余智涛 张 磊 温建燔
环状RNA为非编码RNA家族成员,其广泛存在于人体组织中,其表达具有组织特异性,是非编码RNA 领域的研究热点[1]。既往研究显示,环状RNA具有多种生物学功能,其可通过mRNA海绵作用,提升靶基因的表达[2]。本课题组前期应用芯片技术筛选发现,胃癌组织中环状RNA TADA2A呈低表达。因此,为进一步探讨环状RNA TADA2A与胃癌的关系,本研究对92例胃癌患者进行研究,现报告如下。
选取2020年1月至2021年1月于我院接受手术治疗的胃癌患者92例纳入研究,入组患者均经病理证实为原发性胃癌且术前均未行放化疗。收集术后胃癌组织及癌旁组织(经病理证实为正常胃组织)作为样本,将新鲜组织样本经冷冻处理后置于-80℃冰箱待检。环状RNA TADA2A引物及内参GAPDH委托上海生工生物工程公司合成。
1.2.1 RNA提取 根据Trizol试剂盒(生产厂家:大连宝生物工程公司)说明书操作,取样本组织80 mg,超声匀浆后,经1‰DEPC水溶解后,提取样本中RNA的浓度、纯度,另取1 μl RNA检测RNA完整性。
1.2.2 逆转录反应 根据逆转录试剂盒(生产厂家:大连宝生物工程公司)说明书操作,反应体系(20 μl):2 μl RNA样品、1 μl引物、1 μl逆转录酶、1 μl GAPDH反向引物、1 μl dNTP混合物(10 mM)、0.5 μl RNase抑制剂 、4 μl 5×RT 缓冲液、9.5 μl不含RNase的H2O。反应条件:42℃ 30 s,56℃ 15 min,85℃ 1 min,4℃ 5 min,产物置于-20℃保存。
1.2.3 PCR扩增 采用实时荧光定量PCR仪(生产厂家:西安天隆科技公司),按照PCR试剂盒(生产厂家:广州锐博生物科技公司)说明书操作,反应体系(25 μl):2 μl稀释的cDNA、12.5 μl SYBP Premix EX TaqTMⅡ、2 μl引物,加ddH2O水补至25 μl。反应条件:95℃ 1 min,95℃ 30 s,60℃ 1 min,42℃ 30 s,40个循环。
1.2.4 结果计算 采用2-△△CT方法计算,GAPDH为内参,取三个复孔均值,以 2-△△CT表示目的基因表达,环状RNA TADA2A的相对表达量=2-△△CT值(环状RNA TADA2A)-2-△△CT值(GAPDH)。
环状RNA TADA2A在胃癌组织中相对表达量为(0.83±0.14),明显低于癌旁组织(2.29±0.87),两组比较差异显著(t=15.892,P<0.001),见图1。
图1 组织中环状RNA TADA2A的相对表达量比较
临床分期高、深层浸润、发生淋巴结转移、有脉管癌栓的胃癌组织中环状RNA TADA2A的相对表达量显著下降(P<0.05),见表1。
表1 环状RNA TADA2A的相对表达量与胃癌临床特征的关系
由ROC曲线可知,环状RNA TADA2A诊断胃癌的AUC为0.796(95%CI:0.683-0.925,P<0.05),诊断特异度为80.21%,敏感度为88.43%,见图2。
图2 环状RNA TADA2A诊断胃癌的ROC曲线
临床研究显示,环状RNA的分子结构为封闭环状,它是特殊的内源性非编码RNA,存在于人体细胞中且具有多种生物学功能[3]。近年来,环状RNA与肿瘤的关系已成为临床研究的热点问题。陈炳合等[4]研究报道,胃癌组织中环状RNA cRAPGEF5表达下调,其可能参与胃癌的侵袭、增殖、转移。罗再等[5]研究发现,胃癌组织中环状RNA RUNX1呈高表达,且其表达与胃癌病理特征、患者预后有关。朱秋霞等[6]研究发现,肺腺癌组织中环状RNA TADA2A呈高表达,下调表达水平可抑制肿瘤细胞的侵袭、迁移。另有学者研究报道,FAM107A在胃癌等多种癌症中呈低表达,TADA2A可能与FAM107A相互作用,共同参与细胞过程,发挥抑癌作用[7]。
本研究发现,与癌旁组织比较,胃癌组织中环状RNA TADA2A的相对表达量明显降低。结果提示,胃癌组织中环状RNA TADA2A呈低表达。既往研究显示,环状RNA TADA2A位于人17号染色体,其在大肠癌组织中表达下调,其可通过miR-374a-3p/KLF14轴抑制大肠癌的进展[8]。另有研究报道,乳腺癌组织中环状RNA TADA2A呈低表达,其可通过靶向miR-203a-3p/SOCS3轴抑制乳腺癌的进展和转移[9]。由以上研究可知,环状RNA TADA2A在肿瘤组织中呈异常表达,其与恶性肿瘤的的发生有关。
本研究表明,临床分期高、深层浸润、发生淋巴结转移、有脉管癌栓的胃癌组织中环状RNA TADA2A的相对表达量显著下降。通过ROC曲线分析,环状RNA TADA2A诊断胃癌的特异度、敏感度较高,结果提示,环状RNA TADA2A可能参与胃癌的发生进展过程,其可能成为胃癌临床诊断标记物。有研究显示,环状RNA TADA2A可通过调节CREB3表达、海绵化miR-203a-3p,进而促进骨肉瘤进展[10]。另有研究报道,环状RNA TADA2A可通过抑制成纤维细胞的增殖和活化来缓解特发性肺纤维化[11]。有学者发现,新型环状RNA TADA2A可通过海绵化miR-203促进卵巢癌的增殖和转移。李震等[12]研究发现,环状RNA TADA2A可通过促进结直肠癌细胞的凋亡,而抑制癌细胞增殖,其在结直肠癌中发挥抑癌作用。因此,我们推测环状RNA TADA2A在肿瘤组织发挥抑癌作用。
综上所述,环状RNA TADA2A在胃癌组织中呈低表达,其可能与胃癌的发生进展有关,但临床尚需进一步探讨其作用机制。