姚克喜,张一君,许 栋,马海明
(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
宁乡猪肉质性状相关氟烷基因Hal多态性研究
姚克喜,张一君,许 栋,马海明
(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
为探讨宁乡猪肉质相关氟烷基因(Halothane gene,Hal)遗传多态性,利用PCR-RFLP检测该基因Hha I位点的多态性;结果表明,在宁乡猪中均只检测到了显性纯合子HalNHalN。与之比较,在781个大白猪的样本中检测到杂合子HalNHaln,基因型频率是0.003 8,但未发现隐性纯合子HalnHaln。本研究为宁乡猪肉质性状深入的研究打下基础。
猪;Hal基因;肉质性状
宁乡猪原产于湖南省宁乡县的流沙河及草冲一带,原名为流沙河猪或草冲猪。宁乡猪形成历史悠久,宁乡猪的特征是“丝颈葫芦肚,耳薄嘴筒齐,稀毛现薄皮,鱼尾后脚直,奶子一斩齐,四脚要撒蹄”,“乌云盖雪银颈圈”。宁乡猪体型中等,体质疏松细致,体躯呈圆筒状,毛色为黑白花,基本色调是四肢、肋腹及颈下部为白色,头和臀部呈黑色。
氟烷基因(Halothane gene,Hal)是肉质性状的
主效基因[1]。该基因被定位于猪的6号染色体上。氟烷基因有显性纯合子(HalNHalN)、(杂合子HalNHaln)和隐性纯合子(HalnHaln)。显性纯合子和杂合子表现为氟烷阴性,隐性纯合子表现为氟烷阳性,易产生应激综合征。本研究采用PCR-RFLP检测了宁乡猪Hal基因的基因频率和基因型频率,旨在筛选可应用于宁乡猪肉质性状遗传标记,为其保种和开发利用打下良好的基础。
1.1 样本采集
68头宁乡猪耳样采自宁乡大龙畜牧科技有限公司,781头大白猪耳样采自正虹科技股份有限公司原种猪场。耳组织-20 ℃保存。
1.2 猪的基因组DNA提取
按常规酚-氯仿法提取基因组DNA[2]。
1.3 引物合成与聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)扩增
Hal基因引物Hha I位点PCR-RFLP的左引物为5'-TCC AGT TTG CCA CAG GTC CTA CCA-3',右引物为5'-ATT CAC CGG AGT GGA GTC TCT GAG-3'。扩增片段大小为659 bp,由上海生工生物工程公司合成。PCR扩增的Hal基因片段长度为659 bp。PCR扩增反应体系为25 μL,包括模板Premix Taq 12.5 μL,上下游引物各5 pmol,DNA 1 μL,ddH2O补至25 μL。PCR扩增程序:94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共35个循环;72 ℃后延伸10 min,最后4 ℃保存。
1.4 PCR-RFLP检测
利用Hha I酶切Hal基因659 bp。酶切反应体系为20 μL,其中PCR扩增产物10 μL,限制性内切酶4 U,10×Buffer 2 μL,37 ℃(Hha I酶)酶切8 h,酶切产物用2%琼脂糖凝胶电泳检测并确定基因型。
2.1 Hal基因PCR扩增产物的酶切
Hal基因659 bp的扩增产物被Hha I酶切为493 bp和166 bp 2条带,基因型为HalNHalN,若不被内切酶识别,扩增产物不能被酶切,只有一条659 bp的带,即HalnHaln基因型,杂合子HalNHaln被内切酶不完全酶切,显示659 bp、493 bp和166 bp 3条带。扩增产物经Hha I酶切的部分电泳结果见图1。
2.2 基因和基因型频率
在宁乡猪中只检测到了氟烷基因的显性纯合子HalNHalN。Hal基因的Hha I的酶切位点上。与之比较,在781个大白猪的样本中检测到了氟烷基因的杂合子HalNHaln,基因型频率是0.003 8,并未检测到隐性纯合子HalnHaln,经Hardy-Weinberg平衡适合性检测表明,均处于不平衡状态。
猪对氟烷敏感是由基因HalN和Haln控制,氟烷隐性纯合子猪虽然容易发生应激综合症,但氟烷基因杂合子猪的瘦肉率和饲料转化率较高,生长速度较快[3,4]。我国地方猪种不含隐性氟烷基因或频率极低[5],宁乡猪只检测到了氟烷基因的显性纯合子HalNHalN,与此相符。在大白猪中并未发现隐性纯合子HalnHaln基因型,出现了极少量的杂合子HalNHaln。只含有少量杂合子,通过结合分子生物学的方法,能够剔除掉易发生应激综合症的HalnHaln基因个体,合理利用氟烷基因可提高猪种瘦肉率、饲料转化率,提高养猪业的效益。□□
(5篇,略)
S813.1
A
1001-0769(2016)11-0024-02