宁夏番茄地田间杂草携带主要病毒检测及分析

2024-04-19 01:04戴荣李建设
农业与技术 2024年7期
关键词:菊科侵染种类

戴荣 李建设

(宁夏大学葡萄酒与园艺学院,宁夏 银川 750021)

引言

番茄是宁夏设施冷凉露地主要栽培蔬菜之一[1],其罹患的病毒病呈现出爆发性强,传播快且危害范围广的现象,是造成番茄减产的重要原因[2]。目前,番茄可感染病毒病的种类较多,同时番茄出现复合侵染的情况较为普遍[3-5]。而田间杂草对番茄生长会造成严重威胁[6],与番茄竞争生长空间,同时也为番茄病毒病的传播提供了媒介[6]。目前,已对宁夏番茄植株上携带的病毒病种类做出鉴定[7-10],但番茄田间杂草携带病毒种类还未有报道。本研究主要针对宁夏3个县(市)7个乡镇56块疑似携带病毒的番茄地田间杂草进行采样,采取PCR、RT-PCR技术,明确田间杂草携带病毒种类,以期为今后番茄病毒病的防控提供更加科学的指导。

1 材料与方法

1.1 试验材料

2023年8月,对宁夏3个县(市)7个乡镇共计56块番茄田进行采样调查。对疑似发病番茄周边(地膜下杂草不取)的杂草进行拍照、采样。株型小的杂草采集全株,株型大的杂草使用75%乙醇消毒后的剪刀剪取带叶片的茎秆(藤蔓)1~2条,装入装样袋,做好标记。将采集样品立即置于液氮中速冻,保存于-80℃冰箱保存备用。每剪取1个样品后立即用75%乙醇擦拭剪刀消毒处理。

1.2 植物总DNA/RNA的提取及cDNA的合成

参照试剂盒提供的方法,分别使用天根多糖多酚植物总RNA提取试剂盒(货号:DP441)与天根多糖多酚植物基因组DNA提取试剂盒(货号:DP360)提取田间杂草总RNA/DNA。以提取的总RNA为模板进行反转录。采用Vazyme生物公司的HiscriptⅢ1st Strand cDNA Synthesis Kit(货号:R312-01)进行反转录,反应的体系及步骤参照产品说明书。

1.3 番茄病毒引物信息

宁夏地区番茄病毒病主要受到番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)、番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)、番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)、番茄斑驳花叶病毒(tomato mottle mosaic virus)、南方番茄病毒(STV)、番茄褪绿病毒(Tomato chlorosis virus,ToCV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)7种病毒的侵染,并新发现番茄褐色皱纹病毒病(Tomato brown rugose fruit virus,ToBRFV)。同时检测另外常见的2种侵染番茄的病毒——烟草花叶病毒(tobacco mosaic virus,TMV)、番茄环纹斑点病毒(Tomato zonate spot virus,TZSV)。引物相关信息见表1。

表1 用于RT-PCR扩增番茄病毒的特异性引物

1.4 RT-RCR/RCR及电泳检测

PCR/RT-RCR检测:利用病毒特异性引物,见表1,按下述体系与条件扩增。体系:2×TaqMaster Mix(Dye Plus)(货号:P112-01)10μL,上下引物各0.5μL,cDNA模板2μL,ddH2O 7μL。条件:94℃→4min;94℃→30s,53℃→30s,72℃→45s,34个循环,72℃延伸10min。扩增完成,分别取4μL扩增产物在0.8%琼脂糖凝胶上电泳检测,并用全自动凝胶成像系统记录结果。

2 结果与分析

2.1 杂草感染病毒的表现特征

通过走访拍照采样发现,与正常生长的杂草相比,感染病毒的苦苣菜上部新叶出现浅黑褐色斑点,见图1a;下部老叶斑点颜色加深,斑点扩大,轻微萎缩,叶片蜷曲,可从叶片扩展至整棵植株,见图1b;叶片背部叶脉由绿转紫,茎秆支撑力变弱,植株倒伏,部分叶片发生脱落,见图1c。马齿苋叶片出现黄色斑点,见图1d;反枝苋新叶呈现黄色斑点,老叶边缘黄化、褪绿,从边缘辐射至叶脉,出现枯斑,见图1e;打碗花叶片出现黄绿相间的花叶,见图1f,茎秆发黄变脆,叶片向下卷曲,蔓延至整棵植株;凹头苋叶片背部与长鬃蓼叶片正面,见图1g、图1h,均出现浅褐色斑点,集中密集;乳苣叶片出现古铜色斑块,见图1i,部分斑块枯萎,叶片背部也清晰可见。

注:a~c为苦苣菜(菊科);d为马齿苋(马齿苋科);e为反枝苋(苋科);f为打碗花(旋花科);g为凹头苋(苋科);h为长鬃蓼(蓼科);i为乳苣(菊科)。图1 几种杂草侵染病毒田间症状

2.2 宁夏番茄田间不同种类杂草所携带病毒检测结果

通过对采集的18科53种576份杂草样品提取总RNA/DNA,利用特异性引物进行RT-PCR/PCR扩增,如表2所示,结果表明,共检测出6种病毒,分别为ToMV、TYLCV、TSWV、ToMMV、STV、ToCV。其中,295份样品检出病毒,有281个样品未检测到病毒,病毒检出率高达51.22%。

表2 宁夏番茄田间杂草及其携带病毒种类

不同病毒感染的杂草种类与感染率有一定差异。STV可侵染的杂草种类和数量最多,除黄花蒿外18科52种193株杂草被感染,杂草种类间感染率略有差异,节节草感染率最高为64.71%,马唐的感染率最低为9.09%;其次是ToCV,可侵染17科45种杂草,采集的菊科杂草2/3可被侵染;ToMV可感染12科23种杂草,菊科可侵染杂草种类最多,包括欧洲千里光、花叶滇苦菜等5种杂草;受到TYLCV侵染的杂草高达31种,采集的禾本科杂草均可感染此病毒,以冰草最甚,侵染率高达100%;TSWV可侵染的杂草种类最少,涉及6科11种杂草,十字花科的3种杂草皆可感染此病毒,1/2独行菜样品检测出此病毒;ToMMV可侵染的杂草种类最少,涉及5科8种杂草,包括马唐、早熟禾、苦苣菜、黄花蒿、藜、地肤、打碗花与野西瓜苗。

从被感染杂草种类的角度来分析,STV感染杂草的情况依次为其他科、苋科、藜科、菊科、蓼科、禾本科;ToCV感染率排序为苋科>其他科>藜科>菊科、蓼科>禾本科;ToMV感染杂草的种类最低为藜科,禾本科、菊科、苋科感染率相差不大,蓼科未检测到被侵染杂草;TYLCV感染率排序为苋科>禾本科>菊科>藜科>蓼科>其他科;TSWV感染率的高低顺序为其他科>苋科>菊科,其中禾本科、蓼科与藜科未检测到杂草感染;ToMMV感染率排序为其他科>禾本科>藜科>菊科,蓼科与苋科未检测到感染样本。

对杂草感染番茄病毒种类整理并进行数据分析,STV的检出比例最高为33.51%,是危害宁夏范围最广的病毒;其次是ToCV,检出率为27.95%;ToMV、TYLCV的检出率分别为13.37%、14.41%;TSWV、ToMMV总检出率较低,分别为5.73%、4.17%。

2.3 宁夏地区杂草携带番茄病毒的复合侵染分析

使用ToMV、TYLCV、TSWV、ToMMV、STV与ToCV的特异性引物,见表1,对所采集的576份样品进行PCR/RT-PCR检测,结果显示,分别扩增出480bp、648bp、425bp、1193bp、681bp、450bp。而TMV、CMV、TZSV、ToBRFV与阴性对照均未扩增出目的条带。对采自立岗镇的打碗花进行实验,扩增出480bp、425bp、681bp、450bp 4条特异性DNA条带,见图2,分别为ToMV、TSWV、STV、ToCV 4种病毒。说明所采集的番茄地田间杂草发生了复合侵染现象。

1.番茄花叶病毒;2.番茄黄化曲叶病毒病;3.番茄斑萎病毒;4.烟草花叶病毒;5.番茄斑驳花叶病毒;6.南方番茄病毒;7.黄瓜花叶病毒;8.番茄褪绿病毒;9.番茄环纹斑点病毒;10.褐色皱纹果病毒;11.阴性对照;M.分子质量标准DL2000 DNA Marker图2 打碗花PCR/RT-PCR扩增电泳凝胶图像

通过对杂草感染番茄病毒复合侵染的现象进行分析发现,见表3,在292份阳性样品中,有37份样品为单一病毒感染,复合侵染率高达87.33%。2种病毒复合侵染情况最严重,占复合侵染总比的41.57%,其中STV加ToCV为优势毒株,在宁夏地区侵染面积最广,感染植株种类最多;3种病毒复合侵染类型较多,侵染率为38.04%;4种病毒复合侵染率略低,占复合侵染总比的19.61%;5种病毒侵染率最低,为0.78%,病毒感染种类复杂,分别为ToMV加TSWV加ToMMV加STV加ToCV,ToMV加TYLCV加ToMMV加STV加ToCV。暂未检测出6种病毒的复合侵染。

表3 宁夏地区杂草主要病毒病侵染率

3 讨论

本研究采用分子技术检测的方法,对采自宁夏3个县(市)7个乡镇56块番茄田18科53种576份杂草样本进行病毒检测,结果共检测出ToMV、TYLCV、TSWV、ToMMV、STV与ToCV 6种病毒。刘晨等研究认为,TYLCV可以感染多种杂草[15],本试验暂未得到全部验证,可能与样本数量、采样地环境、药物控制及此地频发病毒类型等原因相关。TSWV可侵染的杂草以菊科侵染的数量占比最大,与李婷婷等研究结果吻合[16],同时杂草也是TSWV越冬毒源[17]。STV可侵染的杂草种类和数量最多,遍布所采样本的18科52种193株杂草;ToCV为宁夏番茄病毒病的主流病毒[18],发现可侵染17科46种杂草;表明STV、ToCV这2种病毒在杂草上的寄主广泛,以禾本科和菊科可侵染杂草种类最多;且卢丁伊慧等通过对ToCV的模型研究得出,上一茬番茄收获后,杂草作为中间寄主,利用烟粉虱的活动侵染下一茬番茄,形成周期性循环[19]。ToMMV自宁夏地区番茄上检出后,首次在禾本科、菊科、藜科等5科8种杂草上被鉴定,检出率为4.17%,可能通过混有病残体的土壤、种子与携带病毒的植物摩擦[20]传播此病毒。ToMV可侵染禾本科等11科22种杂草,与张海峰研究相符合[21],或通过与感病番茄叶片摩擦、携带病毒的土壤和残存的根茎与种子带毒传播[22]。ToMMV与ToMV的寄主范围有一定差异[23]。高温干旱、粉虱的爆发与病毒病的传播密切相关[24]。从杂草类型的角度分析,禾本科与菊科感染频率最高,可能与这2种杂草种类多且为田间优势杂草有关。所采集的样品来自番茄采收末期,正值番茄病毒爆发期。高温干旱,粉虱、蓟马等虫害,田间管理与病株间相互摩擦等综合因素使得病毒侵染率居高不下。

蔬菜作物上检出病毒复合侵染情况不足为奇,不同类型病毒发生复合侵染,导致植物内病毒间协同或拮抗,更多表现为协同[25]。杂草最多可被5种病毒同时侵染,STV与多种病毒复合侵染,在山东[28]、新疆[29]、北京[30]等地均有报道。本研究通过对番茄病毒在杂草上复合侵染的现象进行分析发现,2种及2种以上病毒复合侵染现象频发。复合侵染的杂草样本占总样本数量的44.27%,主要以ToMV与TSWV、ToMMV、STV、ToCV、TYLCV病毒发生复合侵染,其中2种病毒复合侵染情况最严重,占复合侵染总比的41.57%,以STV加ToCV复合侵染为宁夏地区优势病毒。检测出ToCV与TSWV侵染,这2种病毒间发生相互协作[26]。刘微研究表明,ToCV与烟粉虱、植物三者存在互作关系,与健康番茄相比,带ToCV的番茄释放出的物质吸引烟粉虱取食,加速病毒的传播[27]。猜测携带ToCV的杂草也可释放出吸引烟粉虱来取食的物质,从而加速病毒传播。而TSWV加ToCV两者的协同作用或导致对2种病毒敏感的番茄加速死亡,携带Sw-5抗病基因的番茄对TSWV表现出抗性[26];在杂草上是否表现抗性或加速死亡,还需进一步探究。TYLCV加TSWV加STV加ToCV 4种病毒的复合侵染,或因昆虫获毒、病毒协作、土壤带毒所致[31]。杂草出现病毒复合侵染与病毒的传播方式、周围环境、土传病害、栽培作物等息息相关[10]。

试验样品采自番茄收获末期,未体现不同生长阶段番茄与杂草携带病毒的差异性及相关性;番茄生长后期携带病毒种类繁多,可能导致杂草带病毒率更高。杂草是否感染宁夏地区番茄病毒病的其他毒源,还需进一步扩大样本容量去证实。

4 结论

宁夏地区番茄地田间杂草感染番茄病毒情况较为严重,2种病毒复合侵染情况最为普遍,暂未发现杂草不感染番茄病毒。杂草作为昆虫栖身地与饮食场所,也是病毒传播的重要寄主[16,32-35],为番茄病毒病的传播提供了可能,控制杂草在控制番茄病毒传播的同时有效减轻对作物伤害。结合前人众多研究成果和本研究结果分析认为,在农业操作中,种植前彻底铲除田间杂草成为必要的工作[36],还要控制田间昆虫数量,减少传播来源,切断传播途径[37],实行轮作,以避免因杂草、种子或土壤带毒传染下一茬作物,引发番茄病毒病,从而造成减产和品质下降。

猜你喜欢
菊科侵染种类
揭示水霉菌繁殖和侵染过程
菊科药用植物遗传多样性及亲缘关系的ISSR分析
种类丰富的酒具
消防车种类知多少
镜头像差的种类
芸薹根肿菌侵染过程及影响因子研究
消防车有哪些种类
甘蓝根肿病菌休眠孢子的生物学特性及侵染寄主的显微观察
菊科植物总黄酮的提取工艺研究进展
施秉县菊科植物资源评价研究