降香黄檀—檀香根际土壤高效解磷细菌的分离筛选与鉴定

2015-04-29 00:44:03徐睿刘君昂周国英李冬琴罗娜黄馨
热带作物学报 2015年2期
关键词:檀香

徐睿 刘君昂 周国英 李冬琴 罗娜 黄馨

中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室,湖南长沙 410004

摘 要 利用PKO无机磷培养基从不同林龄的降香黄檀-檀香根际土壤中分离筛选高效解磷菌,为进一步研制专用生物复合肥提供依据。通过溶磷圈法筛选溶磷较强(D/d值大于1.5)的菌株19株,采用钼锑钪比色法测定其解磷能力。结果显示:菌株无机磷溶量在9.23~223.27 μg/mL之间,3株菌无机磷溶量在170 μg/mL以上;菌株有机磷溶量在0.43~25.05 μg/mL之间,有机磷溶量在15 μg/mL以上有4株。采用Salkowski 比色法测定菌株分泌IAA能力,10株菌具有分泌能力,其中DosaP25分泌IAA量达32.14 μg/mL。综上所述,菌株DosaP15、DosaP25具有较强的解磷、分泌IAA能力。基于形态学、生理生化特性及16 S rDNA序列比较分析,初步鉴定DosaP15属于Bacillus pumilus、DosaP25属于Bacillus subtilis。试验同时表明,菌株溶磷量、分泌IAA量与培养液pH值之间不存在显著相关性。

关键词 降香黄檀;檀香;根际解磷菌;解磷能力;IAA

中图分类号 S182 文献标识码 A

磷是植物生长发育的必需元素且主要从土壤中获取,而土壤中绝大部分磷以难溶状态存在,不利于植物吸收,成为限制植物生长发育的重要因素[1-2]。有研究发现,土壤中存在着将植物难以吸收的难溶态磷转化成有效态磷的微生物,称其为解磷菌或溶磷菌[3]。甚至部分解磷菌还能分泌促生物质,改善植物根际土壤环境,促进植物生长[4-5]。乔志伟等[6]从石灰性土壤作物根际分离溶磷细菌,其中W25对磷酸三钙的溶解能力达385.5 mg/L,同时可分泌甲酸、乙酸、草酸、琥珀酸等多种有机酸。

降香黄檀(Dalbergia odorifera)为豆科蝶形花科半落叶乔木,国家II级重点保护野生植物[7];檀香(Sandalwood)为半寄生性常绿乔木,须与寄主共生才能存活[8]。两者均为珍贵红木用材树种,心材坚硬、耐湿耐腐,是制作名贵木制品的重要原料,具有重要的药用价值[9-10]。然而降香黄檀、檀香生长缓慢,通常数十年才能成材,人为盗伐严重,野生资源已濒临灭绝。近年来,通过对降香黄檀、檀香的大规模推广种植,以推动贫困地区致富,同时对降香黄檀、檀香种质资源起到有效的保护。其中以降香黄檀-檀香混交模式种植,效果较好。檀香抑制降香黄檀快速增高有利于其心材的形成,降香黄檀为檀香提供营养物质促进檀香生长[11-12]。但降香黄檀、檀香幼苗(幼林)长势差、生长缓慢等问题未得到有效解决,同时大量化肥的施用引起了环境污染、生产成本增加等问题。本文旨在从降香黄檀、檀香根际土壤中筛选出高效解磷菌,研究其解磷、分泌IAA等特性,为专用生物复合肥研制提供理论基础,以解决降香黄檀、檀香幼苗(幼林)长势差、生长缓慢等问题,到达减少化肥施用量、降低生产成本的目的。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 土样采集 在海南省降香黄檀、檀香种植区(澄迈、定安、尖峰、东方、白沙等地),利用五点随机采样法,采集3、4、5、6、7、10年生的降香黄檀、檀香根际土壤(20~40 cm),装入保鲜袋(无菌)中,冷冻保存带回实验室分离。

1.1.2 供试培养基 PKO无机磷培养基、蒙金娜有机磷细菌培养基、King氏培养基、LB培养基等[13]。

1.2 方法

1.2.1 根际高效解磷细菌的分离 称取样品10 g(不同林龄的降香黄檀、檀香土样),置入装有90 mL无菌水的三角瓶中,振荡20 min,制成土壤悬液。采用10倍稀释法配制浓度梯度为10-4、10-5、10-6的土壤悬液样品,用于解磷细菌的分离。每个浓度梯度吸取100 uL涂布于PKO无机磷固体培养基上,重复3次,恒温28 ℃培养2~4 d。挑选长势较好的单菌落,做好标记后选用LB固体培养基进行纯化,4 ℃保存。

1.2.2 菌株解磷能力测定 定性测定:将分离纯化后的培养物采用PKO无机磷固体培养基、恒温28 ℃培养4 d,记录D/d(溶磷圈直径/菌落直径)值,筛选D/d 值较大的菌株,用LB培养基斜面保存。

定量测定:在250 mL三角瓶中加入灭菌的100 mL PKO无机磷液体培养基或蒙金娜有机磷液体培养基,取1 mL待测菌株菌悬液(108 cfu/mL)分别加入到250 mL三角瓶中,160 r/min,恒温30 ℃培养7 d,测定培养介质pH值;对照组用1 mL无菌水替换1 mL菌液,其余条件不变。将培养液4 ℃,10 000 r/min离心10 min,取上清液。采用钼锑抗比色法测定上清液OD700 nm值,根据标准曲线计算菌株的无机磷(有机磷)溶量[14]。

1.2.3 菌株分泌IAA能力测定 用分光光度计,采用Salkowski比色法[15]测定波长530 nm的OD值,根据标准曲线换算出IAA分泌量,并各测定各菌液的环境pH值。

1.2.4 菌株鉴定 菌株形态观察:记录待鉴定菌株在蒙金娜有机磷固体培养基上培养2 d的菌落特征,用显微镜观察菌体形态特征。

生理生化:参照《伯杰氏细菌鉴定手册》(第八版)及《常见细菌系统鉴定手册》(东秀珠编),进行细菌生理生化试验。

16 S rRNA序列测定及分析:以提取的待测细菌菌株基因组DNA为模板,选用细菌16 S rRNA基因通用引物27F和1492R,进行PCR扩增。PCR反应条件:94 ℃ 5 min,94 ℃ 1 min,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,循环30个,72 ℃ 10 min。将所得产物样品送至上海博尚生物技术公司测序,测序结果在NCBI中进行BLAST分析,利用EGA5.05软件,使用Neighbor-Joining法进行计算分析(Bootstraps=1 000),构建菌株系统进化树。

1.3 数据分析

采用SPSS 19.0进行方差分析和多重比较(LSD法和Duncan检验),并用Excel 2010制作图表。

2 结果与分析

2.1 根际高效解磷细菌的分离、筛选

2.1.1 解磷细菌的分离纯化 利用PKO无机磷培养基,从不同林龄(3、4、5、6、7、10 a)的降香黄檀、檀香根际土壤,分离纯化出可培养物187个。菌落呈近圆形或椭圆形、白色或黄色、半透明或不透明、大部分表面扁平、边缘规则、生长速度中等。

2.1.2 菌株解磷能力定性测定 利用溶磷圈法在PKO无机磷固体培养基上培养4 d,测定各菌株溶解磷酸钙能力,筛选出D/d值大于1.5的菌株共计19株(图1)。其中9株菌株的D/d值在1.5~2.0之间,占测定菌株的47.36%;D/d值在2.0~2.5间的菌株有6株,占测定总数的31.58%;有4株的D/d值大于2.5,占测定总数的21.05%。溶解磷酸钙能力较强菌株是DosaP25,D/d值达到4.1;其次是DosaP7,D/d值为3.23。

2.1.3 菌株解磷能力定量测定 各菌株溶解无机磷(磷酸钙)的量在9.23~223.27 μg/mL之间(表1),其中3株菌的无机磷溶量在170 μg/mL以上,占供试菌株的15.79%。DosaP25溶解磷酸钙的量高达223.27 μg/mL,其次是DosaP15和DosaP23,分别达196.47、174.32 μg/mL。无机磷溶量在20~100 μg/mL间的菌株有9株,占供试总数的47.37%;5株菌株的无机磷溶量在20 μg/mL以下,占供试总数的26.32%。除菌株DosaP2与DosaP10间无显著差异外,其它菌株间均达到显著差异(p<0.05)。DosaP25的溶解无机磷能力是DosaP5(9.23 μg/mL)的24.19倍,是对照组(4.55 μg/mL)的49.07倍。

同时测定各菌株对有机磷(卵磷脂)的溶解能力,供试菌株对卵磷脂的溶解量在0.43~25.05 μg/mL之间。有机磷溶量在10 μg/mL以下的菌株有13株,占供试总数的68.42%;5株菌株的有机磷溶量在10~20 μg/mL之间,占供试总数的26.32%;其中DosaP15溶解卵磷脂的能力最强,达到25.05 μg/mL,其次是DosaP25(19.22 μg/mL)。菌株DosaP3与DosaP9、DosaP4与DosaP16之间卵磷脂溶解量无显著差异,其余菌株之间差异显著(p<0.05)。DosaP15、DosaP25溶解有机磷的能力分别是DosaP5的58.26、44.70倍。

2.1.4 菌株解磷能力与终点pH值间关系 PKO无机磷、蒙金娜有机磷液体培养基的起始pH值均为7.2,各菌株PKO无机磷培养液终点pH值的测定结果显示:终点pH值偏酸且随着磷酸钙溶解量的增加呈下降趋势,对照组的pH值在7.0附近略微变化(图2)。DosaP15溶解磷酸钙的量达223.27 μg/mL,对应的培养液终点pH值为5.62。17株菌株的培养液终点pH值在6.0~7.0之间,占供试菌株的89.47%。菌株对磷酸钙的溶解量与培养液终点pH值之间不存在显著的线性回归关系,R2(相关系数)仅为0.850 6。

各菌株蒙金娜有机磷培养液终点pH值的测定结果表明:与磷酸钙的溶解量相比,随着卵磷脂溶解量的增加,终点pH值的下降趋势更加明显(图3)。6株菌株的培养液终点pH值在5.23~6.0之间,占供试菌株总数的31.58%;菌株DosaP15溶解卵磷脂的量最大,其培养液终点pH值(5.23)下降明显;对照组的pH值无明显变化。菌株溶解卵磷脂的量与终点pH值之间的相关系数为0.536,表明两者之间无显著线性回归关系。

菌株的PKO无机磷、蒙金娜有机磷培养液终点pH值绝大部分集中在6.5左右,而对照组的起始pH值与终点pH值均在7.0左右。这些说明解磷细菌分泌一些酸性物质,使得H+数量增加导致pH值下降。DosaP5的终点pH值(6.13)低于DosaP14(6.15),但DosaP14的卵磷脂溶量(4.35 μg/mL)远高于DosaP5(0.43 μg/mL)。表明,解磷细菌溶解磷的能力不完全取决于培养介质中H+的数量。

2.1.5 菌株分泌IAA能力测定 结果显示(表2),10株菌株具有分泌IAA能力,占供试总数的52.63%;分泌IAA量在25 μg/mL以上的菌株有3株,即DosaP25(32.14 μg/mL)、DosaP23(28.7 μg/mL)、DosaP15(27.53 μg/mL)。各菌株之间分泌IAA能力差异显著,其中DosaP25(32.14 μg/mL)分泌IAA量是DosaP5(4.56 μg/mL)的7.05倍。

King氏液体培养基的起始pH值为7.2,各菌株分泌IAA量与培养液终点pH值之间的相关系数R2为0.944,表明菌株分泌IAA量与终点pH值之间无显著的线性回归关系(图4)。随着菌株分泌IAA量的增加,培养液终点pH值呈下降趋势;无分泌IAA能力菌株培养介质终点pH值偏中性或碱性,说明菌株分泌IAA导致培养介质中H+数量增加从而引起pH值下降。

2.2 菌株鉴定

2.2.1 菌株形态学观察 挑选有机磷溶量在19.0 μg/mL、无机磷溶量在190.0 μg/mL、分泌IAA能力在27.0 μg/mL以上的菌株DosaP15、DosaP25进行形态学观察。

在蒙金娜有机磷固体培养基上培养2 d,DosaP15菌落呈污白色,近圆形、半透明或不透明、表面光滑、边缘整齐、生长较慢;DosaP25菌落呈淡黄色,近圆形、不透明、表面光滑、中间隆起、边缘整齐,生长较快(图5)。

DosaP15革兰氏染色阳性,细杆状,单个或成对排列,大小为(2.2~2.8)μm×(0.6~0.7)μm,产芽孢;DosaP25革兰氏染色阳性,杆状,两端钝圆,多个排列时成短链,大小为(2.2~3.0)μm×(0.7~0.8)μm,产芽孢(图6)。

2.2.2 菌株生理生化实验 DosaP15、DosaP25的主要生理生化指标试验结果表明(表3), 两者相同点在于运动性试验、V.P试验、过氧化氢试验为阳性,不产气,可利用葡萄糖、果糖、柠檬酸盐,液化明胶;在2% NaCl、5% NaCl中均可生长,5 ℃不生长,耐受温度为41 ℃,产芽孢。不同点在于DosaP15 甲基红试验为阳性,不能利用乳糖,不可水解淀粉,硫化氢、硝酸盐还原试验阴性;DosaP25甲基红试验为阴性,可利用乳糖,水解淀粉,硝酸盐还原、硫化氢试验阳性。结合形态学特征和生理生化指标,初步判断DosaP15、DosaP25属于芽孢杆菌科,芽孢杆菌属。

2.2.3 16 S rRNA基因序列测定及分析 将待鉴定菌株16 S rRNA基因测序所得序列,采用BLAST进行同源性比较,与GenBank中的核酸数据对比分析,DosaP15与Bacillus pumilus(JX 102495)同源性达99%,DosaP25与Bacillus subtilis(KF 831377)同源性达99%。选取同源性较高的代表菌株,以16 S rRNA基因序列为基础,构建系统发育树(图7、8)。相比芽孢杆菌属的其它种,DosaP15与短小芽孢杆菌的遗传进化距离最近,同处一个最小分支;DosaP25与枯草芽孢杆菌的遗传进化距离最近,同处一个最小分支。将DosaP15、DosaP25的形态特征、生理生化测定指标与表4[16-17]进行对比,发现DosaP15、DosaP25的主要特征分别与短小芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌相一致。结合16 S rRNA序列分析,初步鉴定DosaP15为短小芽孢杆菌、DosaP25为枯草芽孢杆菌。

3 讨论与结论

土壤中磷素循环以微生物活动为中心,微生物活动对土壤磷素的转化影响很大。土壤微生物在植物根系区间的生态分布数量远高于非根系土壤区间。植物的代谢物质通过根系进入土壤中,不仅能作为微生物繁殖的营养物质,甚至对一些菌群的生长起到刺激作用。Kabznelson等[18]和赵小蓉等[19]研究发现,解磷菌在植物根际土壤中的分布数量比非根际土多出1~2个数量级。

溶磷圈法只能作为初筛解磷微生物的方法,D/d值不能完全反应菌株的溶磷量。本研究中,溶磷圈法初筛的D/d值DosaP15(1.89)小于DosaP23(3.0),而DosaP15的无机磷溶量(196.47 μg/mL)、有机磷溶量(25.05 μg/mL)均高于DosaP23(174.32、19.22 μg/mL)。Kucey等[20]研究也证实了溶磷圈法只能用于初筛解磷菌。另外,不同根际解磷菌株的解磷能力存在较大差异,DosaP25溶解磷酸钙的量(223.27 μg/mL)是DosaP5(9.23 μg/mL)的24.19倍,DosaP15、DosaP25溶解卵磷脂的量(25.05、19.22 μg/mL)分别是DosaP5(0.43 μg/mL)的58.26、44.70倍。这可能与植物所处的土壤类型、土壤肥力、气候及植物的年龄、长势等综合因素有关。林启美等[21]研究证实了不同土壤生态环境中解磷菌分布存在较大差异,菜地土壤中有机磷细菌数量是林地、草地、农田的10倍。

对于解磷菌的解磷机理,尚未有一个准确的定论,不同菌株的解磷机理有所差别。在土壤无机磷缺乏的情况下,解磷菌通过分泌核酸酶、磷酸酶及植酸酶等,溶解有机磷转化成无机磷酸盐的形式。一般认为,解磷菌溶解无机磷与自身分泌酸性物质有关,这些物质可降低pH值,能与Al3+、Mg2+、Ca2+、Fe3+、Fe2+等离子结合,从而溶解难溶性磷酸盐。不同解磷菌株分泌有机酸的种类存在较大差别,如席琳乔等[22]从棉花根际分离出的解磷菌可分泌酒石酸、乙酸、柠檬酸、丁二酸,而朱颖[23]从三叶草根际土壤中分离的解磷菌可产草酸、酒石酸、乳酸、柠檬酸、苹果酸。一些解磷菌还可分泌植物激素IAA且不同菌株分泌IAA量存在明显差异。如DosaP25分泌IAA量是DosaP5的7.05倍;李显刚等[24]从百脉根根际土壤筛选出11株具有分泌IAA能力的溶磷菌,其中菌株LC20分泌IAA能力是LC5的4.62倍。本研究中菌株的解磷能力、分泌IAA能力与培养介质终点pH均无显著相关性,各菌株培养介质终点pH与起始pH相比呈下降趋势,对照组的培养介质pH无明显变化呈中性或略偏碱性。与赵小蓉等[25]研究发现解磷菌的溶磷量与培养介质pH值及有机酸分泌量均无显著相关性的结果相近。菌株的磷酸钙溶量、卵磷脂溶量、IAA分泌量与培养介质终点pH之间的相关系数存在如下关系,R32(0.944)>R12(0.8506)>R22(0.536)。说明IAA分泌量与培养介质终点pH之间的关系更为密切,证实了解磷细菌通过分泌一些酸性物质,使得质子数量增加导致pH值下降。下一步将对筛选出的高效解磷菌作进一步研究,以用于专用生物复合肥的研制。

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