基于DNA模板制备的金属纳米簇及其在分析检测中应用进展

2018-04-03 02:26贺锦灿李攻科胡玉玲
分析科学学报 2018年1期
关键词:碱基荧光模板

贺锦灿, 李攻科*, 胡玉玲*

(中山大学化学学院,广东广州 510275)

1 引言

金属纳米簇(Metal Nano-Clusters,M NCs)一般由10~100个金属原子构成,其直径通常小于2 nm,接近电子的费米波长,连续密度态分裂成离散的能级,可认为是一种“分子物种”。由于独特的分裂能级和量子尺寸效应,M NCs呈现出与较大金属纳米颗粒显著不同的光学、电学和化学性质。M NCs具有强荧光性、优异的光稳定性以及良好的生物相容性等,因此在生化分析,环境监测、工业催化等领域有广泛的应用前景[1]。M NCs的尺寸很小,表面能非常大,容易团聚成不发光的大颗粒,因此制备稳定性好、强荧光的M NCs是相关研究的热点和难点。常见的方法是利用模板分子的包覆作用制备结构和性质稳定的M NCs。目前,已报道的模板主要为聚合物、蛋白质、巯基小分子、寡聚核苷酸(DNA) 等[2]。DNA碱基序列和长度可调、二级结构多样、生物相容性好[3],使之成为最具特色的模板之一。DNA杂环碱基上的N、O 功能基团可与过渡金属离子配合;同时,DNA碱基对自组装可形成多形态的超分子结构,包括G -四链体、i-motif、以及传统的Watson-Crick双链等。以DNA为模板制备M NCs具有如下优势:(1) 可通过调节DNA长度、碱基序列合成从蓝到近红外的M NCs;(2) 可通过设计同时包含适配体和碱基模板的DNA序列实现对目标物选择性识别与检测;(3) 与传统有机荧光染料和半导体量子点相比,无需再将DNA与M NCs进行共价连接,费用降低;(4) DNA为M NCs提供了良好的生物活性表面,促进了其在生物成像和核酸检测方面的应用[1]。

目前,虽有不少Ag NCs合成[2]和应用[3 - 6]方面的综述,但基于DNA为模板制备M NCs及其在分析检测中的应用综述甚为鲜见。本文总结了DNA-M NCs的合成方法及光学性质,重点介绍了DNA-M NCs 在分析检测中的应用,并总结和展望其存在的问题和发展趋势。以期为DNA-M NCs在分析化学中的发展提供一定的参考。

2 DNA-M NCs的制备

根据DNA模板的不同,可将DNA-M NCs的合成方法分为以下几类:(1)单链DNA(ssDNA);(2)双链DNA(dsDNA)和发夹结构DNA;(3)三链DNA、i-motif和G -四链体;(4)模板置换等。

2.1 单链DNA

2004年,Dickson等[7]首次在磷酸缓冲溶液中以12碱基DNA序列为模板(5′-AGGTCGCCGCCC-3′)合成荧光Ag NCs。DNA为Ag NCs提供了有效的模板(支架)。Ag+与DNA存在较强的作用力,加入还原剂NaBH4后,得到的少量Ag原子(1~4个) 键合在ssDNA上。他们进一步发现,胞嘧啶碱基与Ag NCs的作用最强,可通过调控化学计量比和DNA序列制备理想的Ag NCs。胞嘧啶[8 - 10]和鸟嘌呤[11 - 12]与Ag+的结合力较强,因此富C的ssDNA常被用于合成Ag NCs。Petty等[8]发现富C序列C12是一种制备Ag NCs的高效模板,Ag NCs主要结合在胞嘧啶的N3位置。Vosch等[9]采用同一种DNA序列为模板制备了近红外发光、耐光性好的Ag NCs。胸腺嘧啶的N3位置需在较高pH才能发生去质子化,因此富T序列很少用来合成Ag NCs[13]。此外,可通过调节DNA的碱基序列和长度获得具有不同发射波长的Ag NCs[14 - 15]。

一般来说,DNA-Au NCs的发射光的颜色主要与还原试剂有关而不是DNA序列。用强还原剂NaHB4还原HAuCl4只能得到较大粒径的Au NPs。Liu等[16]以含30个碱基的DNA为模板,以柠檬酸钠为还原剂,合成了蓝色发射波长的Au NCs。pH和反应物化学计量比影响碱基与Au的结合。以C30为模板时,仅在较低pH和大量DNA存在下才可制备出荧光Au NCs;而以A30为模板时,在中性pH和约1∶1 反应计量比条件下即可制备出荧光Au NCs。除柠檬酸钠外,二甲基胺硼烷也常被用作制备Au NCs的还原剂[17 - 19]。

Cu NCs的荧光强度弱且稳定性差,因此相关研究并不多。由于胸腺嘧啶与Cu NCs的作用较强,因此常用富T序列的ssDNA为模板合成Cu NCs[20 - 21]。以ssDNA为模板不仅可以合成单一金属组分的M NCs,也可合成双金属组分的M NCs,如Cu/Ag NCs[22 - 23]。

2.2 双链DNA和发夹结构DNA

通过调节DNA的多态结构,如双链DNA和含loop区的发夹DNA,可制备具有不同荧光特性的Ag NCs[24 - 27]、Au NCs[18,28]和Cu NCs[29 - 32]。DNA发夹序列不同,所制备的Ag NCs荧光特性不尽相同。Gwinn等[27]发现C发夹和G发夹制备的DNA-Ag NCs亮度较高,A发夹制备的DNA-Ag NCs亮度很低,而T发夹制备的DNA-Ag NCs无荧光。Liu等[18]发现基于loop区发夹DNA为模板制备的Au NCs,荧光特性与loop区序列组成有关,富C loop形成的Au NCs产率最高。与T和A loop相比,C和G loop形成的Au NCs荧光强度要高很多。Wang等[32]发现错配dsDNA比匹配dsDNA调控出的DNA-Cu NCs 荧光强度高很多,为核苷酸位点突变检测提供了新方法。

2.3 三链DNA、i-motif和G -四链体

除了ssDNA和dsDNA,三链DNA(Triplex DNA)也可作为制备M NCs的模板。Ren等[33]以三链DNA为模板制备了均一性好、亮度高的Ag NCs。Ag NCs的成核与三链DNA的CG.C+位点有关。通过对DNA序列的合理设计,可在CG.C+位点形成均相Ag2团簇。

与传统的双链互补配对不同,i-motif结构是一种以C.C+碱基对为基本单元的DNA二级结构。Jeffrey等[34]用两条具有C4i-motif结构的序列(dTA2C4)4和(dC4A2)3C4合成了红色荧光和绿色荧光Ag NCs。Li等[35]以具有i-motif结构的DNA序列合成了Pd NCs。密度泛函理论计算显示位于i-motif结构上的CH+.C碱基对可通过胞嘧啶的N3位点与Pd离子有效结合。

G -四链体(G -quadruplex)是一种鸟嘌呤连接的四链DNA螺旋结构。研究发现G -quadruplex也是一种调控荧光Ag NCs的有效模板。Wang等[36]用可形成G -quadruplex的抗核仁素适配体AS1411为模板,合成了在420 nm和680 nm处发光的Ag NCs。进一步研究发现,合成Ag NCs后,AS141仍保持原有的结构,可与癌细胞核仁素结合。同时,这种结合可以增强Ag NCs的荧光强度,利用该性质成功实现了HeLa细胞的荧光成像。该方法也可拓展到其他G -quadruplex模板。

2.4 模板转换

除了直接合成法,Dickson等[37]发现可以通过模板转化法制备DNA-Ag NCs。由聚丙烯酸为模板合成的Ag NCs发光很弱,加入C12后,团簇转移到更具亲和力的ssDNA模板上,其荧光亮度提高了10倍。荧光转换效率受溶液的pH值、缓冲溶液和温度等因素的影响。类似地,Martinez等[38]发现,以含12碱基成核序列和30碱基杂化序列的DNA为模板合成的DNA-Ag NCs接近富G序列3′-G4(TG4)2TG3)后,红色荧光增强了500倍。

3 M NCs的光学性质

M NCs的能级谱带不连续,分裂成类似于分子的分立能级,因此具有与分子类似的性质。由于独特的分裂能级和量子尺寸效应,M NCs呈现出与较大金属纳米颗粒显著不同的光学性质,如强荧光、优异的光稳定性等。

3.1 吸收光谱和荧光光谱

金属纳米粒子的吸收光谱主要取决于导带电子的表面等离子性质,而表面等离子共振来源于导带电子与入射光的相互作用。M NCs的连续密度态分裂成不同的能级,不再表现出等离子性质,但仍可以通过不同能级间的电子跃迁与光相互作用,显示出吸收峰。Zhang等[39]发现C12-Ag NCs在波长442 nm和547 nm处有吸收峰。最近,Tseng等[40]发现A30-Au NCs在290 nm处有吸收峰。虽然不同配体为模板的M NCs 吸收峰位置不尽相同,但通常都表现出电子的离散跃迁,因此吸收光谱可作为鉴定M NCs的一种手段。

M NCs与常见的有机荧光染料相比,显示出更加优越的荧光性质,有良好的光稳定性、如光漂白抗性好、斯托克斯位移大(100 nm以上)等[41]。大块金属发光极其微弱,主要是由于存在有效的非辐射跃迁和能级带。当金属的尺寸减小到纳米级,发光效率明显增强。当粒径接近导带电子的费米波长时,M NCs显示出强荧光性质。DNA-M NCs的发光通常归因于纳米簇能带间的电子跃迁(可见发射) 及DNA碱基与纳米簇间的电荷转移(紫外发射)[42]。目前有研究者提出一些解释小尺寸M NCs发光的机理,但都存在一定的局限性,仍无一种普遍适用的解释。DNA-M NCs的荧光性质与多种因素有关,如DNA序列、溶剂、pH、试剂浓度、纳米簇的尺寸和氧化态等[43]。

3.2 溶剂致变色效应

溶剂变色效应是指物质在不同的溶剂中有不同的显色能力。溶剂变色效应常见于大尺寸金属纳米粒子,这种性质与表面等离子体性质有关。最近的研究显示,M NCs表现出类似的光学性质。随着溶剂极性的变化,不同DNA序列包裹的Ag NCs产生强的、不连续的荧光,吸收峰和发射峰在可见和近红外区间[44]。最近,Elisabeth等[45]发现不同DNA模板合成的AgN-DNAs经纯化后溶剂致变色效应不尽相同,且比未纯化的AgN-DNAs溶剂变色效应弱很多。

3.3 双光子吸收性质

双光子吸收是指两个相同或不同频率的光子同时吸收,从而将一个分子从低能态激发到高能态。与单光子激发相比,双光子激发所需要的能量减半,通常位于近红外区。由于色散率低和自荧光变小,其近红外区域的穿透深度和空间分辨率增加,尤其适合生物体内成像和光动力治疗。Dickson等[46]发现发射峰的截面为35 000 GM,680 nm处发射峰的截面为34 000 GM,在710 nm处发射峰的截面高达50 000 GM。M NCs的双光子吸收截面接近水溶性量子点的截面(66 000 GM),远大于水溶性双光子染料的截面。Goodson等[47]发现当用800 nm对dsDNA-Ag NCs进行激发时,可在630 nm处检测到双光子激发荧光。双光子吸收的截面约为3 000 GM。

3.4 电化学发光性质

电化学发光(Electrochemiluminescence,ECL)是指在电极表面施加一定的电压而引发的特异性化学发光反应,包括化学发光与电化学两个过程。存在共反应试剂存在时,M NCs显示强烈的ECL信号。共反应试剂在氧化或还原时产生强还原性或强氧化性中间体,该中间体和ECL体系的发光基团作用,从而增强ECL发光效率[48]。ECL体系中最常见的激发方式为氧化还原激发,发光物质最先被阴极产生的氧化自由基氧化,然后被高能电子还原,进而回到初始氧化态基态。Xu等[49]发现CdS纳米晶体(CdS NCs) 的发射峰与DNA-Ag NCs的吸收峰重叠,能发生有效的ECL共振能量转移。加入共反应试剂K2S2O8后,工作电极表面的DNA-Ag NCs发生反应而逐渐减少,导致CdS NCs的ECL信号减弱,据此建立了一种检测micro RNA的方法。Yuan等[50]结合聚合酶链反应和杂交链反应,在电极表面组装富胞嘧啶茎环,促使Ag NCs的合成,在0.24 V处观察到较强的电化学发光信号。

4 DNA-M NCs在分析检测中的应用

DNA-M NCs具有超小尺寸、强荧光、良好的稳定性、良好的生物相容性,已成为构建生化传感平台的新型荧光探针。环境变化容易导致DNA二级结构发生变化,从而引起Ag NCs的荧光增强、猝灭或荧光激发、发射波长发生位移。这种性质为DNA-M NCs在分析检测方面的应用提供了可能。目前,DNA-M NCs 已成功用于金属离子[25,51 - 55]、有机小分子[56 - 65]、核酸[66 - 71]、蛋白质[24,72 - 74]分析检测和成像标记[75 - 83]等分析检测领域。

4.1 检测金属离子

基于荧光猝灭(“turn off”)、荧光增强(“turn on”)或发射波长位移,已实现Hg2+ [25,51 - 52]、Cu2+[53 - 54]和Ag+[55]等金属离子的检测。以“turn off”模式为例,Yang等[51]用ssDNA模板(5′-CCCCCCCCCCCC TTTTTT-3′)合成Au NCs,加入Hg2+后形成“T-Hg2+-T”结构,DNA-Au NCs发生聚集,荧光强度降低,Hg2+的检出限为0.083 μmol/L。此外,也可通过“turn on”模式实现金属离子的检测。Chang等[54]发现3-巯基丙酸(MPA)对DNA-Cu/Ag NCs荧光具有猝灭作用,加入Cu2+后,MPA被氧化为二硫化物,DNA-Cu/Ag NCs荧光恢复,荧光恢复程度与Cu2+浓度相关,依此建立检测Cu2+的方法,其检出限为2.7 nmol/L。最近,Kim等[55]利用荧光发射波长的变化实现了Ag+的检测。Ag+可同时连接两个Cyt12-Ag NCs,使Cyt12-Ag NCs的荧光从红色变为绿色,从而建立一种检测Ag+的方法,检出限10 nmol/L。

4.2 检测有机小分子

除了金属离子,DNA-M NCs对生物硫醇[56 - 58]、腺苷[59]、三磷酸腺苷(ATP)[60 - 61]、可卡因(Cocaine)[62 - 63]、赭曲霉毒素A(OTA)[64]、硝基化合物[65]等小分子也有优异的检测效果。巯基与Ag有较强的亲和作用,可通过硫醇对荧光DNA-M NCs的猝灭实现对硫醇的分析检测。Wang等[58]发现含巯基的氨基酸(半胱氨酸Cys、同型半胱氨酸Hcy和谷胱甘肽GSH) 可高效猝灭DNA-Ag NCs荧光。该方法对Cys、Hcy和GSH的检出限分别为4.0、4.0和0.2 μmol/L。最近,He等[61]设计了一条哑铃状的DNA模板,该模板由两个富C loop(可合成Ag NCs) 和富A-T碱基对的茎环(可合成Cu NPs) 组成,既可作Ag NCs 的合成模板,又可作Cu NPs的合成模板。由于T4 DNA连接酶的催化需ATP做辅助因子,因此当体系中存在ATP时,向模板中加入T4 DNA连接酶后,5′端和3′端连接,形成闭合形哑铃状dsDNA,ExoⅠ和EXoⅢ无法将其水解,加入Ag+/NaBH4或Cu2+/抗坏血酸后,可以形成具有荧光的Ag NCs或Cu NPs;而当体系中不存在在ATP时,T4 DNA连接酶无法起催化作用,加入ExoⅠ和ExoⅢ后DNA模板被水解,无法形成荧光纳米簇,从而建立了检测ATP的灵敏方法。进一步研究发现,Cu NPs对ATP的检测限为81 pmol/L,比Ag NCs更高。该方法同样也适用DNA等大分子的检测。

4.3 检测核酸

M NCs也可用于DNA[66 - 68]和micro RNA[69 - 71]等核酸检测。研究发现,荧光DNA-Ag NCs的形成具有高度的序列依赖性,可基于此特性检测核酸。例如,Zhang等[66]用两种不同序列的DNA loop模板合成两种Ag NCs,开发了一种同时检测H1N1基因和H5N1基因的方法。模板P1(或P2) 由不同成核序列的茎环以及含H1N1基因(或H5N1基因) 识别序列的双链组成。当加入H1N1基因(或H5N1基因) 时,茎环打开,成核序列与Ag+结合,在还原剂NaBH4的作用下形成绿色(或橙色) 荧光的DNA-Ag NCs。P1模板合成的绿色荧光DNA-Ag NCs最大发射光为507 nm,P2模板合成的橙色荧光DNA-Ag NCs的最大发射光为597 nm。将两种DNA-Ag NCs混合,分别用不同波长的光进行激发,实现了H1N1基因和H5N1基因的同时检测。DNA-M NCs与恒温指数放大反应结合,可以提高检测灵敏度。Ye等[71]通过设计特殊的DNA模板“AXAXB”,结合恒温指数放大法,合成的Ag NCs对micro RNA的检测限低达2 amol/L。

4.4 检测蛋白质

蛋白质是生命的物质基础,是构成细胞的基本有机物质,与生命及各种形式的生命活动紧密联系在一起。适配体可与靶分子高亲和力,高特异性结合。将适配体与荧光M NCs结合,可提高蛋白质检测的选择性[24,72 - 74]。与其他检测蛋白质的方法相比,其优势在于不需要额外的标记分子(如染料等) ,因此方法更有效,成本降低。Martinez等[72]首次报道了以适配体功能化的DNA-Ag NCs检测蛋白质。DNA模板由凝血酶适配体和富C碱基组成,所合成的DNA-Ag NCs具有良好的光稳定性。加入凝血酶后,荧光被猝灭,该方法对凝血酶的检出限为1 nmol/L。由于适配体的高特异性,该方法对凝血酶具有良好的选择性,其他蛋白质的加入不会引起荧光猝灭。利用类似的“turn off”模式,实现了酶活性的检测[73]。当然,也可利用“turn on”模式实现蛋白质的检测[24,74]。例如,Yang等[74]通过设计两条DNA探针P1和P2,实现了PDGF BB的高灵敏检测。P1由PDGF BB适配体序列和发卡序列组成,P2由与P1发卡互补的序列和富C序列组成。当向P1中加入PDGF BB和P2后,P1的适配体序列与PDGF BB结合,发卡打开,发卡序列与P2中相应的互补序列进行配对,从而使富C序列裸露出来。加入Ag+和NaBH4后,产生荧光DNA-Ag NCs。该方法对PDGF BB的检出限为0.37 nmol/L。

4.5 细胞标记和成像

DNA-M NCs作为一种新型荧光探针,具有合成简单、粒径小、毒性低、光稳定性好,靶向性等优点,逐渐应用于细胞标记与成像、细胞核染色等研究领域。目前,利用DNA-M NCs进行细胞靶向成像主要分为两种方式。第一种是先合成DNA-M NCs,再修饰生物素或抗体等特异性识别分子,通过“生物素-亲和素”或“抗原-抗体”识别模式[75 - 76]对细胞进行靶向成像;第二种是一步法合成适配体(sgc8c[77 - 78]、MUC-1[79 - 80]、AS1411[80 - 83]) 功能化的DNA-M NCs,以“适配体-靶标”识别模式对细胞进行识别与成像,这种方法集合成和修饰为一体,无需再额外修饰识别分子。例如,Wang等[77]以sgc8c-A6-C12为模板,一步法合成了具有特异性识别功能的DNA-Ag NCs。其中sgc8c为识别适配体,A6为连接碱基,C12为Ag NCs的成核序列。利用sgc8c对CCRF-CEM肿瘤细胞表面和细胞核的特异性识别作用,实现了CCRF-CEM肿瘤细胞的靶向成像。除利用DNA-Ag NCs进行单一荧光成像外,也可将DNA-Ag NCs与其他功能材料进行复合,进行双模式成像。例如,Xu等[83]利用EDC/NHS连接PEG -Cd2O3和AS1411-Ag NCs,PEG -Cd2O3作为核磁共振成像(MR)造影剂,AS1411-Ag NCs作为荧光标记物,实现了MCF-7癌细胞的MR和荧光双模式成像。

5 结论与展望

DNA-M NCs是研究最为广泛和最具特色的M NCs之一。DNA-M NCs具有超小尺寸、光化学性质稳定、荧光光谱可调、生物相容性良好等优点,使其成为构建化学生物传感平台的新型荧光探针,在分析检测、细胞成像等领域发挥重要的作用。尽管DNA-M NCs在分析化学中具有一定进展,但其进一步发展面临一些挑战。第一,缺少通用有效的方法设计DNA序列;第二,DNA-M NCs的合成机理及结构研究尚处于初步阶段;第三,与常见的有机染料和半导体量子点相比,DNA-M NCs的量子产率较低且成本较高,限制了其在分析检测中的灵敏度和商业化推广;第四,多数分析方法基于荧光猝灭,环境中多种已知或未知的因素也会造成荧光猝灭,选择性有待提高。面对这些挑战,需进一步改进、创新合成方法和深入的理论研究,以合成更稳定、具有更好发光性能的DNA-M NCs。我们相信,DNA-M NCs作为一种超小且环境友好的荧光材料,在分析化学中有着光明的未来。

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