郭蕊
【摘 要】人乳頭瘤病毒(human papillomavirus, HPV)在人群中感染率较高,并且宫颈癌等多种肿瘤的发生密切相关,但目前仍缺乏一种简单快捷的检测方法。本研究选取中国境内常见高毒力HPV病毒,根据其相对保守序列设计通用引物GP5和GP6,采用PCR法检测各种HPV。研究结果表明,通用引物GP5和GP6可以检出HPV-16、18、11、6、52型,但HPV-58、51、31和33型未能检出。本研究建立的通用引物GP5和GP6已基本涵盖我国境内高毒力型HPV,具有极高的临床应用价值。
【关键词】人乳头瘤病毒;通用引物;PCR
【中图分类号】R730 【文献标识码】A 【文章编号】1672-3783(2018)08-0118-01
人乳头瘤病毒(human papillomavirus, HPV)与许多常见病有关,该病毒的研究在人群传播广泛。大量研究发现,宫颈癌以及其他肿瘤(包括胃癌、肺癌和食道癌等)均与HPV的感染直接相关[1]。由于HPV种类繁多,目前确认的种类已达到60余种,其中可以感染人的有6型、11型、16型、18型和33型等十余种型别[2]。
核酸杂交技术和聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction, PCR)是目前检测HPV的主要方法,但由于HPV型别复杂,现有的PCR-反向点杂交法检测成本高昂,难以在临床大规格推广。我们借鉴国外报道,使用通用引物检测HPV感染,取得了较好的效果,现将结果报告如下:
1 材料和方法
1.1 标本
6份不同类型HPV标本,采集自本院宫颈糜烂患者宫颈脱落细胞,采用亚能生物技术公司HPV分型检测试剂盒检测并确定HPV型别。选取携带HPV-11、16、18、31、33、51、52和58型样本用于本研究。
1.2 试剂和仪器
HPV分型检测试剂盒购自亚能生物技术(深圳)有限公司;分子杂交仪(YH-H16)购自深圳亚能生物技术有限公司;2×PCR Master Mix预混液购自南京诺唯赞公司;DNA Marker 2000 bp购自上海捷瑞公司;PCR扩增仪和凝胶电泳成像分析系统均购自美国Bio-Rad公司;水平电泳套件购自上海天能生物公司。
1.3 通用引物合成
根据HPV基因组高度保守L1序列设计通用引物,其序列为:HPV-GP5: TTTGTTACTGTGGTAGATAC和HPV-GP6: GAAAAATAAACTGTAAA TCA。其PCR产物预测长度约150 bp。引物由苏州泓讯生物技术有限公司合成。
1.4 PCR检测
PCR反应体系为25 μL,包括宫颈脱落细胞DNA模板4 μL,PCR反应上下游引物为1 μL。PCR反应条件:94℃预变性5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 45 s,共40个循环,最后72℃延伸10 min。5μL PCR产物于2%琼脂糖凝胶电泳观察结果。
2 结果
2.1 PCR产物检测结果
采用通用引物进行不同类型HPV检测后,其产物长度约150 bp。产物条带清晰易辨,无非特异性扩增,阴性对照无扩增产物(见图1)。
2.2 通用引物检测效果
6种HPV标本中,GP5/GP6通用引物可以检出HPV-16、18、11、6、52型,HPV-58、51、31和33型未能检出(见图1)。
3 讨论
HPV感染与宫颈癌等肿瘤关系密切,但目前缺乏HPV病毒的体外培养系统,HPV-DNA检测代替病原学诊断方法,成为HPV感染诊断的“金标准”。PCR法简单方便,成本低廉,是检测HPV感染的理想方法。但由于HPV型别众多,难以寻找到一段保守序列用于引物的设计,因此开发PCR通用引物是检测不同型别HPV的唯一方法。
本研究根据我国境内常见HPV型别,包括HPV-11、16、18、31、33、51、52和58型L1基因序列[3],选取相对保守一段序列设计通用引物GP5和GP6。并且在PCR扩增时,采用较低的退火温度以降低PCR反应严谨性,允许引物和目的基因之间存在一定程度错配,以提高扩增成功率[4]。我们的检测结果表明,GP5和GP6通用引物可以检出HPV-16、18、11、6和52型,已基本涵盖我国境内高毒力型HPV,具有极高的临床应用价值[5]。
在后续研究中,如需要进行HPV型别鉴定时,可以将阳性PCR产物进行测序,通过BALST比对后即可知道HPV类型。该方法可以节省大量检测费用,操作简单,更适合于在临床推广使用。
参考文献
[1]Juan C,Feoli-Fonseca JC,Luc L.Human papillomavirus study of 691 pathological specimens from Quebec by PCR-direct sequencing approach [J].J Med Virol,2001,63(4): 284-292.
[2]Takeshima E,Tomimori K,Kawakami H,etal.NF-κB activation by Helicobacter pylori requires Akt-mediated phosphorylation of p65 [J].BMC Microbiol,2009,9(1): 36-44.
[3]Chansaenroj J,Theamboonlers A,Junyangdikul P,etal.Whole genome analysis of human papillomavirus type 16 multiple infection in cervical cancer patients[J]. Asian Pacific J Cancer Prev,2012,13(2):599-606.
[4]Hildesheim A,Schiffman M,Bromley C,etal.Human papillomavirus type 16 variants and risk of cervical cancer[J].J Natl Cancer Inst, 2001, 93: 315-318.
[5]Cornet I,Gheit T,Franceschi S,etal.The IARC HPV variant study group:human papillomavirus type 16 genetic variants: phylogeny and classification based on E6 and LCR[J].J Virol,2013,86(12):6855-6861.