CTLA-4基因多态性及其相关蛋白与原发性胆汁性胆管炎的相关性

2023-03-30 00:43冯婧黄祎王琴黄山
分子诊断与治疗杂志 2023年2期
关键词:免疫性等位基因多态性

冯婧 黄祎 王琴 黄山★

原发性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangitis,PBC)又称原发性胆汁性肝硬化,是一种慢性以女性为主的炎症性和胆汁淤积性肝病,其特征是中小型肝内胆管受到自身免疫性破坏,临床上多以血清中碱性磷酸酶升高和抗线粒体抗体M2亚型阳性为主要特点[1]。PBC 是一种具有明显遗传易感性的自身免疫性肝病。从遗传学的角度分析,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与多种自身免疫疾病相关,它包括基因的编码序列、基因的非编码区和基因之间的基因间区域。由于SNP 引起相关蛋白结构发生改变,进而影响自身免疫性疾病的发生发展。细胞毒性T 淋巴细胞抗原4(cytotoxic T lymphocyte antigen 4,CTLA-4)是编码T 细胞调节、激活和抑制蛋白的基因,被认为是许多自身免疫性疾病的候选基因,已有多个基因多态性报道,其中包括rs231775 和rs3087243 和[2-4]。CTLA-4基因编码常见的蛋白有两种:CTLA-4 与可溶性CTLA-4(soluble cytotoxic T lymphocyte antigen 4,sCTLA-4)[3]。有研究显示,某些自身免疫性疾病(如Graves'病、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮)与CTLA-4的分子变异有关[2-4]。本研究拟探讨CTLA-4基因多态性、CTLA-4 及sCTLA-4 与PBC的关系,为诊断PBC 寻找新的血清学指标。

1 资料与方法

1.1 研究对象

选取2019年10月至2021年10月重庆市中医院PBC 患者共78 例,其中男10 例,女68 例,平均年龄(62.19±10.04)岁,入组标准:PBC 诊断依据2017年欧洲肝病学会临床实践指南[5];健康组60名来自同期本院的健康体检者,其中男9 名,女51名,平均年龄(62.27±12.43)岁。排除标准:①合并其他自身免疫性疾病者;②诊断为其他肝胆疾病者;③合并恶性肿瘤等疾病。两组年龄、性别之间差异无统计学意义(P>0.05)。两基因位点的各基因型频率分布符合Hardy-Weinbery 遗传平衡检验(P>0.05),所得数据具有良好的群体代表性。所有患者或家属知情同意,本实验通过医院伦理委员会批准。

1.2 方法

1.2.1 rs231775、rs3087243 位点SNP 检测

采集静脉血5 mL,以3 000 r/min 速度(离心半径为10 cm)离心10 min,分离血清,留存血细胞均于-80℃冻存备用。①采用上海生工公司血液基因组Ezup 柱式DNA 抽提试剂盒,提取血液中的基因组DNA,操作按照试剂盒说明书进行。②参照NCBI GeneBank 数据获取2 个基因多态性位点的序列,设计待测SNP 位点的聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增引物,rs231775 上游引物:5'-CCC ACG GCT TCC TTT CTC-3',下游引物:5'-TAC CTG GCG CTC TGT TCT G-3',产物534 bp。rs3087243 上游引物:5'-TTC ATT CAG TAT CTG GTG GAG-3',下游引物:5'-TGA GAA AGC AGG CGG TAA-3',产物283 bp。采用上海生工公司Taq PCR Mix 预混液(2×,含蓝染料)试剂盒,使用25 μL 反应体系在BIO-RAD CFX Connect PCR 仪器上进行PCR 反应,具体反应条件如下:94℃预变性4 min;94℃变性30 s,60℃退火30 s,72℃延伸30 s,共进行35 次循环,72℃终延伸10 min,反应终止后4℃保存。③采用海生工公司DNA 分子量标准Marker(100~600 bp),对扩增产物进行2%琼脂糖凝胶电泳。④rs231775、rs3087243 目的基因扩增结束后,使用第一代基因检测技术检测SNP(目的基因正向一代测序由武汉金开瑞生物公司完成)。

1.2.2 CTLA-4、sCTLA-4 的检测

对上述冻存血清,采用酶联免疫吸附法(试剂盒购买自上海江莱生物)检测CTLA-4、sCTLA-4,操作按照试剂盒说明书进行。

1.3 统计学处理

采用SPSS 19.0 进行统计学处理;计量资料进行方差齐性分析,若方差齐,以()描述,进行t检验分析,若方差不齐以M(P25~P75)描述,进行非参数秩和检验分析;计数资料以n(%)表示,行χ2检验;多态性位点的基因型、等位基因与患病的风险分析采用非条件Logistic 回归计算比数比(odds ratio,OR),以OR及95%CI表示相对风险度;相关性采用Spearman 分析;采用受试者工作特征曲线(ROC)对诊断效能进行评价;以P<0.05 表示差异有统计学意义。

2 结果

2.1 rs231775、rs3087243 扩增产物2%琼脂糖凝胶电泳及测序

rs231775、rs3087243 经PCR 扩增后目的基因为分别为534 bp、283 bp,对目的基因进行2%琼脂糖凝胶电泳后见图1;rs231775、rs3087243目的基因进行正向位点测序,各基因型图谱。见图2。

图1 扩增产物2%琼脂糖凝胶电泳Figure 1 2%agarose gel electrophoresis of amplified products

图2 rs231775、rs3087243 正向位点测序图Figure 2 rs231775、rs3087243 forward site sequencing map

2.2 病例组与对照组rs231775、rs3087243 各基因型、等位基因比较

与对照组比较,病例组的rs231775 GG 基因型比例、AG 基因型比例、G 等位基因频率及rs3087243 的GA 基因型比例均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05),且四者均能增加PBC 的患病风险(P<0.05);两组rs3087243 等位基因频率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。见表1、2。

表1 病例组及对照组rs231775 各基因型、等位基因比较[n(%)]Table 1 Comparison of genotypes and alleles of rs231775 in case group and control group[n(%)]

2.3 病例组与对照组外周血CTLA-4、sCTLA-4 浓度比较

与对照组比较,病例组外周血的CTLA-4、sCTLA-4 浓度均较低,差异有统计学意义(P<0.05)。见表3。

表2 病例组及对照组rs3087243 各基因型、等位基因比较[n(%)]Table 2 Comparison of genotypes and alleles of rs3087243 in case group and control group[n(%)]

表3 病例组与对照组外周血CTLA-4、sCTLA-4 浓度比较[(±s),M(P25~P75)]Table 3 Comparison of CTLA-4 and sCTLA-4 concentrations in peripheral blood between case group and control group[(±s),M(P25~P75)]

表3 病例组与对照组外周血CTLA-4、sCTLA-4 浓度比较[(±s),M(P25~P75)]Table 3 Comparison of CTLA-4 and sCTLA-4 concentrations in peripheral blood between case group and control group[(±s),M(P25~P75)]

组别病例组对照组t/Z 值P 值n 78 60 CTLA-4(ng/mL)3.66±1.78 6.00±5.09 2.48 0.016 sCTLA-4(ng/mL)0.29(0.00~0.63)0.54(0.00~0.83)-1.13 0.043

2.4 外周血CTLA-4、sCTLA-4 水平与ALT、AST、GGT、ALP 水平的相关性

相关分析显示,外周血CTLA-4 水平与γ-谷氨酰基转移酶(gamma-glutamyltransferase,GGT)水平呈负相关(P<0.05),与丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(aspartate aminotransferase,AST)、及碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)水平均无明显相关性(P>0.05);sCTLA-4 水平与ALT、AST、GGT 及ALP水平比较差异无统计学意义(P>0.05)。见表4。

表4 外周血CTLA-4、sCTLA4 水平与ALT、AST、GGT及ALP 水平的相关性Table 4 Correlation of peripheral blood CTLA-4 levels and sCTLA-4 levels with ALT,AST,GGT and ALP levels

2.5 外周血CTLA-4、sCTLA-4 的诊断效能

根据ROC 曲线分析,CTLA-4 诊断为PBC 的敏感度为0.850、特异度0.714,曲线下面积(AUC)为0.827(95%CI=0.755~0.899);sCTLA-4 诊断为PBC 的敏感度为0.667、特异度为0.486,AUC 为0.583(95%CI=0.486~0.682)。见图3。

图3 外周血CTLA4、sCTLA-4 对PBC 的诊断效能ROC 曲线Figure 3 ROC curve of diagnostic efficacy of peripheral blood CTLA4 and sCTLA-4 for PBC

3 讨论

PBC 是一种受遗传因素影响较多自身免疫性肝病,其表现出较强的遗传易感性,对同卵双胞胎进行自身免疫性疾病研究,结果显示PBC 的一致性最高[6]。PBC 易感基因主要分为人类白细胞抗原基因和非人类白细胞抗原基因(如CTLTA-4基因)两大类,其基因易感位点大多与免疫调节相关,这表明免疫调节通路紊乱可能在PBC 的发病中起关键作用[7]。

CTLA-4核苷酸大小约为6.2 kb,由4 个外显子和3 个内含子组成。前导肽序列由外显子1 编码,Ig 结构域由外显子2 编码,外显子3 和4 编码分别编码疏水性跨膜区和细胞质结构域。rs231775 也称为CTLA-4+49A/G,其位于CTLA-4第一外显子区域,由于其位点的A 突变为G 引起丙氨酸突变为苏氨酸,从而使CTLA-4 的功能发生了改变[2-3]。rs231775 G 等位基因携带者具有较强的PBC 易感性,这与报道[8-10]一致。rs3087243 亦与多种自身免疫性疾病相关[2-3,11-12]。CTLA-4 CT60(rs3087243)位于CTLA-4基因的3'端非编码区,虽然CTLA-4 CT60在3'端非编码区,但它可能会影响mRNA 的终止,从而影响CTLA-4 的剪接,CTLA-4 和sCTLA-4 两种mRNA 剪接形式的比例与rs3087243 不同的基因型有关[12]。但在本研究中,病例组rs3087243 GA 基因型比例高于对照组,但AA 基因型比例和等位基因频率在两组间并没有差异。而有报道[10,12]称rs3087243的A 等位基因是PBC 的保护因素,这可能与地域或人种有差异,但需要大量样本进行验证。

CTLA-4 是一种在调节性T 细胞(regulatory T cells,Treg)上组成性表达的跨膜蛋白,作为一种抑制性受体,它在结构上与CD28 同源,是Ⅰ型糖蛋白跨膜型免疫球蛋白超家族受体[10]。CTLA-4 比CD28 对B7(CD80/CD86)分子有更强的亲和力,并下调T 细胞的功能,CTLA-4 这种下调T 细胞功能的作用,阻止了自身免疫的发生,因此在自身免疫性疾病的易感性中起着关键作用[3]。正常的Treg可以抑制免疫细胞的过度活化,但在WANG 等人[13]的研究中,PBC 模型小鼠下调T 细胞的功能被抑制,从而导致免疫抑制功能较弱。转氨酶是反应肝肝脏功能较敏感的指标,在其他肝脏疾病和在PBC患者中常伴随转氨酶升高[14],在本研究中,CTLA-4与GGT 存在明显的相关性,这或许能用于PBC 与其他肝脏疾病的鉴别诊断。此外,ROC 曲线分析显示,CTLA-4 对诊断PBC 具有较好的诊断效能。sCTLA-4 亦与自身免疫性疾病相关,sCTLA-4 在静息Treg 中表达占主导地位,它可通过阻断B7(CD80/CD86)相互作用来抑制T 细胞的早期激活[9,15]。sCTLA-4 在PBC 中尚无报道,但在其他自身免疫性疾病中其低于正常对照组[16],在本研究中,病例组浓度虽然较低,但其对诊断PBC 效能较差。

综上所述,rs231775 的AG 基因型、GG 基因型、G 等位基因以及rs3087243 GA 基因型均能增加PBC 患病风险,此外,CTLA-4 与GGT 具有较强的相关性,其对PBC 具有较好的诊断效能,有望成为PBC 诊断的新指标。但在本研究中由于标本量有限,rs231775、rs3087243 的和CTLA-4、sCTLA-4 在临床实践中的有效性需要大量样本进一步验证。已有报道[15]针对CTLA-4 的融合蛋白用于其他自身免疫性疾病的治疗,后续试验意在研究CTLA-4对CD4+CD25+Treg 细胞的发育和功能影响,为探索PBC 的发病机制和临床治疗提供新思路。

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