P2X受体的结构解析进展

2014-05-17 03:03虞诗诚郑超然顾霄鹏李桂林梁尚栋
中国药理学通报 2014年10期
关键词:晶体结构孔道斑马鱼

虞诗诚,郑超然,顾霄鹏,李桂林,梁尚栋

(南昌大学基础医学院生理学教研室,江西南昌 330006)

三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)配体门控P2X受体家族是由7个克隆亚型分别组装的同源或异源三聚体离子通道。研究显示,ATP不仅是细胞中主要的能量来源和核酸组分,在细胞间信息交流中也发挥重要作用。已证实[1-2],P2X受体为非选择性阳离子通道,存在于哺乳动物组织中并调节多种生理功能,可影响神经系统突触信号的快速传递,平滑肌细胞收缩、血小板聚集、巨噬细胞活化、细胞增殖和死亡等。P2X受体斑马鱼P2X4受体晶体结构的发现极大地推进了对其P2X受体分子和生理功能的理解,以及其药物靶点的预测和实验验证。本文探讨P2X受体结构和功能的关系,并简单介绍P2X受体选择性配体最新研究成果。

1 P2X受体的分子结构

1.1 主要结构和亚基拓扑结构 P2X受体含有两个跨膜结构域(transmembrane domain,TM),一个大的胞外配体结合环,胞内的 N(氨基)和 C(羧基)末端[1]。

1.2 四级结构 异源性表达于非洲爪蟾卵母细胞中P2X1和P2X3受体的实验首次揭示P2X受体通道的三聚体结构,并最后被斑马鱼P2X4亚型的晶体结构所证实[1,3]。

2 P2X受体的晶体结构

斑马鱼P2X4受体(zfP2X4受体)同源三聚体受体结构与一只酒杯相似,TM区由6个螺旋体形成沙漏形状,大的胞外结构域则突出于膜表面大约70Å之上,并且从细胞质侧面观察呈右旋状[1,4-5]。zfP2X4单个亚基结构形状类似海豚,其中TM螺旋和胞外区分别类似“尾鳍”和“上身”。附着于“身体区域”的分别定义出“头域”,“背鳍”和“左右脚蹼”(Fig 1)。

Fig 1 Crystal structure of an independent subunit from the zfP2X4 crystal form

3 配体结合位点与结构解析

3.1 ATP结合位点 研究表明,P2X受体家族有保守的ATP结合口袋(Fig2),带正电荷的氨基酸残基(Lys68、

Fig 2 Crystal structure of the ATP-binding zfP2X4

Lys70、Arg292和 Lys309)和芳香残基 (Phe185、Thr186、Asn290和Phe291)(P2X1受体编号)对ATP结合起着重要作用[6-7]。

3.2 拮抗剂结合位点 研究显示,(136KAKRK140)(P2X1受体编号)在NF449的P2X1选择性拮抗中发挥作用,Arg290和Gly72(P2X2受体编号)对苏拉明衍生物强力的拮抗作用非常重要[8]。

3.3 与激动剂和拮抗剂作用的结构变化 有研究报道,结合区域的构象变化发生在ATP结合之前,P2X受体拮抗剂TNP-ATP的结合后头域几乎无移动[9-11]。

3.4 ATP结合与通道门控 研究表明,激动剂结合后引起整个受体发生巨大的构象变化,这些变化导致TM2螺旋的加宽,把孔道展开成虹膜状,进而允许离子穿过孔道[10-13]。

3.5 离子进入孔道 斑马鱼P2X4受体晶体结构揭示在相邻亚基的边界形成3个侧向的“窗孔”,并通过短的通道连接跨膜孔。侧向“窗孔”可能是P2X受体的重要变构调节区域,一旦离子穿过“窗孔”,它们即可迅速通过开放的孔道[14-15]。

4 结语与展望

P2X受体的晶体结构证实了许多基于突变研究的推测,并有助于进行有计划的点突变研究,通过不同亚型同源模型结构推测和解释实验结果。但是,特定亚型的分子机制尚不清楚,受体孔道的开放、胞膜形态的变化尚需探明。竞争性抑制的原子机制、变构调节、失敏及其它功能变化的问题都亟待深析。然而,斑马鱼P2X4受体晶体结构的发现有助于利用P2X受体结构信息,通过分子模拟软件预测可能的配体结合方式和作用类型,进而从许多未知作用的药物中筛选出P2X家族潜在的特异性激动剂和拮抗剂。

参考文献:

[1] Kawate T,Michel JC,Birdsong W T,et al.Crystal structure of the ATP-gated P2X4ion channel in the closed state[J].Nature,2009,30:592-8.

[2] 徐昌水,高 云,梁尚栋,等.骨骼肌P2受体的功能与疾病[J].中国药理学通报,2010,26(2):144-7.

[2] Xu C S,Gao Y,Liang SD,et al.Function of P2 receptors in skeletalmuscle and their roles in the diseases[J].Chin Pharmacol Bull,2010,26(2):144-7.

[3] Nicke A,Bäumert H G,Rettinger J,etal.P2X1and P2X3receptors form stable trimers:a novel structuralmotif of ligand-gated ion channels[J].EMBO J,1998,17(11):3016-28.

[4] Hausmann R,Günther J,Kless A,et al.Salt bridge switching from Arg290/Glu167 to Arg290/ATP promotes the closed-to-open transition of the P2X2receptor[J].Mol Pharmacol J,2013,83:73-84.

[5] Miklavc P,Thompson K E,Frick M.A new role for P2X4receptors asmodulators of lung surfactant secretion[J].Front Cell Neurosci,2013,7:171.

[6] Du J,Dong H,Zhou H X.Gatingmechanism of a P2X4receptor developed from normalmode analysis and molecular dynamics simulations[J].PNAS,2012,109(11):4140-5.

[7] Mahaut-Smith M P,Jones S,Evans R J.The P2X1receptor and platelet function[J].Purinergic Signal,2011,7:341-56.

[8] El-Ajouz S,Ray D,Allsopp R C,Evans R J.Molecular basis of selective antagonism of the P2X1receptor for ATP by NF449 and suramin:contribution ofbasic amino acids in the cysteine-rich loop[J].Br Pharmacoll Sci,2012,165:390-400.

[9] Jiang R,Taly A,Lemoine D,et al.Tightening of the ATP-binding sites induces the opening of P2X receptor channels[J].EMBO J,2012,31:2134-43.

[10]Jiang R,Taly A,Grutter T.Moving through the gate in ATP-activated P2X receptors[J].Trends Biochem Sci,2013,38:20-9.

[11]LörincziÉ,Bhargava Y,Marino S F,et al.Involvement of the cysteine-rich head domain in activation and desensitization of the P2X1receptor[J].Proc Natl Acad Sci USA,2012,109(28),11396-401.

[12]Hibbs R,Gouaux E.Principles of activation and permeation in an anion-selective Cys-loop receptor[J].Nature,2011,474:54-60.

[13]Du J,Dong H,Zhou H X.Gatingmechanism of a P2X4receptor developed from normalmode analysis andmolecular dynamics simulations[J].PNAS,2012,109:4140-5.

[14]Roberts JA,Allsopp R C,Ajouz SM,et al.Agonist binding evokes extensive conformational changes in the extracellular domain of the ATP gated human P2X1receptor ion channel[J].PNAS,2012,109,4663-7.

[15]Asatryan L,Popova M,Woodward JJ,etal.Roles of ectodomain and transmembrane regions in ethanol and agonist action in purinergic P2X2and P2X3receptors[J].Neuropharmacology,2008,55,835-43.

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