湖南地区汉族人群20个非CODIS STR基因座多态性

2015-12-13 12:26周健吴晓雪
法医学杂志 2015年6期
关键词:湘西自治州基因座遗传学

周健,吴晓雪

(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)

·研究简报·

湖南地区汉族人群20个非CODIS STR基因座多态性

周健,吴晓雪

(湘西自治州公安局,湖南吉首 416000)

法医遗传学;多态现象,遗传;短串联重复序列;湖南;汉族

本研究采用Goldeneye誖DNA身份鉴定系统22NC试剂盒,对湖南湘西自治州300名汉族无关个体的20个非CODIS STR基因座进行群体遗传学调查,以获取20个STR基因座在该地区的相关群体遗传学数据,为该地区的法医学应用提供基础数据,现报道如下。

1 材料与方法

湖南汉族人群血样在知情同意原则下采自健康志愿者,包括男性180名,女性120名。采用Chelex-100法[1]提取DNA。Goldeneye誖DNA身份鉴定系统22NC试剂盒购自基点认知(北京)公司。PCR反应体系为10 μL,循环条件:95℃11 min;94℃30 s,60℃60s,70℃60s,30个循环;60℃30min。PCR产物变性后在3130XL型遗传分析仪(美国AB公司)上进行毛细管电泳,用GeneMapper ID v3.2.1软件对STR基因座进行分型。对基因型频率进行Hardy-Weinberg平衡检验。采用PowerStats软件分别计算20个基因座的杂合度(H)、个人识别率(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)等群体遗传学参数。

2 结果与讨论

目前市场上的商业化试剂盒中大多数基因座是CODIS基因座结合个别非CODIS基因座,由于STR基因座的突变率较高,在亲权鉴定中对于非CODIS基因座的需求比较大。本研究采用的Goldeneye誖DNA身份鉴定系统22NC试剂盒则涵盖了20个非CODIS基因座,这20个STR基因座的群体遗传学参数见表1。

经对每个基因座的基因型分布进行χ2检验,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05)。20个STR基因座的DP值均大于0.85,在群体中的累积个体识别率为1-3.2264×10-26。该20个STR基因座在二联体和三联体中的累积非父排除率均大于0.99999。以上表明,这20个STR基因座在湖南汉族人群中具有良好的多态性,能够用于日常法医学实践。

表1 20个STR基因座在湖南汉族人群中的群体遗传学参数(n=300)

[1]Walsh PS,Metzger DA,Higushi R.Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material.BioTechniques 10(4):506-513(April 1991)[J].Biotechniques,2013,54(3):134-139.

DF795.2

B

10.3969/j.issn.1004-5619.2015.06.017

1004-5619(2015)06-0478-01

2015-08-24)

(本文编辑:李成涛)

周健(1982—),男,法医师,主要从事法医物证学鉴定;E-mail:45159121@qq.com

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