刘淑荣 黄显娇 赵文静等
[摘要] 目的 研究长春地区598例乙型肝炎患者乙型肝炎病毒(hepatitis B virus)基因分型及耐药基因突变情况。方法 收集598例HBVDNA高于检测下限(>1000拷贝/mL)乙型肝炎患者血清,PCR反向点杂交法检测HBV基因型和耐药变异位点。 结果 598例样本中, B基因型35例(5.85%), C基因型525例(87.79%),BC混合基因型32例(5.35%),D基因型2例(0.33%),未分型4例(0.67%)。79例发生HBV耐药变异,总体变异率为13.21% ,其中B基因型3例(3.80%),C基因型73例(92.41%),BC混合基因型2例(2.53%),未分型1例(1.27%); rtM204检出率最高75.94%(60/79), rtM204变异位点耐药突变模式有10种类型。 结论 长春地区HBV感染患者基因型以C基因型为主,HBV基因耐药以rtM204位点检出率最高,变异模式复杂。
[关键词]乙型肝炎;HBV基因分型;基因耐药;PCR反向点杂交法
[中图分类号] R446.61 [文献标识码] A [文章编号] 2095-0616(2015)15-12-03
[Abstract] Objective To investigate Hepatitis B virus genotype and drug-resistant mutation patterns in 598 patients with hepatitis B in Changchun region. Methods Serum of a total 598 patients with hepatitis B whose HBVDNA was higher than the lower limit of detection (more than 1000copies/mL) were collected. To detect HBV genotype and drug-resistance site mutation by PCR reverse dot blot hybridization method. Results Of the 598 serum samples, there were 35 samples(5.85%) of genotype B, 525 samples(87.79%) of genotype C, 32 samples(5.35%) of B and C mixed genotype, 2 samples(0.33%) of genotype D and 4 samples(0.67%) of undifferentiated type. Drug-resistant mutation were detected in 79 samples, accounting for 13.21%, which included 3 samples(3.80%) of genotype B, 73 samples(92.41%) of genotype C, 2 samples(2.53%) of B and C mixed genotype and 1 case(1.27%) of undifferentiated type. The most frequently detection rate of rtM204 mutation was 75.94%(60/79). There were 10 types of patterns in rtM204 site mutation. Conclusion The main HBV genotype is genotype C in patients infected by HBV in Changchun region, and the detection rate of rtM204 site mutation is the highest among all the drug-resistance site mutations detected in patients with hepatitis B, what's more the mutation patterns are complicated.
[Key words] Hepatitis B; HBV genotype; Drug-resistance mutation; PCR combined reverse dot blot method
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是全球性的公共卫生问题,我国约有9300万HBV感染者,其中慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)患者约2000万例,每年约有30万人死于HBV感染所指的肝衰竭、肝硬化和肝细胞癌[1-2]。根据HBV全基因核苷酸序列的异质性将HBV分为A-H共8种基因型,HBV基因型具有明显的地域差异,同时不同基因型与病情的严重程度、预后、抗病毒治疗效果等方面都可能有一定的相关性[3-5]。核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogue,NAs]起效迅速、服用方便、副作用小,是目前临床治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的重要药物,随着NAs的长期使用HBV发生耐药的危险性也随之增加,HBV耐药变异是引起NAs 抗病毒治疗失败的最重要的原因[6-10]。本研究采用PCR反向点杂交法检测长春地区598例HBV感染患者的HBV基因型及常见的8个耐药位点变异情况,了解本地区HBV基因型分布特征和HBV耐药变异位点突变模式,为乙型肝炎患者抗病毒治疗提供依据。
1 材料与方法
1.1 血清标本
采集2013年1月~ 2014年1月吉林省肝胆病医院门诊和住院乙型肝炎患者,筛选出HBVDNA高于检测下限(>1000拷贝/mL)患者598例,其中男448例,女150例,年龄15 ~ 76岁。病例诊断均符合2010版中国《慢性乙型肝炎防治指南》诊断标准[11],排除合并甲、丙、戊和庚型肝炎病毒感染,血清标本-80℃保存备检。
1.2 HBV感染血清学标志物和HBVDNA测定
患者血清HBV感染标志物HBsAg、HBsAb、HBeAg、HBeAb 、HBcAb采用罗氏试剂在罗氏7100电化学发光仪测定(Roche Diagnose,中国上海);HBVDNA采用中山达安基因有限公司试剂在美国ABI荧光定量PCR扩增仪测定。
1.3 HBV基因分型和耐药检测
采用深圳亚能生物技术有限公司生产HBV分型和耐药突变基因检测试剂盒,可检测HBV B\C\D基因型以及常见核苷(酸)类似物耐药相关的8个耐药位点,包括:rt180、rt184、rt204、rt202、rt207、rt181、rt236、rt250。
1.4 HBV基因型和耐药性检测方法
严格按试剂盒说明书进行操作,主要操作流程如下:(1)离心柱提取方法提取血清HBVDNA;(2)DNA为模板进行HBVDNA 的PCR扩增;(3)恒温杂交箱47℃杂交1.5h;(4)洗膜;(5)孵育;(6)显色:将膜条浸泡与显色液中避光显色15min,观察结果。
2 结果
2.1 患者基本临床资料
598例乙型肝炎患者中,急性肝炎25例,慢性乙型肝炎313例,肝癌58例,肝硬化202例, 均为HBsAg阳性,其中HBe Ag阳性358例,HBe Ag阴性240例,HBVDNA定量检测显示Log10 HBVDNA(5.36±2.24)copies/mL。
2.2 HBV基因分型检测结果
598例乙型肝炎患者HBV基因分型检测结果:B基因型5.85%(35/598),C基因型87.79%(525/598),BC混合基因型HBV感染者占5.35%(32/528),D基因型0.33%(2/598),未分型4例占0.67%(4/598)。313例慢性乙型肝炎患者B基因型6.07%(19/313), C基因型89.45%(280/313),BC混合基因型3.51%(11/313),D基因型0.32%(1/313),未分型0.63%(2/313)。
2.3 HBV耐药变异检测结果
在598例患者中检出79例发生HBV耐药变异,总体变异率为13.21%(79/598),其中B基因型3例(3.80%,3/79),C基因型73例(92.41%,73/79),BC混合基因型2例(2.53%,2/79),未分型1例(1.27%,1/79)。检出相关耐药突变位点有rtL180M、rtT184A/L、rtM204I/V、rtS202G、rtM/V207I、rtA181V/T、rtN236T、rtM250V/L。8个HBV相关耐药突变位点检出率各不相同, rtM204检出率最高75.94%(60/79),其余位点检出率分别为rtL180(38/79),rtA181(18/79), rtN236(9/79), rtT184(3/79), rtS202(1/79), rtM250(1/79), rtM/V207(1/79)。
进一步分析对60例rtM204位点变异情况,rtM204位点有10种突变模式,2种rtM204单一位点变异和8种与其他耐药位点联合突变模式,结果见表1。
3 讨论
在中国主要以B基因型和C基因型为主,其中北方以C基因型为主,南方以B基因型为主[12]。本研究采用PCR反向点杂交法检测长春地区598乙型肝炎患者HBV基因型,检测出B基因型5.85%(35/598), C基因型87.79%(525/598),基因BC混合型5.35 %(32/528),0.33%(2/598),未分型4例占0.67%(4/598),其中313例慢性乙型肝炎患者B基因型6.07%(19/313), C基因型89.45%(280/313),BC混合基因型3.51%(11/313),D基因型0.32%(1/313),未分型0.63%(2/313),研究结果表明长春地区HBV感染者以C基因型为主,B基因型和BC混合型较少,此研究结果符合我国北方HBV基因型地理分布特点。
目前治疗CHB的核苷(酸)类药物主要有拉米夫定(LAM),阿德福韦酯(ADV),恩替卡韦(ETV)和替比夫定(LdT),在应用NAs长期抗病毒治疗过程中,耐药是非常重要的问题,一旦发生耐药,不仅影响抗病毒治疗效果,增加后续治疗的难度,甚至可导致疾病进展,增加发生肝功能失代偿的风险。在抗病毒治疗过程中检测HBV耐药位点检测,确定HBD耐药基因突变模式,合理选择抗病毒药物及确定治疗方案。本研究主要对临床常用的四种核苷(酸)类药物相关的8种耐药基因进行检测。在598例乙型肝炎患者中检出79例有HBV耐药变异,总体变异率为13.21%(79/598),79例耐药变异中8个位点上的耐药变异检出率各不相同, rtM204检出率最高75.94%(60/79),rtM204I/V位点变异主要与LAM和LDT耐药相关,rtM204检出率高可能有二方面的原因,一是LAM和LDT 为低耐药基因屏障药物,另一方面可能与LAM在我国上市最早、使用时间最长,应用患者较多有关[13-14]。
本研究对60例发生rtM204位点变异进行了分析,结果显示rtM204位点有10种突变模式,2种rtM204单一位点变异和8种与其它耐药位点联合突变模式。rtM204I/V耐药通路与LAM和LdT耐药及ETV耐药进化相关[15],仅需出现rtM204原发耐药位点突变位点即可导致LAM和LDT耐药,同时rtM204I/V位点变异可以促进发生ETN耐药,在现有的可供选择的抗病毒药物中,一旦发生rtM204I/V变异,后续抗病毒治疗的难度明显增加。Tenney等[16]的研究表明rtM204V与rtL180M联合变异病毒株更易发生与ETV耐药相关rt184、rt202和rt250位点突变, 在临床治疗中对已发生rtM204V与rtL180M联合突变的疗效不佳CHB患者加用或换用ETV抗病毒治疗时,必须密切注意患者的病情变化。
综上所述,本研究通过检测了598例HBV感染患者的HBV基因型及常见的8个耐药位点变异情况,长春地区HBV感染患者以C基因型为主,B型和BC混合型较少,同时观察到乙型肝炎患者HBV基因耐药的变异类型和变异模式日趋复杂,在长期抗病毒治疗过程中,进行HBV基因耐药检测,对于正确选择抗病毒药物及合理选择治疗方案具有重要的参考价值。
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(收稿日期:2015-03-12)