曹 辉
(沈阳工学院生命工程学院,沈阳 抚顺 113122)
猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)又称“蓝耳病”,是一种危害大、难以控制的猪高度接触传染性疾病,主要是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)感染造成。主要临床表现为母猪繁殖障碍(晚期流产、早产、死胎、弱胎、木乃伊胎)、仔猪呼吸障碍、非特异性淋巴单核性和间质性肺炎甚至死亡等[1-4]。由于PRRSV 的变异性很高,在疫苗和药物的研究方面比较困难。
小RNA 又称为microRNA(miRNA),是一类内源性非编码RNA 分子,长度约为22 个碱基,且保守性很高。它可以与靶mRNA 进行互补或者部分互补,使mRNA 降解或导致其翻译受抑制,作为重要的转录后的调节因子用于调控基因的表达[5]。研究表明,miRNA 能影响病毒的复制,主要是miRNA 可靶向病毒基因组或调控宿主抗病毒反应。学者通过探索与PRRSV 相关的microRNA 来揭示其致病机制,以此来取得更新、更好治疗PRRS 的策略[6-10]。对有关miRNA 调控PRRSV 作用的研究进行阐述,为PRRSV 的防控研究提供科学指导,对制定合理的免疫程序以及开发PRRSV 疫苗具有重要意义。
研究表明,宿主细胞编码的miRNA 在各种免疫细胞的产生、增殖、发育以及免疫应答过程中发挥着重要的调控作用。在T 细胞增殖过程中,miR-142-3p 可以与跨膜蛋白GARP(Glycoprotein A repetitions predominant)的3'端高度保守的miRNA 结合区域结合,通过调节GARP 的表达来控制CD4+T 细胞的增殖[11]。在B 细胞的发育和凋亡过程中,miR-34a 和miR-17-92 簇可以分别通过下调转录因子Foxp1 和促凋亡蛋白Bim,抑制B 祖细胞向前体B 细胞发育[12]。同时,宿主细胞编码的miRNA 还能通过干扰病毒复制因子,调控病毒复制及染毒细胞凋亡来影响病毒增殖。如miR-340-5p 可以影响HBV 的复制[13],miR-325-3p 能 抑 制HBV 的 复 制[14],miR-211-5p 能够促进HBV 的复制[15];miR-34a 能抑制AIV 病毒的复制[16],而miR-29c 在AIV 的诱导下能够促进细胞凋亡过程[17]。gga-miR-445-5p、miR-375 能够抑制NDV 的复制[18,19]。随着miRNA 的病毒调控作用方面研究的深入,尤其是在猪病毒疾病的研究中,与PRRSV 相关的miRNA 也陆续被挖掘,PRRSV 作为单股正链RNA 病毒,其基因组含有较长的非编码区,可以为microRNAs 发挥作用提供众多靶点。不同的miRNA 可以通过不同的机制来调节PRRSV 入侵宿主的生物学过程[20]。
CD163 是PRRSV 入侵宿主细胞的关键受体。吴俊静等[21]通过筛选和鉴定来获得能够调控CD163基因进行翻译表达的miRNA,并以此为基础找到能很好抑制PRRSV 复制的miRNA。在此基础上,通过试验进一步在细胞水平证实了miRNA-181c、miRNA-23b、miRNA-4262 能对PRRSV 的复制产生抑制效应,其中miRNA-4262 的抑制效果最好。研究还发现,miRNA-4262 也可调控CD169基因。CD163和CD169这2 个基因可能同时受miRNA-4262 靶向调控,从而提高了抑制PRRSV 复制的能力。
为探讨mir-3215 和mir-let-7g 和PRRSV 的 关系,钟瑶[22]成功筛选到mir-3215 和mir-let-7g 靶向基因组保守区域位,设计特异性引物,选取不同的时间点,用qPCR 的方法检测经PRRSV 刺激后的Marc-145细胞,观察对miRNA表达的影响。结果表明,在感染早期,mir-3215 和mir-let-7g 表达受到抑制,但随着时间延长,抑制情况减弱,36 h 左右mir-let-7g 先恢复到正常水平,而mir-3215 表达量要稍高一些,可能的原因是细胞内mir-3215 表达代偿性强。
Reinhart 等[23]在秀丽隐杆线虫里发现了let-7,它是一种能够调节lin-41基因mRNA 表达的microRNA。此外,在果蝇和人类等有机体内也证实存在let-7。研究表明,let-7 家族成员在对抗病原微生物的感染过程中起着重要作用。李娜[24]通过不同的引物设计、生物信息学软件预测等方法,发现let-7f-5p 能够和MYH9 3’UTR 的miRNA 特异性结合,发挥对MYH9 转录后的调控作用,let-7f-5p 在PAMs被PRRSV 感染后表达水平有所下降,但是它的靶基因MYH9的表达水平有上升的趋势。此外,在PAMs中进行了let-7f-5p 模拟物的转染试验,将转染终浓度设置为20、50、100 nmol/L,当转染100 nmol/L let-7f-5p 模拟物时,将其与对照组相比发现,细胞培养上清液中PRRSV 的病毒基因组拷贝数降低了83%,PRRSV ORF7 mRNA 降低了80%,抑制了MYH9 的表达,表明let-7f-5p 呈浓度梯度依赖性抑制PRRSV在PAMs中的复制。
miR-130a、miR-130b、miR-301a、miR-301b 和miR-454 是miR-130 家族的5 个成员。李丽薇[25]在MARC-145 细胞上转染miR-130 家族模拟体,结果显示miR-130 可以抑制病毒复制。其中抑制作用最强的是miR-130b。以miR-130b 作为主要的研究对象,通过间接免疫荧光试验验证miR-130b 对PRRSV N 蛋白的影响,结果表明N 蛋白表达被miR-130b 所抑制。随着miR-130b 转染剂量的增加,其对PRRSV 抑制作用越明显。
使用不同PRRSV 毒株感染宿主靶细胞PAMs,采用qRT-PCR 方法对PAM 中mir-10a-5p 水平进行定量检测,验证了宿主靶细胞PAMs 中miR-10a-5p表达上调可通过不同PRRSV 毒株感染来进行诱导;将前后转染的miR-10a-5p mimics 用不同毒力的PRRSVs 进行感染,结果显示这2 种情况下过表达miR-10a-5p 均可抑制不同毒力PRRSVs 的复制,且效果显著;此外,还对特异性表达SRP14 的腺病载体进行了构建,研究SRP14 对PRRSV 复制的影响,结果表明,为控制对PRRSV 的复制以及SRP14 的翻译,可以使miR-10a-5p 与相应的靶细胞结合,以此来识别SRP14,可有效抑制其表达,但会使PRRSV感染加速,导致SRP14 的表达能力降低,从而控制PRRSV 在PAMs的产生[26,27]。
miRNA 会对PRRSV 的复制起到促进作用。陈静[28]运用过表达miR-373 的模拟物(miR-373 mimic)或抑制miR-373 表达的抑制剂(miR-373 inhibitor)转 染MARC-145 细胞 来检 测PRRSV 的增 殖情况,结果发现PRRSV 滴度可以通过miR-373 模拟物来提高,细胞内外的PRRSV RNA 和N 蛋白的表达水平上调;相反,PRRSV 滴度可以通过miR-373 抑制剂来降低,细胞内外PRRSV 的RNA 和N 蛋白的表达水平下调。这表明,PRRSV 在MARC-145 细胞和PAMs 中的复制可以通过miR-373 来促进。研究还发现,用抑制Sp1 表达和过表达Sp1 的质粒先转染MARC-145 细胞,再进行感染PRRSV,说明通过抑制Sp1 也能抑制PRRSV 的RNA 水平,降低PRRSV滴度和下调PRRSV N 蛋白的表达水平,而过表达Sp1 则起到相反的作用。这表明Sp1 可以促进PRRSV 复制。此外,用MARC-145 细胞共同转染Sp1-Flag、miR-373 inhibitor 或形成各自对应的对照,转染后通过检测PRRSV 增殖情况,结果表明Sp1促进PRRSV 复制依赖于miR-373 的表达。
Xiao 等[29]研究PRRSV 感染仔猪肺组织的转录组变化时发现,PRRSV 感染后血红素加氧酶1 基因(heme oxygenase 1,HO-1)显著下调表达,与体外研究结果一致[30]。王雪[31]通过生物信息学软件预测并 验 证 出miR-24-3p 是HO-1 的 靶miRNA,用PRRSV 感染MARC-145 细胞发现,miR-24-3p 的表达量显著升高;在MARC-145 细胞中过表达miR-24-3p 发 现,HO-1 的表 达量 下 降而PRRSV 的 感染量上升,这说明HO-1 的表达受miR-24-3p 调控,且miR-24-3p 和HO-1 的关系呈负相关。
在病毒与宿主的对抗中,细胞运用多重障碍以及自身的免疫防御来阻止病毒的入侵,但在长期进化过程中,病毒为了能顺利进入细胞,完成复制增殖和传播一系列过程[32-34],采取各种策略来建立有利于感染的环境。miRNA 既可以靶向作用病毒入侵的细胞关键因子[35,36],也可以直接作用于病毒基因组,其在病毒与宿主的互作中扮演着重要的角色[37,38]。随着miRNA 研究的不断深入,宿主miRNA 如何调控PRRSV 的复制也将更清晰,PRRSV 疫苗的成功开发也将指日可待。