俄罗斯圣彼得堡国立理工大学(SPbPU)的研究人員开发了一种新的数学模型来预测作物的经济表现。这种方法可以帮助育种者获得尽可能高质量的植物。该研究成果已在第五届“植物遗传学、基因组学、生物信息学和生物技术”(PlantGen2019)会议上进行汇报,并发表在《BMC遗传学》(BMC Genetics)期刊上,由俄罗斯基础研究基金会项目(编号:18-29-13033)提供支持。
这种新的数学模型被用于预测作为功能基因型的作物表型性状,农业中的此类模型被称为基因组选择模型。培育新的植物品种通常需要10到12年的时间,而使用基因组选择模型,将使培育植物新品种的过程加速好几倍。由于包含的参数较少,这一基于机器学习方法的数学模型比现代的模拟模型表现得更好。
研究人员已应用该模型对一种重要作物——大豆的表型特征进行了预测,分析了作物的株高、单株种子数、产量、种子中的蛋白质和油分含量。
对于育种者来说,选择能够产生高质量后代的亲本植物是非常重要的,由于模型中参数的数量很少,育种者可以根据后代的质量对亲本对(breeding pairs)进行排序,从而筛选出代表新的、具备潜在理想性状的优良的亲本对。
来源:SeedWorld