史喜玉 孙金霞 马桂芳 杨李 潘梦丹
摘 要:目的 分析过敏性哮喘(简称哮喘)患者IL-4的表达及IL-4基因单核苷酸多态性(SNP)与哮喘遗传易感性的关系。方法 应用ELISA法检测67例过敏性哮喘患者和85例对照组的血清中IL-4的表达情况,采用测序的方法检测两组中IL-4基因单核苷酸多态性(SNP)rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位点的基因分型情况,并进行统计学分析。结果 实验组患者血清IL-4的表达增高,P<0.05;4个SNP各基因型在实验组和对照组中没有明显差异,P>0.05。结论 患者血清中IL-4的表达增高,rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250多态性与IL-4的表达增高没有明显关联。
关键词:哮喘 IL-4 ELISA SNP 测序
中图分类号:R562.25 文献标识码:A 文章编号:1672-3791(2019)10(c)-0218-03
过敏性哮喘是一种严重的过敏性疾病,是最常见慢性病之一。它的特点是气管支气管对多重刺激的反应性增加,各种炎症细胞特别是嗜酸性粒细胞浸润增加,气道上皮细胞损伤、气道平滑肌肥厚,且血清总IgE升高。哮喘往往在夜间加剧,可进展为严重的气流阻塞、呼吸急促、呼吸困难和吸氧不足。如不及时治疗,会发生严重的后果,如缺氧癫痫发作,呼吸衰竭,甚至死亡[1],它也是当今世界上最常见的慢性气道炎症性疾病。流行病学研究表明,全世界范围内呼吸道过敏的患病率高达15%~30%[1],哮喘影响了3.5%~20%的人群[2]。
家系和双子研究显示哮喘的发病具有家族聚集性和明显的遗传倾向[3],其遗传度可达60%~80%。IL-4是Th2细胞分泌的,常见哮喘患者IL-4表达增高。目前国际上有多篇文献报道IL-4的单核苷酸多态性(SNP)和哮喘的相关研究,但结果存在分歧。该研究设计对照病例研究,挑选IL-4基因的启动子区rs2243250(-589T/C)和rs2227284、 rs2070874、rs4986964四个SNP位点进行分析研究,探讨IL-4基因多态性多哮喘遗传易感性的影响。
1 材料与方法
1.1 材料
研究材料为哮喘患者或正常对照外周血,取自盐城周边地区人群,病例组67例,平均年龄43.2±16.27,患者符合2009年中华医学会呼吸病学会哮喘学组制定的诊断标准。正常对照组85例,平均年龄42.97±19.86,为同期健康體检人员,无哮喘史,无过敏史。
1.2 方法
1.2.1 提取基因组DNA
每例全血3~5mL,3000rpm,10min分离上清,血清转移至离心管,-20℃储存备用。剩余血细胞,采用全血DNA提取试剂盒(三博远志,离心柱型SG012)提取标本血细胞DNA,1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定,-20℃储存备用。
1.2.2 ELISA法检测血清IL-4的表达
每孔加100?L实验血清,密封并室温下孵化2h;加入二抗,密封并室温下培养1h;洗板5次,且最后一次置厚吸水纸上拍干。加入生物素化抗体工作液100?L/孔,密封并室温下孵化60min;洗板5次,且最后一次置厚吸水纸上拍干。加入酶结合工作液100?L/孔,用封板胶纸封住反应孔,避光室温孵育20min。洗板5次,最后一次置厚吸水纸上拍干。加入显色剂TMB100?L/孔,避光室温孵育20min;加入终止液50?L/孔,混匀后,用酶标仪(450nm,Bio-Rad iMark) 即刻测定光密度(OD)值,测量OD450,并分析数据。应用SPSS 19.0统计软件对数据进行处理。
1.2.3 设计引物
IL-4基因4个单核苷酸多态性SNP位点rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位点,设计相应的引物,交由上海生工生物有限公司合成引物。
1.2.4 PCR反应进行待测位点扩增
PCR反应体系为:模板1μL,引物F1μL,引物R1μL,10mMdNTP1μL,TaqBuffer5μL,25mMMgCl25μL,5U/μLTaq酶l0.5μL,水35.5μL。PCR反应条件为预变性95℃,3min,变性94℃,30s,退火55℃~60℃,35s;延伸72℃,40~50s,修复延伸72℃,循环35次。最后1%琼脂糖电泳,150V、100m、A20min电泳观察。采用PCR产物纯化回收试剂盒(生工SK1141),然后进行基因测序,鉴定位点的基因型。
1.3 统计学分析
将病例组和对照组基因型频数进行哈代-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)检验,之后进行采用SPSS 16.0软件进行数据分析。所有的统计检验均为双侧概率检验,P<0.05被认为有统计学意义。
2 结果
2.1 DNA提取后电泳结果
收集哮喘患者及正常人体检血液标本,分离血清,血细胞。血清至于离心管中,-20℃保存。剩余血细胞,采用全血DNA提取试剂盒提取标本血细胞DNA,电泳鉴定见图1。
2.2 ELISA法检测患者及对照组血清IL-4的表达
ELISA法检测67例患者及85例对照IL-4的蛋白表达,结果见表1。实验组IL-4的表达值为(0.75±0.19)pg/mL,对照组表达值为(0.39±0.13)pg/mL,P<0.05。
2.3 IL-4基因SNP筛选及测序鉴定鉴定
根据rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位点的DNA序列,设计相应的引物,结果见表2。之后进行PCR反应,电泳验证后,用PCR产物纯化回收试剂盒(生工SK1141),测序并分析(见表3)。在4个SNP位点在实验组和对照组中无明显差异,P>0.05。
3 讨论
基因多态性是指在人群中个体间基因的核苷酸序列存在差异,即人类染色体的某个位点上单个核苷酸变异,且在人群的发生频率超过1%,称为单核苷酸多态性(SNPs)。人类基因组中SNP数量众多,平均每300~1000个碱基中就存在一个SNP。由于SNP分布广泛并且相对稳定,是人类个体差异主要的分子标记,因此,常用于反应个体表型差异、不同个体对疾病易感性以及不同个体对药物敏感性的研究[4]。
哮喘的主要免疫特征是过度的Th2反应的Th1/Th2平衡紊乱作为重要的Th2因子,IL-4可以直接促进IgE合成,因此在哮喘的病理生理过程中扮演重要角色[5]。
该研究通过病例对照研究,发现患者血清IL-4的表达增高,通过检测IL-4的4个多态性位点的基因型,发现在病例和对照中无明显差异。但此次研究样本量偏少,频率低的基因位点检测结果可能有偏颇,扩大样本量能更好地反映实际情况。
参考文献
[1] 孙金霞,周鹰,杨李,等.粉尘螨变应原Der f Mal f 6的克隆、表达及生物信息学分析[J].中国病原生物学杂志,2013,8(6):530-534.
[2] 孙金霞,崔玉宝.哮喘的遗传学研究进展[J].醫学综述,2014,20(1):3-7.
[3] 杨李,周鹰,王运刚,等.粉尘螨变应原第1组分原核表达质粒pCold-TF-Der f 1构建及鉴定[J].中国媒介生物学及控制杂志,2012,23(4):289-291.
[4] DA, Srinivasan M, Egholm M. The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequeneing[J].Nature,2008,452(7189):872-876.
[5] EI Biaze M,Boniface S,Koscher V,et al. T cell activation, from atopy to asthma: more a paradox than a paradigm[J].Allergy,2003,58(9):844-853.