杜司晨 摘编
本文发表在2012年的《Clinical Chemistry》上。
目前,通过对母体血浆DNA 的深度测序可以确定胎儿的遗传基因组和突变基因组,这项技术在许多单基因遗传疾病的无创性产前诊断(NIPD)中有重要应用。在此过程中,相关单倍体剂量(RHDO)分析是十分关键的一步,即通过父母的SNP深度测序数据推断出母体外周血中胎儿的单倍型。临床上筛选致病基因位点时,RHDO 的靶向应用可能会减少数据分析的成本及复杂性。因此,证明靶向RHDO 分析在NIPD 中的可行性是十分必要的。
作者运用大规模平行测序技术,对2个经产前诊断为β-地中海贫血家系的β-珠蛋白基因进行测序,之后通过液相杂交实现靶向富集。同时,运用数字PCR 从理论上推断亲代的单倍型。最后,运用RHDO 分析技术,对富集的序列以及推断的亲代单倍型分析,以此判断胎儿是否患有β-地中海贫血。结果显示,一对具有相似单倍型结构的亲代家系,其所有的胎儿都是β-地中海贫血基因的携带者。因此,对靶向富集的基因数据的RHOD 分析是成功的。
综上所述,母亲血浆DNA 靶向测序应用于单基因遗传疾病的无创性产前诊断是成立的。