祁云霞,达 赖,付绍印,何小龙,张兴夫,王 标,特日格勒,刘永斌
(内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特 010031)
微小RNA(microRNA,简称miRNA)是非编码RNA(non-coding RNA)家族的一员,长度一般在18~25 nt(nucleotide),普遍存在于真核生物中。 编码miRNA的基因一般位于蛋白编码基因的内含子区,不翻译成蛋白质。miRNA序列在不同物种间保守性强,表达具有时空特异性,是其他功能基因表达的重要调控分子,参与多种重要的生命活动。据推测,人体中超过三分之一的基因都受到miRNA 的调控[1]。
1993年,Lee等在研究线虫时克隆到1个基因lin4,该基因不编码蛋白质,而是编码一个长度为22 nt的小分子RNA,调控胚胎发育[2]。7年后,在线虫中发现了第2个同样具有基因调控功能的小分子RNA 1et-7。后来陆续在果蝇、小鼠和人类等生物中也发现了这样的小分子RNA,它们长度在18~25 nt,作为非编码基因组的一部分调控基因表达,被命名为miRNA。截至目前,已在小鼠上发现了1 915种成熟miRNA,人上发现了2 588种miRNA[miRBase数据库(V21)2014年 6月发布数据][3],并且这一数量还在不断增长。
miRNA由基因组DNA在细胞核内转录形成初级pri-miRNA后,经过核糖核酸酶Drosha剪切成发夹结构的前体pre-miRNA,后者被运送出核后由核糖核酸酶 Dicer加工成熟[4-6]。成熟的miRNA通过RNA诱导沉默复合体(RISC)作用于靶基因的 mRNA 的 3′非翻译区(3′-UTR),降解靶基因mRNA或抑制其翻译。近年发现,miRNA也可以作用于mRNA的编码区,直接调节基因的翻译过程,而且在不同物种中,靶位点也不具有保守性[7]。miRNA的生物合成和作用机制可用图1表示。
图1 miRNA的生物合成与工作原理[8]
随着研究的深入,miRNA在雌性哺乳动物生殖过程中的作用也逐渐受到重视。Dicer是miRNA成熟过程中必需的加工酶,敲除Dicer后雌性小鼠会产生不同表型的缺陷,但有个共同的特点是都出现不同程度的生殖缺陷,这些生殖缺陷是由Dicer敲除后pre-miRNA的聚集和成熟体的减少导致的[9-10]。
Rajkovic研究小组[11]利用 miRNA 芯片技术研究了鼠卵巢中miRNA的表达情况,在检测的373种鼠miRNA中有177种在野生型新生鼠的卵巢中显著表达,其中表达量最高的是miR-199a;而在人上的研究发现,人卵巢上皮癌发生过程中,miR-199a 的表达量急剧降低[12-13]。
Pan等[14]利用基因芯片,比较了人子宫内膜基质细胞和腺上皮细胞的miRNA表达,发现在检测的287个miRNA中有32个差异表达,这些差异表达miRNA的靶基因中,有一部分与维持子宫内膜功能相关,例如转化生长因子(TGF-β)和受体、雌激素受体(ER)、孕酮受体(PR)和芳香化酶CYP19A1。此外,类固醇激素可调节子宫内膜中miRNA表达,例如,子宫内膜基质细胞和上皮细胞中的miR-20a、miR-26a和miR-21受雌激素和孕酮调节;miR-20a在基质细胞中的表达、miR-21在腺上皮的表达受雌激素下调;孕酮抑制基质细胞中miR-20a、miR-26a和miR-21的表达,但在腺上皮中却对miR-20a和miR-26a有明显的上调[14]。
Fiedler等[15]比较小鼠排卵前卵巢颗粒细胞的miRNA表达谱,发现LH/hCG处理前后在所检测的212个miRNA中,有13个差异表达,其中miR-132和miR-212在LH/hCG处理后均显著上调。用实时定量PCR检测发现,无论体内或体外,LH/hCG可以同时上调miR-132和miR-212的前体和成熟体。
在牛的生殖系统中,包括子宫、卵巢、输卵管以及黄体等组织器官也发现了大量的miRNA表达,如 miR-18a、miR-29a 和 miR-199 等[16]。
在国内,姚桂东[17]对小鼠卵泡发育过程中的miRNA进行了研究,他们检测了TGF-β1刺激小鼠腔前卵泡颗粒细胞的miRNA表达变化情况,结果发现3个miRNA发生显著上调,13个miRNA显著下调[17]。其中,miR-224是上调最为显著的miRNA之一。这种上调效果可以通过在颗粒细胞培养基中加入SB431542而阻断,其中SB431542是一种能够阻断TGFβ下游Smad2/3发生磷酸化的抑制剂,表明TGF-β1促进颗粒细胞miR-224的上调至少部分是通过经典的TGF-β/Smads信号通路[17]。
苏立杰等[18]分析了大白猪胎盘(妊娠33 d和90 d)的MicroRNA表达变化,从检测的56个miRNA中筛选出31个差异表达miRNA。这些差异miRNA的靶基因主要富集在细胞过程、发育过程、代谢过程以及生物黏附等GO条目中。通路分析发现,显著富集的通路与黏附、新陈代谢和内分泌功能密切相关[18]。
康丽[19]利用Solexa测序技术研究了开产前后鸡卵巢miRNA的差异表达。对比42 d雏鸡和23周产蛋白来航鸡(各3只)的卵巢组织,获得差异表达miRNA 72个,其中上调表达34个,下调表达38个。在未开产鸡的卵巢中筛选到189个新miRNA,在开产鸡的卵巢中筛选到97个新miRNA[19]。
由上述研究可见,miRNA在人、鼠、牛、猪和鸡等生殖系统中广泛表达,对卵泡发育、卵母细胞成熟以及性腺激素等都有调控作用。但目前对miRNA的表达模式研究居多,对功能研究尚显不足,因此应深入开展miRNA功能挖掘,以阐明miRNA在动物生殖中的作用机制。
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[1]秦一雨.miRNA检测方法学的研究进展[J].医学研究生学报,2007,20(11):1198-1201.
[2]LEE R C,FEINBAUM R L,AMBROS V.The C.elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14 [J].Cell,1993,75(5):843-854.
[3]KOZOMARA A,GRIFFITHS-JONES S.miRBase:annotatinghigh confidencemicroRNAsusingdeep sequencing data [J].Nucleic Acids Research,2014,42(Database issue):D68-D73.
[4]任刚,杨增明.MicroRNA在雌性哺乳动物生殖中的作用[J].细胞生物学杂志,2009,31(6):805-810.
[5]OKAMURA K,HAGEN J W,DUAN H,et al.The mirtron pathway generates microRNA-class regulatory RNAs in Drosophila[J].Cell,2007,130(1):89-100.
[6]ESQUELA-KERSCHER A,SLACK F J.OncomirsmicroRNAs with a role in cancer [J].Nat Rev Cancer,2006,6(4):259-269.
[7]TAY Y,ZHANG J,THOMSON A M,et al.MicroRNAs to Nanog,Oct4 and Sox2 coding regions modulate embryonic stem cell differentiation [J].Nature,2008,455(7216):1124-1128.
[8]ZOON C K.Current molecular diagnostics of breast cancer and the potential incorporation of microRNA [J].Expert Rev Mol Diagn,2009,9(5):455-467.
[9]OTSUKA M,ZHENG M,HAYASHI M,et al.Impaired microRNA processing causes corpus luteum insufficiency and infertility in mice [J].J Clin Invest,2008,118(5):1944-1954.
[10]NAGARAJA A K,ANDREU-VIEYRA C,FRANCO H L,et al.Deletion of Dicer in somatic cells of the female reproductive tract causes sterility [J].Mol Endocrinol,2008,22(10):2336-2352.
[11]ZHAO H,RAJKOVIC A.MicroRNAs and mammalian ovarian development [J].Semin Reprod Med,2008,26(6):461-468.
[12]YANG H,KONG W,HE L,et al.MicroRNA expression profiling in human ovarian cancer:miR-214 induces cell survial and cispltin resistance by targeting PTEN [J].Cancer Res,2008,68(2):425-433.
[13]IORIO M V,VISONE R,DILEVA G,et al.MicroRNA signatures in human ovarian cancer [J].Cancer Res,2007,67(18):8699-8707.
[14]PAN Q,LUO X,TOLOUBEYDOKHTIT,etal.The expression profile of micro-RNA in endometrium and endometriosis and the in-fluence of ovarian steroids on their expression [J].Mol Hum Reprod,2007,13(11):797-806.
[15]FIEDLER S D,CARLETTIM Z,HONG X,etal.Hormonalregulation ofMicroRNA expression in periovulatory mouse mural granulosa cells [J].Biol Reprod,2008,79(6):1030-1037.
[16]HOSSAIN M M,GHANEM N,HOELKER M,et al.Identification and characterization of MicroRNAs expressed in the bovine ovary [J].BMC Genomics,2009,10:443.
[17]姚桂东.MiRNA-224参与小鼠卵泡发育调控作用的研究[D].合肥:中国科学技术大学,2011.
[18]苏立杰,赵书红,朱猛进,等.应用Exiqon芯片分离大白猪33天和90天胎盘差异表达而microRNA[C]//中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集.北京:中国畜牧兽医学会,2009:8.
[19]康丽.鸡卵泡发育相关基因和miRNA的鉴定及功能分析[D].泰安:山东农业大学,2009.