河南汉族人群12个X-STR基因座的遗传多态性

刘亚举，苏伟民，岳俊涛，史绍杏，郭利红

（1.许昌市公安局刑事科学技术研究所，河南许昌461000；2.长葛市公安局刑侦大队，河南长葛461500；3.南阳市公安局刑事科学技术研究所，河南南阳473000；4.河南省公安厅刑事科学技术研究所，河南郑州450003）

采用Investigator Argus X-12复合扩增系统对河南汉族人群12个X-STR基因座的遗传多态性进行调查，获得了这12个X-STR基因座的河南汉族人群遗传学数据，旨在为法医学应用及群体遗传学研究提供基础数据，报道如下。

1 材料与方法

538例河南汉族无关个体纸质血样取自实验室日常建库，每个样本均有条码标记，其中男性269名，女性269名。

采用BSD-QP型打孔机按直径3.2 mm取样，检材置于96孔板管孔内，每板中待测样本90个。采用sbeadex®forensic kit（英国LGC有限公司）提取基因组DNA，参照Investigator Argus X-12试剂盒（德国QIAGEN公司）说明书进行X-STR复合扩增。PCR扩增体系为8 μL，其中反应混合物A（包含Mg2+、dNTP和BSA）1.6μL，引物0.8μL，Taq DNA聚合酶0.2μL，纯水4.9μL，模板0.5μL。热循环参数：94℃4min；96℃30s，63℃120s，72℃75s，5个循环；94℃30s，60℃120s，72℃75s，25个循环；68℃60 min；10℃保温。然后取1μL扩增产物、DNA size standard 550（标记橙色荧光素BTO）0.5μL和去离子甲酰胺10μL混合，95℃变性3min后，冰浴3min，置3500XL型遗传分析仪上进行全自动毛细管电泳，Collection软件收集数据，用GeneMapper ID-X软件进行等位基因分型。

用PowerMarker v3.25软件[1-2]分别统计269名男性个体和269名女性个体在12个X-STR基因座的等位基因频率。用Arlequin v3.5软件对男性群体和女性群体之间各基因座的等位基因频率分布差异进行Fisher’s精确检验，并对12个X-STR基因座在女性群体中的分布进行Hardy-Weinberg平衡检验。用PowerMarker v3.25软件和Cervus 3.0软件统计12个X-STR基因座在538名河南汉族无关个体中的等位基因频率，登陆http://www.chrx-str.org网站[3]使用在线计算功能，用男女合并后数据计算所得等位基因频率，统计分析各个基因座在男性群体的个人识别率（DPM）、在女性群体的个人识别率（DPF）、杂合度（H）、三联体平均非父排除率（MECtrio）、二联体平均非父排除率（MECduo）和多态信息含量（PIC）等群体遗传学参数[4-5]。

2 结果与讨论

对12个X-STR基因座在男性和女性群体中的等位基因频率分别进行计算，经Fisher’s精确检验后，12个X-STR基因座的等位基因在男性和女性群体中的分布差异无统计学意义，故计算12个X-STR基因座在538名无关个体中的等位基因频率，结果见表1，等位基因分型标准物之外的稀有等位基因（offladder allele）被检出。采用Arlequin v3.5软件对12个X-STR基因座在女性群体中的Hardy-Weinberg平衡进行检验，发现各基因座均符合Hardy-Weinberg平衡（P＞0.05），基于总体频率数据计算12个X-STR基因座的群体遗传学参数，结果见表2。

本研究中，12个X-STR基因座在河南汉族人群中共检出180个等位基因，其中DXS10135基因座等位基因数最多，为26个；DXS7423基因座等位基因数最少，为5个。这12个X-STR基因座在河南汉族人群中的H值为0.504 4～0.911 6，PIC值为0.426 2～0.9048。多态性分析结果表明，12个X-STR基因座中，DXS7423具有中度多态性，其余11个基因座均具有高度多态性（PIC＞0.5，H＞0.5）。这12个X-STR基因座在河南汉族男性群体和女性群体中的累积个人识别率（CDP）分别为1-2.2105×10-9、1-2.2049×10-15，在河南汉族三联体和二联体中的累积平均非父排除率（MEC）分别为1-1.6496×10-6、1-9.3067×10-9。

本研究显示，Investigator Argus X-12系统在河南汉族人群具有良好的多态性，其系统效能达到了法医DNA检验的要求，对法医学个人识别和亲权鉴定案件，尤其是能够为疑难复杂特殊亲权案件的鉴定提供有效的手段，在河南汉族人群中具有较高的应用价值。

表1 河南汉族人群12个X-STR基因座的等位基因频率分布（n＝538）

表2 河南汉族人群12个X-STR基因座的群体遗传学参数（n＝538）

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