。

本研究还将本文结果与既往研究数据进行比较,我们发现武汉汉族PAI-1-675位点4G等位基因频率显著低于广州,与青岛、石家庄、潍坊、北京、长沙相比无显著性差别。4G/4G基因型频率显著低于广州、长沙,与青岛、石家庄、潍坊、北京地区无显著性差异;4G/5G基因型频率显著高于广州、长沙,与青岛、石家庄、潍坊、北京地区无显著性差异。以上结果提示地区可能是PAI-1-675位点4G/5G多态性分布的影响因素,华中华北地区可能具有相似的PAI-1-675位点遗传背景,而华南地区PAI-1-675位点遗传多态性可能有自己的独特性。

由于我国幅员辽阔民族多样,导致遗传背景可能存在差别,又由于本研究所采用的样本量较大,有一定的代表性,因此我们选择以武汉汉族人代表中国人与其他种族进行比较。通过比较我们发现,武汉汉族人4G等位基因频率显著高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人,与荷兰人、马其顿人无显著性差异;4G/4G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、马其顿人、日本人、南非人;4G/5G基因型频率高于加纳人、土耳其人、印度人、日本人、南非人,低于马其顿人,与荷兰人无显著性差异。以上结果提示种族可能是PAI-1-675位点遗传多态性的影响因素。

[1] Souto JC, Almasy L, Borrell M,et al.Genetic susceptibility to thrombosis and its relationship to physiological risk factors: the GAIT study. genetic analysis of idiopathic thrombophilia[J].Am J Hum Genet, 2000,67(6):1452-1459.

[2] Sartori MT, Danesin C, Saggiorato G,et al.The PAI-1 gene 4G/5G polymorphism and deep vein thrombosis in patients with inherited thrombophilia[J].Clin Appl Thromb Hemost, 2003,9(4):299-307.

[3] 李长贵,董砚虎,王海燕,等.PAI-1基因4G/5G多态性与2型糖尿病合并肾病的相关性研究[J].中国糖尿病杂志,2001,9(6):334-336.

[4] 国雪,石晓明,赵晓云,等.PAI-1启动子区4G/5G基因多态性、ACE插入/缺失多态性与脑卒中的相关性[J].基础医学与临床,2011,31(11):1238-1241.

[5] 管立学,杜欣莹,王敬先,等.PAI-1基因和MTHFR基因多态性与复发性早期自然流产的关系[J].中华医学遗传学杂志,2005,22(3):330-333.

[6] 张晓岩,林江涛,杨萌,等.PAI-1基因多态性对哮喘气道重塑影响的研究[J].实用临床医药杂志,2009,13(12):1-6.

[7] Luo Y, Wang C, Tu H. Impact of the 4G/5G polymorphism in the plasminogen activator inhibitor-1 gene on primary nephrotic syndrome[J]. Mol Med Rep, 2014,9(3):894-898.

[8] 陈懿建,张立群,陈方平.脑梗死患者PAI-1基因启动子区域4G/5G多态性与血浆活性关系的研究[J].中国全科医学,2008,11(2A):213-227.

[9] White MJ, Kodaman NM, Harder RH, et al.Genetics of plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) in a ghanaian population[J]. PLoS One, 2015,10(8):0136379.

[10] van Goor ML, Gómez García E, Leebeek F, et al.The plasminogen activator inhibitor (PAI-1) 4G/5G promoter polymorphism and PAI-1 levels in ischemic stroke. a case-control study[J]. Thromb Haemost, 2005,93(1):92-96.

[11] Gunes HV, Cosan DT, Ata N, et al. Plasminogen activator inhibitor type-1 gene 4G/5G polymorphism is associated with hypertensive patients in the Turkish population[J]. Genet Test Mol Biomarkers, 2010,14(3):303-305.

[12] Pegoraro RJ, Ranjith N. Plasminogen activator inhibitor type 1 (PAI-1) and platelet glycoprotein Ⅲa (PGⅢa) polymorphisms in young Asian Indians with acute myocardial infarction[J].Cardiovasc J S Afr, 2005,16(5):266-270.

[13] Spiroski I, Kedev S, Antov S, et al. Investigation of SERPINE1 genetic polymorphism in macedonian patients with occlusive artery disease and deep vein thrombosis[J]. Kardiol Pol, 2009,67(10):1088-1094.

[14] Sugano T, Tsuji H, Masuda H, et al. Plasminogen activator inhibitor-1 promoter 4G/5G genotype is not a risk factor for myocardial infarction in a Japanese population[J]. Blood Coagul Fibrinolysis, 1998,9(2):201-204.

[15] de Lange Z, Rijken DC, Hoekstra T, et al. In black South Africans from rural and urban communities, the 4G/5G PAI-1 polymorphism influences PAI-1 activity,but not plasma clot lysis time[J]. PLoS One, 2013,8(12):e83151.

[16] Cohen AT, Agnelli G, Anderson FA, et al. Venous thromboembolism (VTE) in Europe. The number of VTE events and associated morbidity and mortality[J]. Thromb Haemost, 2007,98(4):756-764.

[17] Naess IA, Christiansen SC, Romundstad P, et al. Incidence and mortality of venous thrombosis: a population-based study[J]. J Thromb Haemost, 2007,5(4):692-699.

[18] Hosseini S, Kalantar E, Hosseini MS, et al. Genetic risk factors in patients with deep venous thrombosis, a retrospective case control study on Iranian population[J]. Thromb J, 2015(13):35.

张耕(E-mail: 370924938@qq.com)

10.3969/j.issn.1002-266X.2017.31.031

R968

B

1002-266X(2017)31-0098-03

2017-03-13)

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