大肠癌易感基因hMLH1、hMSH2的筛查

2012-08-20 05:46侯睿智安治国毛静涛侯治富
中国实验诊断学 2012年1期
关键词:大肠癌危险性基因突变

侯睿智,安治国,魏 君,毛静涛,侯治富*

(1.吉林大学中日联谊医院,吉林 长春 130033;2.北京龙迈达科技有限公司,北京 100176)

大肠癌易感基因hMLH1、hMSH2的筛查

侯睿智1,安治国1,魏 君1,毛静涛2,侯治富1*

(1.吉林大学中日联谊医院,吉林 长春 130033;2.北京龙迈达科技有限公司,北京 100176)

目的 探讨hMLH1、hMSH2基因多态性与大肠癌发病危险的研究。方法采用大样本随机对照试验,运用PCR和DNA直接测序方法,筛查外周血单个核细胞DNAhMLH1、hMSH2基因多态性。结果大肠癌组hMLH1-exon12 1151T→A的突变阳性率为12.20%,与对照组(6.10%)相比,无显著差异(P>0.05);而hMSH2-exon1 IVS1+9C→G的突变阳性率为46.70%,与对照组(33.33%)相比差异显著(P<0.05)。在各年龄组间,hMLH1-exon12、hMLH1-exon12突变无显著性差异(P>0.05)。危险性分析表明,携带hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生大肠癌的相对危险性为无基因突变组的1.75倍,若不携带基因突变,其肠癌发病率将降低42.9%;若在人群中无hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生,则大肠癌的发病率将降低20%。结论hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变可作为大肠癌发病的危险因素,并可作为检测指标。

大肠癌;多态性;hMSH2

(ChinJLabDiagn,2012,16:0049)

hMSH 2基因位于染色体区域2p 21,在遗传连锁分析中,是最早被确定的影响遗传性非息肉性大肠癌(HNPCC)综合征的一个重要的候选基因。其编码产物hMSH 2蛋白与hMSH 6或hMSH 3形成异二聚体,并以异二聚体复合物的形式识别、结合DNA复制中的错误位点,借以消除子代序列中的错误,使DNA复制按照母模板序列正常复制。

hMLH1基因位于染色体3p 21-23,与hMSH 2基因一样与HNPCC有关。其基因编码产物hMLH1蛋白本身无酶活性,与hMLH3,hPMS2或hPMS1形成异二聚体,借以结合其他的DNA修复蛋白。

早期的研究表明,hMSH2基因的16个外显子和hMLH1基因的19个外显子都能发生致病性突变。目前尚没有关于这两个基因致病性突变、或是多态性的评价标准。在本项研究中,试图通过大样本随机对照试验,探索在大肠癌中这种突变的致病性或致病危险性。

1 对象与方法

1.1 患者选择与分组150例大肠癌患者均为2007年-2009年吉林大学中日联谊医院住院病例。其中,男性86例,女性64例;平均年龄为49.5岁。诊断标准采用全国大肠癌病理研究协作组2002年制定的《全国大肠癌病理研究统一规范》。另选取150例健康体检者作为对照,其中男性79例,女性71例;平均年龄47岁。

1.2 去静脉全血,分离单个核细胞提取DNA,用QIAGEN旋转柱纯化样本。

1.3 PCR扩增目的基因片段由宝生物工程(大连)有限公司合成引物。hMLH1-exon12上游引物5′-ACAGACTTTGCTACCAGGACTTG-3′,下 游引 物 5′-TGTCTTATCCTCTGTGACAATGG-3′。hMSH2-exon1上游引物 5′-TCGCGCATTTTCTTCAACC-3′,下 游 引 物 5′-GTCCCTCCCCAGCACGC-3′。PCR循环参数为:充分变性95 ℃、5 mins,变性95℃、40s,退火55℃、40s,延伸72℃、60s。35个循环,再充分延伸72℃、5mins。经琼脂糖电泳鉴定PCR产物。

1.4 DNA序列测定PCR反应管内加入1μl的3M醋酸钠,1μl EDTA和25μl无水乙醇,吹打混合均匀。室温放置15-30min,12 000rpm,4℃15-20min离心,小心吸弃溶液,加入70%的乙醇漂洗,12 000rpm,4℃8-10min离心,再次加入70%的乙醇漂洗,上述条件离心,开盖闭光晾置,至残余酒精彻底挥发干净,使PCR产物纯化。加入10μl hidi(甲酞胺),95℃变性2-3min,立即冰浴,即可上机。比较在测序图上的相应碱基序列峰型,如果出现峰型重叠,根据峰型的颜色、波幅,判定置换的碱基。

1.5 统计方法采用SPSS13.0统计软件,对hMSH2基因IVS1+9C→G、hMLH1基因1151T→A多态性进行危险度(Risk)分析和等级相关分析。

2 结果

2.1 PCR扩增结果对150例健康体检者、150例大肠癌患者外周血单个核细胞DNA进行hMLH1-exon12、hMSH2-exon1 扩 增 后,分 别 在 216bp 和281bp处获得了扩增产物。其中有147例健康体检者、82例大肠癌标获得hMLH1-exon12扩增出结果;126例健康体检者、90例大肠癌标本获得hMSH2-exon1扩增出结果。

2.2 DNA序列分析结果对147例健康体检者和82例大肠癌患者hMLH1-exon12扩增PCR产物进行DNA序列分析(结果见表1,2)。

统计结果表明,大肠癌组的突变阳性率为12.20%,与对照组(6.10%)相比,无显著差异(P>0.05)。

Tab.1 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer patients

Tab.2 hMLH1-exon12 1151T→A in colorectal cancer of different ages

在各年龄组间,hMLH1-exon12 1151T→A突变阳性率的Kendall等级相关分析表明,无显著性差异,χ2近似于零,P>0.05)。

对126例健康体检者和90例大肠癌患者hMSH2-exon1扩增PCR产物进行DNA序列分析(结果见表3,4)。

Tab.3 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer patients

结果表明,大肠癌组的突变阳性率为46.70%,与对照组(33.33%)相比差异显著(P<0.05)。

危险性分析表明,携带hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生大肠癌的相对危险性(OR)为无基因突变组的1.75倍;在对照组中,若不携带基因突变,其肠癌发病率将降低42.9%(特异危险性百分比AR%);若在人群中无hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生,则大肠癌的发病率将降低20%(人群特异危险性百分比PAR%)。

Tab.4 hMSH2-exon1IVS1+9C→G in colorectal cancer of different ages

在各年龄组间,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变阳性率的Kendall等级相关分析表明,无显著性差异(χ2=0.139,P>0.05)。

3 讨论

大肠癌(Colorectal cancer,CRC)是全球第三个最常见的癌症,位居肺癌和乳腺癌癌症之后。60%发生在较发达地区。按年龄标准化率和累计计算,0-74岁人群中大肠癌的发病率和死亡率有明显的地理变异。在世界各地,捷克发病率最高(43/10万),非洲(3.6/10万,除南非)和中南亚(4.5/10万)发病率最低。欧洲CRC死亡率最高,中非地区死亡率最低。

根据中国卫生部2002年的报告,结直肠癌的发病率已由70年代的第6位升至90年代的第3位,并且年死亡率上升至10.25/10万,在世界范围内处于较低水平[1-4]。

大肠癌的确切病因仍不清楚,随着人们对家族性腺瘤性息肉病、遗传性非息肉性大肠癌认识的深入,追寻遗传标志筛查大肠癌成为当今的热点。本课题组的前期研究也表明,大肠癌p53基因突变率为44%,并于ras基因协同突变[5,6]。揭示了大肠癌发生演变中的遗传因素的作用。

关于MMR基因突变,国内外有较多的文献报道。特别是在遗传性非息肉性结直肠癌(hereditary nonpolyposis colorectal cancer,HNPCC)的研究中,己有大量的错配修复基因突变资料的积累。在HNPCC中绝大多数的肿瘤是由hMSH2和hMLH1基因的胚系突变引起的,其中hMSH2基因的突变占31%,hMLH1占33%。在散发性结肠癌和胃癌中,己报道的hMLH1基因的突变(42%),较hMSH2基因高(8%)[7]。

有研究发现,至少在白人中hMLH1的 WS14-19多态位点的A和G两种基因型,预实验的数据提示这种多态与部分直肠癌的发病有关。Hutter等报道,在结直肠癌患者中hMLH1的突变型IVS14-19G基因型较正常人群的高,分别为55.5%和39.2%,相关危险性G是A的1.93倍。除了荷兰患者组,其余各组亦得到相同结果。错配修复基因PMs2中的SNPs与MLH1之间存在蛋白水平的相互作用,可导致基因的改变,进而影响表达蛋白的功能,这三种多态均增加了HNPCC发生危险[7]。

本研究采用了PCR-DNA Direct sequencing技术,针对大肠癌患者的外周血单个核细胞的DNA进行了检测,进一步深入研究hMSH2和hMLH1基因多态与大肠癌发病的相关性和危险性。研究结果表明,hMLH1-exon12 1151T→A突变阳性检出率,大肠癌组为12.20%,与对照组(6.10%)相比,无显著差异(P>0.05)。在各年龄组间的Kendall等级相关分析结果无显著性差异(χ2近似于零,P>0.05)。在hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变分析中,大肠癌组的突变阳性率为46.70%,显著高于对照组(33.33%)(P<0.05)。进一步的危险性分析提示,携带hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生大肠癌的相对危险性(OR)为无基因突变组的1.75倍;在对照组中,若不携带基因突变,其肠癌发病率将降低42.9%(特异危险性百分比AR%);若在人群中无hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变发生,则大肠癌的发病率将降低20%(人群特异危险性百分比PAR%)。在各年龄组间,hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变阳性率的Kendall等级相关分析无显著性差异(χ2=0.139,P>0.05)。

尽管这一结果与国外有关大肠肿瘤hMLH1基因和hMSH2基因变异的蛋白表达水平研究结果不完全一致,但结果提示,hMSH2基因突变不仅与HNPCC的发病有关,而且与一定比例散发性大肠癌有关,并且认为hMSH2基因是诱导细胞凋亡而导致肿瘤抑制的一个重要机制。因此,筛查hMSH2-exon1IVS1+9C→G突变,仍然可以作为大肠肿瘤筛查、早期诊断的参考指标。

[1]Miladinov-Mikov M,Lukic N,Petrovic T.Epidemiological characteristics of colorectal cancer in Vojvodina[A].In:Riboli E,Lambert R,editors.Nutrition and Lifestyle:Opportunities for Cancer Prevention[C].International Agency for Research on Cancer.Lyon:IARC Sci Publ,2002:156,547.

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[7]Hutter P,Wijnen J,Rey-Berthod C,et al.An MLH1haplotype is over-represented on chromosomes carrying an HNPCC predisposing mutation in MLH1[J].J Med Genet,2002,39(5):323.

Screening of susceptible gene hMLH1and hMSH2in Colorectal cancer

HOURui-zhi,ANZhi-guo,WEIJun,etal.(China-JapanUnionHospitalofJilinUniversity,Changchun130033,China)

ObjectiveTo explore the hMLH1,hMSH2gene polymorphisms and colorectal cancer risk.MethodsUsing large sample randomized controlled trials,hMLH1,hMSH2gene polymorphism of peripheral blood mononuclear cells DNA were screened by PCR and DNA direct sequencing.ResultshMLH1-exon12 1151T->A mutation in colorectal cancer group was 12.20%,there is no significant difference comparing with control group(6.10%)(P>0.05);hMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation(46.70%)was significantly higher than control group(33.33%)(P<0.05).But there is no significant difference in ages(P>0.05).Risk analysis shows that,the relative risk with hMSH2-exon1IVS1+9CG mutations in colorectal cancer is 1.75times of control group.The incidence of colorectal cancer will be reduced by 42.9%if it do not carry the gene mutation,and be reduced by 20%in population.ConclusionhMSH2-exon1IVS1+9C->G mutation can be used as the pathogenesis of colorectal cancer risk factors,and can be used as the testing index.

Colorectal cancer;polymorphism;hMSH2

1007-4287(2012)01-0049-03

吉林省科技发展计划项目(200705308,20090738)

*通讯作者

R735.3+4

A

2010-11-29)

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