李学才,常 瑜,白 静,武军艳,李博文,赵玉红,孙柏林,王万鹏,唐德耀,范小龙,朱文英,马 骊,孙万仓
(1.甘肃省干旱生境作物学重点实验室,甘肃农业大学农学院,甘肃 兰州 730070;2.甘肃省农业技术推广总站,甘肃 兰州730020;3.甘肃省康县茶叶科技开发中心,甘肃 陇南 746500;4.甘肃省崆峒区农业技术推广中心,甘肃 平凉 744000)
世界上有灌溉条件的耕地面积尚不足15%,其余皆为依靠自然的雨养农业区[1-2]。随着气候变暖及陆地表面趋向干旱化,水资源短缺成为限制农业发展的主要因素之一[3-4]。中国北方大部分地区属干旱、半干旱地区,面积约占我国陆地面积的50%,其生态环境脆弱、气候异常多变、水资源匮乏,农业生产因干旱受到严重损失[5]。
脱落酸(Abscisic acid,ABA)是一种重要的倍半萜类植物内源激素,不仅参与胚胎发育、种子休眠、叶片衰老等生长发育过程,同时又是植物体内的一种抗胁迫激素,参与传递逆境信号,诱导植物产生一系列抗逆反应,提高植物的抗逆性。玉米黄质环氧化酶(Zeaxanthin epoxidase,ZEP)是一种类囊体膜基质面的双功能单加氧酶,其主要作用是将玉米黄质环氧化形成花药黄质,再进一步环氧化形成紫黄质。分子氧和NADPH是ZEP的协同作用底物,FAD是其辅助因子,能够提高其催化活性[6]。研究表明ZEP是黄质醛转变成ABA的间接合成途径中的关键调控酶[7]。拟南芥(Arabidopsisthaliana)中ABA1缺失突变体表现为玉米黄质无法转化为紫黄质,烟草中则为ABA合成反应第一步无法进行[8]。ZEP在不同环境胁迫下的表达模式随植物种类和组织而发生变化。在烟草和番茄中,根中ZEP的表达量在干旱胁迫后显著上升,而叶片中的表达量基本不发生变化[9-10]。Audran等[11]却发现烟草叶片中ZEP的表达量在干旱胁迫下急剧下降。过表达ZEP会导致番茄对强光的敏感性增加,也会使转基因拟南芥中ABA含量上调[12-13]。Park等[14]研究发现,拟南芥过表达AtZEP基因,转基因植株在盐胁迫和旱胁迫条件下生长更旺盛。通过RNA-seq技术对甘蓝型油菜的耐旱基因进行挖掘发现,干旱胁迫下ZEP、NCED等参与ABA合成基因的高表达提高植株的耐旱性[15]。在逆境条件下,植物体内合成大量的ABA,可以促进气孔关闭,抑制气孔开放,抑制植物的光合作用,从而减缓逆境环境对植物造成的伤害,增强植物的抗逆性。
白菜型冬油菜是我国北方寒旱区重要油料作物之一,具有生育期短、耐迟播、耐贫瘠、抗逆性强的突出优点。北方白菜型冬油菜3月中下旬开始返青,进入需水旺盛期,但北方4—6月为旱季,7—9月才进入降雨期,油菜返青后需水期与降雨期不同步,对北方冬油菜生产造成了严重影响[16]。因此,研究北方白菜型冬油菜的抗旱性具有重要意义。本课题组前期研究表明[17],超强抗寒白菜型冬油菜品种根系及叶片的ABA含量升高时期早于弱寒性品种,白菜型冬油菜根系ABA 含量与其越冬率和抗寒性呈显著正相关。因此,本研究对ABA合成途径中的关键调控酶基因ZEP进行克隆并分析其在干旱胁迫下的表达模式,进一步揭示ZEP基因在白菜型冬油菜抗旱响应中的作用,为白菜型冬油菜抗旱机理研究提供科学依据。
以白菜型冬油菜陇油7号和天油4号为试验材料。选择健康、均匀的种子用0.1% NaClO消毒10 min后,用蒸馏水冲洗2~3次,播种在铺有2层滤纸的培养皿中进行种子萌发(光照14 h,25℃;黑暗10 h, 25℃),待胚根露白后播种至装有基质的花盆中,培养至五叶期选择生长健康的植株进行胁迫处理。
试验设置4个处理:T1:对照(CK),喷施蒸馏水200 mL;T2:喷施20 mg·L-1ABA 200 mL;T3:喷施10 mmol·L-1钨酸钠200 mL;T4:同时喷施20 mg·L-1ABA 100 mL和10 mmol·L-1钨酸钠100 mL。试验材料处理前7 d始终保持花盆内土壤持水量在70%~80%,并用土壤水分仪(恒美HM-WSYP)监测每日土壤含水量[18]。将试验材料放置于光照培养箱中(光照14 h,25℃;黑暗10 h,25℃;相对湿度45%)进行干旱处理,取第0天(Normal)和第7天(Drought)植株叶片和根系,并液氮冷冻后存储于-80℃冰箱。
参照TIANGEN天根生化科技(北京)有限公司试剂盒(DP419)说明书提取总RNA,质量检测后按照TakaRa大连宝生物有限公司PrimeScriptTMRT Master Mix(Perfect Real Time)试剂盒的方法合成cDNA,检测质量及浓度后-20℃保存。
根据美国国立生物技术信息中心(NCBI)提供的白菜型油菜的玉米黄质环氧化酶(ZEP)基因的CDS序列,利用Primer 5.0设计扩增引物。引物序列为ZEP-F:5’-ATGGGTTGTTCAACTCCCTTCTGCT-3’;ZEP-R:5’- TCAAGCAGCCTGAAGCAATTTACCG -3’。以陇油7号(CK)叶片cDNA为模板,进行PCR扩增,扩增程序为:94℃ 3 min;94℃ 30 s,62℃ 30 s,72℃ 2 min,30个循环;72℃ 10 min;16℃保存。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物片段大小,参照Axygen Prep DNA凝胶回收试剂盒(离心柱型)说明书回收目的条带。采用pMD-19T载体连接回收产物,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞中进行蓝白斑筛选,挑取阳性克隆进行测序(生工生物工程上海股份有限公司)。
采用ORF Finder软件对ZEP的核酸序列、氨基酸序列和开放阅读框进行分析,利用Protparam工具进行蛋白质基本理化性质分析,氨基酸疏水性分析采用Protscale,跨膜结构预测采用TMpred Server软件,采用Signal P4.1 Server预测蛋白信号肽,利用SOPMA工具预测蛋白质二级结构,保守结构域分析用SMART工具。利用DNAMAN进行白菜型冬油菜ZEP基因的氨基酸序列比对及进化树构建。
依据实时荧光定量PCR引物设计原则设计白菜型油菜ZEP基因(XM_009105212.3)qPCR引物。以相同浓度陇油7号和天油4号cDNA为模板,以白菜型油菜β-actin(Actin-F,5'-GTGTCATGGTTGGGATGGGT-3';Actin-R,5'-AAGAACCGGGTGCTCTTCAG-3')作为内参[15]。实时荧光定量PCR按照Unique Aptamer TM qPCR SYBR® Green Master Mix试剂盒说明书(天津诺禾致源生物信息科技有限公司),采用两步法,扩增程序为:95℃ 5 min;95℃ 10 sec,60℃ 30 sec,40个循环;熔解曲线:95℃ 15 sec,60℃ 60 sec,95℃ 15 sec。采用2-ΔΔCt法[19]对ZEP基因的表达量进行分析。
以陇油7号叶片cDNA为模板,进行PCR扩增,纯化回收目的片段,连接T载体后转化大肠杆菌,利用菌液PCR筛选阳性克隆,得到一条2 000 bp左右的目的片段(图1)。对挑选的阳性克隆进行测序,结果显示该基因全长为2 013 bp。
利用NCBI ORF finder对陇油7号的ZEP基因碱基序列查找开放阅读框,结果显示,该序列含有一个长度为2 013 bp的完整开放阅读框,编码含670个氨基酸的蛋白质,起始密码子为ATG,终止密码子为TGA(图2)。利用ProtParam在线软件预测ZEP基因编码蛋白质的理化性质,结果显示:ZEP蛋白的分子式为C3294H5172N912O980S25,由20种氨基酸组成,Gly(G)、Leu(L)所占比例最高,分别为10.0%、8.2%;含有酸性氨基酸(D、E)88个、碱性氨基酸(K、R)83个、疏水氨基酸(A、I、L、F、W、V)234个和极性氨基酸(N、C、Q、S、T、Y)142个;预测相对分子质量为74.03 kDa,理论等电点(pI)为6.16;预测不稳定指数为46.09,属于不稳定蛋白(稳定系数>40即为不稳定蛋白质);预测脂肪指数为81.94,平均亲水性值(Grand average of hydropathicity)为-0.261(图3A),说明ZEP基因编码的蛋白是亲水性蛋白。
白菜型冬油菜陇油7号ZEP蛋白的N-末端信号肽预测结果表明,该蛋白无信号肽(图3B)。利用TMpred分析ZEP蛋白氨基酸序列,结果显示含有3个跨膜区段(图3C);利用SOPMA 预测ZEP蛋白二级结构,结果显示该蛋白无规则卷曲(Random coil)占42.39%,α-螺旋(α-helix)占30.45%,延伸链(Extended strand)占19.85%,β-转角(β-turn)占7.31%(图3D)。采用SMART在线软件对陇油7号ZEP保守序列进行预测,结果表明,该基因编码的蛋白具有非常保守的结构域:黄素腺嘌呤二核苷酸(FAD)结合位点和57个氨基酸组成的FHA结构域(图3E)。
利用DNAMAN及BLASTP对陇油7号与其他十字花科植物ZEP蛋白同源性进行比较,结果表明,陇油7号ZEP蛋白序列与其他植物的ZEP氨基酸序列相似性很高,与甘蓝型油菜、甘蓝、大白菜、萝卜以及拟南芥ZEP基因的相似度分别为99.40%、97.16%、98.81%、95.52%、89.25%(图4)。从进化树分析发现(图5),陇油7号与天油4号的ZEP蛋白在进化上同甘蓝型油菜(Brassicanapus)、大白菜(Brassicarapasubsp.pekinensis)的ZEP氨基酸序列亲缘关系更近。
利用qPCR分析外源喷施ABA与钨酸钠对干旱胁迫下白菜型冬油菜陇油7号、天油4号叶片中ZEP基因表达量的影响,结果如图6所示,将未进行干旱处理的白菜型冬油菜叶片的ZEP基因的表达量定为Normal,干旱胁迫后陇油7号和天油4号叶片中ZEP基因均上调表达。干旱胁迫处理喷施ABA后,2个品种ZEP表达量在转录水平上显著高于CK,陇油7号、天油4号较CK分别增加66.63%、75.35%;干旱胁迫处理喷施钨酸钠后,2个品种的ZEP基因表达量在转录水平上均低于CK,陇油7号、天油4号较CK分别减少12.74%、16.32%;干旱胁迫处理并同时喷施ABA和钨酸钠后,陇油7号、天油4号较CK的ZEP基因表达量分别增加3.3倍和2.28倍。
外源喷施ABA与钨酸钠对干旱胁迫下白菜型冬油菜根系中ZEP表达量的影响如图7所示,未进行干旱处理的白菜型冬油菜根系的ZEP基因的表达量为1,陇油7号和天油4号2个品种ZEP基因均上调表达。喷施ABA干旱处理后,陇油7号、天油4号较CK的基因表达量分别增加1.18倍和1.74倍。喷施钨酸钠根系中ZEP在转录水平上低于CK,干旱胁迫后,陇油7号、天油4号较CK减少了12.52%和11.44%。同时喷施ABA和钨酸钠,干旱胁迫下,陇油7号、天油4号较CK的基因表达量分别增加1.07倍和1.27倍。
干旱胁迫下,植物对外界环境的刺激做出反应,产生各种代谢产物以适应外界环境。ABA是植物产生的重要激素,在逆境胁迫中可调节植物的代谢活动,提高植物的抗逆能力。ABA在植物受干旱胁迫时通过信号传导,调控胁迫基因表达,调节植物体内蛋白、激素等物质的积累,从而增强植物对环境的适应能力[20]。玉米黄质环氧化酶ZEP是ABA合成反应第一步的调控酶,催化玉米黄质(Z)经单环氧玉米黄质(A)向双环氧紫黄质(V)的转化[21-22]。这一反应在植物叶黄素循环途径、ABA合成途径以及类胡萝卜素循环中都具有重要作用[23-25]。ABA 合成抑制剂钨酸钠通过抑制 ABA 合成中的醛氧化酶原(ABA-aldehydeoxidase)使得 ABA 醛不能转化为 ABA[26]。本研究发现,干旱胁迫下,白菜型冬油菜叶片和根系中ZEP基因均上调表达。邓昌哲等[27]研究表明,ABA合成抑制剂在类胡萝卜素降解途径中可抑制ZEP的表达,本试验发现,喷施ABA后,无论叶片或根中,ZEP基因的相对表达量均显著高于对照,说明ABA可以诱导ZEP基因的表达。本试验研究表明,外源喷施钨酸钠后,白菜型冬油菜叶片和根中的ZEP基因表达受到抑制,相对表达量显著低于对照。
ZEP是一种双功能单加氧酶,也是ABA合成途径中的调控酶之一,属于脂质运载蛋白家族[28],主要定位到叶绿体类囊体膜和外被膜上[29-30]。本试验成功克隆了白菜型冬油菜的ZEP基因,包含2 013 bp的开放阅读框,编码含670个氨基酸残基的蛋白质,预测蛋白质分子量为74.03kDa,理论等电点(pI)为6.16,包含FAD-binding 3结构域及FHA结构域,这些结果与甘蓝型油菜和紫花苜蓿中的研究相似[31-32]。ZEP不仅是ABA间接合成过程中的作用酶,也是叶黄素循环中的关键酶。本试验从白菜型冬油菜陇油7号和天油4号中成功克隆出ZEP基因序列,与拟南芥、甘蓝型油菜等进行比对,发现其同源性分别为89.70%和99.40%。经qPCR分析发现,ZEP基因在白菜型冬油菜叶片和根系中均有表达,与烟草ABA2、番茄NpZEP的表达模式相似,叶片中的表达量最高,根系表达量较少[12,33]。且干旱胁迫下,叶片和根系中均有表达,说明ZEP基因在白菜型冬油菜抗旱中发挥作用。