田会东,王静,郭丽娜,贾明璐,陈雪平,王瑞
(1.河南省漯河市中心医院药学部,漯河 462000;2.漯河医学高等专科学校,漯河 462000)
近年来,随着我国人口老龄化与生活方式及饮食结构的改变,糖尿病已经从少见病变成一个流行病,2型糖尿病患病率持续攀升[1]。据最新数据显示,我国成人糖尿病的患病率达10.9%,患病人数居世界之首[2]。2型糖尿病及其并发症严重危害人类健康,并给社会带来巨大的经济负担。因此,抗2型糖尿病药物的研究,已经成为当今医药研究领域的热点和难点。中药因具有“多成分-多靶点-多通路”发挥整体协同作用的特点,在治疗糖尿病及其并发症等疾病方面具有得天独厚的优势。中医认为,2型糖尿病及其并发症是由于机体燥热内盛、炼液为痰、血流滞涩所致,治疗应以清热燥湿、化痰通络为主[3]。黄连是毛茛科植物黄连(CoptischinensisFranch.)、三角叶黄连(CoptisdeltoideaC.Y.Cheng et Hsiao)或云连(CoptisteetaWall.)的干燥根茎,性寒、味苦,具有清热润燥的疗效[4];三七为五加科植物三七[Panaxnotoginseng(Burk.)F.H.Chen]的干燥根和根茎,性温、味甘,具有活血通络之效[5];二者配伍正体现清热润燥、益气活血法治疗“消渴症”的基本方法。现代中医临床发现,黄连-三七在很多中药处方中都有体现,是中医治疗糖尿病的常用药对[6- 7]。然而,由于中药多成分多靶点等特点,黄连-三七药对抗2型糖尿病的作用机制尚未完全阐明。网络药理学是一种新的研究药物作用机制的方法,广泛应用于中药复方的研究,为中药作用机制的研究开辟了新的思路[8]。因此,本研究采用网络药理学方法,对“黄连-三七”药对主要活性物质、作用靶点及信号通路对其抗2型糖尿病的作用机制进行探索,旨在为黄连-三七抗2型糖尿病的进一步探索提供科学依据。
1.1筛选活性成分及相应靶点 分别以黄连、三七为关键词,从中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)(http://lsp.nwsuaf.edu.cn/tcmsp.php) 中获取所有化学成分。把口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%和类药性(drug-like,DL)≥0.18作为筛选条件[9],从而得到活性成分。其中OB和DL是筛选活性成分的重要指标,OB、DL值越高,表明其越有可能被开发成为药物[10-11]。活性成分的作用靶点从TCMSP数据库中获得,把靶点名称输入UniProt数据库(https://www.uniprot.org/),获得其相应靶点的人源的靶点基因名称。
1.2构建“活性成分-靶点蛋白”网络 将黄连-三七药对筛选出的活性成分和UniProt数据库获得的人源靶点导入Cytoscape 3.6.1版软件,运用Network Analyzer插件分析构建“活性成分-靶点蛋白”的网络图。
1.3构建抗2型糖尿病靶点蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络 运用比较毒物基因组学数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)(http://ctdbase.org/)和治疗靶点数据库(therapeutic target database,TTD)(https://db.idrblab.org/ttd/),以“Type 2 Diabetes”为关键词,检索与2型糖尿病相关的靶点,将得到的靶点基因输入STRING在线分析平台(https://string-db.org/),选择分值大于0.7(高置信度评分)[12],预测靶点与靶点之间的相互作用关系,构建抗2型糖尿病靶点PPI网络图。
1.4网络合并 运用Cytoscape 3.6.1版软件中的Merge功能将活性成分-靶点网络和抗2型糖尿病PPI网络合并,观察是否有交集网络。有交集的蛋白靶点可能是抗2型糖尿病的关键靶点。
1.5通路富集分析 运用DAVID6.8数据库对黄连-三七抗2型糖尿病靶点蛋白,进行基因的本体(gene ontology,GO)生物学过程富集分析和KEGG代谢通路富集分析,并以P<0.05作为筛选条件,结果用在线制图平台Omishare Tools可视化处理,进一步阐明靶点蛋白在信号通路中的作用。
2.1主要活性成分 文献[13],皂苷类化合物口服,会被代谢生成次生皂苷或苷元,而真正在体内发挥疗效的多为次生苷或苷元。TCMSP 数据库对此以“皂苷-qt”表示,为准确模拟化合物在体内的真实情况,本研究对皂苷类化合物也以后缀qt 的形式进行描述。通过TCMSP数据库共获得167个黄连-三七对药的已知成分,黄连成分有48个,三七成分有119个;以OB≥30%和DL≥0.18作为筛选条件获得20个成分,其中黄连14个,三七7个,共有相同化合物1个。20个化合物中有3个化合物在TCMSP数据库没有筛选到相关作用靶点。因此,本研究共纳入黄连-三七对药的17个成分作为候选化合物,如表1所示。
2.2“活性成分-靶点”网络图构建 从UniProt数据库得到人源靶点基因共116个,将活性成分与作用靶点通过Cytoscape 3.6.1构建成网络图,如图1所示。图1包含133个节点(17个活性成分和116个相关靶点)和261条线,其正八边形代表活性成分,三角形代表相关靶点,线代表活性成分与相关靶点的关系。据报道,度值(degree)和介数值的节点(betweenness)与活性成分的重要性呈正相关,即其值越大,相应的节点在此网络图中越重要[14]。结果显示,槲皮素(quercetin)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)、氢化小檗碱[(R)-canadine]等化合物和前列腺素G/H合成酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)、前列腺素G/H合成酶1(prostaglandin-endoperoxide synthase 1,PTGS1)、5α钠通道蛋白、核受体激活剂2等靶点蛋白在网络图中具有枢纽作用,可能是关键的活性成分和靶点蛋白。这也充分说明了黄连-三七药对是以多成分、多靶点协同作用的特点。
表1 黄连-三七药对筛选后得到的17个活性成分
图1 活性成分-靶点网络图
2.3抗2型糖尿病靶点PPI网络构建 在TTD数据库检索到抗2型糖尿病靶点75个,其中具有人源基因的靶点53个,在CTD数据库中检索到有直接证据来源的靶点211个,将这些靶点输入STRING在线分析平台,从而构建抗2型糖尿病靶点PPI网络,如图2所示。
2.4合并网络 运用Cytoscape 3.6.1版软件中的Merge功能将活性成分-靶点网络和抗2型糖尿病靶点PPI网络合并,获得交集网络图,见图3。从而得到黄连-三七药对发挥抗2型糖尿病作用的化合物15个,包括槲皮素、β-谷甾醇、黄连碱、巴马汀、小檗浸碱等;关键靶点19个,包括胰岛素受体、前列腺素G/H合成酶2、二肽基肽酶IV、肠道麦芽糖酶-葡糖淀粉酶、凋亡调节因子Bcl-2、过氧化物酶体增殖物激活受体γ等,见表2。
图2 抗2型糖尿病靶点PPI网络
2.5通路富集分析 运用DAVID平台进行GO功能富集分析得到111个GO条目(P<0.05),其中生物过程(biological process,BP)条目92个,细胞组成(cellular component,CC)条目12个,分子功能(molecular function,MF)相关的条目7个,见图 4。KEGG通路富集,筛选出21条信号通路(P<0.05),涉及HIF-1信号通路、胰岛素抵抗通路、脂肪细胞脂解调控通路、PI3K-Akt信号通路等,见图5。
图3 抗2型糖尿病作用活性成分-靶点网络
其中准确度最高(P最小)的通路为HIF-1信号通路。缺氧诱导因子(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)是由α和β亚单位组成一种异源二聚体,属于转录因子碱性螺旋-环-螺旋家族蛋白。HIF与细胞和组织内的能量代谢有关,在缺氧条件下,可上调糖酵解途径,降低线粒体功能来维持细胞代谢平衡,并且HIF还参与肝内糖类和脂质代谢[15]。由DAVID6.8平台富集的HIF-1信号通路图可知(图6),黄连-三七通过作用于EGFR、IL-6、HMOX1、bcl-2、NOS3、NOS2、INSR等7个靶蛋白调控HIF-1信号通路,起到抗2型糖尿病及其并发症的作用。
表2 核心靶点信息
图4 核心靶点GO富集分析
图5 核心靶点GO富集分析
中医药学有相对完备的理论基础,在防治糖尿病方面具有优势,中药能有效降低糖尿病的发病率已逐渐得到验证[16]。本研究采用网络药理学方法预测了黄连-三七对药抗2型糖尿病的主要活性成分及潜在分子作用机制。由抗2型糖尿病作用活性成分-靶点网络可知,15种成分能对2型糖尿病的相关靶点产生作用,其中6种来自三七,10种来自黄连,槲皮素是黄连和三七的共有成分。据报道槲皮素具有显著的降糖功效,可通过降低大鼠血清抵抗素从而改善胰岛素抵抗,并对空腹血糖、空腹胰岛素水平有直接降低作用[17]。这也为两药联合抗2型糖尿病的合理性提供理论依据。
从交集网络靶点可知,黄连-三七抗2型糖尿病是多靶点协同作用的结果。研究证实,IL-6可促进肝脏合成超敏C反应蛋白(hs-CRP)等急性时相蛋白,促进炎症发生,是2型糖尿病的独立影响因素之一[18];抑制二肽基肽酶4(dipeptidyl-peptidase 4,DPP4),可以阻断对GLP-1的降解,因此增加了体内内源性GLP-1水平和活性,从而促进胰岛素分泌[19];过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)基因定位予3p25,属于转录因子的核激素受体超家族,在调节胰岛素敏感性方面具有重要作用[20]。这些研究报道部分预示着通过网络药理学预测黄连-三七药对作用靶点和通路的可行性,可以把IL6、PTGS2、DPP4、SCD、PPARG等19个关键靶点作为黄连-三七抗2糖尿病的潜在作用靶点深入研究其分子作用机制。
图6 HIF-1信号通路
从GO富集分析可知,靶点主要富集在BP(生物过程)环节,如氧化应激,炎症应答,细胞对镉离子反应等;KEGG通路富集分析发现HIF-1信号通路、胰岛素抵抗通路、脂肪细胞脂解调控通路、PI3K-Akt信号通路等与2型糖尿病密切相关,其中胰岛素抵抗通路直接与糖尿病相关,表明黄连-三七具有良好的抗2型糖尿病效果。HIF-1信号通路准确度最高(P=1.0×10-7),是黄连-三七主要抗2型糖尿病途径。研究表明,缺氧贯穿于糖尿病并发症发病机制的始终[21]。HIF-1α作为调节细胞内氧代谢的关键因子之一,是目前发现的唯一能在特异性缺氧状态下发挥活性的转录因子,对糖尿病及其并发症的发生、发展起促进作用[22-23]。本研究发现黄连-三七能作用于HIF-1信号通路上EGFR、IL-6、HMOX1、bcl-2、NOS3、NOS2和INSR 7个靶点,证明黄连-三七的抗2型糖尿病作用可通过调控HIF-1信号通路实现。Akt是PI3K通路末端重要的靶蛋白,PI3K-Akt通路在胰岛素调节血糖稳定方面发挥作用,孟昭杰[24]发现黄连素能上调糖尿病患者受损的Akt活性,促进GLUT4转位,从而改善胰岛素抵抗,这与本研究富集在PI3K-Akt通路的结论是吻合的。叉头转录因子(FoxO)是体内一重要的转录因子,已证实与糖代谢密切相关[25];据王水秀等[26]报道,NF-κB信号通路的活化与炎症反应及胰岛素抵抗的发生密切相关;这些通路也可能是黄连-三七抗2型糖尿病的主要途径之一。
本研究首次采用网络药理学的方法对“黄连-三七”药对抗2型糖尿病的复杂机制进行了探究,成功预测了黄连-三七药对抗2型糖尿病的主要活性成分、作用靶点和相关信号通路,体现了中药复方多成分、多靶点、多通路的特点,为进一步深入探讨作用机制奠定基础,同时也为中药复方治疗2型糖尿病的物质基础和作用机制提供了借鉴。诚然,网络药理是一种新兴的研究方法,本研究的结论仍存在局限性,尚需要基础和临床药理试验的进一步验证。