中国大陆地区的3.5亚系PRRSV起源于中国台湾地区的3.2亚系

猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus，PRRSV)是引起猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)的病原，该病毒分为两个基因型，以LV 株为代表的欧洲型(基因1 型)和以VR2332 株为代表的美洲型(基因2 型)。根据ORF5基因，基因2 型PRRSV 被划分为9 个系，目前，在中国已检测到5 个系，包括1，3，5，8 和9 系。1998 年，中国台湾报道首株3 系PRRSVMD-001。2004 年，中国香港检测到3 系PRRSV，并且在遗传进化树上形成了一个独立的分支。2005 年，中国大陆检测到的第一株3 系PRRSV FJ-1。2010 年以后，3 系PRRSV 在中国大陆逐渐呈现流行趋势，尤其在广东、福建等南方地区。有研究报道，根据毒株间的演化关系及猪只的贸易主要是由中国大陆销往中国香港，推测中国香港不是大陆3 系PRRSV 的起源地，因此，中国大陆地区3 系PRRSV 的起源尚不清楚。

近期发表于《Transboundary and Emerging Diseases》 上的一项报道，将3 系PRRSV 分为5 个亚系，中国台湾地区的3 系PRRSV 为3.1～3.5 亚系，中国香港地区为3.4 亚系，中国大陆地区为3.5 亚系。通过毒株间的遗传演化分析和氨基酸变异分析，推测中国大陆地区的3.5 亚系可能起源于中国台湾地区的3.2 亚系。

2017 年，该研究从中国大陆北方地区的猪场检测到2 株3 系PRRSV，分别命名为SD110-1608 和SDWH27-1710。为了探究这2 株毒株的特性和中国大陆地区3 系PRRSV 的起源，根据GenBank 中收录的146 条3 系PRRSV 的ORF5 基因序列，以及该实验室检测到的3 系PRRSV 的ORF5 序列，利用MEGA6.0 软件构建了系统发育树。遗传演化分析结果表明：中国台湾地区的3 系PRRSV 被划分为3.1～3.3 亚系，中国香港地区的3 系PRRSV 被划分为3.4 亚系，中国大陆地区的3 系PRRSV 被划分为3.5 亚系。通过Simplot 和RDP4 进行重组分析，重组结果显示，SD110-1608 和SDWH27-1710 均由QYYZ(主要母本毒株)和JXA1(次要母本毒株)重组而来。序列比对结果显示，SD110-1608 和SDWH27-1710 与QYYZ、GM2、GDsg 等3 系毒株在Nsp2 区域均存在36 个aa 的插入。SD110-1608 和SDWH27-1710 在Nsp2 和GP5 蛋白上与广东的早期分离株QYYZ、GM2 等具有相同的分子特征，因此推测SD110-1608 和SDWH27-1710 可能是从广东地区传播而来。根据中间PRRSV 毒株FJ-1 和FJFS 在GP2a、GP3、GP4、GP5 和N 蛋白上氨基酸的变化规律及基于各基因的遗传演化分析，推测中国大陆地区3.5 亚系可能起源于中国台湾地区的3.2 亚系。与此同时，其它课题组也在该杂志上发表了类似的报道。

本研究为3 系PRRSV 的分类提供了依据，为中国大陆地区3.5 亚系PRRSV 的起源及在大陆地区的传播提供参考，同时，为3 系PRRSV 的防控提供重要参考。