利用TCGA数据集分析E2F7在肺腺癌中的表达及临床意义

赵秋荣 郭 静 陈良远▲

1.福建省立医院检验科，福建福州 350001；2.福建省龙岩市第三医院检验科，福建龙岩 364000

肺癌是目前全球最常见的恶性肿瘤之一。男性肺癌新发病例及死亡率居所有恶性肿瘤第1 位。女性肺癌新发病例居第3 位，死亡率居第2 位[1]。肺腺癌是一种恶性上皮肿瘤，有腺样分化和黏液分泌两种类型，目前已成为最常见的肺癌病理类型[2-3]。

E2F 家族的转录因子成员在各种肿瘤中表达，在增殖、分化、凋亡和肿瘤生成中具有作用；此外，其异常激活和调节与肿瘤发育和预后不良有关[4-6]。E2F 系列有8 个成员，称为E2F1+8，充当转录活化剂（E2F1+3）或抑制器（E2F4+8）[7]。它们在正常组织中以低水平表达，但在肿瘤组织中表达过度，成为具有吸引力的潜在治疗靶点[6-8]。在肺腺癌中E2F 家族的研究较少，目前就E2F1 有相关报道[9]。鉴于此情况，本研究通过癌症基因组图谱公共数据集（the cancer genome stlas，TCGA）下载肺腺癌组织及癌旁组织E2F7 蛋白表达量的数据，研究E2F7 在肺腺癌中的表达及其相关病理特征的关系，以探讨其在肿瘤发生发展中的作用机制，为临床提供参考。

1 材料与方法

1.1 TCGA 数据下载

在TCGA（https：//cancergenome.nih.gov/）搜索并下载数据库中肺腺癌相关RNAseq 数据，在排除缺失生存资料和临床参数的病例后，共纳入337 例肺腺癌组织（肿瘤组）与59 例癌旁组织（癌旁对照组）的RNAseq 数据及对应的肺腺癌患者临床数据。

1.2 对E2F7 表达与临床预后的关系进行分析

利用已有数据，分析在总体337 例肺腺癌（肿瘤组）和59 例癌旁组织（癌旁对照组）中E2F7 的表达差异。利用COX 逻辑回归分析评估肺癌患者预后的独立危险因数。利用Log Rank检验对不同E2F7 表达水平肺腺癌患者进行分析。

1.3 统计学方法

采用SPSS 22.0 软件包对数据进行统计分析，使用Graph-Pad Prism v6 进行图片绘制；两组间均数比较采用t检验，方差不齐采用非参数检验，多组间均数比较采用方差分析；Log Rank检验对不同E2F7 表达水平肺腺癌患者进行分析；COX 风险比例模型用于评估肺癌患者的独立危险预后因数，以P＜0.05 为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 两组样本E2F7 表达量的比较

肿瘤组E2F7 表达水平高于癌旁对照组，差异有统计学意义（P<0.05）（图1，封四）。

2.2 E2F7 表达与肺腺癌患者预后关系

采用TCGA 进行生存预后分析，结果显示E2F7表达水平与肺腺癌患者预后存在相关性（P=0.002），表达越高，预后越差（图2，封四）。单因素COX 逻辑回归分析显示，E2F7 的表达水平与性别、年龄以及M 分期无相关性，Stage 分期、T 分期和N 分期是E2F7 表达的相关因素（P＜0.05）（表1）。多因素COX风险比例模型结果显示，高E2F7 表达水平和Stage分期是肺腺癌患者预后差的独立危险因素（P＜0.05）（表2）。

表1 肺腺癌患者E2F7 表达的单因素COX 逻辑回归分析

表2 肺腺癌患者E2F7 表达的多因素COX 逻辑回归分析

3 讨论

目前为止TCGA 中总共收集了33 种肿瘤的11000 多个样本数据，包含了这些肿瘤的DNA、RNA、蛋白质等，还提供了分子学资料[9-10]。该数据库自2006年创建以来，基于TCGA 数据库的各类癌症相关高质量研究论文已有近3000 篇[11]。TCGA 数据库的完善，为肿瘤相关蛋白或基因的筛选、机制探索、验证研究提供了可靠的依据和强大的支撑[12-13]。

肺癌是目前全球最常见的恶性肿瘤之一，肺腺癌作为肺癌最常见的病理类型，肺癌的死亡率和发生率高，所以寻找早期诊断和预后指标对肺癌的治疗至关重要。Yang 等[14]发现E2F7 促进细胞增殖、细胞转移和肿瘤生成。Yao 等[15]人证明E2F1/2/3/5/7/8 是诊断结肠癌的潜在生物标志物。Sun 等[16]发现E2Fs 的表达增加与肺癌的高风险临床病理因素之间的关联。Dimova等[17]还证明了包括E2F 在内的RB 通路成分的点突变、缺失、扩增或启动子甲基化等改变常发生在人类肿瘤中。总的来说，这些发现表明E2F 家族在人类肿瘤发生和肿瘤进展中起着至关重要的作用。但是关于E2F7 在肺腺癌中的表达模式及其作用还未明确，故本研究在基于TCGA 数据库分析比对后发现，E2F7在肺腺癌中的表达明显高于癌旁对照组。其表达水平与性别、年龄以及M 分期无关相关性，Stage 分期、T分期和N 分期是E2F7 表达的相关因素（P＜0.05），预后分析结果显示在肺腺癌患者中E2F7 表达越高，预后越差；多因素COX 风险比例模型结果显示，高E2F7表达水平和Stage 分期是肺腺癌患者预后差的独立危险因素（P＜0.05）。

综上所述，本研究通过分析TCGA 数据库可知E2F7 在肺腺癌中高表达，且与临床特征密切相关，本研究推测E2F7 可能通过多种途径参与到肺癌的发生发展过程，从而影响肺腺癌患者的预后。因此，E2F7 可作为肺腺癌潜在治疗靶点或诊断标志物。但肺腺癌中E2F7 的作用机制需要进一步研究。