长链非编码RNA在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的研究进展

2018-03-19 01:32罗瑜张剑青赵芝焕
实用医学杂志 2018年21期
关键词:靶点生物学编码

罗瑜 张剑青 赵芝焕

昆明医科大学第一附属医院呼吸内二科(昆明 650032)

慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)是一种常见的可防可治的疾病,以持续气流受限及呼吸道症状为特征,与暴露于有害环境相关。近日一项全国多中心横断面研究指出[1],我国COPD患病人数约1亿,40岁以上患病率为13.7%。COPD目前居于全球第四大死亡原因,预计到2020年,其排名将升至第3位[2]。COPD的高发病率及病死率严重威胁人类健康,成为亟待解决的公共卫生问题,但COPD的早期诊断及治疗仍然没有很大的进步。MARTINEZ等[3]人提出了早期COPD定义,但因早期COPD患者症状轻微,进展到晚期之前很少就诊,造成患者生存质量下降及治疗效果欠佳等。因此,寻找一种能在早期诊断COPD的生物学标记物有助于为COPD的防治提供理论依据和指导。近来研究发长链非编码RNA(lncRNA)在COPD肺组织中特异性异常表达[4],提示lncRNA可能参与影响COPD发生、发展。通过沉默或过表达lncRNA,能够调控蛋白编码基因的表达水平,提示lncRNA可能在慢阻肺的发生、发展中起重要作用。本文就lncRNA与COPD的发病机制的关系研究最新进展进行综述,将lncRNA作为COPD发生发展的生物学标志物及作为潜在COPD临床治疗应用前景进行阐述。

1 LncRNA的生物学功能

研究显示[5],约3%的基因编码蛋白,大量的基因转录为非编码的RNA(ncRNA)。ncRNA主要包括lncRNA及小RNA(miRNA)。lncRNA是一类核苷酸数>200 nt的非编码RNA,无编码蛋白的功能。DERRIEN等[6]根据lncRNA编码序列与蛋白质编码基因的相对位置进行了分类,包括正义IncRNA、反义lncRNA、双向lncRNA、内含子lncRNA、基因间lncRNA五种类型。

目前大多数lncRNAs的生物学功能仍然未知,但lncRNAs在基因调控中发挥复杂作用[7]。lncRNA定位于细胞核,在生命的生长发育的各个阶段都发挥着重要的调节作用,与炎症、肿瘤、代谢异常等多种病变密切相关,并且参与着表观遗传学调控、转录调控及转录后调控。lncRNA可以稳定或促进目标mRNA与靶蛋白的结合与翻译,也可促进mRNA衰减或抑制目标信使核糖核酸的翻译[8],另外lncRNA可以抑制前体mRNA拼接,翻译时诱导RNA结合蛋白或miRNA,调节基因表达、影响细胞分化、增殖及死亡等细胞过程,达到调节生理和病理过程的作用[9]。lncRNA广泛参与肺部生理及病理性疾病的发生、发展,如哮喘、肺癌、肺纤化等,在细胞炎症、免疫等方面具有重要作用。lncRNA可能作为COPD发生、发展的早期生物学标志物;通过探讨对其作用于COPD的发生、发展机制,从而为COPD早期诊治提供理论指导。

2 lncRNA在COPD发生发展中的作用

COPD的发生、发展是一个复杂的过程,其发病机制主要包括慢性炎症、蛋白酶-抗蛋白酶失衡、氧化应激等,但其具体分子机制尚不明确。吸烟是慢阻肺的最重要的环境危险因素,然而重度吸烟者仅10%~20%发病,终生不吸烟者仍有患慢阻肺的风险,并且慢阻肺具有家族聚集性,故此推断慢阻肺具有遗传易感性[10]。微阵列和高通量测序等技术的出现,改变了检测呼吸系统内lncRNA表达水平的能力。早期有研究者在COPD患者的肺组织中观察到lncRNA的表达改变,如LINC00882,LINC00883 和 PVT1[11];CHEN 等[12]指出,lncRNA HCG4B在COPD中特异性表达,可作为COPD潜在的治疗靶点。这些研究表明lncRNA与COPD的发生发展密切相关。

2.1 lncRNA与COPD炎症机制的关系慢性炎症是COPD发病的核心机制,研究发现[13]lncRNA可通过调控基因的表达,具有促进、优化和抑制炎症发生发展的作用,多种lncRNA参与COPD炎症反应的机制。吸烟是COPD慢性炎症的常见诱因,WANG等[14]通过微阵列分析发现,香烟暴露组与正常对照组小鼠肺组织中共108个lncRNAs和119个mRNA表达异常,qRT-PCR进一步证实了lncRNA的表达水平变化;该研究在进一步通过对动物进行实验验证,说明慢性气道炎症与lncRNA表达水平密切相关。推测通过改变lncRNA表达水平可影响气道炎症的水平。这些实验数据揭示了lncRNA可以作为早期炎症标记物的可能性。

NF-kB信号通路作为经典的炎症通路,与哮喘及COPD发生发展密切相关。已有研究表明[15]在哮喘的发生、发展中,NF-κB可通过与miRNA结合,调节气道炎症水平变化。lncRNA可通过调节相关基因,改变相关蛋白表达水平,引起NF-κB通路种炎症因子水平变化,改善COPD肺部慢性炎症发生、发展。有研究指出,lncRNA BIC及其miRNA终产物miR-155是新型抗炎和抗重塑治疗的潜在靶点[16]。近期一项研究发现[17],lncRNA-EPS在巨噬细胞中被精确调节以控制免疫应答基因(IRG)的表达,lncRNA-EPS-缺陷小鼠在体内内毒素攻击后,表现出更严重的炎症反应及更高的致死率;通过染色体上位置的标注,发现lncRNA-EPS定位于IRG的调节区,以控制核小体定位并抑制转录。该研究提示将lncRNA-EPS可作为炎症反应的阻遏物,为进一步深入研究其表达模式及功能奠定了基础,也为抗炎治疗提供了新思路和新方法。

2.2 lncRNA与COPD的蛋白酶-抗蛋白酶失衡机制的关系α-1-抗胰蛋白酶缺乏可导致中性粒细胞弹性蛋白酶水平升高,进而降低肺部弹性蛋白,导致COPD患者肺气肿的发生发展[18]。α-1-抗胰蛋白酶缺乏症(A1ATD)是由SERPINA1基因突变引起的遗传性疾病,SERPINA1转录本异构体在组织类型中差异表达[19]。近期一项研究发现[4],α-1-抗胰蛋白酶蛋白表达水平可在转录后水平上被控制,且定位了α-1-抗胰蛋白酶缺陷的遗传位点位于非编码基因区;通过对非编码区的lncRNA基因位点进行破坏,α-1-抗胰蛋白酶表达水平发生明显变化,说明lncRNA遗传改变可能导致α-1-抗胰蛋白酶缺陷,从而引起COPD发生、发展。这表明lncRNA可能作为蛋白酶-抗蛋白酶失衡患者早期诊断的生物学指标以及治疗潜在靶点。

供体血清衍生的α-1-抗胰蛋白酶静脉内给药是AIATD常用的治疗手段,但这种治疗费用昂贵且疗效未知[20],并不能从根本上改善疾病的发生发展。LncRNA表现出与α-1-抗胰蛋白酶表达水平有相关性,通过靶向改变lncRNA在转录后水平对α-1-抗胰蛋白酶表达进行调控,有待成为AIATD的新疗法。

2.3 lncRNA与COPD的氧化应激机制COPD患者的氧化应激增加可导致细胞功能障碍,引起炎症反应及蛋白酶-抗蛋白酶失衡。BI等[21]对肺组织lncRNA分析发现,吸烟无COPD组与非吸烟无COPD组相比,有87种lncRNA上调,244种lncRNA下调;吸烟COPD组与吸烟无COPD组相比,发现有120个lncRNA上调和43个lncRNA下调;吸烟可影响lncRNA表达异常,与新陈代谢通路的激活相关,而COPD患者表达异常的lncRNA与转录、新陈代谢及免疫系统激活相关。THAI等[22]发现了一种与烟雾相关的新型lncRNA,被称为lncRNA-1(SCAL1,lnc-ARRDC3-1),用香烟提取物(CS)对人支气管上皮细胞进行刺激后,可测到lncRNA-1升高,敲除支气管上皮细胞中的SCAL1导致CS诱导的细胞毒性的显着增强。我们推测SCAL1可能有气道炎症抑制性调节作用。进一步的研究表明,lncRNA-1可能作用于NRF2的下游,调节基因表达并介导气道上皮细胞的氧化应激保护。lncRNA-1表达水平的升高可能作为气道炎症早期反应的生物学标记物,也可能是控制香烟烟雾暴露引起氧化应激的新型治疗靶点。

2.4 其他鞘氨醇-1-磷酸(S1P)是一种有效的信号传导脂质,在内皮中S1PR1是主要的受体。lncRNA NONHSAT004848(LISPR1)与 S1PR1基因紧密相连,在人脐静脉内皮细胞以及人肺组织中,qRT-PCR和RNA-Seq显示LISPR1的高表达,而在COPD肺组织中S1PR1和LISPR1表现为下调,LISPR1控制内皮细胞S1PR1的表达,从而控制内皮细胞中S1P诱导的信号传导。lncRNA LISPR1充当对S1PR1表达和内皮细胞功能重要的新调节单位,可作为COPD诊断的早期标志物及治疗的潜在靶点。

CHAO等[23]研究发现,lncRNA090007通过介导SIRT1/p53和FoxO3a信号通路,导致SIRT1和FoxO3a的表达水平降低,SAL-RNA2,SAL-RNA3,p53和p21在肺组织中表达上调,引起Ⅱ型肺泡上皮细胞凋亡,加重COPD肺气肿发生。通过对lncRNA进行抑制或过表达,可作为间接调控Ⅱ型肺泡上皮细胞凋亡的手段,为COPD早期诊治提供了新的思路。

3 展望

越来越多研究表明,lncRNA在COPD的诊断和治疗中有着巨大的潜在应用价值。大量研究证实了lncRNA在COPD肺组织中异常表达,且部分lncRNA出现明显的特异性表达,这一特点将有助于寻找COPD相关的早期生物学标志物和药物治疗靶点。LncRNA在COPD中的表达及其生物学功能仍有待深入的研究,调控经典炎症通路中关键位置基因相关的lncRNA,有望成为COPD患者再起诊治的关键。COPD的发生发展是一个多因素、多环节相互作用的结果,上述机制为目前研究的一部分,另外还有很多其他因素在COPD的发病过程中起着重要作用,例如遗传易感性、免疫失衡等。尽管目前lncRNA的分子机制还有待进一步探索,但相信通过不断的深入研究,lncRNA有望成为COPD早期诊断及诊疗的靶点。

猜你喜欢
靶点生物学编码
维生素D受体或是糖尿病治疗的新靶点
谷稗的生物学特性和栽培技术
基于SAR-SIFT和快速稀疏编码的合成孔径雷达图像配准
肿瘤免疫治疗发现新潜在靶点
《全元诗》未编码疑难字考辨十五则
子带编码在图像压缩编码中的应用
初中生物学纠错本的建立与使用
初中生物学纠错本的建立与使用
Genome and healthcare
心力衰竭的分子重构机制及其潜在的治疗靶点