弱阳离子磁珠联合MALDI-TOFMS技术检测肾盂尿路上皮癌血清差异蛋白

2013-03-22 05:58董德鑫李汉忠石冰冰张玉石徐维锋
基础医学与临床 2013年11期
关键词:诊断模型磁珠肾盂

董德鑫,李汉忠,石冰冰,张玉石,徐维锋

(中国医学科学院北京协和医院泌尿外科,北京100730)

肾盂尿路上皮癌术前诊断困难,需要与肾盂里的凝血块和息肉等进行鉴别,而尿找瘤细胞等确诊阳性率较低[1]。本研究利用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱技术(matrix assisted laser desorption ionization time of flightmass spectrometry,MALDI-TOFMS)比较肾盂尿路上皮癌组和对照组的血清样本,寻找对于肾盂尿路上皮癌具有鉴别意义的血清差异蛋白峰,弥补尿找瘤细胞阳性率不高的缺点,提高肾盂尿路上皮癌的术前诊断率。

1 材料与方法

1.1 研究对象:肾盂尿路上皮癌组:2010年12月至2011年4月期间,于北京协和医院泌尿外科病房采集肾盂癌患者术前血清样本共计16例,其中男性10例,女性6例,年龄范围54~79岁,平均70.3岁。所有患者均行腹腔镜肾盂癌根治术,术后病理确诊为肾盂尿路上皮癌。对照组:采集非肾盂癌对照组术前标本共计11例,均为男性,年龄范围34~77岁,平均52.5岁。术后病理确诊为肾囊肿4例,肾结石4例,良性前列腺增生3例。

1.2 标本收集:清晨空腹状态抽取肘静脉血3~5 mL,置入真空无抗凝剂BD采血管,2 000 r/min,离心10 min后吸取上层血清,分装入艾本德管后置于-80℃低温冰箱冻存。

1.3 实验步骤:200μL样品管加入10μL磁珠结合缓冲液、10μL磁珠和5μL血清吸打混匀,分离后加入100μL磁珠清洗缓冲液,重复上述步骤两次,加入5μL磁珠洗脱缓冲液,分离后将上清液移入新的0.5μL样品管,加入5μL磁珠稳定缓冲液并吸打混匀。

取1μL标准品与10μL基质混合,后取1μL混合液点在Anchorchip靶标准品位置。采用美国AutoflexTMMALDITOF-MS质谱仪,不同结晶点,多点采集,累加5~10个结晶点数据。取磁珠处理后的样品,同标准品点样方法,结果分子量偏差小于100 ppm。

1.4 结果判定:根据整体波形特点,剔除不合格图谱,并对低分子量区间波峰分子量进行校正。采集分子质量区间范围为1~10 ku,选择标准品进行分子质量校正。利用Clin-ProTools2.2软件对质谱图的数据进行分析,筛选血清差异蛋白峰,建立肾盂尿路上皮癌的诊断模型。

2 结果

2.1 肾盂尿路上皮癌与对照组之间血清差异蛋白峰筛选:质谱仪采集分子质量区间1~10 ku范围内全部可识别蛋白峰127个,凝胶模拟示意图(图1),具有显著差异的蛋白峰6个,分子质量分别为 4074.14、145.15、7475.45、1546.94、2547.55和4592.11(P<0.05)。

2.2 遗传算法建立肾盂尿路上皮癌诊断模型:利用ClinPro-Tools2.2软件通过遗传算法优化选择,筛选出符合条件的14个差异蛋白峰建立诊断模型(表1),交叉验证后识别能力为100%。

图1 两组样本血清差异蛋白峰凝胶模拟示意图Fig 1 Gel simulation diagram of differential protein peaks of two samp les of serum

表1 筛选出符合条件的14个差异蛋白峰建立诊断模型Table 1 The diagnosismodel is established by 14 differentially expressed proteins

3 讨论

肾盂尿路上皮癌是发生在肾盂或肾盏上皮的恶性肿瘤,约占所有肾肿瘤的10%左右。本病大多数为尿路上皮癌,尿路上皮癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同时出现。患者发病年龄多在40岁以上,男女比例约为3∶1,左右发病无明显差异,双侧发病者约2% ~4%[2]。

约70%~90%的肾盂移行细胞癌患者早期临床表现的重要症状为无痛性肉眼血尿,少数病人因肿瘤或凝血块阻塞肾盂输尿管而引起腰部不适、隐痛及胀痛。肾盂癌术前诊断困难,尤其与肾盂里的息肉、血块等良性病变鉴别诊断困难,而尿找瘤细胞等检查阳性率偏低。肾盂占位的术前诊断不同,采取的手术方式截然不同。

MALDI-TOFMS技术是在新近发展起来的蛋白质组学新技术,采集的差异蛋白峰分子质量范围在1~10 Da,结果中许多在统计学上显著差异的蛋白质分子质量在5000 Da以下,MALDI-TOFMS技术在寻找小分子量差异蛋白上的优势明显[3]。遗传算法是近些年发展起来的一种全局优化算法,借用了生物遗传学的观点,通过自然选择、遗传及变异等作用机制,实现个体的适应性提高。本研究利用ClinPro-Tools2.2软件对质谱图的数据进行分析,就是利用遗传算法进行组合优化,筛选多个差异蛋白峰,建立肾盂尿路上皮癌的诊断模型。该诊断模型敏感性和特异性较高。

本研究是应用蛋白组学对肾盂尿路上皮癌的初步研究,应用蛋白组学技术筛选差异蛋白峰,并建立肾盂尿路上皮癌的诊断模型具有较高的敏感性和特异性,可以弥补尿找瘤细胞阳性率不高的缺陷,有利于肾盂尿路上皮癌的早期诊治。

[1]Giebel R,Worden C,Rust SM,et al.Microbial fingerprinting using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flightmass spectrometry(MALDI-TOF MS)applications and challenges[J].Adv Appl Microbiol,2010,71:149-184.

[2]Raman JD,Scherr DS.Management of patients with upper urinary tract transitional cell carcinoma[J].Nat Clin Pract Urol,2007,4:432 -443.

[3]Wong MY,Yu KO,Poon TC,etal.Amagnetic bead-based serum proteomic fingerprintingmethod for parallel analytical analysis andmicropreparative purification[J].Electrophoresis,2010,31:1721-1730.

猜你喜欢
诊断模型磁珠肾盂
经输尿管软镜钬激光内切开引流治疗肾盂旁囊肿21例体会
CD4细胞计数联合IGRA预测AIDS/Ⅲ型TB影像诊断模型分析
胎儿肾盂扩张相关疾病的三维超声诊断研究
磁珠固定化凝血酶的制备及其在槐米中活性化合物筛选中的应用
肾衰合剂对大鼠肾盂高灌注压损伤的保护作用
鸢尾黄斑病毒免疫磁珠RT-PCR检测方法的建立及应用
马蹄肾自发性肾盂破裂伴尿外渗1例报告
应用磁珠法检测并提取尿液游离甲基化DNA
对于电站锅炉燃烧经济性诊断模型的研究
纳米免疫磁珠富集猪肉中的盐酸克伦特罗