尚 丹 李美红 许 馨 曹山虎 孙绍光1.北京铁路局石家庄卫生防疫站,河北石家庄050000;2.山东省招远市人民医:药剂科,山东招远265400;.河北医科大学基础医学:生物化学与分子生物学教研室,河北石家庄050017
m iR-342-3p抑制SM 22α启动子的转录活性
尚丹1*李美红2*许馨3曹山虎3孙绍光3
1.北京铁路局石家庄卫生防疫站,河北石家庄050000;2.山东省招远市人民医:药剂科,山东招远265400;3.河北医科大学基础医学:生物化学与分子生物学教研室,河北石家庄050017
目的探究miR-342-3p是否通过作用于SM22α启动子,从转录水平调控SM22α的表达。方法通过软件RNAhybrid分析发现,大鼠SM22α启动子中存在一个miR-342-3p的识别位点。将miR-342-3pmimics与报告基因载体pGL3-SM22α-Promoter共转染293A细胞,通过检测荧光素酶活性来分析miR-342-3p对SM22α启动子转录活性的影响。将miR-342-3p mimics转染血管平滑肌细胞,采用qRT-PCR和Western blot分别检测SM22α mRNA和蛋白质水平,分析miR-342-3p对血管平滑肌细胞中SM22α表达的影响。结果与miR-control相比,miR-342-3p能够使SM22α启动子转录活性降低(0.54±0.03)倍,差异有统计学意义(P<0.05);与miR-control相比,miR-342-3p能够使血管平滑肌细胞中SM22αmRNA水平降低(0.45±0.04)倍,SM22α蛋白质水平下降(0.41± 0.05)倍,差异有统计学意义(P<0.05)。结论miR-342-3p通过抑制SM22α启动子活性,从转录水平降低SM22α的表达,为miRNA调控血管平滑肌细胞表型转化研究提供了新角度。
microRNA;miR-342-3p;SM 22α;启动子
[Avsteact]Ov jective To explore whethermiR-342-3p could repress the expression of SM22αat the transcriptional level by targeting its promoter.M ethods Therewas a potential binding site ofmiR-342-3p in the SM22αpromoter analyzed by using RNAhybrid software.293A cells were co-transfected with miR-342-3p mimics and pGL3-SM22α-Promoter reporter gene vectors,luciferase activity was detected to analyze whether the SM22αpromoter activity is repressed bymiR-342-3p.Vascular smoothmuscle cellswere transfected withmiR-342-3p mimics,SM22αmRNA and protein levelswere detected by using qRT-PCR and Western blot,to explore the influence ofmiR-342-3p on the expression of SM22αin vascular smooth muscle cells.Results Compared with miR-control,SM22αpromoter transcriptional activity was reduced(0.54±0.03)folds bymiR-342-3p,the difference was statistically significant(P<0.05).The SM22αmRNA in vascular smooth muscle cellswas decreased(0.45±0.04)folds,and the SM22αprotein levelwas decreased(0.41±0.05)folds bymiR-342-3p,compared withmiR-control,the differenceswere statistically significant(P<0.05).Conclusion miR-342-3p represses the expression of SM22αat the transcriptional level by targeting its promoter,which provides a novel perspective for the study ofmiRNA in vascular smooth muscle cell phenotypic switch regulation.
[Key woeds]microRNA;miR-342-3p;SM22α;Promoter
microRNA(miRNA)是一类内源性的、长约22个核苷酸的调控性非编码RNA。miRNA的主要作用模式是通过碱基不完全互补配对的方式介导RNA诱导沉默复合体(RNA-induced silencing complex,RISC)与胞质中靶mRNA的3'UTR结合,从转录后水平抑制靶基因的翻译[1]。值得关注的是,成熟miRNA不但分布在细胞质中,还广泛分布在细胞核内,并且很多miRNA在核内的浓度远高于在胞质中的浓度[2-3]。研究证实,胞核中的miRNA通过与基因启动子结合,从转录水平调控靶基因的表达。例如,miR-320通过与POLR3D基因启动子结合,抑制其转录[4];miR-373与E-cadherin启动子结合在转录水平诱导基因的表达[5];miR-744和miR-1184均可与cyclin B1启动子结合并诱导其转录上调,参与肿瘤的发生[6];miR-130a与水通道蛋白AQS4 M1基因启动子结合抑制其转录水平,参与调控细胞液体平衡[7]。
目前,关于miRNA能否从转水水平参与调控血管平滑肌细胞表型转化完全未知。SM22α(smooth muscle 22)是一种重要的分化型血管平滑肌细胞的表型标志物,参与调控血管平滑肌细胞的增殖和表型转化,在动脉粥样硬化、血管再狭窄等血管重塑性疾病中发挥重要作用[8-9]。本研究发现,大鼠SM22α启动子中存在一个miR-342-3p识别位点,经报告基因分析等实验证明,miR-342-3p能够抑制SM22α启动子转录活性,从转录水平下调SM22α的表达,进而可能参与调控血管平滑肌细胞表型转化。本研究为miRNA调控血管平滑肌细胞表型转化的机制研究提供了新角度。
1.1主要仪器与试剂
实时定量PCR仪型号为ABI7300,凝胶成像仪为Li-COR公司Odyssey红外荧光扫描成像系统,管式冷光仪为Berthold Technologies公司Flash&Glow LB955。质粒提取纯化试剂盒、质粒pGL3和pRL-TK、双荧光素酶报告基因测试试剂盒购自Promega公司;脂质体Lipofectamine 3000、Trizol、逆转录和实时定量PCR检测试剂盒等购自Life Science公司;miRNA mimics购自上海吉玛制药技术有限公司;抗体购自武汉三鹰生物技术有限公司;大鼠血管平滑肌细胞株(A7R5)和293A细胞购自美国ATCC公司;胎牛血清和高糖DMEM培养基购自Gibco公司;重组质粒pGL3-SM22α-Promoter[10]为河北医科大学:生物化学与分子生物学教研室构建保存。
1.2细胞培养
大鼠血管平滑肌细胞株(A7R5)和293A均使用含有10%胎牛血清和双抗的高糖DMEM,在37℃、5% CO2培养箱中进行培养。
1.3miRNA的转染
将A7R5细胞接种到T25细胞培养瓶,细胞密度达到80%时进行转染。用脂质体Lipofectamine 3000转染试剂,每瓶加入15μL脂质体溶于100μL无血清无抗生素DMEM培养液中,混匀,室温静置5min。每瓶加入40 nmol/LmiRNA溶于100μL无血清无抗生素高糖DMEM培养液中,混匀,室温静置5 min。将上述脂质体和核酸轻轻混匀,室温静置20min。每瓶换新鲜的无血清无抗生素DMEM培养液1.8 mL,将混合液加入,混匀后置培养箱中,37℃培养。转染后6 h,更换为常规高糖DMEM培养液。培养48 h后收细胞,进行RNA或蛋白质提取。
1.4293A细胞转染与报告基因分析
将293A细胞接种到24孔板,细胞密度达到80%时进行转染。每孔加入5μL脂质体Lipofectamine 3000、400 ng质粒pGL3-SM22α-Promter、50 ng内参质粒pRL-TK和20 nmol/LmiRNA,其他操作与上述A7R5细胞的转染相同。培养24 h后,按Dual-Luciferase报告基因检测试剂盒进行荧光素酶活性测定。
1.5RNA提取、逆转录与实时定量PCR
采用Trizol一步法提取RNA。逆转录和实时定量PCR操作均按照试剂盒说明进行。使用的PCR引物序列为SM22α上游引物:5'-CGAGGAAGGAGCACGAAG-3',SM22α下游引物:5'-TCCTGCGTTGCTGTCTGT-3',β-actin上游引物:5'-TGTGCCCATCTATGAGGGTTACG-3',β-actin下游引物:5'-AAGAGGATGCGGCAGTGGC-3'。PCR反应程序:95℃预变性3 min;95℃变性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸15 s,重复40个循环;然后进行溶解曲线分析。采用相对定量方法(2-△△Ct)对实时定量PCR的结果进行分析。
1.6W estern blot检测蛋白表达
采用RIPA细胞裂解液提取细胞蛋白,用改良的Lowry法进行蛋白定量。采用12%SDS-聚丙烯酰胺凝胶进行电泳,每个泳道加入30μg蛋白样本。采用半干转膜法。使用含5%脱脂奶粉的TTBS于37℃封闭PVDF膜2 h。将膜置入TTBS适当稀释的一抗溶液中,4℃孵育过夜。TTBS室温洗膜3次,每次10min。将膜置入1∶2000稀释的荧光标记二抗溶液中,于室温避光孵育1 h。避光洗膜后,使用Odyssey红外荧光成像系统扫描成像。
1.7统计学方法
上述实验均重复3次,取其均值。采用SPSS 19.0统计学软件进行数据分析,计量资料数据用均数±标准差(x±s)表示,两组间比较采用t检验;以P<0.05为差异有统计学意义。
2.1大鼠SM 22α启动子与m iR-342-3p的结合位点
采用RNAhybrid[11]软件分析发现,大鼠SM22α启动子(-103~-122)含有一个miR-342-3p识别位点;通过Targetscan[12]软件分析大鼠SM22α3'UTR上未发现miR-342-3p的识别位点。见图1。
2.2m iR-342-3p对大鼠SM 22α启动子转录活性的影响
为了论证miR-342-3p与大鼠SM22α启动子是否存在直接相互作用,本研究将miR-342-3p mimics、miR-control分别与pGL3-SM22α-Promoter和pRLTK质粒共转染293A细胞,通过荧光素酶活性分析显示,与miR-control相比,miR-342-3p能够使SM22α启动子转录活性降低(0.54±0.03)倍,差异有统计学意义(P<0.05)。见图2。细胞表型标志基因α-SMA蛋白质水平下降了(0.28± 0.04)倍,差异有统计学意义(P<0.05),见图3B。
图1 大鼠SM 22琢启动子与m iR-342-3p的结合位点
图2 m iR-342-3p对大鼠SM 22琢启动子转录活性的影响(n=3)
2.3m iR-342-3p对血管平滑肌细胞中SM 22α mRNA和蛋白质水平的影响
为了论证miR-342-3p是否在血管平滑肌细胞中调控通过与启动子互作从转录水平调控SM22α的表达,本研究向A7R5细胞中分别转染miR-342-3p mimics、miR-control。qRT-PCR检测显示,与miR-control相比,miR-342-3p使SM22αmRNA水平降低了(0.45±0.04)倍,差异有统计学意义(P<0.05),见图3A。另外,Western blot检测显示,转染miR-342-3p血管平滑肌细胞中SM22α蛋白质水平下降了(0.41± 0.05)倍,差异有统计学意义(P<0.05);血管平滑肌
图3 m iR-342-3p对血管平滑肌细胞中SM 22琢m RNA和蛋白质水平的影响(n=3)
miRNA除了通过与启动子结合,从转录水平调控靶基因的表达外[4-7],还能够通过以下调控模式参与众多生物学过程:①miRNA能够进入线粒体,与靶mRNA 5'UTR结合,激活靶基因的翻译。例如,miR-1与Ago2协同结合于线粒体中ND1和COX1 mRNA的5'UTR,增强它们的翻译效率,调控骨骼肌、心肌细胞的分化过程[13]。②miRNA能够与胞核中靶primiRNA结合,参与miRNA的加工调控。例如,miR-709可以与核内pri-miR-15a/16-1结合,抑制miR-15a/16-1的成熟,参与调控细胞凋亡[14]。③miRNA通过与靶mRNA的开放阅读框结合,从转录后水平抑制其翻译。例如,miR-134、miR-296和miR-470能够结合于Nanog、Oct4和Sox2等基因mRNA的开放阅读框,抑制蛋白表达水平,参与调控胚胎干细胞的分化[15]。④miRNA除了识别靶mRNA的3'UTR外,还能与靶mRNA的5'UTR结合,从转录后水平调控靶基因的翻译。例如,miR-10a能够结合于多种核糖体蛋白mRNA的5'UTR,增强它们的翻译效率[16]。⑤miRNA与lncRNA发生互作。例如,miR-133和miR-135可通过与linc-MD1的结合,在转录后水平调节转录因子MAML1和MEF2C的表达,参与肌肉分化调控过程[17]。⑥miRNA与假基因发生互作。例如,miR-19b和miR-20a可与PTENP1假基因3'UTR结合降低其丰度,进而调控抑癌基因PTEN活性[18]。⑦miRNA通过与蛋白因子结合在转录后水平调节基因的表达。例如,miR-328可以与蛋白质HnRNPE2结合,使其与CEBPA mRNA解离,促进细胞分化[19]。
miRNA广泛参与了VSMC表型转化、增殖、分化等生物学过程[20-25],在动脉粥样硬化等疾病的发生发展中扮演重要角色,但这些成果主要关注miRNA对胞质中mRNA 3'UTR的转录后调控模式,而未对上述其他调控模式进行探讨。本研究发现,miR-342-3p能够降低血管平滑肌细胞中SM22αmRNA和蛋白质水平。通过分析在SM22αmRNA 3'UTR中未发现miR-342-3p的识别位点,而在大鼠SM22α启动子中存在1个miR-342-3的识别位点。由此推测miR-342-3可能通过与SM22α启动子相互作用,从转录水平,而不是转录后水平,调控SM22α的表达。为了论证上述推测,本研究通过报告基因分析,证明miR-342-3能够抑制SM22α启动子转录活性。提示miR-342-3p通过作用于SM22α启动子,从转录水平下调SM22α的表达。
总之,本研究证明miR-342-3p不通过作用于大鼠SM22αmRNA 3'UTR,而是通过作用于大鼠SM22α启动子,从转录水平下调SM22α的表达,进而可能参与血管平滑肌细胞表型转化调控,为miRNA调控血管平滑肌细胞表型转化的机制研究提供了新角度。
[1]Chua JH,Armugam A,Jeyaseelan K.MicroRNAs:biogenesis,function and applications[J].CurrOpinMol Ther,2009, 11(2):189-199.
[2]Liao JY,Ma LM,Guo YH,et al.Deep sequencing of human nuclear and cytoplasmic small RNAs reveals an unexpectedly complex subcellular distribution of miRNAs and tRNA 3'trailers[J].PLoSOne,2010,5(5):e10563.
[3]Jeffries CD,Fried HM,Perkins DO.Nuclear and cytoplasmic localization of neural stem cellmicroRNAs[J].RNA,2011,17(4):675-686.
[4]Kim DH,Saetrom P,Snøve O Jr,et al.MicroRNA-directed transcriptional gene silencing inmammalian cells[J].Proc Natl Acad Sci U SA,2008,105(42):16230-16235.
[5]Place RF,Li LC,Pookot D,et al.MicroRNA-373 induces expression of genes with complementary promoter sequences[J].Proc Natl Acad SciU SA,2008,105(5):1608-1613.
[6]Huang V,Place RF,Portnoy V,et al.Upregulation of Cyclin B1 bymiRNA and its implications in cancer[J].Nucleic Acids Res,2012,40(4):1695-1707.
[7]Sepramaniam S,Ying LK,Armugam A,et al.MicroRNA-130a represses the transcriptional activity of Aquaporin 4 M1 promoter[J].J Biol Chem,2012,287(15):120006-120015.
[8]Feil S,Hofmann F,Feil R.SM22alphamodulates vascular smooth muscle cell phenotype during atherogenesis[J]. Circ Res,2004,94(7):863-865.
[9]Dong LH,Wen JK,Liu G,et al.Blockade of the Ras-extracellular signal-regulated kinase 1/2 pathway is involved in smooth muscle 22 alpha-mediated suppression of vascular smooth muscle cell proliferation and neointima hyperplasia[J].Arterioscler Thromb Vasc Biol,2010,30(4):683-691.
[10]Wang C,Han M,Zhao XM,et al.Krüppel-like factor 4 is required for the expression of vascular smooth muscle cell differentiation marker genes induced by all-trans retinoic acid[J].JBiochem,2008,144(3):313-321.
[11]Agarwal V,Bell GW,Nam J,et al.Predicting effective microRNA target sites in mammalian mRNAs[J].Elife Sciences,2015,4:e05005.
[12]Krüger J,Rehmsmeier M.RNAhybrid:microRNA target prediction easy,fast and flexible[J].Nucleic Acids Res,2006,34:W451-454.
[13]Zhang X,Zhang XR,Zuo XX,et al.MicroRNA Directly Enhances Mitochondrial Translation during Muscle Differentiation[J].2014,Cell,158(3):607-619.
[14]Tang R,Li LM,Zhu DH,et al.Mouse miRNA-709 directly regulatesmiRNA-15a/16-1 biogenesis at the posttranscriptional level in the nucleus:evidence for a microRNA hierarchy system[J].Cell Res,2012,22(3):504-515.
[15]Tay Y,Zhang J,Thomson AM,et al.MicroRNAs to Nanog,Oct4 and Sox2 coding regionsmodulate embryonic stem cell differentiation[J].Nature,2008,455(7216):1124-1128.
[16]Ørom UA,Nielsen FC,Lund AH.MicroRNA-10a binds the 5'UTR of ribosomal protein mRNAs and enhances their translation[J].Mol Cell,2008,30(4):460-471.
[17]Cesana M,Cacchiarelli D,Legnini I,et al.A long noncoding RNA controlsmuscle differentiation by functioning as a competing endogenous RNA[J].Cell,2011,147(2):358-369.
[18]Poliseno L,Salmena L,Zhang J,et al.A coding-independent function of gene and pseudogene mRNAs regulates tumour biology[J].Nature,2010,465(7301):1033-1038.[19]Eiring A M,Harb JG,Neviani P,et al.miR-328 functions as an RNA decoy to modulate hnRNP E2 regulation of mRNA translation in leukemic blasts[J].Cell,2010,140(5):652-665.
[20]Cordes KR,Sheehy NT,White MP,et al.miR-145 and miR-143 regulate smoothmuscle cell fateand plasticity[J]. Nature,2009,460(7256):705-710.
[21]Cheng Y,Liu X,Yang J,et al.MicroRNA-145,a novel smooth muscle cell phenotypic marker and modulator,controlsvascularneointimal lesion formation[J].Circ Res,2009,105(2):158-166.
[22]Sun SG,Zheng B,Han M,et al.miR-146a and Krüppellike factor 4 form a feedback loop to participate in vascularsmoothmusclecellproliferation[J].EMBORep,2011,12(1):56-62.
[23]Chen J,Yin H,Jiang Y,et al.Induction ofmicroRNA-1 bymyocardin in smooth muscle cells inhibits cell proliferation[J].Arterioscler Thromb Vasc Biol,2011,31(2):368-375.
[24]Torella D,Iaconetti C,Catalucci D,et al.MicroRNA-133 controls vascular smooth muscle cell phenotypic switch in vitro and vascular remodeling in vivo[J].Circ Res,2011,109(8):880-893.
[25]Li P,Zhu N,Yi B,et al.MicroRNA-663 regulates human vascular smooth muscle cell phenotypic switch and vascular neointimal formation[J].Circ Res,2013,113(10):1117-1127.
m iR-342-3p eepeesses teansceiptional activity of SM 22αpeomotee
SHANG Dan LIMeihong XU Xin CAO Shanhu SUN Shaoguang
1.Shijiazhuang Health and Epidemic Prevention Station,Beijing Railway Bureau,Hebei Province,Shijiazhuang 050000,China;2.Department of Pharmacy,Zhaoyuan People's Hospital,Shandong Province,Zhaoyuan 265400,China;3.Department of Biochemistry and Molecular Biology,Basic Medical College,Hebei Medical University,Hebei Province,Shijiazhuang 050017,China
R34
A
1674-4721(2016)08(c)-0012-051*2*333
2016-05-23本文编辑:程铭)
国家自然科学基金项目(81200215);河北省自然科学基金资助项目(H2013206151);河北省医学科学研究重点课题计划(1120140198)。
*共同第一作者
孙绍光(1978.4-),男,博士,副教授;研究方向:调控性非编码RNA。