KeyGene首次在植物中成功应用适应性DNA测序

KeyGene是一家专注于提高作物产量和质量跨国农业生物技术公司，该公司的科学家们于近期首次报道了适应性DNA测序（adaptive DNA sequencing）在植物中的成功应用，利用Oxford Nanopore Technologies公司的MinION测序设备（具有强大的GPU配置和讀取软件），研究小组成功地将瓜类基因组中的800个区域进行了8倍扩增，并对这些区域进行了选择性测序。

这项突破性发现将进一步减少勘测基因组中已知的、与重要植物性状有关的区域（如果实的颜色、味道或对病原体的抵抗力）所需的时间和资金。通过对这些区域的详细测序和分析，可以解释变异的原因并将其应用于育种。于此，改良品种可以更快地被推向市场。

适应性测序允许对选择出的DNA区域进行测序。当DNA片段穿过测序器的小孔时，该设备将产生一系列核苷酸。一台功能强大的计算机将生成的序列与研究人员研究的区域的信息进行比较。当计算机断定该片段不属于目标区域时，小孔将收到信号，在对DNA片段进行完全测序之前将其推出该区域。然后这个小孔将再次作用于样本中的下一个DNA片段。

这一切都在不到一秒的时间内发生，并且需要实时比较测序器中通过512个小孔的DNA片段的序列，以及植物DNA选定区域的所有序列。

来源：KeyGene