禽流感病毒生物学特性与基因组结构

2019-09-28 07:29何雯雯
农家致富顾问·下半月 2019年7期
关键词:亚型禽流感氨基酸

何雯雯

摘 要 禽流感 (Avian Influenza,AI) 是由A型流感病毒(Avian Influenza Virus,AIV)的各种亚型引起的禽类疾病综合征,几乎所有的野生及家养禽类都可感染。根据病毒毒力的不同,可将其分为高致病性禽流感(Highly Pathogenic Avian Influenza,HPAI)、低致病性禽流感(Low Pathogenic Avian Influenza,LPAI)和非致病性禽流感三大类。HPAI被世界动物卫生组织(OIE)标为通报疫病,在我国为A类动物疫病。根据病毒粒子表面的两个关键蛋白—血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA),可将其分为18个HA亚型和11个NA亚型。其中感染人的主要是H5N1、H9N2、H7N7亚型,感染禽类的主要是H5N1、H9N2亚型,感染猪的主要是H1N1、H3N2亚型。

关键词 禽流感病毒;基因组结构

1 AIV的生物学特性

禽流感病毒属于正粘病毒科,A型流感病毒属,呈单股负链RNA病毒,AIV具有多种形态,只有典型的病毒粒子呈球形,直径大约是80—120nm,平均为100nm。有的病毒在初次分离时呈长丝状,且长短不一,但是经鸡胚或细胞连续传代培养后可变为球形。AIV具有血凝性,能凝集多种动物的红细胞。病毒的结构由内而外分为三部分:核心、基质蛋白和胞膜。病毒的核心由核衣壳蛋白(NP)、四种聚合酶蛋白(PB1、PB1-F2、PB2、PA)和8个负链单链RNA片段组成;基质蛋白位于病毒胞膜与核心之间,抗原性稳定;胞膜表面有两种病毒编码的糖蛋白纤突,分别为HA和NA,变异性高,是流感病毒亚型分类的依据。

AIV对乙醚、氯仿等有机溶剂和消毒剂较为敏感,温度和湿度对AIV的影响较大,低温下保存的AIV具有较好的稳定性,-70℃下可长期保存,且病毒活力不发生明显的变化,4℃能保存数周,56℃加热30min,70℃仅加热数分钟基本可使病毒丧失活性。干燥的环境有利于AIV的存活。紫外线照射可迅速使HA和NA 的活性丧失,近而破坏其感染性。

2 病毒的基因组结构

AIV为分阶段的单股负链RNA病毒,基因组全长约13.6kb,由8个独立的RNA片段组成,分别以片段1,2,3—8来命名,共编码11中蛋白质,包括PB1、PB1-F2、PB2、PA、HA、NA、NP、M1、M2、NS1、NS2。AIV基因组中所有片段的5端的1前13个核苷酸序列(HO-UCGUUUUCGUCC)和3端的前12个核苷酸序列(GGAACAAAGAUGAPPP)高度保守。此外,靠近3端的第四个氨基酸有的毒株是U,有的是C。在这些共同的序列中,有部分序列可以反向互补,这一点对病毒RNA的复制很重要,在每一节段靠近5端15-21核苷酸处有一保守区,其序列为poly U,这一保守区在病毒mRNA合成时是产生poly A的信号。

片段1-3编码RNA聚合酶中的PB1、PB1-F2、PB2、PA,它們是病毒粒子中分子量最大的蛋白质,PB1是由片段2编码的,含有757个氨基酸,主要功能是延长开始合成的病毒的mRNA。此外,PB1在模板RNA(cRNA)和病毒RNA(vRNA)的合成过程中,也起延伸、增长的作用。PB1-F2是由PB1基因编码的,通过对近2000株的A型流感病毒的序列比对发现,约有87%以上的病毒的PB1-F2含78个以上的氨基酸。PB1-F2的主要功能是诱导细胞凋亡,降低抗原的递呈性和免疫应答水平。PB2是由片段1编码的,含有759个氨基酸,主要功能是在病毒mRNA转录的过程中,识别结合在5端帽子结构,同时还具有限制性内切酶的活性。PA是由片段3编码的,含有716个氨基酸,PA与PB1、PB1-F2、PB2共同构成聚合酶复合体,但其在病毒RNA合成过程中的具体作用尚不清楚。

血凝素蛋白(Hemagglutinin,HA)是由片段4编码的,约含有562个氨基酸,是典型的Ⅰ型糖蛋白,含有四个结构域:信号肽、胞浆域、跨膜域和胞外域,是病毒粒子表面含量最丰富的蛋白,具有高度的免疫原性。HA的主要功能之一是帮助病毒穿透宿主唾液酸之类的细胞受体,介导病毒的吸附与穿膜,启动病毒感染过程;另一重要功能是帮助病毒穿透宿主的细胞膜以及改变抗原性,从而逃脱宿主的免疫监视。HA与膜结合形成的同聚物形成头杆状大钉子般的结构。转译后的HA0能被宿主的胰酶裂解成HA1和HA2两个亚单位,HA的裂解是病毒获得感染的先决条件。

神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)由片段6编码,约含有453个氨基酸,属于Ⅱ类糖蛋白,即氨基端在囊内而羧基端在囊膜外,与HA正好相反。NA的一级结构包括四个区域,即氨基端胞浆尾、非极性跨膜区、茎部和头部序列。NA亚单位为四聚体,由四个单体NA组成,呈蘑菇状。

核蛋白 (Nucleoprotein,NP)由片段5编码,是构成核衣壳的主要成分,具有型特异性。根据NP抗原性的不同,可以将流感病毒分为A型、B型、C型。针对NP的单克隆抗体不能给动物提供被动保护,用提纯的NP免疫动物所产生的抗感染能力很微弱,但NP是细胞毒性淋巴细胞(Cytotoxic lymphocyte,CTL)识别的主要抗原。

基质蛋白(Matrix protein,M)是由基因组片段7编码的,是病毒粒子中含量最大的蛋白质,约占蛋白总量的30%。片段7有2个阅读框,可转录出2个mRNA,分别翻译M1和M2两种蛋白质。M1由252个氨基酸组成,位于病毒囊膜的类脂双层内侧、核衣壳的外侧,能维持病毒粒子的形态,调节病毒转录酶的活性,此外,M1在子代病毒粒子装配过程中也发挥重要作用。M2作为一种离子通道,主要在病毒脱壳时酸化病毒粒子的内部环境。

非结构蛋白(Non-structural protein,NS)由片段8编码,片段8也具有两个阅读框,编码两种蛋白质即NS1和NS2,主要存在于胞浆内。序列分析表明,NS1和NS2有70个氨基酸的重叠,并且在N端有9个相同的氨基酸。非结构的蛋白的功能机制尚不清楚,可能在病毒复制过程中起一定作用,NS2还可能调节非结构蛋白合成的作用。

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