张一君,王玲玉,马海明
(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
宁乡猪肉质相关Wnt10b基因多态性研究
张一君*,王玲玉,马海明**
(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
为探讨宁乡猪肉质相关Wnt10b基因的遗传变异情况,本研究以宁乡猪为研究对象,并与外来品种大白猪进行了比较,并用PCR-RFLP方法检测了该基因一个A→G类型的 SNP。结果表明,PCR-RFLP-Sal I多态性在宁乡猪品种中A基因为优势等位基因,其基因频率为0.686 6;大白猪中A基因为优势等位基因,基因频率为0.667 7。经卡方检验,符合孟德尔定律。本研究为宁乡猪的保种选育积累了有益的资料。
猪;Wnt10b基因;PCR-RFLP
宁乡猪原产于湖南省宁乡县的流沙河及草冲一带,原名为流沙河猪或草冲猪。宁乡猪形成历史悠久,其体型特征是“丝颈葫芦肚,耳薄嘴筒齐,稀毛现薄皮,鱼尾后脚直,奶子一斩齐,四脚要撒蹄”,“乌云盖雪银颈圈”。体型中等,体质疏松细致,体躯呈圆筒状,毛色为黑白花,基本色调是四肢、肋腹及颈下的下部为白色,头和臀部呈黑色。Wnt10b基因是经典Wnt通路上的重要成员,该通路与猪肉质性状有密切关系。本研究旨在筛选宁乡猪肉质性状遗传标记,旨在为该标记应用于宁乡猪的保种选育提供理论依据。
1.1 样品采集
取小块猪耳组织提取DNA,宁乡猪67头,大白猪325头,共计402头,采猪耳组织样品-20 ℃保存。
1.2 基因组DNA提取及聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增
基因组DNA提取按常规酚-氯仿进行。Wnt10b基因SNP位点PCR-RFLP-Sal I的PCR扩增条件为95 ℃ 2 min(预变性),95 ℃ 30 s(变性),59 ℃30 s(退火),72 ℃ 30 s(延伸),40个循环。
对Wnt10b基因A/G位点的基因频率、基因型频率见图1。PCR-RFLP-Sal I多态性的分布情况如表1所示。
由表2可知,这2个猪种的遗传纯合度都在0.5以上,且比较接近。宁乡猪的有效等位基因数低于大白猪。从多态信息含量上看,两个品种猪的PIC在0.25~0.5之间,属于中度多态。
在宁乡猪品种中,A基因为优势等位基因,其基因频率为0.686 6。在外来品种大白猪中,A基因为优势等位基因,基因频率为0.667 7;经适合性卡方检验,可知符合孟德尔遗传分离定律基因型频率比1∶2∶1。大白猪和宁乡猪在该基因位点具有遗传多态性,并且具有较高的遗传变异。□□
S813.1
A
1001-0769(2016)11-0023-02
2016-06-24。
宁乡猪基础研究(5026401-0315069)。
张一君(1988.11- ),女,汉族,甘肃天水人,硕士在读,研究方向为猪的分子遗传与育种;E-mail:362824409@qq.com。
**通信作者:马海明,博士,教授,研究方向动物遗传育种;E-mail:mahai ming2000@163.com。