胡丽梅,张 瑞,邹军根(巴中市公安局物证鉴定所,四川 巴中 636099)
·学术争鸣·
接触性生物检材DNA提取方法的比较
胡丽梅,张瑞,邹军根
(巴中市公安局物证鉴定所,四川 巴中 636099)
关键词:法医遗传学;提取法;接触性生物检材;Chelex-100法;DNA IQTMSystem
在现代犯罪行为中,现场物证呈现多样化、微量化的趋势,接触性生物检材所占比例越来越大。接触性生物检材DNA模板量低,检验分型效果不稳定,随着法医DNA检验技术的不断提高、各种纯化试剂盒和检验设备的研发和应用,其检出率逐渐提高[1-2]。本研究采用Chelex-100法与DNA IQTMSystem(DC6700,美国Promega公司)分别对本实验室近年来实际检案中的接触性检材进行DNA提取,分析比较两种方法的提取效果,报道如下。
1.1材料
57份接触性生物检材中,瓶口、吸管类检材29份,手柄类工具检材17份,口罩、手套、衣物类检材11份,均来自本实验室日常检案。
1.2方法
29份瓶口、吸管类检材和17份手柄类工具检材,采用普通医用棉签干湿两步法进行擦拭提取;11份口罩、手套、衣物类检材,采用脱落细胞粘取器(公安部物证鉴定中心)粘取。以上检材均取适量后分为两份,分别采用Chelex-100法和DNA IQ纯化法提取DNA。
Chelex-100法:检材放入1.5mL的微量离心管,加入100 μL Chelex-100混悬液及3 μL蛋白酶K,56℃水浴30min,100℃煮沸8min,以离心半径5cm,13000r/min,离心4min,取上清液适量扩增。
DNA IQ纯化法:检材置于1.5mL的微量离心管中,加入DNA IQTMSystem裂解液300 μL及1 mol/L DTT 3μL,95℃煮沸30min,套管离心,去载体后加入3μL磁珠,混匀后室温放置10min,旋涡振荡后将微量离心管放在磁架上,小心吸去液体,然后用100μL洗液洗涤3次,室温下空气干燥10min,加入30μL的纯水,65℃ 5min进行洗脱,取洗脱液适量进行扩增。
使用Identifiler®Plus试剂盒(美国AB公司),10μL反应体系,在9700型PCR扩增仪(美国AB公司)上进行28次循环扩增,扩增产物在3130xl型遗传分析仪(美国AB公司)上进行电泳检测,采用GeneMapper ID v3.2软件进行数据分析。
通过对上述检验图谱进行分析统计,DNA IQTMSystem检出率明显高于Chelex-100法,结果见表1。
表1 两种DNA提取方法效果比较 [份(%)]
瓶口、吸管类检材两种方法检出率均较高,尤其采用DNA IQ纯化法时更高,且峰型均衡、无杂峰,峰高基本在1 000 RFU以上,大多数为单一来源;采用DNA IQ纯化法检验结果<9个基因座的案例中,有2例瓶口无瓶盖,2例吸管包装不当,可能致DNA降解严重。
手柄工具及口罩、手套、衣物类检材,Chelex-100法的检出率均不高;使用DNA IQ纯化法提取,检出率均有明显提高,峰高基本在1000~2000RFU,但多
Chelex-100法提取DNA,因其操作简便快捷、价格便宜、仪器设备要求低、在同一管中操作、检材损失低、相对不易污染而广泛用于常规检材的DNA提取[2-3],但对微量、腐败、降解检材的DNA提取有一定的局限性,如本研究使用该方法处理手柄工具及口罩、手套、衣物类检材检出率较低,分别为35.29%、18.18%,明显低于DNA IQ纯化法的70.58%、72.72%。
DNA IQ纯化法提取DNA,在高浓度硫氰酸胍和盐酸胍等存在的条件下,核酸吸附到二氧化硅上,而在低盐条件下核酸被洗脱下来,运用该系统提取DNA或对Chelex-100法提取的DNA进行纯化,成功率得到普遍提高。当然该方法操作较繁琐,不适合大批量检材的提取,如采用自动化工作站进行提取[4],更省时、简便。
参考文献:
[1]王彦涛,宋道江.M48磁珠法和Chelex-100法提取脱落细胞DNA的初步比较[J].刑事技术,2013,(2):53-54.
[2]杨电,张丽萍,刘超,等.Chelex-100和两种磁珠法提取接触DNA效果的比较[J].刑事技术,2012,(1):11-13.
[3]范生贵,王兴俊,王得椿.不同方法提取生物检材DNA的比较研究[J].生物技术世界,2014,(4):121.
[4]杨电,刘超,徐曲毅,等.DNA IQ磁珠法结合MaxwellTM16自动仪提取接触DNA[J].刑事技术,2011,(3):3-5.
(本文编辑:李成涛)
中图分类号:DF795.2
文献标志码:B
doi:10.3969/j.issn.1004-5619.2016.03.013
文章编号:1004-5619(2016)03-0215-02
作者简介:胡丽梅(1984—),女,主要从事法医物证学研究;E-mail:261031103@qq.com数检出混合图谱。
收稿日期:(2015-08-24)