实时荧光定量PCR检测人感染狂犬病病毒的分析报告

2019-09-10 23:34:22何芝菲
大科技·C版 2019年1期
关键词:实时荧光定量PCR检测

何芝菲

摘    要:狂犬病是一种由狂犬病病毒引起的烈性传染病。本试验通过实时荧光定量PCR技术对一例疑似人感染狂犬病病毒的病例分7个时段采集其尿液及唾液标本进行实验室检测。结果显示,7个唾液样本狂犬病病毒均为阳性,7个尿液样本中5个样本为阳性,2个样本为阴性,唾液样本Ct值明显优于尿液样本。本试验对实时荧光定量PCR技术应用到临床检测狂犬病病毒具有重要的参考价值。

关键词:狂犬病病毒;实时荧光定量PCR;检测

中图分类号:S852.65            文献标识码:A               文章编号:1004-7344(2019)03-0272-02

狂犬病(rabies)是由狂犬病毒(rabiesvirus,RABV)所致的人兽共患急性传染病,发病后死亡率接近100%。全球每年约有5.5万人死于狂犬病,我国是狂犬病高发地区,因感染狂犬病死亡的人数居世界第二[1]。在我国,狂犬病是国家重点防控的乙类传染病。近年来,由于我国养犬、猫等宠物的家庭日渐增多,该病的发病率呈上升趋势[2]。据中国疾病预防控制中心2017年的最新统计,2017年全国狂犬病发病数为516人,死亡502人。

狂犬病毒属于弹状病毒(Rhabdoviridae)狂犬病毒属,是单股负链RNA病毒,基因组长度为11928~11932nt,编码5种蛋白结构,5种蛋白对应5种结构基因编码,其中N基因具有毒株间的相对保守性和高拷贝复制性,是分子诊断的目标序列[3]。近年来,随着分子生物技术的迅猛发展,核酸诊断技术被应用到狂犬病的诊断中。实时荧光定量PCR(Real-TimePCR)是基于传统PCR上发展起来的新技术,具有实时监测核算拷贝数量、灵敏度高、检测速度快等优点,被广泛应用于病毒性病原体的快速检测中[4]。目前,国内鲜有采用实时荧光定量PCR技术对人体感染狂犬病病毒样本进行检测的报道。本试验通过实时荧光定量PCR技术对一例人感染狂犬病病毒的病例进行取样检测,旨在为实时荧光定量PCR技术应用到临床检测狂犬病病毒提供参考。

1  材料与方法

1.1  标本信息

患者刘某,男,53岁,重庆市潼南区人。该患者于2018年7月被犬咬伤手臂,暴露程度Ⅲ度,伤口未处理。刘某于2018年11月28日出现烦躁、恐水、怕风、抽出等症状,并于12月1日入院。2018年12月3日晚间19点至4日早上7点期间,时隔2h对患者中段尿及唾液进行采集,共计14个样本(1~7号为尿液样本,8~14号为唾液样本),采集后的样品于-20℃下保存。

1.2  试剂与仪器

病毒核酸提取试剂盒(磁珠法)和狂犬病毒核酸检测试剂盒(荧光PCR法)均购自江苏硕世生物科技有限公司,Real-TimePCRSystem(stepone),全自动核酸提取仪(SSNP-2000A)。

1.3  方 法

1.3.1  核酸提取

将样品于室温条件下融冻,向病毒核酸提取试剂盒对应孔位分别加入样品200μl,置于全自动核酸提取仪中进行核酸提取,具体操作见说明书。提取完成后吸出样品核酸于保存管中,-20℃下保存。

1.3.2  实时荧光定量PCR反应

①反应体系:每人份PT-PCR反应液7.5μl,酶混合液5μl,狂犬病反应液4μl,去RNA酶水3.5μl,样品5μl,总体积25μl。②反应条件:逆转录反应50℃30min,预变性95℃5min,变性95℃10s,退火、延伸及检测荧光55℃40s45个循环。

1.3.3  结果判定方法

(1)阳性对照:Ct≤30且扩增曲线呈典型S型显示。

(2)阴性对照:无典型S型扩增曲线显示。

(3)样本阳性:Ct≤35且曲线呈S型。若样本检测结果35(4)样本阴性:Ct>38或者未检出。

2  结 果

2.1  实时荧光PCR对尿液样品检测结果

对7个时段采集的病人中段尿样品进行实时荧光定量PCR检测,结果见图1,由图可知2号和6号样本为阴性,其余样本实时荧光定量PCR的Ct值分别为1号:35.68,3号:35.77,4号:36.63,5号:36.12,7号:35.92。

2.2  实时荧光PCR对唾液样品检测结果

对7个时段采集的病人唾液样品进行实时荧光定量PCR检测,结果见图2,由图可知7个唾液样本均含有狂犬病病毒,各样本实时荧光定量PCR的Ct值分别为8号:30.12,9号:31.22,10号:30.91,11號31.75,12号:29.33,13号:29.89:14号29.78。

3  讨 论

本试验采用实时荧光定量PCR方法对以一例真实发病的病人7个时段唾液及尿液为样本进行检测。由结果可知尿液样本中2号和6号样本结果为阴性,其余时段尿液均有病毒检出,而7个唾液样本所有时均为阳性,且曲线的CT值明显优于尿液样本。这是由于狂犬病的最主要传染源是发病和携带病毒的动物,这些动物的唾液中含有大量病毒[5],并通过咬伤、抓伤进行传染,因此唾液样本的病毒含量远高于尿液样本。而狂犬病毒的分泌量由一定的波动性[6],因此在尿液样本中出现两个阴性。

目前,对狂犬病毒的实验室诊断方法主要有酶联免疫吸附试验(ELISA)、荧光抗体技术(FAT)、环介导等温扩增技术(LAMP)、逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)及实时荧光定量PCR(Real-TimePCR)等。目前FAT技术是WHO和OIE推荐的黄金标准方法,但此方法需要异硫氰酸荧光素盐为荧光标记物标记抗体以定位抗原,同时还需要使用荧光显微镜,操作较繁琐,对试验操作人员专业素质要求较高。实时荧光定量PCR技术以其快速、灵敏、重复性好的特点已被广泛应用于高通量的病毒检测,目前,国内外已经应用这一技术建立了多种检测RABV的荧光定量PCR方法,针对我国狂犬病的流行特征,许运斌[7]等均成功合成引物和探针建立了荧光定量PCR检测RABV的方法。但实时荧光定量PCR技术在试验过程中容易造成样本的污染导致假阳性的出现,这一情况有待进一步研究改善。

狂犬病是一种严重危害人类生命安全的疫病,急需一种快速、准确、灵敏的诊断方法。本试验通过实时荧光定量PCR检测了一例人感染狂犬病病毒的尿液及唾液样本,一定程度上填补了国内使用此方法用于临床检测报道的空白,对未来实时荧光定量PCR用于临床检测人感染狂犬病病毒的检测及推广有一定的参考价值。

参考文献

[1]Blanton J D,Palmer D,Dyer J,etal.Rabies surveillance in the United States during[J].J Am Vet Med Asso,2011,239:773~783.

[2]王 科,叶 峰,赵英仁.狂犬病的研究进展[J].临床内科杂志,2010,5(27):298~301.

[3]Bourhy H,Tordo N,Kissi B.Molecular diversity of the Lyssa-virus genns[J]. Virology,1993,194:70~91.

[4]高 鑫,朱武洋,卢学新.实时荧光定量PCR在病毒检测中的应用[J].中国人兽共患病学报,2018,34(7):660~666.

[5]罗 明.我国狂犬病流行状况分析及防治对策[J].中国人兽共患病杂志,2005,02.

[6]Zaidman G W,Billingsley A.Corneal impression for the diagnosis of acute rabies encephatilis[J].Ophthalmology,1998,105(2):249~251.

[7]许远斌,邵明富,范金红,等.基因I型狂犬病毒一步荧光定量PT-PCR检测方法的建立[J].中国人兽共患病学报,2011,27(4):297~310.

收稿日期:2018-12-7

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