龙海燕,杨菁玉 综述,冯 萍 审校(四川大学华西医院感染性疾病中心,成都 610041)
·综 述·
艰难梭菌感染实验室检测技术及其研究进展
龙海燕,杨菁玉 综述,冯 萍△审校(四川大学华西医院感染性疾病中心,成都 610041)
艰难梭菌; 细菌培养; 毒素检测; 免疫学; 分子生物学
艰难梭菌(CD)是一种专性厌氧的革兰染色阳性芽孢杆菌,它广泛分布于自然环境、动物和人的粪便中,芽孢抵抗力较强,可在外界环境存活数周至数月。CD本身没有侵袭性,部分产毒细菌通过分泌毒素A、毒素B及二元毒素引起抗菌药物相关性腹泻、结肠炎甚至致死性假膜性肠炎,统称为艰难梭菌感染(CDI)。广谱抗菌药物的使用、炎性反应肠病、慢性肝病、器官移植、化疗、长期使用激素、丙种球蛋白减少等患者以及怀孕及分娩前后的妇女更易发生CDI[1]。目前,CD是公认的院内感染和抗菌药物相关性腹泻最重要的病因。进入21世纪以来,CDI发病率和疾病严重程度在全球范围内呈上升趋势。而我国多数医院对CDI检查手段有限,诊断率低,因此,目前对早期、快速、准确、廉价地诊断CDI提出了更高要求,以期早期治疗,降低住院时间、病死率等。本文就现有CDI检测技术及其进展作一综述。
1.1 细胞毒性试验(CTA) CTA是通过验证标本中存在特异性毒性效应产物来诊断CDI,主要原理是将过滤的粪便抽提物接种至处于生长的健康单层细胞中培养24~48 h,若样本中存在CD毒素则会出现特殊的细胞病变效应(细胞变圆),为明确其特异性需再在样本中加入特定的抗毒素进行细胞毒素中和试验。研究发现,毒素B所致的细胞病变效力是毒素A的103~104倍[2]。CTA因其敏感性和特异性高曾被美国食品药品监督管理局认定为检测CDI的金标准。但是CTA需要难度较高细胞培养技术,测定时间长,受标本稀释浓度等影响使其在常规临床微生物实验室应用有一定困难。
1.2 A/B毒素的免疫学检测(A/B EIA) 该方法是通过检测CD产生的主要毒素来判断CDI。CD通常产生A、B两种毒素,以前免疫学常针对的是毒素A,但近年国内外均有A/B+株报道,且该菌株仍可导致严重CDI[3]。因此,现在都同时检测A、B两种毒素以提高检测的灵敏度。目前主要采用酶联免疫法、免疫层析法等。其基本原理是通过抗原抗体反应使酶标抗体(或抗原)结合到载体上,经洗涤或层析后与底物反应显色,根据颜色深浅进行定性或定量分析,数小时即可得出结果,是一种快速、简单、便宜、设备技术要求不高的检测手段,目前已经有大量的商品试剂盒上市。以前A/B EIA是应用最为广泛的诊断方法。但有研究表明,与产毒株培养相比其敏感性为32.8%~57.1%,而且在临床中标本留取到正式进入检测的时间如果较长,则毒素容易分解,易造成假阴性[4]。目前普遍认为EIA不能被作为一个单独诊断CDI的检查方法。CD毒素是导致CDI最直接的原因,因此毒素检测对于CDI诊断具有很高特异性,但是其敏感性仍值得商榷。曾有报道,1例经肠镜检查诊断为伪膜性肠炎的患者携带有CD产毒株,但是却未检测到CD毒素,在一定程度上提示若只依靠毒素检测可能会导致某些CDI的漏诊[5]。而关于毒素阳性与疾病严重程度的关系也存在一定分歧,这可能是由检测方法不同导致[6-8]。英国卫生部所发布的指南指出,只有检测出CD毒素的患者才能上报CDI,因此毒素检测在临床上仍占有重要的位置。
2.1 细菌培养 这是CDI的传统检测方法,其主要步骤是预处理大便后,接种至CD选择性培养基-环丝氨酸头孢西丁果糖琼脂(CCFA)中,厌氧环境下至少培养48 h。如果有着足够相关经验,根据培养基上菌落形态及革兰染色阳性的证实就可明确有无CD,可疑者可进行进一步的生化鉴定。目前在传统的培养方法上也有一定的改进,如在CCFA中加入牛磺胆酸钠或者溶菌酶更有助于芽孢的富集,从而提高了敏感性[9]。CD培养敏感性高,培养得到的细菌可以进一步进行毒素分析、细菌分型、耐药分析等,有利于流行病学调查研究。但是厌氧菌标本收集要求高,培养难度大,阳性率受操作人员经验影响大,所需时间长,检验成本较高,在临床实验室未常规开展,主要用于科研方面。若培养为细菌阳性者也不能区别其是否产毒,因此,限制其进一步的应用。
2.2 CD共同抗原(GDH)检测 CD共同抗原是CD表面大量表达的谷氨酸脱氢酶,目前主要用免疫学方法直接检测大便中的GDH抗原。Crobach等[10]研究发现,GDH检测与细菌培养和产毒株培养比较,其平均敏感性分别为88%和60%。Shetty等[11]用Meta分析发现,GDH检测的阴性预测值在94.6%~100%。GDH稳定性和灵敏度较高,不易受到标本存放时间的影响,但不能区分是否为产毒株,且其最大优势在于有很高的阴性预测值,阴性结果者即可基本排除CD的存在,阳性者可再进一步行毒素或产毒基因检测,因此可以作为二步法或三步法的筛查试验。
3.1 产毒菌株培养(TC) TC包括CD培养和毒素检测两个步骤。CD培养阳性者再进行毒素检测,后者主要有细胞毒性检测,聚合酶链反应(PCR)检测毒性基因,免疫法检测毒素A/B等。聚合酶链反应(PCR)只是检测毒素基因,其有不一定表达或表达量太少无法致病的可能,而A/B EIA敏感性不高,因此目前产毒菌株培养是指CD培养加细胞毒性检测才是公认的诊断CDI的金标准[12[13-14]。
3.2 核酸扩增试验(NAAT)
3.2.1 PCR 因为所有产毒菌株都携带B毒素基因,因此大部分PCR主要针对艰难梭菌B毒素基因tcdB,也有针对艰难梭菌A毒素基因tcdA,负向调节基因tcdC,编码二元毒素的基因cdtA和cdtB,CD的特异性基因等。在普通PCR基础上已经发展出实时荧光PCR,多重PCR等技术应用于CDI检测。Deshpande等[15]用Meta分析发现,实时荧光PCR与TC和CTA相比,其平均敏感性和特异性分别为90%、96%、89%、97%。Persson等[16]使用多重PCR检测tcdA、tcdB、ctdA、cdtB和tcdC,发现其对027核酸型有很高特异性,并且能检测其他CD临床类型,对流行病学也有重要意义。目前已经有多种商品试剂盒上市,有些可直接用于粪便检测,耗时1~5 h不等,因其快速、高敏感性而被广泛认可。但是PCR仍存在一些问题:如引物结合区基因修饰导致假阴性结果;只携带产毒基因却不表达或少量表达而不足以致病;无法区分疾病严重程度;新型菌株出现时易漏诊,检测费用昂贵等。
3.2.2 环介导等温扩增技术(LAMP) 因LAMP对目标基因长度只能控制在200 bp左右,因此其针对的是tcdA。LAMP是利用链置换反应在一定温度下进行,反应只需将基因模板、4种针对靶基因的6个区域的特异性引物、链置换型DNA合成酶、基质等共同置于一定温度(60~65 ℃)下,经1个步骤即可完成。Lalande等[17]以产毒株培养为金标准,用LAMP检测CD发现,敏感性和特异性分别可达91.8%和99.1%且可1 h内出结果。Boyanton等[18]用实时荧光PCR与LAMP相比发现两者在敏感性上相差无几,后者特异性稍低一些,但都远远超过A/B EIA。该方法检测时间短(1 h左右)、设备简单、操作简便、费用相对便宜,配合相应显色试剂还能实现肉眼判别结果。但其缺点是容易污染,造成假阳性结果;有些产毒菌株有tcdA缺失,从一定程度上影响了LAMP准确度。
3.2.3 依赖解螺旋酶恒温扩增技术(HDA) 该技术是2004年报道的一种新型恒温基因扩增技术。HDA基本原理是先用解旋酶解开双链DNA,再依靠单链DNA结合蛋白与模板单链结合,使模板单链处于单链状态并保护它的完整性,引物与模板杂交,然后在DNA聚合酶催化下扩增,新合成的双链DNA即产物作为底物进入下一轮扩增。目前有分别针对tcdA、tcdB的HDA。Deak等[19]发现AmpliVue C.Difficile assay(针对tcdA)与LAMP法比较,其敏感性和特异性分别为96%、100%。有学者对The Portrait Toxigenic C.difficile assay(针对tcdB)进行了一个多中心的临床检测评价,发现该法以TC为金标准,其敏感性和特异性分别为98.2%、92.8%,可在90 min内出结果[20]。HDA模仿自然界DNA合成方式,不易引起非特异性扩增,具有高敏感性和高保真性。反应在同一温度下可以进行,因而不需要昂贵的PCR仪,很适合基层实验室的使用,为一种崭新的恒温扩增技术,虽然还有待更进一步的探索研究,但是具有很大的发展前景。
目前NAAT因其敏感性高、快速而被广泛认可,2013年《美国胃肠病学杂志》发表的关于CDI诊断的指南中指出,建议NAAT可以单独作为一种诊断手段[1]。它有利于临床CDI诊治和控制措施的快速开展,从而减少经验性治疗、平均住院时间、CD传播的发生率等,因此可一定程度上降低整体医疗支出[21]。但在临床应用中仍发现一些问题:难以区分无症状携带者;导致CDI发病率报道的增加[22]。因此,建议临床医生把检测手段与临床症状相结合以综合判断病情。
CTA和TC因敏感性高而曾先后推荐为CDI的诊断金标准,但其技术要求高,耗费时间长;A/B EIA虽然方便、快速、便宜但敏感性不足;NAAT敏感性高、快速,但费用昂贵。因此很多指南推荐二步法和三步法,但关于该法的具体构成存在不一致性。2012年英国卫生部更新的指南建议:使用NAAT或GDH为初筛试验,阳性者再加敏感的A/B EIA,全阳性考虑CDI;NAAT(GDH)阳性,A/B EIA阴性,考虑CD携带,有传染的可能性,可选择性地再进行PCR检测;全阴性不考虑CDI。2013年美国《胃肠病学杂志》发表的指南建议,GDH为初筛试验,阴性者排除CDI;阳性者必须再进行NAAT或A/B EIA检测;NAAT阳性则考虑CDI,反之排除;A/B EIA阳性者考虑CDI,阴性者还需再用NAAT进行确诊[2]。无论二步法或三步法构造怎样,其都具有很好的敏感性和特异性[23-24];虽然确诊可能会稍有延长,但能够迅速排除CDI,明显缩减疾病负担费用[25]。见表1。
表1 CDI实验室检测技术比较
CD正在不断进化,CDI的地理范围、严重程度、发病特点、人群种类也在不断变化。诊断CDI的检测技术也经历了产毒细菌分离培养,免疫学检测到分子生物学技术检测时代。细菌分离培养是金标准,但对标本、技术人员要求高,耗时长;免疫学检测快速但是敏感性较低;NAAT则以更敏感、更快速而被大家推崇,虽然费用稍高,但是随着不同的NAAT技术发展,费用正在逐步降低,有望走向临床;二步法和三步法同时具有很好的敏感性和特异性,可针对性检测,从而在整体效益上明显缩减医疗费用,也有临床应用前景。但是因检测到CD产毒基因并不代表CDI,因此CDI诊断需要结合患者症状和其他生化辅助指标以综合评判患者的病情,以免过度治疗。如何提高CDI诊断率仍将是生物学工作者及临床医生的一大难题,本综述对CDI的诊断技术进行复习,希望对提高CDI的诊断意识及水平有一些帮助。
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10.3969/j.issn.1672-9455.2015.08.049
A
1672-9455(2015)08-1143-03
2014-10-17
2014-11-22)
△通讯作者,E-mail:fengp_62@163.com。