研究揭示小白菜维生素C等营养物质的代谢机制

2020年12月28日，南京农业大学园艺学院教授侯喜林团队在《Horticulture Research》上在线发表研究论文，以不结球白菜“苏州青”为材料，利用最新的测序手段，获得了396.83 Mb近完整的高质量染色体级基因组，并对其功能进行注释。此基因组质量高于现有其他白菜基因组。根据这一新基因组，研究发现重复序列占全基因组的比例约为53%，并且注释得到了48 158个蛋白质编码基因。比较基因组分析证实，不结球白菜经历了一个与其他十字花科物种共享的全基因组三倍化（WGT）事件，这发生在与拟南芥共享的WGD事件之后，为研究芸薹属芸薹种亚种之间分化提供了重要的依据。对维生素C和硫代葡萄糖苷（GSLs）合成和代谢途径相关基因进行鉴定和比较分析，得到了串联复制导致的基因拷贝数变异，并且GSL基因在白菜基因组中发生了高度扩张。联合转录组分析，对相关基因的表达进行了探究，揭示了不结球白菜维生素C和硫代葡葡糖苷营养物质的代谢调控机制。该研究为优良性状分子设计育种奠定了坚实基础。