采用Graphpad prism 5.0绘制生存曲线

高永强，孙芳

1.内蒙古鄂尔多斯市第二人民医院肝病科，内蒙古鄂尔多斯017000；2.内蒙古鄂尔多斯市中心医院保健科2区，内蒙古鄂尔多斯017000

采用Graphpad prism 5.0绘制生存曲线

高永强1，孙芳2

1.内蒙古鄂尔多斯市第二人民医院肝病科，内蒙古鄂尔多斯017000；2.内蒙古鄂尔多斯市中心医院保健科2区，内蒙古鄂尔多斯017000

医学论文经常涉及对统计学及图表的应用，本文简要阐述科学图形软件Graphpad Prism5.0在生存曲线绘制、图表修改方面的应用。

统计学；科学图形软件；生存分析

Graphpad Prism是一款集数据分析和作图于一体的数据处理软件，它可以直接输入原始数据，也可以输入初步统计数据，然后自动进行基本的生物统计，如t检验、卡方检验、生存分析等，并根据需要制作科学图表。虽然其数据分析统计功能没有SAS、SPSS等专业软件强大，但其所具有的功能实用精炼，操作简单，图表绘制颇具特色，深受生命科学研究领域的研究者喜爱。

生存分析为预后研究的通用方法，主要目的是了解影响疾病病程和转归的各种预后因素,为医生预判患者结局并选择适当的干预措施提供依据[1]。目前国内学者的医学论文中统计分析及插图绘制出错屡见不鲜，有学者指出应从插图的物理意义、物理量与单位的搭配以及版面的需求和美学的观点等方面审核插图,合理布局,和谐统一[2]。生存曲线绘制对于医生或者研究生来说也有不小的挑战。

GraphPad Prism拥有基本的生物统计、曲线拟合和科学作图功能，并能将3者紧密结合。由于该软件易于操作，适合应用于生命科学领域中的数据作图与分析[3]。

1 软件打开

打开Prism→选择survival→选择第一或第四个图。Show result as中选择“Fractions”那么纵坐标是从0～1，选择“Percents”那么纵坐标是从0～100。点击create，进入下一步(图1)。

2 数据录入

录入生存数据。数据的排列格式如下（以两组随访资料比较为例）(图2)。

图1 GraphPad Prism软件数据作图与分析

①第一列（X轴）：是研究中患者的随访时间。单位可以是月、年等。

②第二列（甲）：是第一组患者对应的生存或死亡的情况，这里0代表生存，1代表死亡。第一行在表中是1,0，说明该患者随访了1个月，1个月随访时状态是生存，这一组第一个死亡的病例在表中是：10,1，说明该患者在10个月的时候死亡。

图2 GraphPad Prism数据的排列格式

③第三列（乙）：是第二组患者对应的生存或死亡的情况，解释同上。

数据都录入好了就可以直接点左侧Graphs的Data1 (图3)，这样可以得到最初的生存曲线(图4)。

图3 Graphs的Data1

目前曲线不能直接用，不符合论文统计图要求，生存曲线需要Y轴的最高点是1或100%，这个图明显不合适。下面我们来改改这个图让它更符合我们的要求。

3 曲线编辑

把鼠标点向Y轴，双击出现以下对话框（图5）。

①点击去掉Automatically determine the range and interval。

图4 最初的生存曲线

②把range中的maximum改成100。

③点击”OK“就可以获得我们常常看到的生存曲线了(图6)。

图5 曲线编辑

4 曲线的美化

①双击任一生存曲线可以改变曲线的颜色，线型。改的同时图示中的颜色和线型也会同步改过来。

②双击Y轴可以添加参考线。大多数研究会讨论中位生存时间，只要我们在图中双击Y轴，在”Additional ticks and grid lines“中写入50，点选Tick Line在Details按钮中选择参考线的颜色和线型即可。可以得到以下这条符合要求的生存曲线了（图7）。

甲组的中位生存时间大概是16个月，B组的中位生存时间大概是25个月。当然，要是愿意增加25%或75%都是可以的。只要在”Additional ticks and grid lines“中根据需要添加即可。同样方法双击X轴可以得到1年生存率等等。还可以双击修改图片名称、坐标轴名称等等（图7，图8）。

图6 生存曲线1

图7 生存曲线2

5 图像输出

首先选择上方一排中的工具栏，找到其中的导出（export）工具，接着导出窗口会显示出来，然后在其中做正确的选择。选择不同是依照不同的目的。因研究需要最终投稿印刷。故选择导出TIF格式[2]。接着在导出的选项中，选择输出分辨率（1200dpi）（为保障打印清晰，线图必须保证在1000dpi以上）。颜色模式（Color mode）选择RGB颜色，真彩色（millions of colors）选项。在Size选项里输入8 cm（该研究需打印半版面8 cm，若打印2/3整版面就填15 cm、若打印整个版面就填17 cm）[4]。接着在导出地址的选择，选择要导出的文件夹。以及为导出的图片命名，点击OK。

图8 生存曲线3

图9 整版图片

该软件包含另外一个功能，它支持在软件中将多个图表同时进行排版，最后输出一张集合在一起的整版图片。关键要点是选择排版布局（Layouts）进行完成[3]，见图9。

一个图像的大小和清晰度，主要看它的分辨率和尺寸。大小相同的图像，分辨率越高图像显示越清晰。分辨率大小是指单位尺寸范围内包含的像素数目，所以像素与分辨率有直接关系。在像素数额定前提下，图像尺寸改变，其分辨率也会发生变动。

科技期刊内，线条图的比例占有成分很大。为了达到清晰的图形效果，往往都将模糊的图形进行重新描绘。

而这样得出的图形，不同程度上失去了其原貌，尤其是在两幅图差别本来就极小，如波形图，从而造成图像混淆、重叠等现象，图像的质量得不到认可，且描图时所需工作量很大，既费时又费力。而采该研究的处理方法使用后，一是图形不失真，二是工作量较小，图形也可以自己负责处理，这对于自行排版的论文人而言，无疑是有巨大实用价值的。

总之，插图是科技论文中最具表现力的部分规范而准确的插图不仅具有活跃和美化版面的功能，还能提高论文的质量和可读性，对基础研究、临床实践、医学教研都有很高的实用价值[5]。计算机软件科学的发展促进和提高了科技论文图片的编辑加工水平。

[1]李楠,陶立元,赵一鸣.生存分析—儿科预后研究的常用工具[J].中华儿科杂志,2015(2):152.

[2]王蕾.科技论文插图审核应注意的几个问题[J].天津科技, 2015，42(4):68-70.

[3]周登远,崔壮，焦振山.临床医学研究中的统计分析和图形表达实例详解[M].北京：军事医学科学出版社,2011：238-244.

[4]许卓文,杜媛鲲.医学论文中插图的正确表达和编辑加工[J].临床荟萃,2013,28(9):1079-1080.

[5]唐增煦,陈海峰,崔彦红,等.科技期刊论文插图常见问题分析[J].卫生研究,2013,42(2):350-352.

Drawing Survival Curve by Graphpad Prism 5.0 Software

GAO Yong-qiang1，SUN Fang2
1.Department of Liver Disease Section,The Second People's Hospital of Ordos City,Ordos,Inner Mongolia，017000 China；2.Department of Care Division 2 Area,Ordos City of Inner Mongolia Hospital,Ordos,Inner Mongolia，017000 China

Statistics and charts was often involved in medical academic papers.This paper briefly expounds the methods of drawing survival curve by scientific graphics software graphpad prism5.0 and modifying the chart.

Statistics;Scientific graphics software;Survival analysis

R19

A

1672-5654(2015）05(b）-0012-04

2015-02-11）

高永强（1979.9-），男，陕西榆林人，硕士，主治医师，目前从事消化系统疾病、老年病临床研究及卫生统计相关工作。