E2F调控lncRNA HOTAIR在高磷诱导VSMCs钙化中的作用机制研究*

2023-02-07 08:35陈艳霞涂卫平朱淑英
中国病理生理杂志 2023年1期
关键词:萤光信息学靶向

陈艳霞, 柯 本, 涂卫平, 陈 艳, 黄 翀, 朱淑英

(南昌大学第二附属医院肾脏内科,江西 南昌 330006)

慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)是威胁人类健康的主要疾病之一,其患病率超过10%[1],其中矿物质代谢紊乱导致的血管钙化(vascular calcification, VC)是其特有且常见的并发症或合并症。CKD患者死亡的主要原因为心血管疾病(cardio vascular diseases, CVD),发生比例为 61.5%[2],其死亡率增加的独立危险因素为VC,同时VC被认为是最高的心血管危险因素[3]。据报道,CKD5期患者VC的发生率高达80%~90%[4]。许多因素参与了VC的发病机制[5],CKD患者的高磷血症已被证实是VC发病率和死亡率的独立危险因素[6]。VC是一个被积极调节的病理生理过程[7],且关键环节是血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells, VSMCs)向成骨细胞的转化[8]。前期研究显示高磷(high phosphorus,HP)能够诱导VSMCs的钙化,促使其向成骨细胞的表型发生转化,表达骨分化的标志物如骨形态发生蛋白9、Runt相关转录因子2等,同时其收缩表型如α-平滑肌肌动蛋白的表达下调[9]。深入探讨CKD患者VC的病理发生发展过程,对防治CKD患者的CVD,改善预后降低心血管风险具有重要研究意义和临床价值。

长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)HOTAIR可通过靶向miRNA-130b-3p抑制VSMCs的凋亡[10],参与VC过程。我们前期研究发现lncRNA HOTAIR可通过靶向miR-126上调Klotho从而抑制Wnt/β-catenin信号通路逆转HP诱导的VSMCs钙化[11]。生物信息学发现lncRNA HOTAIR的上游转录因子为 E2F、E2F-1、E2F-2、E2F-3a、E2F-4和叉头框蛋白 O1a(forkhead box protein O1a, FOXO1a),且已有研究表明E2F可通过调控细胞凋亡、炎症并介导Wnt/β-catenin信号通路发挥生物学作用,下调VC相关的骨桥蛋白的表达[12-14],提示E2F在VC发挥重要作用,但具体机制不清楚。本研究拟探讨E2F调控lncRNA HOTAIR在HP诱导VSMCs钙化中的作用及其机制,为VC防治寻找新的干预靶点和治疗策略提供研究方向。

材料和方法

1 主要试剂与仪器

人VSMCs购自于Lonza;钙沉积含量测定试剂盒购自于Biovision;细胞培养液中的胎牛血清购自Gibco;DMEM/F12 培养液购自 HyClone;Trizol试剂、qPCR用试剂盒、BCA试剂盒、Lipofectamine 2000、双萤光素酶相关的试剂、抗体、引物等均购自Invitrogen。核酸蛋白测定仪、PCR扩增仪和凝胶图像成像系统购自Bio-Rad;DYPC-31DN型电泳仪为北京六一仪器厂产品;酶标仪为Thermo产品。

2 实验方法

2.1 HP诱导VSMCs钙化构建细胞钙化模型和实验分组 以人主动脉VSMCs为研究对象,采用HP[10 mmol/L β-磷酸甘油酯(β-glycerol phosphate, β-GP)]诱导12 d后构建细胞钙化模型[9]。实验分组如下:正常对照(control)组,正常VSMCs培养;HP组,正常VSMCs+10 mmol/L β-GP共培养;HP+空载(HP+Adlaz)组,正常VSMCs+10 mmol/L β-GP共培养+Adlaz;HP+过表达 E2F(HP+AdE2F)组,正常 VSMCs+10 mmol/L β-GP共培养+AdE2F。以上实验处理中,转染时间为48 h。

2.2 RT-qPCR Trizol法提取组织或细胞RNA,逆转录合成cDNA。采用Primer Premier5.0设计上游和下游引物,将所得cDNA加至PCR反应体系中扩增目标片段。PCR反应条件为:95 ℃ 15 min;94 ℃变性30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,共 40个循环,以GAPDH作为参考。引物序列见表1。

表1 RT-qPCR引物序列Table 1. The sequences of the primers for RT-qPCR

2.3 Western blot 首先采用RIPA裂解液裂解细胞收集蛋白并进行蛋白浓度的测定,其次SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳。蛋白电泳后湿转于PVDF膜上,采用含5%脱脂奶粉的TBST封闭液封闭2 h,加入Ⅰ抗孵育过夜后加入辣根过氧化物酶标记的Ⅱ抗,洗膜后加入化学发光试剂显色。凝胶成像分析仪摄像并计算出检测蛋白灰度值。

2.4 茜素红S染色 PBS漂洗3次,10%中性甲醛固定,室温环境下孵育10 min,双蒸水漂洗3遍;加茜素红S染色液滴染1~5 min;McGee-Russell分化液进行迅速分化数秒,Mayer苏木素染色核浅染1~2 min后冲洗10 min;使用中性树胶封固后于倒置显微镜下观察,读取562 nm处的吸光度(absorbance,A)进行定量。

2.5 钙沉积含量测定 按说明书操作步骤准备标准曲线,准备好样品按操作说明书进行具体操作,30 min内读取波长610 nm处的标准液及待测样品的A值,根据标准曲线计算待测样品中钙含量。

2.6 双萤光素酶报告基因实验 采用生物信息学软件进行预测E2F、lncRNA HOTAIR和Klotho的可结合区域,合成E2F、Klotho野生(wild-type, WT)和突变(numtant, MUT)报告质粒,分别为E2F-WT-luc、E2F-MUT-luc、Klotho-WT-luc和 Klotho-MUT-luc。当VSMCs培养达到70%~80%融合时,通过Lipofectamine 2000将合成的报告质粒与lncRNA HOTAIR模拟物(mimics)或lncRNA HOTAIR阴性对照(negative control, NC)共转染48 h,根据制造商的方案,通过双萤光素酶报告基因系统评估每组萤光素酶相对活性,验证E2F、lncRNA HOTAIR和Klotho的关系。

3 统计学处理

采用SPSS 22.0统计软件进行数据处理。计量资料数据符合正态分布的用均数±标准差(mean±SD)表示。两组间比较采用独立样本t检验,多组奖比较采用单因素方差分析,组间多重比较用LSD-t法。以P<0.05为差异有统计学意义。

结 果

1 E2F、lncRNA HOTAIR和Klotho在HP诱导的VSMCs钙化中的表达

采用HP诱导VSMCs钙化构建细胞钙化模型,结果表明,HP组VSMCs出现钙化,钙沉积含量增加(图1A); RT-qPCR显示E2F mRNA、lncRNA HOTAIR和Klotho mRNA在HP组VSMCs中表达下调(图1B);Western blot显示E2F和Klotho蛋白在HP组VSMCs中表达下调(图1C)。

Figure 1. Expression of E2F, lncRNA HOTAIR and Klotho in calcification of VSMCs induced by high phosphorus (HP). A: calcium deposit content; B: the expression of E2F mRNA, lncRNA HOTAIR and Klotho mRNA detected by RT-qPCR; C:the expression of E2F and Klotho proteins detected by Western blot. Mean±SD. n=3. *P<0.05 vs control group.图1 E2F、lncRNA HOTAIR和Klotho在高磷诱导的VSMCs钙化中的表达

2 过表达E2F对HP诱导VSMCs钙化的影响

茜素红染色及钙沉积测定结果显示,过表达E2F后VSMCs钙化程度减轻(图2A、C); RT-qPCR结果显示,HP+AdE2F组VSMCs中lncRNA HOTAIR和Klotho mRNA表达上调(图2B);Western blot结果显示,HP+AdE2F组VSMCs中E2F和Klotho蛋白表达上调(图2D)。

Figure 2. Effect of E2F overexpression on high phosphorus (HP)-induced VSMCs. A: alizarin red S staining showed the formation of intracellular calcium nodules; B: the expression of E2F mRNA, lncRNA HOTAIR and Klotho mRNA detected by RT-qPCR; C: calcium deposit content; D: the protein levels of E2F and Klotho detected by Western blot. Mean±SD. n=3.*P<0.05 vs control group; #P<0.05 vs HP+Adlaz group.图2 过表达E2F对高磷诱导VSMCs的影响

3 E2F与lncRNA HOTAIR靶向关系验证

生物信息学发现lncRNA HOTAIR的上游转录因子为E2F,通过GSEA发现lncRNA HOTAIR高表达与KEGG通路中基础转录因子通路(BASAL_TRANSCRIPTION_FACTORS)显著正相关(NES=1.488,P=0.047),提示lncRNA HOTAIR上游可能受到转录因子的调控。Jaspar生物信息学网站预测发现转录因子E2F与lncRNA HOTAIR启动子存在5个结合位点。萤光素酶活性分析示lncRNA HOTAIR的低表达显著降低E2F WT中的萤光素酶活性,E2F的表达水平与lncRNA HOTAIR有直接相关性,呈现明显的正相关,见图3。

4 Klotho是lncRNA HOTAIR的靶基因

生物学信息软件预测发现,lncRNA HOTAIR的1 967~1 859位置与Klotho的976~1 117位置存在碱基互作配对,预测结合能为-30.3772 kcal/mol,提示lncRNA HOTAIR与Klotho具有可结合区域(图4A);萤光素酶活性分析示lncRNA HOTAIR的低表达显著降低Klotho WT中的萤光素酶活性,Klotho的表达水平与lncRNA HOTAIR有直接相关性,呈现明显的正相关(图4B)。

讨 论

lncRNA为大于200个核苷酸的非编码RNA,可直接调控基因的表达,也可通过“分子海绵”作用靶向多个 miRNA,间接调控基因的表达[15]。lncRNA HOTAIR的基因定位于12号染色体,为转录自HOXC位点的反义链[16]。在人主动脉瓣膜细胞中,lncRNA HOTAIR可被循环拉伸及受Wnt/β-catenin调节抑制细胞钙化[17]。lncRNA HOTAIR抑制大鼠骨髓间充质干细胞向成骨细胞分化,其作用机制与调控Wnt/β-catenin途径有关[11]。lncRNA HOTAIR可通过靶向miRNA-130b-3p抑制VSMCs的凋亡[10],参与VC钙化的过程。同时我们发现在HP诱导VSMCs钙化的细胞模型中,lncRNA HOTAIR可通过靶向miR-126上调Klotho抑制Wnt/β-catenin信号通路逆转HP诱导的VSMCs钙化[18]。由此可见,lncRNA HOTAIR参与CKD患者的VC过程。

Figure 4. Klotho was the target gene of lncRNA HOTAIR. A:binding regions between lncRNA HOTAIR and Klotho; B: low expression of lncRNA HOTAIR significantly reduced the luciferase activity in Klotho-WT. Mean±SD. n=3. *P<0.05 vs sh-NC group.图4 Klotho是lncRNA HOTAIR的靶基因

转录因子E2F最初是由于发现其能激活腺病毒E2启动子而被命名的,目前发现哺乳动物存在着多种E2F蛋白,每种E2F蛋白由300~500个氨基酸组成,且在结构上形成其特有稳定的结构域,为其发挥复杂功能的结构基础。E2F家族包括E2F1~8,通过介导特定下游靶基因转录激活调节细胞增殖和细胞周期。E2F家族还具有调节自噬、线粒体功能和DNA损伤反应的作用[19]。生物信息学发现,lncRNA HOTAIR的上游转录因子为E2F、E2F-1、E2F-2、E2F-3a、E2F-4和FOXO1a,且已有研究表明E2F可通过调控细胞凋亡和炎症并介导Wnt/β-catenin信号通路发挥生物学作用,下调VC相关的骨桥蛋白的表达[12-14],提示E2F在VC中发挥重要作用,但具体机制不清楚。我们研究发现HP诱导的VSMCs钙化中,HP组E2F和lncRNA HOTAIR表达下调,E2F蛋白也表达下调,提示E2F参与HP诱导的VSMCs钙化。过表达E2F,HP诱导的VSMCs钙化减轻,lncRNA HOTAIR表达逆转,提示E2F对HP诱导的VSMCs钙化具有保护作用,同时本研究发现lncRNA HOTAIR是E2F的靶基因,且具有正相关。因此,我们推测E2F通过调控lncRNA HOTAIR表达参与HP诱导VSMCs钙化过程。

Klotho介导VC的调控机制复杂。研究发现,LRRC75A-AS1可通过抑制VSMCs成骨样表型转化改善 VC[20]。lncRNAH19 通过 MAPK 信号通路调控Runt相关转录因子2的表达诱导VSMCs成骨样表型转化促进VC[21]。lncRNAES3可介导高糖诱导的VSMCs钙化[22]。虽对lncRNA的研究在不断增加,但lncRNA调控VC的研究较少[23]。我们既往研究提示lncRNA-SNHG29可通过下调miR-200b-3p激活Klotho/FGF23轴抑制 HP 诱导的 VSMCs的钙化[24],Klotho可通过抑制Wnt7b/β-catenin信号通路逆转HP诱导的VC过程[8]。本研究发现在HP诱导的VSMCs钙化中,HP组E2F和Klotho mRNA表达下调,Klotho蛋白也表达下调。过表达E2F后,Klotho mRNA表达呈现逆转,结合本项目组既往研究结果,推测E2F通过调控lncRNA HOTAIR介导Klotho参与HP诱导VSMCs钙化过程。

本实验目前局限在细胞水平的研究,动物水平及临床水平E2F通过调控lncRNA HOTAIR介导Klotho参与HP诱导VSMCs钙化过程需要进一步探讨。本研究提示E2F通过调控lncRNA HOTAIR介导Klotho参与HP诱导VSMCs钙化过程,为CKD患者VC的防治提供新的思路和依据。

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